Luật thuế GTGT đợc Quốc hội khoá IX, kỳ họp thứ 11 thông qua ngày 10 tháng 5 năm 1997, đợc Chủ tịch nớc ký sắc lệnh công bố vào ngày 22 tháng 5 năm 1997 và có hiệu lực thi hành vào ngày 1 tháng 1 năm 1999. Công tác triển khai thực hiện thuế GTGT gồm những công tác sau:
- Cấp mã số thuế: Căn cứ vào quyết định số 75/1998/QĐ-TTg ngày 1 tháng 4 năm 1998 của Thủ tớng Chính phủ qui định các tổ chức, cá nhân thuộc mọi thành phần kinh tế phải kê khai, đăng ký thuế để đợc cấp mã số xác định đối tợng nộp thuế. Ngay từ tháng 7 năm 1998, cơ quan thuế đã tổ chức cho các cơ sở kê khai, đăng ký cấp mã số thuế. Cuối quí I năm1999, cơ quan thuế đã cấp mã số thuế cho 985.194 cơ sở, trong đó có 489.517 cơ sở kinh doanh đợc phép thành lập và có đăng ký kinh doanh, số còn lại cha có đăng ký kinh doanh những vẫn đợc cấp mã số thuế để quản lý thu thuế.
- Thực hiện chế độ hoá đơn chứng từ, sổ sách: Từ đầu tháng 12/1998, các cơ sở kinh doanh đã đợc mua hoá đơn mới để chuẩn bị cho việc thực hiện thuế GTGT. Gần 700 cơ sở kinh doanh đợc phép tự in hoá đơn đặc thù của mình.
- Tổ chức tập huấn, đào tạo, bồi dỡng cán bộ ngành thuế.
- Đổi mới qui trình thu thuế:
Trớc đây, theo qui trình thu thuế cũ: cán bộ chuyên quản của phòng quản lý thu nhận tờ khai của các đối tợng nộp thuế (từ ngày 5 đến ngày 10 hàng tháng), kiểm tra tờ khai sau đó gửi phòng kế hoạch. Phòng kế hoạch ra thông báo nộp thuế chuyển cho cán bộ chuyên quản phòng quản lý thu. Phòng quản lý thu có trách nhiệm thông báo cho đối tợng nộp thuế trớc ngày 15 hàng tháng. Định kỳ mỗi tháng một lần cán bộ chuyên quản xuống kiểm tra các đơn vị về tình hình kê khai và nộp thuế.
Nh vậy, trớc kia công tác quản lý thuế đợc thực hiện theo chế độ “chuyên quản”. Mỗi cán bộ thuế đợc phân công chuyên trách lâu dài một số cơ sở kinh doanh. Chế độ chuyên quản đã từng đợc đánh giá là công tác quản lý thờng xuyên, cán bộ thuế có thể nắm chắc đợc tình hình sản xuất kinh doanh của các cơ sở thuộc địa bàn mình phụ trách để đảm bảo việc thu thuế ngày càng đúng, đủ, chính xác đối với hoạt động sản xuất kinh doanh của từng cơ sở. Tuy nhiên trong cơ chế thị trờng, qui trình quản lý nh vậy đã bộc lộ nhiều nhợc điểm. Khi lập tờ khai thuế, thông thờng cán bộ trực tiếp quản lý thuế đến doanh nghiệp để tính, xác định số liệu và kê khai nộp thuế. Với cách làm đó cha làm rõ đợc trách nhiệm của doanh nghiệp về tính chính xác qua các tài liệu mà họ kê khai. Có một số trờng hợp cơ sở kinh doanh cho rằng cán bộ thuế đã nắm đợc tình hình nên họ không thực hiện đầy đủ các thủ tục kê khai hoặc kê khai không chính xác, gây nhiều khó khăn cho công tác tính và lập sổ thuế. Trong một số trờng hợp, vì có quan hệ cá nhân, cán bộ thuế giải quyết công việc không theo các nguyên tắc đã đợc qui định, không đảm bảo tính đúng đắn và công bằng. Vì thế, chế độ quản lý thuế
theo kiểu này đã phát sinh tiêu cực, gây thất thu thuế nghiêm trọng, tạo sự nghi ngờ về tính đúng đắn của chính sách thuế trong nhân dân.
Từ những tồn tại của qui trình quản lý cũ, trong cải cách thuế bớc 2, ngành thuế đã xây dựng qui trình quản lý thu thuế mới. Qui trình này gồm các bộ phận chính trực tiếp thực hiện việc thu của cơ quan thuế nh: phòng quản lý thu, phòng máy tính và phòng thanh tra xử lý. Qui trình quản lý thu thuế đợc thực hiện trình tự theo các bớc sau:
+ Đăng ký thuế và cấp mã số thuế + Xử lý tờ khai và chứng từ nộp thuế + Hoàn thuế
+ Miễn thuế, giảm thuế, tạm giảm thuế + Quyết toán thuế
+ Cỡng chế thuế
+ Quản lý hồ sơ doanh nghiệp
Điểm đặc biệt của qui trình mới là việc chuyển sự quản lý các công ty trách nhiệm hữu hạn, công ty t nhân từ chi cục lên cục thuế.
