Danh mục và Hệ thống hài hòa mô tả và mã hóa hàng hóa của Công ước HS
Danh mục biểu thuế xuất khẩu, biểu thuế nhập khẩu của Việt Nam đƣợc xây dựng trên cơ sở tuân thủ theo Hệ thống HS và Danh mục HS của WCO.
Phân loại áp mã số hàng hóa xuất nhập khẩu theo Danh mục HS bao gồm các chú giải phần, chƣơng, nhóm hàng, phân nhóm hàng, chi tiết nhóm hàng với sự mô tả hàng hóa và tuân theo sáu nguyên tắc chung HS để xếp vào vị trí phù hợp nhất trong 5228 điều ƣớc HS, còn áp dụng theo hƣớng dẫn của các bộ ngành có liên quan. Điều này gây khó khăn, phức tạp trong phân loại và áp mã hàng tính thuế theo tờ khai hải quan, nhất là các mặt hàng có tính kỹ thuật và chuyên ngành cao. Khi khai báo mã hàng (mã số thuế), doanh nghiệp chọn dòng có nội dung giống nhất với tên hàng hóa nhập khẩu tại biểu thuế là khai áp mã số hàng đó và thƣờng tìm cách áp mã hàng ở mức thuế suất thấp nhất vì Biểu thuế nhập khẩu còn quá nhiều mức thuế.
Hơn nữa với sự phát triển của khoa học và công nghệ ngày càng xuất hiện nhiều mặt hàng mới với những đặc tính khác nhau nên việc hiểu và xác định chính xác tên gọi cũng nhƣ bản chất hàng hóa là việc không dễ dàng.
Việc phân loại, áp mã hàng hóa chính xác và thống nhất đối với doanh nghiệp XNK cũng nhƣ với cơ quan hải quan là việc còn khó, đòi hỏi sự am hiểu về hàng hóa và có kiến thức chuyên môn về lĩnh vực phân loại, áp mã hàng.