Do không được quản lý chặt chẽ nên giá chứng khoán trên thị trường tự do thường biến động lớn, người mua và người bán dễ bị tác bị tác động tâm lý, thường mua bán theo phong trào, không thuận lợi mua bán cho các nhà đầu tư nói chung. Thị trường tự do hiện nay là một trong những yếu tố bất cập của hệ thống TTCK Việt Nam, nhưng không phải ở bản thân hoạt động thị trường mà trên phương diện chưa được quản lý hữu hiệu để phát huy những mặt tích cực và hạn chế những mặt tiêu cực của thị trường. Tuy thị trường có vai trò và vị trí nhất định trong giai đoạn hiện nay, đáp ứng phần lớn nhu cầu phát hành và giao dịch chứng khoán cho các công ty và các nhà đầu tư, nhưng thực tế thị trường đã bộc lộ những mặt tiêu cực như sau:
¾ TTCK tự do không đảm bảo tính công bằng, minh bạch và đảm bảo quyền lợi cho những người tham gia thị trường. Những nhà hoạt động kinh doanh trên thị trường hoạt động trong điều kiện không công bằng, trốn thuế…, gây thiệt hại và ảnh hưởng đến hoạt động của thị trường chính thức.
¾ Xét về tổng thể, vĩ mô, TTCK tự do không đảm bảo sự phát triển hài hòa, đồng bộ, phù hợp với các lĩnh vực và các mục tiêu kinh tế - xã hội khác khi nằm ngoài quỹ đạo quản lý và định hướng phát triển chung của Nhà nước.
¾ Hoạt động của thị trường tự do hiện tại và về lâu dài sẽ ảnh hưởng đến thị trường chính thức, gây bất bình đẳng trong việc mua bán cổ phiếu của các nhà đầu tư tham gia TTCK, hệ quả tất yếu là không đảm bảo sự phát triển lành mạnh, ổn định của tổng thể hệ thống TTCK nói chung.
Những mặt trái của TTCK tự do nếu không được kiềm chế và ngăn chặn không những gây ra những rủi ro đối với chính thị trường này mà còn lây lan đối
với toàn bộ hệ thống thị trường tài chính nói chung và gây hậu quả tiêu cực không lường cho nền kinh tế - xã hội, đặc biệt là đối với một thị trường nhạy cảm và mang tính dây chuyền lớn như TTCK.