Qui trình quản lý thuế mới đã nâng cao tính tự giác thực hiện nghĩa vụ thuế theo pháp luật của tất cả các đối tợng nộp thuế thông qua việc thực hiện phơng pháp tự kiểm tra, tự tính thuế, tự khai và nộp thuế theo thông báo của cơ quan thuế. Cơ quan thuế thực hiện các chức năng hớng dẫn, giúp đỡ, quản lý kiểm tra và xử lý vi phạm theo đúng qui định; đồng thời thực hiện chức năng, quyền hạn của mình trong việc hành thu, xoá bỏ chế độ cán bộ thuế “chuyên quản”đối với đối tợng nộp thuế. Cán bộ thuế chỉ trực tiếp làm việc với doanh nghiệp khi có dấu hiệu gian lận thuế. Theo qui định mới, khi tiến hành kiểm tra thuế của doanh nghiệp, phải có từ hai cán bộ thuế trở lên. Việc cử cán bộ sẽ đợc cơ quan thuế chỉ định đảm bảo phù hợp về năng lực trình độ và kinh nghiệm đối với từng vụ việc; thờng xuyên thay đổi cán bộ kiểm tra đối với mỗi doanh nghiệp để đảm bảo tính khách quan, tránh việc cán bộ thuế bị mua chuộc và lợi dụng.
- Tăng cờng công tác thanh tra, kiểm tra thuế để kịp thời phát hiện những hành vi gian lận, trốn thuế của đối tợng nộp thuế và việc chấp hành các qui định về quản lý thu và tính thuế của các bộ phận quản lý thu.
Nhìn lại thời gian 18 tháng chuẩn bị, hớng dẫn áp dụng thuế GTGT, ta thấy nổi lên một số bất cập sau:
- Các tầng lớp nhân dân và các doanh nghiệp tức là cả ngời chịu thuế và ngời nộp thuế - những nhân vật chính của sắc thuế vẫn cha đợc chuẩn bị sẵn sàng để nhận thức và hiểu một cách rõ ràng về cơ chế vận hành của thuế GTGT. Các vấn đề lý thuyết không đợc giải thích một cách cặn kẽ; ví dụ nh: khác với thuế doanh thu đợc “thu chìm” trong giá trớc đây nên cả ngời bán và ng- ời mua đều không trực tiếp nhìn thấy mục thuế ghi trên hoá đơn bán hàng. Nay do có mục đó, lợi dụng điều này, nhiều ngời kinh doanh dễ dàng nâng giá bán mà không bị mang tiếng bởi “giá tăng do Nhà nớc tăng thuế chứ không phải do cửa hàng ”. Và ng… ời mua cũng cảm thấy đúng nh thế khi họ nhìn thấy trên hóa đơn ghi rõ ràng 2 yếu tố: giá gốc của HH-DV và số tiền thuế GTGT.
- Với 4 mức thuế suất là quá phức tạp và lạc hậu so với thế giới (xu hớng hiện nay là chỉ áp dụng 1 mức thuế suất duy nhất ngoài mức 0%), hơn nữa nhiều mức thuế suất dễ gây ra tình trạng nhập nhằng, tuỳ tiện khi thực hiện, tạo cơ hội trốn lậu thuế, tăng chi phí thanh tra, kiểm soát thuế.
- Công thức tính thuế dễ có sự hiểu lầm, dẫn đến vận dụng sai, gây tổn hại đến NSNN, tạo sự bất bình đẳng trong các doanh nghiệp. Thật ra, phơng pháp trực tiếp không phải là phơng pháp tính thuế và thu thuế trong thực tế. Đó chỉ là một cách tiếp cận khoa học trong nghiên cứu nhằm chỉ rõ đây là một loại thuế chỉ đánh vào phần giá trị tăng thêm mỗi khi có giá trị tăng thêm xuất hiện trong quá trình luân chuyển HH-DV. Việc phân định “giá trị tăng thêm ,” “giá trị đầu vào”, “giá trị đầu ra” xét dới góc độ tính thuế, hạch toán thuế mang ý nghĩa thực tế rất thấp.
- Các văn bản qui định chi tiết thi hành và hớng dẫn thực hiện thuế GTGT cha rõ ràng, chứa đựng nhiều điều bất hợp lý gây lúng túng cho cả ngời nộp thuế và cơ quan thuế khi áp dụng thuế GTGT.
- Đối với hàng hoá xuất khẩu chịu mức thuế suất 0%: cha nhấn mạnh đợc rằng khi áp dụng thuế suất này, các nhà xuất khẩu chẳng những không phải nộp thuế GTGT đối với HH-DV do họ nhập khẩu mà còn đợc hoàn lại số thuế GTGT đã nộp ở khâu trớc. Cha đề cập đến “dịch vụ xuất khẩu”.
- Cán bộ ngành thuế - trọng tài của cuộc chơi không đợc tập huấn về thuế GTGT kịp thời, đến khi chuẩn bị áp dụng thuế GTGT vẫn còn nhiều ngời trong ngành thuế cha nẵm vững các vấn đề lý thuyết và các vấn đề có tính chất nghiệp vụ cho việc áp dụng thuế GTGT.
Có thể kết luận rằng, công việc chuẩn bị triển khai thuế GTGT ở nớc ta là cha đợc chu đáo, điều này đã phần nào gây khó khăn cho thời gian đầu áp dụng thuế GTGT.