Bên cạnh những thành tựu đáng kể trong việc tổ chức sản xuất kinh doanh cũng như trong công tác quản lý, đặc biệt là trong lĩnh vực kế toán thì hệ thống kế toán nói chung và kế toán CPSX, tính giá thành nói riêng vẫn còn một số những hạn chế cần được quan tâm xem xét.
3.1.2.1. Về chứng từ và luân chuyển chứng từ
Do là một công ty xây lắp nên địa bàn hoạt động sản xuất kinh doanh khá rộng, phân tán khắp trong phạm vi cả nước. Chính vì điều đó làm việc luân chuyển chứng từ từ các đơn vị, tổ đội xây lắp thường nộp về phòng kế toán không đúng thời gian quy định gây trở ngại cho việc tập hợp chi phí phát sinh của từng tháng, đôi khi chứng từ dồn tích lại gây quá tải trong công tác kế toán
3.1.2.2. Kế toán chi phí sản xuất
˗ Kế toán chi phí nguyên vật liệu
Chi phí NVL có xu hướng phát sinh tăng chủ yếu do biến động của giá cả thị trường. Do đó, việc quản lý, kiểm soát vật tư là rất quan trọng. Nhưng nơi cất giữ vật tư thường xuyên thay đổi, đa số là được tập kết ở ngoài công trường nên khó bảo vệ, việc giao nhận vật tư chưa được cân đo, đong đếm kỹ lưỡng dẫn đến thất thoát vật tư
Cuối kỳ kế toán, vật liệu xuất kho không sử dụng hết Công ty không tiến hành kiểm kê để nhập lại kho. Do đó, chi phí NVL trong kỳ kế toán hiện tại tăng nhưng kỳ kế toán sau lại giảm mặc dù tổng chi phí vật liệu cho công trình, HMCT là không đổi. Điều này làm chi phí phát sinh trong kỳ không được hạch toán chính xác
˗ Kế toán chi phí sử dụng máy thi công
Hiện nay, trong cùng một thời gian máy thi công được sử dụng để phục vụ nhiều công trình khác nhau dẫn đến việc hạch toán chi phí khấu hao MTC vào toàn bộ công trình: Xây mới KTX nhà D7- Đại học Hà Nội là chưa hợp lý
˗ Kế toán chi phí sản xuất chung
Đối với công trình KTX nhà D7- Đại học Hà Nội, Công ty chưa tiến hành trích trước các khoản chi phí sửa chữa lớn TSCĐ phục vụ máy thi công trong kế hoạch và chi phí bảo hành công trình.
3.1.2.3. Hạch toán các khoản thiệt hại trong sản xuất
Tổ chức sản xuất của ngành xây lắp nói chung và tại Công ty CP Đầu tư và Xây lắp Thành An 665 nói riêng thường chịu ảnh hưởng rất nhiều của điều kiện tự nhiên. Do vậy, các khoản thiệt hại sản xuất tất yếu sẽ phát sinh. Ví dụ, khi trời mưa công nhân phải nghỉ việc nhưng Công ty vẫn phải trả lương cho họ, vẫn phải khấu hao TSCĐ, phải bảo dưỡng,… Đó là những thiệt hại khách quan.
Bên cạnh đó, trong quá trình sản xuất, do khối lượng công việc lớn và đòi hỏi về kỹ thuật cao nên còn xảy ra những thiệt hại mang tính chủ quan. Cụ thể, đối với những hạng mục không đạt yêu cầu phải phá đi làm lại. Những thiệt hại kể trên làm lãng phí cả về chi phí lao động sống và lao động vật hóa. Điều này làm ảnh hưởng không nhỏ đến kết quả hoạt động sản xuất của Công ty. Tuy vậy, các khoản mục này không được theo dõi và phản ánh đầy đủ. Nói cách khác, chi phí về vật liệu và nhân công cho các khoản thiệt hại trong sản xuất vẫn được tính vào giá thành công trình. Cách giải quyết này không thỏa đáng và không có vai trò nâng cao trách nhiệm của người lao động