Để phát hiện virus, lấy bệnh phẩm là huyết thanh, huyết tương, bạch cầu, phổi, hạch Amidan, tổ chức Lympho, dịch báng của thai chết lưu hoặc lợn chết ngay sau khi sinh. Nhìn chung, bệnh phẩm ở lợn con thích hợp hơn bệnh phẩm ở lợn già vì virus gây PRRS tồn tại trong một thời gian dài ở lợn con.
Có thể phân lập virus ở huyết thanh trong vòng 4 – 6 tuần sau khi bị nhiễm ở lợn đang bú, lợn cai sữa và lợn choai, trong vòng 1 – 2 tuần sau khi nhiễm ở lợn đực trưởng thành và lợn nái. Cần phải bảo quản lạnh ngay lập tức bệnh phẩm dùng để phát hiện virus.
Có thể áp dụng các phương pháp sau để phát hiện virus:
Phân lập virus trên một số loại tế bào: Tế bào phế nang của lợn, tế bào MA – 104, tế bào MAC – 145, CL2621 và CL – 11171.
Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 25
Phương pháp huỳnh quang gián tiếp phát hiện kháng nguyên Phương pháp nhân gen (RT – PCR)
Phương pháp lai phân tử tại chỗ (insitu hybridization)
Trong thực tế, vấn đề phân lập virus còn gặp nhiều khó khăn vì tế bào dùng để phân lập virus là tế bào đại thực bào của lợn và đòi hỏi phải lấy ở lợn vô trùng (SPF-Specific Pathogenic Free) ở lứa tuổi 6 – 8 tuần. Lợn vô trùng là lợn được nuôi từ sơ sinh trong điều kiện vô trùng, không được sử dụng bất cứ một loại vaccin nào và cũng hoàn toàn không có bệnh. Không phải tất cả các phòng thí nghiệm chẩn đoán đều chuẩn bị được môi trường tế bào đại thực bào đạt tiêu chuẩn như vậy.
Các tế bào khác tỏ ra không mẫn cảm với virus PRRS và không thể thay thế được môi trường tế bào đại thực bào tiên phát.
Sau khi phân lập được virus, giám định bằng phương pháp huỳnh quang gián tiếp.