Công ty Cổ phần Cấp nước Trà Nóc, được thành lập trên cơ sở thực hiện Quyết định số 2622/QĐ-UBND ngày 05/12/2006 của Chủ tịch UBND TP Cần Thơ về việc phê duyệt phương án chuyển Xí nghiệp cấp nước Trà Nóc trực thuộc Công ty TNHH Cấp thoát nước Cần Thơ thành Công ty Cổ phần Cấp thoát nước Trà Nóc.
Trước đó, công ty hoạt động dưới hình thức chi nhánh cấp nước Bình Thủy – Trà Nóc sau đó là xí nghiệp cấp thoát nước Trà Nóc trực thuộc Công ty TNHH Cấp thoát nước Cần Thơ. Nhằm phục vụ nhu cầu sử dụng nước sạch của nhân dân trên địa bàn, Công ty Cấp nước Cần Thơ thành lập chi nhánh Cấp nước Bình Thủy – Trà Nóc. Công ty đã xây dựng hệ thống cấp nước đặt tại khu công nghiệp (KCN) Trà Nóc. Giám Đốc Công ty Cấp nước Cần Thơ ký Quyết định số 156/QĐ.CN về việc thành lập chi nhánh cấp nước Trà Nóc vào ngày 30/10/2001. Xuất phát từ nhu cầu sử dụng nước sạch của khách hàng trên địa bàn ngày càng tăng. Ngày 23/11/2001, công ty Cấp nước Cần Thơ đã khởi công xây dựng Nhà máy nước Trà Nóc tại vị trí Lô 12A KCN Trà Nóc 2 thuộc Phường Phước Thới, Quận Ô Môn, TP Cần Thơ Ngày 01/01/2007, thực hiện Quyết định số 2622/QĐ-UBND ngày 05/12/2006 của Chủ tịch UBND thành phố Cần Thơ, Công ty Cổ phần Cấp thoát nước Trà Nóc chính thức đi vào hoạt động. Đại hội cổ đông thường niên năm 2010 đã thông qua việc đổi tên thành Công ty Cổ phần Cấp nước Trà Nóc. Ngày 02/08/2011, Công ty Cổ phần Cấp nước Trà Nóc được cấp giấy phép kinh doanh lần 2.