Kiểm toán khoản mục thuế thường được thực hiện với vai trò là một bộ phận không thể tách rời của kiểm toán Báo cáo tài chính. Để đảm bảo tính hiệu quả, tính kinh tế cũng như tính hiệu lực của từng cuộc kiểm toán cũng như để thu thập bằng chứng kiểm toán đầy đủ có giá trị làm căn cứ cho kết luận của kiểm toán viên về tính trung thực và hợp lý cảu số liệu trên Báo cáo tài chính, một cuộc kiểm toán Báo cáo tài chính thường được tiến hành theo quy trình gồm ba giai đoạn như sau:
Sơ đồ 1.8: Quy trình kiểm toán Báo cáo tài chính Giai đoạn I
Lập kế hoach và thiết kế phương pháp kiểm toán
Giai đoạn II
Thực hiện kế hoạch kiểm toán
Giai đoạn III
Trong đó, giai đoạn lập kế hoạch và thiết kế phương pháp kiểm toán gồm các bước sau:
Sơ đồ 1.9: Lập kế hoạch và thiết kế phương pháp kiểm toán:
Do kiểm toán khoản mục thuế là một bộ phận của kiểm toán Báo cáo tài chính nên trong mỗi giai đoạn của quy trình một cuộc kiểm toán Báo cáo tài chính đều có các công việc liên quan đến kiểm toán khoản mục thuế. Cụ thể như sau:
Sơ đồ 1.10: Quy trình kiểm toán thuế trong kiểm toán BCTC: Chuẩn bị cho kế hoạch kiểm toán
Thu thập thông tin cơ sở
Thu thập thông tin về nghĩa vụ pháp lý của khách hàng và thực hiện các thủ tục phân tích Đánh giá tính trọng yếu, rủi ro kiểm toán Tìm hiểu hệ thống kiểm soát nội bộ và đánh giá rủi
ro kiểm soát
Lập kế hoạch kiểm toán toàn diện và soạn thảo chương trình kiểm toán