... hiểu dữliệu bài báo trên PubMed và dữliệu trình tự GenBank trên NCBI. Tìm hiểu các công cụ sinh học dùng trong Bioinformatics. Giai đoạn 2: Xây dựng và tổ chức các dữ liệu. Tìm kiếm dữliệu ... sau : Dữliệu không lớn chỉ vài ngàn gene đƣợc xem là thông dụng nhất trong công nghệ chuyển gene hiện nay. Phải thiết lập các mối liên hệ trong dữ liệu, tiến tới quản lý dữliệu một cách ... xây dựng CSDL 57 II. TÌM KIẾM DỮLIỆU BÀI BÁO 58 II.1. Tìm kiếm tổng hợp tính trạng 58 II.2. Tổng hợp dữliệu Primer dùng trong phát hiện GMO 64 III. TÌM KIẾM DỮLIỆU TRÌNH TỰ 66 III.1. Tìm...
... đổi dữliệu hàng ngày với EMBL/EBI và GenBank/NCBI, nên ba cơ sở dữliệu này chia sẽ cùng dữliệu tại bất kỳ thời điểm nào. DDBJ cũng cung cấp nhiều công cụ cho phân tích và lấy ra các dữliệu ... cứu và tạo ra số Accession number cho dữ liệu trình tự đƣợc gởi tới. DDBJ tập hợp dữliệu chủ yếu từ các nhà khoa học Nhật, tuy nhiên cũng chấp nhận dữliệu và tạo Accession number cho các nhà ... một cơ sở dữliệu trình tự mang tính quốc tế bao gồm: EBI và NCBI (chịu trách nhiệm cho cơ sở dữliệu GenBank) với vai trò là hai thành viên khác. DDBJ đã hợp tác với hai ngân hàng dữliệu thông...
... có thể truy cập cùng một dữ liệu. Điều này nghĩa là nếu một chƣơng trình cần thay đổi cách tổ chức dữ liệu, ta phải tìm tất cả các chức năng hoặc các lệnh truy cập dữliệu đó để có những thay ... trật tự các dòng phù hợp từ nguồn dữ liệu. Để tạo thuận lợi trong sinh học mới, các nhà sinh học phải làm quen với máy tính. Truy xuất dữliệu từ trang web dữliệu sinh học và những công cụ phân ... Biến mảng giống nhƣ biến vô hƣớng, nó đƣợc tạo ra để lƣu dữ liệu. Tuy nhiên dữ liệu là một danh sách (list) (danh sách là một nhóm dữliệu vô hƣớng đƣợc sắp xếp theo thứ tự). Mở đầu biến mảng...
... sở dữliệu khác trên thế giới. - Thông tin trong các cơ sở dữliệu này là rất lớn và luôn đƣợc cập nhật thƣờng xuyên (sau mỗi 24 giờ). - Trong phạm vi đề tài tập hợp và tổ chức dữliệugene ... PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH – Tìm kiếm dữliệu trình tự NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 72 Choose database: giới hạn phạm vi cơ sở dữliệu tìm kiếm trong các cơ sở dữ liệu của chƣơng trình BLAST. ... trình tự sinh học đƣợc lƣu trữ phổ biến trong các cơ sở dữliệu sinh học. Hiện nay, các thông tin này đƣợc lƣu trữ chủ yếu trong các cơ sở dữliệu lớn trên thế giới nhƣ hệ thống GenBank (NCBI),...
... IV.2. Tiến hành tổ chức, phân loại dữliệu Nhận xét về dữliệu mà ta đang có, sẽ có rất nhiều cách để phân loại dữliệu này, tuy nhiên khi phân tích các dữliệu ta thấy mỗi trình tự đều có thông ... đang có trong cơ sở dữliệu thế giới làm cho dữliệu của ta sẽ phong phú hơn, đáp ứng đƣợc nhiều mục đích khai thác sử dụng. PHẦN C: PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH – Tìm kiếm dữliệu trình tự NGUYỄN ... tự trong cơ sở dữliệu khổng lồ sẽ cho kết quả dữliệu khớp rất lớn nếu trình tự primer đó không đặc hiệu, vì thế đối với các primer không chuyên biệt ta rất khó lấy đƣợc dữliệu mong muốn....
... chọn cơ sở dữliệu cần tìm sau đó nhấn nút submit để tìm kiếm. Keywords có thể đƣợc kết hợp với nhau theo toán tử AND, OR, NOT. Theo mặc định keywords đƣợc tìm kiếm trong cơ sở dữliệu NLBI ... cùng sau khi chƣơng trình phân Division đã chạy xong Dữ liệu của ta đƣợc phân loại theo từng trƣờng riêng biệt, đây là cấu tạo tầng dữ liệu của ta. Thống kê kết quả cuối cùng, tất cả các trình ... VÀ THẢO LUẬN NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 98 V. Java tiến hành xử lý dữliệu Xây dựng ứng dụng tra cứu dữliệu trình tự thông qua các keyword do ngƣời dùng chọn lựa và nhập vào. V.1....
