4. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.4.5. Phân tắch gen CP
Protein CP của potyvirus là một trong các gen ựã ựược nghiên cứu rất kỹ. Protein CP có thể ựược chia làm 3 phần (ựầu N, trung tâm và ựầu C). đầu N là phần nhô lên bề mặt phân tử, khá biến ựộng về trình tự và chứa các epitope ựặc hiệu cho virus ở mức loài và mức chủng. CP là một protein cấu trúc và ựa chức năng. Một trong các chức năng quan trọng là qui ựịnh khả năng lan truyềncủa potyvirus qua vector. đầu N của CP chứa 1 motif bảo thủ cao gồm 3 amino acid là DAG. Thông qua motif này, phân tử virus sẽ liên kết với protein HC-Pro theo lý thuyết bắc cầu ựể lan truyền qua vector rệp muộị
Vì 2 virus trong nghiên cứu này ựược phân lập từ cây hoa vốn trồng bằng nhân giống vô tắnh qua thân giả nên chúng tôi kiểm tra trình tự protein CP của chúng ựể xem liệu việc lan truyền liên tục theo chiều dọc qua các thế hệ có ảnh hưởng tới khả năng truyền qua vector thông qua sự có mặt hay thiếu của motif DAG.
Kết quả kiểm tra (Hình 4.13) cho thấy mẫu virus dòng LKđ-1-3 hoàn toàn thiếu motif DAG ở ựầu N của protein CP. Kiểm tra các isolate Vallota speciosa virus trên ngân hàng gen cũng cho kết quả tương tự. Kết quả này gợi ý có lẽ virus này ựã có mặt trên cây họ loa kèn ựỏ từ rất lâu tới mức ựã mất khả năng truyền qua vector.
Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ 57
Trái lại, ựầu N của protein CP của 2 mẫu HiMV của Việt Nam (và các isolate trên ngân hàng gen) vẫn có motif DAG chứng tỏ chúng có thể lan truyền qua vector. Khả năng này dẫn tới virus có thể phát tán và thắch ứng trên các loài cây khác.