Chất hữu cơ có liên quan với thành phần hoá học đất. Chất hữu cơ đất là nguồn dinh dưỡng thực vật đáng kể, trong đất lúa ngay cả khi có bón phân thì có khoảng 50%- 80% N là từ chất hữu cơ trong đất. Tàn dư cây trồng có ý nghĩa lớn trong việc trả lại dinh dưỡng cho đất (Nguyễn Tử Siêm và ctv, 2000)
Mặt khác, phân bã bùn có hiệu quả rất cao đối với cây trồng cạn, đặc biệt là trên nền đất tương đối nghèo dinh dưỡng, nghèo chất hữu cơ (Dương Minh Viễn và ctv, 2005)
Chứa các dưỡng chất tại bề mặt của chúng dưới dạng trao đổi - Làm gia tăng khả năng trao đổi cation, vì vậy
-Làm giảm khả năng trực di các cation, điều này quan trọng trên các loại đất chứa sét
- Làm gia tăng khả năng đệm các chất dinh dưỡng, chủ yếu N, P, S. Vì vậy, làm gia tăng hiệu quả của phân hoá học.
Cung cấp chất dinh dưỡng và năng lượng - Cung cấp CO2 cho sự quang tổng hợp chất hữu cơ.
- Cung cấp chất dinh dưỡng khoáng, đặc biệt là chất đạm, lân, lưu huỳnh và các nguyên tố khác.
- Cung cấp các chất dinh dưỡng hữu cơ: đường, các amino acid. Sự phân huỷ chất mùn hay chất dinh dưỡng khoáng vô cơ:
- Trực tiếp qua sự tiết ra độ chua của vi sinh vật, giải phóng chất dinh dưỡng dự trữ.
- Gián tiếp bởi sự tấn công của acid được tạo thành trong sự phân huỷ chất mùn. Sự bón phân hữu cơ và các tác nhân hoạt động trong đất (Ngô Ngọc Hưng và ctv, 2004).