a) Thuận lợi
Với vị trí thuận lợi là đầu mối giao thông đến các vùng, miền ở khu vực kinh tế Trung Bộ, Tây Nguyên và cả nước. Do đó có nhiều thuận lợi phát huy lợi thế, mở rộng giao lưu kinh tế, văn hóa với các tỉnh thành trong nước và hội nhập quốc tế. Là trung tâm chính trị, kinh tế, văn hóa, khoa học kỹ thuật, y tế, giáo dục của tỉnh nên được tập trung các nguồn lực để đầu tư kết cấu hạ tầng kinh tế xã hội, đồng thời cũng là nơi tập trung được nguồn lực con người để phát triển kinh tế xã hội và ứng dụng các tiến bộ khoa học kỹ thuật. Các điều kiện thuận lợi để phát triển đô thị như về mặt đất đai, xung quanh thành phố là vùng nông thôn thuộc các huyện lân cận, đây có thể coi như là nguồn đất dự trữ để phát triển đô thị trong tương lai hoặc là vành đai xanh cho đô thị, các điều kiện khác như nguồn nước, tài nguyên thiên nhiên rừng, biển khá dồi dào, đa dạng, thuận lợi cho phát triển về kinh tế, xã hội. Cảnh quan tươi đẹp thuận lợi cho phát triển du lịch dịch vụ.
b) Khó khăn
Do địa hình đa dạng, thành phố có những khu vực cao, thấp khác nhau nên hay xảy ra tình trạng ngập úng cục bộ trong các mùa mưa, lũ gây khó khăn cho sinh hoạt hàng ngày của người dân. Đặc điểm về khí hậu, mùa mưa thì mưa quá nhiều gây tình trạng ngập úng, có khi lũ lụt ảnh hưởng rất lớn đến đời sống của nhân dân, có khi dẫn đến thiệt hại người và của; mùa khô với gió Tây Nam khô và nóng cũng gây những ảnh hưởng đến cuộc sống hàng ngày, gây khó khăn trong sinh hoạt cho người dân. Với vị trí tiếp giáp biển và sông nên thành phố Tuy Hòa chịu ảnh hưởng nhiều bởi các thiên tai, lũ lụt vào mùa mưa như xói lở bờ biển, xói lở cửa sông, biến đổi khí hậu, tích tụ ô nhiễm môi trường nên có ảnh hưởng nghiêm trọng đến tính mạng, nhà cửa, tài sản và các hoạt động phát triển kinh tế, dịch vụ...