- Tên khoa học: Mẫu được thẩm định có tên khoa học là Coix lachrymajob
3.3.Tính đa dạng về di truyền
Trong 10 mẫu Ý dĩ được gửi đến phòng thí nghiệm Macrogen, Hàn Quốc để giải trình tự gen thì mẫu Y8 quá trình giải trình tự gen không thành công, nên ta chỉ xác định tính đa dạng di truyền của 9 mẫu còn lại gồm Y1, Y2, Y3, Y4, Y5, Y6, Y7, Y9 và Y10 (Bảng 2.1).
- Sau khi tiến hành giải trình tự gen thu được trình tự nucleotid của 9 mẫu Ý dĩ (Phụ lục 5) .
- Dựa vào trình tự nucleotid, xác định được độ tương đồng di truyền của 9 mẫu Ý dĩ (Phụ lục 6). Trong đoạn trình tự khảo sát là ITS1 – 5.8S – ITS2 thì trình tự nucleotid của 9 mẫu Ý dĩ ít có sự khác biệt với độ tương đồng di truyền giữa các mẫu dao động từ 97% đến 99%.
- Trình tự nucleotid của 9 mẫu Ý dĩ và trình tự nucleotid của 7 đoạn so sánh được gióng hàng trong phần mềm Bioedit, trong đó các nucleotid bôi màu vàng là các nucleotid khác biệt của các đoạn trình tự nghiên cứu (Phụ lục 7). Sử dụng phần mềm PAUP để xây dựng cây phân loại, kết quả 9 mẫu Ý dĩ được chia thành 4 nhóm (Hình 3.14): Nhóm 1 gồm mẫu Y1 (Mai Sơn – Sơn La). Nhóm 2 gồm các mẫu Y2 (Đà Bắc – Hòa Bình) và Y3 (Đạo Trù – Vĩnh Phúc). Nhóm 3 gồm các mẫu Y4 (Hoàng Mai – Hà Nội), Y9 (Văn Quan – Lạng Sơn) và Y10 (Yên Sơn – Ba Vì); trong đó mẫu Y10 được xếp thành 1 nhóm riêng và 2 mẫu Y4 và Y9 được xếp thành 1 nhóm riêng. Nhóm 4 gồm các mẫu Y5 (Chiang Rai – Thái Lan), Y6 (Thuận Châu – Sơn La) và Y7 (Mường Thanh – Điện Biên); trong đó mẫu Y6 được xếp thành 1 nhóm riêng và 2 mẫu Y5 và Y7 được xếp thành 1 nhóm riêng. Dựa cào cây phân loại ta thấy mẫu Y5 và Y7 có trình tự giống với các đoạn trình tự đã được công bố nhất.
BÀN LUẬN Về đặc điểm hình thái và nông học: