KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.4. định danh bằng so sánh trình tự
Sau khi giải trình tự ựoạn ITS1, ựoạn trình tự này ựược so sánh với ngân hành cơ sở dữ liệu NCBI. Sử dụng công cụ Nucleotide BLAST với ựoạn trình tự truy vấn (Query sequence) là trình tự ựoạn ITS1 của tảo cần xác ựịnh tên loài, cơ sở dữ liệu (Database) lựa chọn là Nucleotide collection (nr/nt), lựa chọn chương trình (Program selection) là Highly similar sequences (megablast) ựể ưu tiên so sánh với các trình tự có sự giống nhau với trình tự truy vấn nhất.
Kết quả so sánh trình tự ITS1 với ngân hàng cơ sở dữ liệu NCBI bằng công cụ BLAST cho thấy trình tự này giống hoàn toàn với vùng trình tự ITS1 trong vùng gene mã hóa rRNA của S. quadricauda (AJ49521.1) và giống ựến 99% so với S. obliquus (AJ496388.1). Kết quả phân tắch bằng BLAST ựược trình bày trong hình 4.6. Trong môi trường tự nhiên và BBM, tảo chủ yếu tồn tại ở dạng 4 tế bào ựắnh với nhau, có hình dạng oval kéo dài và tròn ở 2 ựầu. Các tế bào xếp thành 1 hàng thẳng, mỗi ựầu tận cùng của tế bào ngoài cùng ựược kết thúc bởi một roi. Trong khi ựó S. obliquus (Turpin), các tế bào ở dạng elip, sau khi phân chia chúng ựược xếp thành 2 hàng riêng biệt. Ngoài ra, ựối với S. obliquus, các tế bào nằm ngoài cùng
Học viện Nông nghiệp Việt Nam Ờ Luận văn thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp 33
thường không có mối kết nối với bất kì tế bào nằm trong hàng khác. Dựa trên sự khác biệt này, kết hợp với phân tắch trình tự ITS-1, chủng tảo phân lập thuộc loài S. quadricauda (Turp.) Kết quả này cũng phù hợp với sự phân bố phổ rộng của loài S. quadricauda trong các thủy vực ở Việt Nam [Dương đức Tiến, Võ Hành, 1997].
Hình 4.6. Kết quả BLAST ựoạn ITS1 tảo Scenedesmus sp. với cơ sở dữ liệu NCBI