Việc áp dụng 2 cách tính thuế GTGT nh hiện nay đang nảy sinh một số vấn đề sau: Có thể khẳng định ngay rằng việc tính thuế GTGT theo phơng pháp khấu trừ (PP1) so với phơng pháp trực tiếp (PP2) là có lợi, mang tính u đãi và khuyến khích cho ngời nộp thuế hơn. Nhng trong một số trờng hợp, ngời thực hiện đầy đủ chế độ chứng từ, hoá đơn và sổ sách kế toán lại phải nộp thuế cao hơn những ngời không thực hiện đầy đủ, điều này đợc chứng minh nh sau (để đơn giản, giả sử không có hàng tồn kho)
Giả sử: T1: số thuế GTGT phải nộp theo PP1 T2: số thuế GTGT phải nộp theo PP2
⇒ So sánh PP1 và PP2 ta thấy:
* Nếu ∆t = 0: không có sự chênh lệch giữa thuế suất đầu ra và thuế suất đầu vào nên kết quả tính toán giữa hai phơng pháp là nh nhau. Trờng hợp này thờng xảy ra đối với các hoạt động thơng mại, mua đi bán lại, không thay đổi tính năng hình dáng sản phẩm.
* Nếu ∆t < 0: Thuế suất đầu vào lớn hơn thuế suất đầu ra, doanh nghiệp đợc tính theo PP1 lợi hơn PP2, phù hợp với tinh thần của luật.
* Nếu ∆t > 0: doanh nghiệp đợc tính thuế theo PP2 lợi hơn PP1, đi ngợc với tính thần của luật.
Từ công thức T1 = Σgiá mua (tr - tv) - ΣGTGT x tr có thể thấy rằng mức thuế GTGT của các doanh nghiệp phụ thuộc vào thuế suất đầu vào. Thuế suất đầu vào càng cao doanh nghiệp càng có lợi và ngợc lại, điều này sẽ khiến các doanh nghiệp tìm nguồn vật t, sản phẩm và dịch vụ thuộc ngành hàng mà Nhà nớc không u tiên khuyến khích phát triển vì có thuế suất cao, nh vậy những doanh nghiệp đợc Nhà nớc u tiên có thuế suất thấp sẽ bị một rào cản vô hình về thuế trong khâu tiêu thụ sản phẩm. Trong chừng mực nào đó nó sẽ có tác động làm chệch hớng phát triển của nền kinh tế.
PP1: T1 = Tr - Tv = (Gv x tr) - (Gr x tv) mà Gr = Gv + GTGT ⇒ T1 = Gv (tr - tv) + GTGT x tr đặt tr – tv = ∆t ⇒ T1 = Gv x ∆t + GTGT x tr PP2: T2 = GTGT x tr Ta có: Tv =Gv x tv ; Tr = Gr x tr
Trong thực tế, ta thấy rằng thuế suất GTGT phần nguyên liệu cho sản xuất thờng thấp, trong khi đó thuế suất sản phẩm chế biến thờng cao hơn. Vì vậy nhiều trờng hợp ∆t > 0 và tính thuế theo PP2 có lợi cho doanh nghiệp hơn. Nh vậy những doanh nghiệp không đảm bảo chế độ sổ sách có lợi hơn những doanh nghiệp chất hành tốt chính sách thuế.
Ví dụ: Một doanh nghiệp mua nguyên liệu để SX có giá trị là 50 triệu đồng, thuế suất đầu vào là 5%. Giá sản phẩm bán ra là 70 triệu đồng, thuế suất là 10%.
PP1: T1 = (70 x 10%) – (50 x 5% ) = 7 – 2,5 = 4,5 triệu đồng
PP2: T2 = ((70 – 50) x 10% = 2 triệu đồng.
Rõ ràng doanh nghiệp tính theo PP2 lợi hơn doanh nghiệp tính theo PP1.
ở đây, thuế GTGT đã không đảm bảo đợc nguyên tắc: dù tính thuế GTGT theo phơng pháp nào thì các đối tợng có hoạt động kinh doanh giống nhau, áp dụng thuế suất giống nhau với mặt bằng giá nh nhau thì phải nộp thuế nh sau.
Hơn nữa, khi các doanh nghiệp thực hiện theo phơng pháp khấu trừ cung ứng HH-DV cho các doanh nghiệp thực hiện tính thuế theo phơng pháp trực tiếp thì những doanh nghiệp cung ứng này không đợc khấu trừ, trong khi trong giá trị hàng hoá đã có phần thuế GTGT nên lại làm nảy sinh hiện tợng thuế đánh chồng lên thuế. Ngợc lại, khi các doanh nghiệp thực hiện tính thuế theo phơng pháp trực tiếp có quan hệ giao dịch cung ứng HH-DV cho doanh nghiệp tính thuế theo phơng pháp khấu trừ thì HH-DV đó không đợc khấu trừ thuế GTGT, thực chất doanh nghiệp nhận phải trả phần thuế GTGT chìm trong giá bán mà doanh nghiệp trực tiếp đã nộp. Do vậy, hiện nay đang hình thành 2 xu hớng là một số đơn vị đang nộp thuế theo phơng pháp khấu trừ xin chuyển sang nộp thuế theo phơng pháp trực tiếp và ngợc lại tuỳ thuộc vào chiến lợc khách hàng của họ. Hơn nữa trong thực tế, tính thuế theo phơng pháp trực tiếp rất khó chính xác, vẫn chủ yếu tính theo phơng pháp khoán (đối với hộ nhỏ) nh thuế doanh thu trớc đây. Chính điều này đã gây không ít lúng túng khó khăn cho doanh
nghiệp Nhà nớc khi họ phải cạnh tranh trực tiếp với các hộ buôn bán theo phơng pháp trực tiếp.
Chúng ta biết rằng, sở dĩ có hai phơng pháp tính thuế nh hiện nay là xuất phát từ phạm vi của đối tợng nộp thuế GTGT. Qui định này xét ở một góc độ nào đó thì phù hợp với điều kiện thực tế của Việt Nam, song cha thực sự đảm bảo sự bình đẳng giữa các đối tợng nộp thuế GTGT. Việc các đối tợng nộp thuế theo phơng pháp khấu trừ đợc khấu trừ thuế GTGT đầu vào, còn những đối tợng nộp thuế theo phơng pháp trực tiếp thì không đợc khấu trừ thuế GTGT đầu vào đã dẫn đến nhiều hậu quả phái sinh tiêu cực trong quá trình thực hiện nghĩa vụ thuế GTGT.
Từ những phân tích trên, để tạo sự công bằng cho các đối tợng nộp
thuế cũng nh nâng cao hiệu quả của công tác thu và quản lý thuế GTGT, chỉ nên áp dụng một phơng pháp thống nhất là phơng pháp khấu trừ (PP1).