Việc cổ phần hoá NHTM Nhà nước cần được thực hiện theo các nguyên tắc:
Đảm bảo duy trì sự ổn định trong hoạt động Ngân hàng, không gây trở ngại cho hoạt động tiền tệ, tín dụng, thanh toán trong nền kinh tế. Do vai trò quan trọng và tính nhạy cảm của những hoạt động này, chúng có liên quan đến mọi hoạt động khác của nền kinh tế. Bất cứ sự thay đổi nào của chúng cũng có thể tác động lớn đến các ngành khác. Nếu quá trình cổ phần hoá NHTM Nhà nước gây ra bất cứ ảnh hưởng tiêu cực nào thì sẽ không có lợi cho nền kinh tế.
Cổ phần hoá NHTM nhà nước theo hướng đa sở hữu, trong thời gian trước mắt nhà nước vẫn nắm cổ phần chi phối. Trước hết việc này để đảm bảo vấn đề an ninh tài chính, tránh sự thôn tính của các nhà đầu tư nước khác nhất là nhà đầu tư nước ngoài khi chúng ta còn chưa có đủ kinh nghiệm quản lý
trong giai đoạn đầu của cổ phần hoá. Thứ hai, khi chưa triển khai được các giải pháp quản lý gián tiếp bằng chính sách tiền tệ, Nhà nước vẫn cần tiếp tục điều hành chúnh sách này thông qua hệ thống các NHTM Nhà nước cần được cổ phần hoá.
Thực hiện đồng thời cổ phần hoá và tổ chức lại các NHTM Nhà nước theo một đề án tổng thể. Hiện nay, các NHTM Nhà nước đều có mạng lưới các chi nhánh tại các địa phương, vùng lãnh thổ và các đơn vị thành viên hạch toán độc lập như Công ty chứng khoán, công ty liên doanh, công ty cho thuê tài chính… Vì vậy, để có thể đảm bảo các NHTM sau cổ phần hoá có cơ cấu tổ chức hợp lý trước khi các Ngân hàng, tổ chức tài chính nước ngoài được đối xử bình đẳng như các Ngân hàng trong nước cần đồng thời thực hiện cổ phần hoá toàn bộ hệ thống mạng lưới của từng NHTM.
Cổ phần hoá NHTM phải đạt được các mục tiêu đề ra. Các mục tiêu được đặt ra đối với cổ phần hoá NHTM nhà nước đều nhằm hướng tới kết quả thống nhất là khắc phục những hạn chế, nâng cao hiệu quả hoạt động của các ngân hàng. Cổ phần hoá được lựa chọn làm lối ra cho các NHTM nhà nước là bởi nó là mô hình tối ưu nhất trong việc thực hiện những mục tiêu đó. Bởi vậy, thực hiện cổ phần hoá NHTM nhà nước phảI đảm bảo nguyên tắc luôn hướng tới các mục tiêu đã được xác định.
Cơ cấu lại hệ thống NHTM Nhà nước phải gắn liền với việc sắp xếp lại và nâng cao hiệu quả kinh doanh của các doanh nghiệp trong nền kinh tế quốc dân. Yêu cầu này xuất phát từ đặc điểm của ngành Ngân hàng là có mối liên hệ mật thiết với các ngành khác. Các doanh nghiệp là những khách hàng lớn và chủ yếu của các Ngân hàng. Các doanh nghiệp hoạt động có hiệu quả, thì nguồn vốn cho vay của Ngân hàng mới có hiệu quả, do vậy hoạt động của ngành Ngân hàng mới hiệu quả. Nếu các doanh nghiệp làm ăn thua lỗ thì Ngân hàng sẽ không làm ăn hiệu quả được vì nguồn vốn cho vay ra có thể bị mất.