Nhìn chung, cơng tác tổ chức kế tốn chi phí sản xuất của các doanh nghiệp phù hợp với đặc điểm qui trình cơng nghệ, hỗ trợ cho quá trình kiểm sốt, tập hợp
chi phí để xác định giá thành sản phẩm. Việc bố trí nhân sự trong các khâu của quá trình hạch tốn khá hợp lý, cĩ sự phân cơng trách nhiệm rõ ràng.
Tuy nhiên, tồn bộ cơng tác kế tốn chi phí tập trung tại bộ phận kế tốn cơng ty, ở các cơng đoạn sản xuất các cơng ty bố trí nhân sự thống kê ghi chép những khoản mục phát sinh trong kỳ. Các nhân viên thống kê này chỉ thuần túy ghi chép theo các chứng từ phát sinh chứ khơng phát huy được vai trị hỗ trợ cho việc kiểm sốt chi phí.
Cĩù thể nĩi, hạn chế lớn nhất của một số cơng ty là chưa cĩ hệ thống tin học liên kết nội bộ giữa các Ban – Ngành – Xí nghiệp với nhau. Do đĩ, việc cập nhật số lượng hàng tồn kho để cân đối và xuất cho các đơn vị cịn gặp nhiều khĩ khăn mất nhiều thời gian. Chẳng hạn, cơng ty cổ phần Dệt may Thành cơng hiện chưa cĩ chương trình tính giá thành, nhân viên kế tốn chi phí và giá thành chỉ tập hợp từ file excel, foxPro, Visual Fox… các chương trình này rất cũ và hơi lỗi thời, cách nhập liệu của các đơn vị khơng đồng nhất. Kế tốn giá thành phải xử lý lại, nhập thủ cơng nối File các đơn vị, đổi qua phần mền Fox để chạy chương trình giá thành. Vì thế mất khá nhiều thời gian ảnh hưởng đến thời hạn báo cáo của cơng ty.
Phần lớn các doanh nghiệp chưa nhận thức đúng tầm quan trọng của thơng tin kế tốn quản trị hoặc cĩ sự ngộ nhận kế tốn quản trị và kế tốn tài chính. Chính vì thế, cơng tác kế tốn quản trị được kiêm nhiệm bởi một nhân viên kế tốn và chưa thực sự thực hiện đúng chức năng của kế tốn quản trị.