Lý luận hiện đại về quản lý đã chỉ ra "kiểm tra là một chức năng quản lý cơ bản ở mọi cấp". Chức năng quản lý của công việc thanh tra kiếm tra nội bộ là đo lường và chấn chỉnh việc thực hiện đế đảm bảo rằng mục tiêu của quản lý thuế đang được hoàn thành.
Công tác thanh tra kiểm tra nội bộ tại cơ quan thuế cần chú trọng đến các nội dung cơ bản: Hệ thống kiếm tra và quá trình kiếm tra
+ Hệ thống kiểm tra nội bộ: Ngay từ khi bắt đầu triển khai mô hình quản lý "tách 3 bộ phận" giai đoạn quản lý thu thuế lợi tức, Cục Thuế tỉnh Tuyên Quang đã quan tâm đến việc kiểm tra chéo lẫn nhau giữa các bộ phận chức năng trong quy trình quản lý. Tuy nhiên, từ ý đồ đến hiệu quả thực tế còn có khoảng cách quá xa.
Để nâng cao hiệu quả kiểm tra nội bộ, trong thời gian tới cần quan tâm hoàn thiện hệ thống kiếm tra nội bộ theo hai nội dung:
- Kiểm tra có tính chất trực tuyến (cấp trên kiểm tra cấp dưới).
- Kiếm tra giữa các bộ phận ngang cấp (kiếm tra chéo).
Đen nay, Cục Thuế tỉnh Tuyên Quang mới tập trung nhiều hơn vào hệ thống kiểm tra "trực tuyến" hơn là kiếm tra chéo giữa các bộ phận. Việc hoàn thiện hệ thống kiếm tra nội bộ nên bắt đầu tù’ việc hoàn thiện cơ chế phối hợp hoạt động giữa các bộ phận chức năng. Cơ chế phối hợp đó phải bao hàm cả nội dung "kiểm tra chéo" lẫn nhau.
+ Quá trình kiếm tra nội bộ:
về cơ bản quá trình kiếm tra gồm có các bước: (1) xây dựng các tiêu chuẩn (2)
Việc tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra nội bộ tại Cục Thuế tỉnh Tuyên Quang cần đảm bảo các yêu cầu dưới đây:
- Việc thanh tra, kiếm tra cần khách quan.
- Việc thanh tra, kiếm tra cần linh hoạt.
- Việc thanh tra, kiểm tra cần phải tiết kiệm.
- Việc thanh tra, kiểm tra cần phải dẫn đến tác động điều chỉnh.
Thực hiện tốt công tác kiểm tra nội bộ sẽ có căn cứ rõ hơn đế đánh giá phân loại chất lượng cán bộ công chức. Qua đó có kế hoạch đào tạo, bồi dưỡng sắp xếp phân công, bố nhiệm theo đúng khả năng và trình độ đáp ứng với yêu cầu về quản lý thuế trong tình hình mới.