... xây dựng thêm các cơ sở dữliệu khác cũng liên quan đến cây trồng biến đổi di truyền nhƣ: o Cơ sở dữliệu các vector dùng trong chuyển gene vào thực vật. o Cơ sở dữliệu primer dùng trong chẩn ... GMO. o Xây dựng cơ sở dữliệu cho tất cả các gene chỉ thị (Marker Genes) dùng trong quá trình chuyển gene. 3. Vấn đề quan tâm khác Trong quá trình tìm hiểu các cơ sở dữliệu trình tự GenBank/EMBL/DDBJ ... NGHỊ 1. Có biện pháp lọc dữliệu tốt hơn và tổ chức dữliệu hợp lý hơn Hiện tại chúng tôi chƣa đƣa ra đƣợc phƣơng án hoàn hảo cho việc chọn lọc thông tin, vì thế dữliệu hiện nay của chúng...
... accession. Cơ sở dữliệu RefSeq chứa những trình tự tham khảo cũng đƣợc ấn định theo chuẩn tên locus với mỗi record, tƣợng trƣng cho gene. RefSeq tồn tại riêng rẽ với cơ sở dữliệu GenBank, nhƣng ... Cách tìm kiếm: Không thể tìm kiếm ở cơ sở dữliệu trình tự nucleotide và protein bởi số MEDLINE UID. Tuy nhiên, bạn có thể tìm kiếm ở cơ sở dữliệu tài liệu (PubMed) của Entrez cho MEDLINE UID, ... Cách tìm kiếm: Không thể tìm kiếm ở cơ sở dữliệu trình tự nucleotide và protein bởi số PubMed ID. Tuy nhiên, bạn có thể tìm kiếm tài liệu ở cơ sở dữliệu PubMed của Entrez cho số PubMed ID,...
... khai phá dữ liệu. Bước này lấy dữ liệu từ trong một cơ sở dữ liệu, một kho dữ liệu, thậm chí dữliệu từ những nguồn cung ứng web. Trích lọc dữliệu (selection)Ở giai đoạn này dữliệu được ... sử dụng để trích ra các mẫu từ dữ liệu. Thuật toán thường dùng để trích mẫu dữliệu là thuật toán phân loại dữ liệu, kết hợp dữ liệu, thuật toán mô hình hoá dữliệu tuần tự.Đánh giá kết quả ... khai phá dữ liệu Quá trình khai phá dữliệu bắt đầu với kho dữliệu thô và kết thúc với tri thức được chiết xuất ra. Nội dung của quá trình như sau:Gom dữliệu (gatherin)Tập hợp dữliệu là...
... thuộc tính của các bảng dữ liệu: MONHOCThuộc tính Kiểu dữliệu Kích thước Ghi chúMAMH Character 10 Thuộc tính khóaTENMH Character 30SOTINCHI IntegerKHOAThuộc tính Kiểu dữliệu Kích thước Ghi ... “=” bên cạnh)• Data Type: cho phép chọn kiểu dữliệu cho thuộc tính, click vào dấu “…” bên cạnh, cửa sổ các kiểu dữliệu mở ra, ta chọn kiểu dữliệu phù hợp cho các thuộc tính, bên dưới cho ... 1SINHVIENThuộc tính Kiểu dữliệu Kích thước Ghi chúMASV Character 10 Thuộc tính khóaTENSV Character 30NGAYSINH DatetimeDIACHI Character 30LOPHOCThuộc tính Kiểu dữliệu Kích thước Ghi chúMALOP...
... chia, Div, Mod… Kiểu dữliệu có hai loại là kiểu dữliệu sơ cấp và kiểu dữliệu có cấu trúc hay còn gọi là cấu trúc dữ liệu. Kiểu dữliệu sơ cấp là kiểu dữliệu mà giá trị dữliệu của nó là đơn ... Kiểu dữliệu có cấu trúc hay còn gọi là cấu trúc dữliệu là kiểu dữliệu mà giá trị dữliệu của nó là sự kết hợp của các giá trị khác. Ví dụ: ARRAY là một cấu trúc dữ liệu. Một kiểu dữliệu ... và kiểu dữliệu trừu tượng là gì? V III. KIỂU DỮLIỆU - CẤU TRÚC DỮLIỆU VÀ KIỂU DỮLIỆU TRỪU TƯỢNG (DATA TYPES, DATA STRUCTURES, ABSTRACT DATA TYPES) Mặc dù các thuật ngữ kiểu dữliệu (hay...