II. CÁCH XÁC ĐỊNH TẦN SỐ HOÁN VỊ GEN
3. Ứng dụng nhận dạng kiểu gen củ aP khi biết tỷ lệ kiểu hìn hở đời con
*Ví dụ 1.
Cho các cây lúa F1 dị hợp hai cặp gen thân cao – hạt tròn lai với nhau được thế hệ lai gồm 59% cây cao – hạt tròn.
Giải: F1 dị hợp hai cặp gen quy định thân cao – hạt tròn suy ra thân cao – hạt tròn là hai tính trạng trội
A = cao a= thấp B = tròn b = dài
Ta có A-B- = 59% > 56.25% suy ra kiểu gen của F1 là
Tần số hoán vị gen f được xác định như sau:
Ta có A-B- = = 59% (ở đây ta xét f1=f2)
Có . Giải ra ta có f=0.4. Vậy tần số hoán vị gen là 40%
Trong trường hợp tần số hoán vị gen ở đực và cái F1 là không giống nhau thì ta xác định như thế nào?
Ta có
A-B- = = 0.59
+
+
+
+
Như vậy miền nghiệm của tần số hoán vị gen như sau và
Khi f1=f2 thì ta có g f = 0.4.
2.2 Xét trường hợp ba cặp gen dị hợp tử tức là bốn lớp tám kiểu hình
Ở đây chúng ta chỉ xét trường hợp F1 dị hợp tử ba cặp gen có trao đổi chéo kép với lai phân tích. Để dễ hình dung chúng ta xét một số bài toán cụ thể như sau
Bài toán 1. Xét 3 gen liên kết theo trật tự sau
A 30 B 20 D
Nếu một thể dị hợp tử cả 3 cặp gen được lai với thì tỷ lệ các kiểu hình theo lý thuyết
là bao nhiêu trong hai trường hợp có nhiễu và không có nhiễu? Giả sử tần số của các cá thể có trao đổi chéo kép là tích các tần số trao đổi đơn
Vì đây là phép lai phân tích nên tần số của các loại giao tử sẽ bằng tần số của các kiểu hình * Ta xét trường hợp không có nhiễu tức I = 0
Các lớp kiểu hình do trao đổi chéo kép là và . Vậy tần số trao đổi chéo kép là . Vì tái tổ hợp là tương hỗ nên là tần số của mỗi lớp và
và bằng 0.03.
- Tính tần số trao đổi chéo đơn giữa A và B
Ta có tần số trao đổi chéo giữa A và B là 0.3 tần số này bằng tổng tần số trao đổi chéo đơn và tần số trao đổi chéo kép, vì vậy
Tần số trao đổi chéo – tần số trao đổi chéo kép = tổng tần số của các trao đổi chéo đơn Vậy tần số trao đổi chéo đơn giữa A và B là
Tần số mỗi lớp và sẽ bằng 0.12
- Tính tần số trao đổi chéo đơn giữa B và D
tần số mỗi lớp và là 0.07
- Tính các cá thể tạo ra do liên kết gen hoàn toàn bằng cách lấy 1 trừ đi tất cả các cá thể có tái tổ hợp
Tần số mỗi lớp và sẽ là 0.28
* Trường hợp có nhiễu với I = 0.2
Trong một số trường hợp việc xẩy ra một trao đổi chéo sẽ ức chế hoặc khuếch đại một trao đổi chéo thứ hai bên cạnh. Hiện tượng này được gọi là nhiễu
(I – interference) và được tính I = 1 – CC
Để tính toán trước hết tần số trao đổi chéo kép theo lý thuyết phải được tính lại như sau: Vì I = 1 – CC do CC = 0.8
CC = (tần số trao đổi chéo kép thực tế)/(tần số trao đổi chéo kép lý thuyết)
Tức là 0.8 = (tần số trao đổi chéo kép thực tế)/(tần số trao đổi chéo kép lý thuyết) Suy ra - Tần số trao đổi chéo kép thực tế =
- Vì vậy tần số các lớp trao đổi chéo kép bằng 0.048 - Tần số trao đổi chéo đơn giữa A và B là
- Tần số trao đổi chéo đơn giữa B và D là
- Và tần số các lớp không do trao đổi chéo tạo thành là 0.548
Bài 2. Xét có thể có 3 cặp gen lặn liên kết với nhau: cùng nằm trên nhiễm sắc thể thứ hai
của ruồi giấm. Khoảng cách giữa 3 gen như sau
…a……….15cM…………b……….7cM…….d…
Nếu lai con cái với con đực . Cho CC = 0.6. Hãy tính tần số các lớp kiểu hình.
*Hd
Trước hết ta cần hiểu hệ số CC là gì?
Tần số trao đổi chéo kép theo lý thuyết được tính bằng tích của các tần số trao đổi chéo đơn. Tuy nhiên tần số trao đổi chéo kép thực tế (được tính bằng tổng số cá thể tạo thành từ trao đổi chéo kép so với tổng số cá thể nghiên cứu) có thể sai khác với tần số trao đổi chéo kép lý thuyết. Từ đó ta có khái niệm hệ số trùng lặp (CC – coefficient of coincidence)
Trao đổi chéo đơn giữa a và b đó là và ; và trao đổi chéo đơn giữa b và d là và . Trao đổi chéo kép là và . Vì a cách b 15cM và b cách d 7 cM nên tần số trao đổi
chéo kép lý thuyết là .
Vậy tần số trao đổi chéo kép thực tế là
Vì các lớp tương hỗ có tỷ lệ bằng nhau nên tần số mỗi lớp = =0.003
Tần số trao đổi chéo đơn giữa a và b là: => mỗi lớp
= = 0.072
Tần số trao đổi chéo đơn giữa b và d là: => mỗi lớp
= = 0.032
Tần số lớp không có tái tổ hợp còn lại là:
Mỗi lớp = là
Kết quả ta có ở thế hệ lai tỷ lệ
0.393 0.032
0.072 0.003
0.072 0.003