Kết quả phân tích thành phần thực vật nổi ở 9 điểm thu trên các nhánh sông bao gồm nhánh sông Long Bình, kênh Vĩnh Tế, Vàm Xáng Vịnh Tre 1, Vàm Xáng Vịnh Tre 2, kênh Cây Dương, kênh Chắc Cà Đao, rạch Cái Sao (đầu nguồn), rạch Cái Sao (cuối nguồn), kênh Cái Sắn. Có 128 loài thuộc 6 ngành tảo: tảo Khuê (Bacillariophyta), tảo Lục (Chlorophyta), tảo Lam (Cyanobacteria), tảo Mắt (Euglenophyta), tảo Giáp (Dinophyta), tảo Vàng Kim (Chrysophyta), cơ cấu tỉ lệ thành phần loài được trình bày ở Hình 4.6. Tảo Khuê cao nhất với 53 loài chiếm 42%, tảo Lục 44 loài chiếm 34%, tảo Lam 11 loài chiếm 9%, tảo Mắt 14 loài chiếm 11%, tảo Giáp 3 loài chiếm 2%, tảo Vàng Kim 3 loài chiếm 2%.
Hình 4.6: Cấu trúc thành phần loài thực vật nổi trên các nhánh sông Cơ cấu thành phần loài thực vật nổi trên các nhánh sông cũng tương tự như thành phần loài trên tuyến sông chính nhưng có phần phong phú hơn, có sự xuất hiện thêm 3 loài thuộc ngành tảo Vàng Kim (chiếm 2%).
Thành phần loài ở tuyến sông chính (102 loài) có phần chênh lệch so với các nhánh sông (128 loài) nhưng không có chênh lệch nhiều có thể do sông lớn nước chảy mạnh hơn mang sinh vật phù du theo dòng chảy do đó khả năng thu được các giống loài tảo ít hơn. Trong đó tảo Khuê và tảo Lục vẫn chiếm tỉ lệ cao hơn, còn tảo Lam và tảo Mắt thành phần loài thấp hơn.
Một số giống loài có khả năng phân bố rộng, thường xuyên xuất hiện ở hầu hết các thủy vực thu mẫu ở các nhánh sông thuộc sông Hậu như:
0 20 40 60 80 100 120 Đợt 1 Đợt 2 Số loài Tảo Khuê Tảo Lam Tảo Lục Tảo Vàng Kim Tảo Mắt Tảo Giáp Tổng
Climacosphenia moniligera, Coscinodiscus subtili, Cyclotella comta, Gyrosigma attenuatum (tảo khuê), Actinastrum hantzchii var. hantzchii,
Apatococcus lopatus, Eudorina unicocca, Pediastrum biradiatum,
Scenedesmus quadricauda (tảo lục), Oscillatoria limosa, Phormidium autumnale, Spirulina major (tảo lam), Trachelomonas hispidia, Phacus longicauda ,Phacus acuminata (tảo mắt).
Scenedesmus quadricauda Appatococus lobatus