Các quy định về tổ chức bộ máy nhà nước trong Hiến pháp 1946 thể hiện tư tưởng phân quyền tương đối rõ. Có lẽ những người soạn thảo Hiến pháp này mà lãnh đạo là Bác Hồ đã thấm nhuần tư tưởng phân quyền thông qua việc tham khảo các bản Hiến pháp của loài người lúc đó. Theo Hiến pháp này, các chức năng lập pháp, hành pháp và tư pháp do ba cơ quan là Nghị viện nhân dân, Chính phủ và Tòa án thực hiện. Nghị viện nhân dân là cơ quan có quyền cao nhất của nước Việt Nam Dân chủ Cộng hòa (Điều 22), đại diện cho toàn dân do công dân trực tiếp bầu ra với nhiệm kỳ 3 năm. Thẩm quyền của Nghị viện gồm: lập pháp, biểu quyết ngân sách, quyết định các vấn đề quan trọng của đất nước, chuẩn y các hiệp ước mà Chính phủ ký với nước ngoài; bầu Chủ tịch nước, quyết định vấn đề tuyên chiến và có thể
tuyên bố tự giải tán; xem xét việc bãi miễn một nghị viên; phê chuẩn việc chọn Thủ tướng của Chủ tịch nước, việc lựa chọn các Bộ trưởng của Thủ tướng (cả Thủ tướng và Bộ trưởng đều phải là nghị viên). Nghị viện có quyền kiểm soát, phê bình Chính phủ và có quyền yêu cầu sửa đổi Hiến pháp.
Nói chung các quy định về cách thức tổ chức, về nhiệm vụ và quyền hạn của Nghị viện trong Hiến pháp 1946 rất ngắn gọn, song đã thể hiện một số nét cơ bản giống với Nghị viện của các nước trên thế giới như: hình thành bằng con đường bầu cử trực tiếp với nhiệm kỳ nhất định; có cơ cấu đại diện cho các đảng phái chính trị khác nhau; là cơ quan đại diện cao nhất của nhân dân, cơ quan có quyền lập pháp (mà thuật ngữ tương đương trong Hiến pháp là làm pháp luật), có quyền yêu cầu sửa đổi Hiến pháp, tổ chức ra Chính phủ, phê chuẩn hoạt động, bỏ phiếu tín nhiệm và kiểm soát Chính phủ.
Chính phủ là cơ quan hành chính cao nhất của toàn quốc (chữ hành chính ở đây được hiểu một cách tương đương như hành pháp ngày nay). Cơ cấu của Chính phủ gồm có Chủ tịch nước, Phó Chủ tịch nước và Nội các. Nội các có Thủ tướng, các Bộ trưởng, Thứ trưởng, có thể có Phó Thủ tướng.
Chủ tịch nước là người của Nghị viện do Nghị viện bầu ra với nhiệm kỳ 5 năm và phải được 2/3 tổng số nghị viên bỏ phiếu thuận, nếu bỏ phiếu lần đầu mà không đủ số phiếu ấy thì lần thứ hai sẽ theo đa số tương đối. Chủ tịch nước có các quyền hạn và nhiệm vụ như: chọn Thủ tướng trong Nghị viện để đưa ra Nghị viện biểu quyết; thay mặt cho Nhà nước trong các mối quan hệ đối nội và đối ngoại; tổng chỉ huy quân đội, chỉ định hoặc cách chức các tướng soái trong lục quân, không quân, hải quân; ký sắc lệnh bổ nhiệm Thủ tướng, nhân viên Nội các và nhân viên các cấp thuộc các Cơ quan Chính phủ; chủ tọa Hội đồng Chính phủ. Chủ tịch nước phải ban bố các đạo luật mà Nghị viện đã quyết nghị chậm nhất là 10 ngày sau khi nhận được thông tri. Nhưng trong thời gian ấy, Chủ tịch nước có quyền yêu cầu Nghị viện thảo luận lại, và nếu sau khi thảo luận lại, nếu Nghị viện vẫn ưng chuẩn thì Chủ tịch nước phải ban bố. Chủ tịch nước được hưởng đặc quyền là không phải chịu một trách nhiệm nào trừ khi phạm tội phản quốc. Mỗi khi truy tố Chủ tịch
nước, Phó Chủ tịch nước, hay một nhân viên Nội các về tội phản quốc, Nghị viện sẽ lập một Tòa án đặc biệt để xét xử. Việc bắt bớ và truy tố trước tòa án một nhân viên Nội các về thường tội phải có sự ưng thuận của Hội đồng Chính phủ.
Như vậy, Chủ tịch nước vừa đứng đầu quốc gia, vừa trực tiếp chỉ đạo các hoạt động của Chính phủ. Chức năng nguyên thủ quốc gia nhập lại với chức năng hành pháp và Chủ tịch nước là người thực sự nắm quyền hành pháp. Vị trí, vai trò của Chủ tịch nước ta lúc đó có nhiều nét tương tự như của Tổng thống trong các nước Cộng hòa Hỗn hợp.
Ngoài các quyền hạn của Chủ tịch nước, Chính phủ còn có các quyền hạn tương tự như cơ quan hành pháp ở các nước đã xem xét, đó là thi hành các luật và quyết nghị của Nghị viện; đề nghị các dự luật trước Nghị viện và dự án sắc luật trước Ban Thường vụ. Trong lúc Nghị viện không họp mà gặp trường hợp đặc biệt thì Chính phủ có quyền bãi bỏ mệnh lệnh và nghị quyết của cơ quan cấp dưới nếu cần; bổ nhiệm hoặc cách chức các nhân viên trong các cơ quan hành chính hoặc chuyên môn; thi hành luật động viên và mọi phương sách cần thiết để giữ gìn đất nước; lập dự án ngân sách hàng năm.
Giống với một số nước khác, mỗi sắc lệnh của Chính phủ thì bên cạnh chữ ký của Chủ tịch nước phải có chữ ký "phó thự" của một Bộ trưởng và chính người tiếp ký ấy mới phải chịu trách nhiệm trước Nghị viện về hậu quả pháp lý của văn bản đó. Bộ trưởng chỉ chịu trách nhiệm cá nhân mà không chịu trách nhiệm liên đới trước Nghị viện nên chỉ Bộ trưởng nào không được Nghị viện tín nhiệm thì mới phải từ chức và Nội các không phải từ chức tập thể trong trường hợp Bộ trưởng bị mất tín nhiệm. Thủ tướng là người đứng đầu, điều hành Chính phủ và chịu trách nhiệm trước Nghị viện về mọi hoạt động của nó. Thủ tướng và Nội các có thể bị đặt vấn đề tín nhiệm trước Nghị viện khi Ban Thường vụ hoặc 1/4 tổng số nghị viên đặt vấn đề ấy. Trong vòng 24 giờ sau khi Nghị viện biểu quyết không tín nhiệm Nội các thì Chủ tịch nước có quyền đưa vấn đề đó ra thảo luận lại. Sau cuộc biểu quyết lần hai mà vẫn bị mất tín nhiệm thì Nội các phải từ chức. Các Bộ trưởng phải trả lời chất vấn của Nghị viện hoặc Ban Thường vụ.
Quyền lực tư pháp thuộc về hệ thống tòa án bao gồm Tòa án tối cao, các tòa án phúc thẩm, đệ nhị cấp và sơ cấp. Thẩm phán do Chính phủ bổ nhiệm và khi xét xử, thẩm phán chỉ tuân theo pháp luật, các cơ quan khác không được can thiệp. Bằng quy định này, Hiến pháp đã tạo ra sự độc lập khá cao cho Tòa án – một đặc tính cần có của tư pháp và là một trong những điểm mạnh của tư tưởng phân quyền.
Tóm lại, việc quy định chức năng, thẩm quyền và quan hệ giữa các cơ quan lập pháp, hành pháp và tư pháp trong Hiến pháp 1946 có nhiều nét tương tự như ở chính thể Đại nghị và Hỗn hợp. Lập pháp và hành pháp không hoàn toàn độc lập mà có quan hệ chặt chẽ, sự tiếp xúc thường xuyên với nhau vì có sự chung nhân viên giữa chúng, hành pháp có quyền trình dự luật và tham gia vào quá trình lập pháp. Lập pháp tham gia thành lập cơ quan hành pháp và phối hợp với nó qua việc bầu Chủ tịch nước, phê chuẩn sự lựa chọn Thủ tướng của Chủ tịch nước và sự lựa chọn Bộ trưởng của Thủ tướng. Nguyên thủ quốc gia trực tiếp nắm quyền hành pháp và được quyền "vô trách nhiệm". Lập pháp có thể giám sát, chi phối và kiềm chế hành pháp bằng các hình thức: biểu quyết các dự luật, sắc luật và ngân sách do Chính phủ đệ trình, chuẩn y các hiệp ước mà Chính phủ ký với nước ngoài, chất vấn các thành viên của Chính phủ, truy tố và xét xử Chủ tịch nước, Phó Chủ tịch nước hay một nhân viên Nội các khi họ phạm tội phản quốc; lật đổ Chính phủ qua việc biểu quyết vấn đề tín nhiệm Thủ tướng; Ban Thường vụ có quyền kiểm soát và phê bình Chính phủ. Ngược lại, hành pháp có thể kiềm chế lập pháp qua việc Chủ tịch nước có thể yêu cầu Nghị viện thảo luận lại dự luật mà nó đã thông qua; Chính phủ có quyền bắt giam và xét xử các nghị viên phạm tội khi có sự đồng ý của Nghị viện hoặc của Ban Thường vụ, nếu họ phạm pháp quả tang thì Chính phủ có quyền bắt giam ngay song phải thông báo cho Ban Thường vụ chậm nhất là sau 24 giờ. Tuy nhiên, Chính phủ không có quyền giải tán Nghị viện trước thời hạn mà chỉ Nghị viện mới có quyền tuyên bố tự giải tán. Quan hệ giữa hành pháp với tư pháp thể hiện qua việc Chính phủ có quyền bổ nhiệm thẩm phán và tòa án có quyền truy tố và xét xử nhân viên Nội các về thường tội.
tới, thậm chí tên các cơ quan lập pháp và hành pháp cũng không được nhắc đến tới. Song có thể khẳng định trong tổ chức bộ máy Nhà nước ta lúc đó tư tưởng phân quyền được thể hiện ở mức độ tương đối rõ.