Cùng với quá trình phát triển của công ty, bộ máy kế toán được kiện toàn cả về số lượng, cơ cấu tổ chức và hoạt động nhằm đáp ứng nhu cầu quản lý. Hình thức tổ chức bộ máy theo kiểu tập trung tạo thuận lợi cho các nhân viên kế toán phối hợp công việc và tổng hợp số liệu nhanh chóng, kịp thời, đồng thời kế toán trưởng dễ dàng quản lý mọi mặt hoạt động của các nhân viên.
Công việc của phòng được phân chia cho các kế toán viên, mỗi kế toán đảm nhận một hoặc một số phần hành nhất định đảm bảo tính chuyên môn hoá trong công việc. Đội ngũ lao động kế toán của công ty có trình độ chuyên môn bậc cao đẳng, đại học, nắm vững công việc và thường xuyên cập nhật các quy định kế toán mới. Đó là những người trẻ tuổi, năng động, sáng tạo, nhiệt tình học hỏi và giúp đỡ nhau trong công việc, có khả năng sử dụng thành thạo các phần mềm vi tính văn phòng và phần mền kế toán, đảm bảo hoàn thành nhanh chóng và hiệu quả các nhiệm vụ được giao.
Công ty đã tuân thủ các quy định kế toán hiện hành và vận dụng linh hoạt vào điều kiện cụ thể của mình. Các chứng từ kế toán được sử dụng phù hợp với nội dung các nghiệp vụ kinh tế phát sinh, đảm bảo tính pháp lý cho việc ghi sổ kế toán. Trách nhiệm lập và ký duyệt chứng từ được quy định rõ ràng, cụ thể, quá trình lập
và luân chuyển chứng từ được giám sát chặt chẽ. Chứng từ sau khi sử dụng được bảo quản, lưu giữ tại phòng kế toán.
Phù hợp với các chứng từ kế toán là hệ thống tài khoản với các tài khoản mẹ và tài khoản con đầy đủ được thiết kế, mã hoá theo đặc điểm riêng của từng đối tượng phản ánh, tạo thuận lợi cho việc cập nhật các chứng từ này vào phần mềm kế toán và các sổ kế toán chi tiết, tổng hợp. Việc sớm áp dụng các phần mềm vi tính văn phòng, nhất là phần mềm kế toán effect và trang bị cho mỗi nhân viên kế toán một máy tính đã giảm nhẹ đáng kể lao động kế toán đồng thời nâng cao chất lượng thông tin.
Hình thức sổ kế toán Chứng từ ghi sổ phù hợp với quy mô hoạt động không quá lớn và phức tạp của công ty. Hệ thống báo cáo phong phú, bao gồm các báo cáo tài chính bắt buộc và các báo cáo quản trị cung cấp thông tin đa dạng về các mặt hoạt động của công ty cho quản lý.
Bên cạnh những mặt đạt được, tổ chức hạch toán kế toán của công ty vẫn còn tồn tại một số vấn đề.
Phòng kế toán chịu trách nhiệm trong lĩnh vực kế toán- tài chính nhưng chủ yếu chỉ thực hiện chức năng kế toán, việc đóng góp các ý kiến nhằm nâng cao hiệu quả hoạt động tài chính của công ty còn hạn chế, chủ yếu chỉ được thực hiện duy nhất bởi kế toán trưởng. Các báo cáo quản trị của các kế toán phần hành chủ yếu mang tính chất báo cáo, kiểm tra mà không có tác dụng trong việc xây dựng kế hoạch kinh doanh.
Về cơ cấu tổ chức, do số lượng kế toán còn ít nên có nhiều điểm chưa hợp lý liên quan đến phân công nhiệm vụ trong phòng như: Nguyên vật liệu và công cụ dụng cụ chiếm một phần lớn trong tổng tài sản của công ty nhưng kế toán phần hành này còn phải đảm nhiệm việc theo dõi TSCĐ; Kế toán tiền mặt, tiền gửi ngân hàng kiêm thủ quỹ, dẫn đến vi phạm nguyên tắc bất kiêm nhiệm, có thể ảnh hưởng đến chất lượng hệ thống thông tin kế toán. Hiện tại công ty đang có một nhân viên tập sự nên trong thời gian tới nên phân công lại nhiệm vụ cho phù hợp hơn, nhất là trong điều kiện quy mô công ty đang ngày càng mở rộng.
Chứng từ phát sinh không được cập nhật ngay mà thông thường phải chờ đến 3 ngày hoặc một tuần khi chúng được tập hợp và chuyển từ nhà máy lên, phòng kế
toán mới thực hiện vào sổ. Điều này có thể được khắc phục bởi phương pháp ghi sổ chứng từ ghi sổ, tuy nhiên công ty lập một chứng từ ghi sổ tương ứng với một chứng từ gốc làm mất tác dụng của phương pháp này. Trong thời gian tới, công ty nên xây dựng các quy định liên quan đến lập chứng từ ghi sổ dựa trên tiêu chí về thời gian hoặc số lượng nghiệp vụ kinh tế phát sinh.
Thêm vào đó, phần mềm kế toán không xác định quyền cập nhật phần mềm cho từng phần hành dẫn đến hiện tượng nghẽn mạng khi tất cả các thành viên cùng cập nhật. Công ty nên tiến hành phân quyền cho các kế toán viên để tránh tình trạng này xảy ra.