Để thực hiện tốt nhiệm vụ được giao, ngoài việc sửa đổi bổ sung các văn bản pháp luật xác định rõ hơn, đầy đủ hơn vị trí, vai trò, trách nhiệm của các cơ quan thanh tra trong công tác giải quyết khiếu nại, đổi mới tổ chức hoạt động thanh tra, thì việc nâng cao năng lực cho các cơ quan thanh tra để đủ khả năng hoàn thành đúng nhiệm vụ được giao là yêu cầu quan trọng.
Các cơ quan Thanh tra nhà nước phải sắp xếp, kiện toàn tổ chức theo quy định của Luật Thanh tra vừa được Quốc hội thông qua và có hiệu lực kể từ ngày 1/7/2011, Thanh tra Chính phủ phải sớm tham mưu cho Chính phủ ban hành các văn bản hướng dẫn thi hành và theo thẩm quyền ban hành các văn bản để tổ chức chỉ đạo hoạt động thanh tra.
Các cơ quan thanh tra bộ, ngành cơ quan thực hiện chức năng thanh tra sắp xếp, kiện toàn tổ chức, khắc phục tình trạng chồng chéo, trùng lắp hiện nay, theo nguyên tắc mỗi một ngành chỉ có một tổ chức thanh tra hoặc một đầu mối thanh tra đảm nhiệm hai chức năng thanh tra hành chính và thanh tra chuyên ngành. Nghiên cứu xây dựng những quy định trình cấp có thẩm quyền ban hành để hướng dẫn cụ thể về trình tự, thủ tục tiến hành thanh tra chuyên ngành trong các lĩnh vực thuộc phạm vi quản lý nhà nước của bộ, ngành.
Trong công tác giải quyết khiếu nại, cơ quan thanh tra tập trung vào việc giúp thủ trưởng cơ quan cùng cấp trong việc xác minh, kết luận, kiến nghị việc giải quyết khiếu nại; thực hiện tốt chức năng quản lý nhà nước về công tác giải quyết khiếu nại, trong đó đẩy mạnh thanh tra, kiểm tra việc chấp hành pháp luật trong giải quyết khiếu nại, thi hành quyết định giải quyết khiếu nại đã có hiệu lực pháp luật. Đẩy mạnh tuyên truyền, phổ biến, giáo dục pháp luật về khiếu nại, tố cáo; phát hiện những sơ hở trong cơ chế, chính sách pháp luật
làm nảy sinh khiếu nại. Đổi mới công tác lãnh đạo, chỉ đạo của thanh tra cấp trên đối với thanh tra cấp dưới trong giải quyết khiếu nại.
Bồi dưỡng đội ngũ cán bộ thanh tra viên có đủ năng lực, phẩm chất, trình độ làm nhiệm vụ giải quyết khiếu nại. Có chế độ chính sách bồi dưỡng thích hợp cho những người làm công tác tiếp dân giải quyết khiếu nại.
Trang bị máy móc, phương tiện làm việc cho các cơ quan thanh tra, ứng dụng công nghệ thông tin trong tiếp công dân, xử lý đơn thư khiếu nại, bảo đảm thông tin thông suốt trong hệ thống các cơ quan thanh tra nhà nước và trong các cơ quan hành chính để theo dõi kịp thời, đầy đủ, chính xác tình hình khiếu nại, giải quyết khiếu nại trong phạm vi toàn quốc.
Xử lý nghiêm minh những cán bộ thanh tra có vi phạm pháp luật, thiếu ý thức trách nhiệm trong công tác giải quyết khiếu nại.