promoter gen CAD tách dòng được từ bạch đàn nâu Eucalyptus urophylla S.T Blake
Sau khi có được trình tự của đoạn DNA chúng tôi đã tiến hành so sánh trình tự này với trình tự gen CAD của cây bạch đàn gunnii kết quả được thể hiện trên hình 3.13:
Hình 3.13: Kết quả so sánh trình tự DNA với gen CAD của E. gunnii
Từ kết quả so sánh cho thấy đoạn trình tự promoter thu được nằm trùng với vị trí của promoter của gen CAD của cây bạch đàn gunnii ở vị trí từ [- 2143] đến [- 382] bp, điều này cho phép bước đầu kết luận đây chính là promoter của gen CAD của cây bạch đàn urô. Và để khẳng định điều này chúng tôi tiến hành phân tích trình tự DNA thu được nhằm tìm ra các trình tự
(motif) tham gia vào quá trình điều hòa hoạt động của gen ở các điều kiện và giai đoạn phát triển nhất định của cây. Từ các công bố trước đây các nhà khoa học đã phát hiện được các trình tự đặc trưng của promoter tham gia vào quá trình điều hòa sinh tổng hợp lignin ở thực vật như các trình tự Myb hay Zinc
finger [16]. Để thực hiện được công việc này chúng tôi đã sử dụng cơ sở dữ
liệu phân tích chuyên dụng PLACE (Plant Cis-acting Regulatory DNA Elements) (Higo và cộng sự, 1999). Kết quả phân tích thể hiện ở hình 3.14:
Từ kết quả phân tích này, có thể nhận thấy rằng promoter của gen CAD tách dòng được từ cây bạch đàn nâu Eucalyptus urophylla S.T Blake có mang đầy đủ các trình tự đặc trưng của một promoter điển hình như CAATBOX, GATABOX, TATABOX. Đặc biệt trong đó chúng tôi phát hiện được các trình tự có vai trò điều hòa hoạt động của các gen ở tầng xylem và các gen tham gia vào quá trình sinh tổng hợp lignin như đã được công bố bởi các nhà khoa học khác như MYB1AT, MYBPLANT [16]. Những phân tích tin sinh học trên đây là cơ sở lý thuyết rất tốt cho các nghiên cứu tiếp theo nhằm thiết kế vector chuyển gen có mang đoạn promoter mà chúng tôi đã tách dòng thành công trong nghiên cứu này với mục đích cuối cùng là điều khiển quá trình sinh tổng hợp lignin ở các đối tượng cây rừng quan tâm.