3 1 quy trình phát hiện salmonella
Luận văn : XÂY DỰNG QUY TRÌNH PHÁT HIỆN VIRUS PMWaV-1 GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ (Mealybug wilt) TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƯƠNG PHÁP RT-PCR part 3 potx
... Bửu, 19 99) 30 2.8.2.6 Số lượng chu kỳ phản ứng PCR Số chu kỳ cho phản ứng tùy thuộc vào số lượng ban đầu mẫu Ví dụ lượng mẫu ban đầu 10 5 cần 25 – 30 chu kỳ, lượng mẫu 10 2 – 1 03 số lượng chu kỳ 35 ... 9 .3% , 8 .1% 4 .1% Còn tỷ lệ bệnh nơng trường: nông trường Phạm Văn Hai, nông trường Lê Minh Xuân – Tp.HCM nông trường Thọ Vực – Đồng Nai 6%, 7% 12 .1% (Phạm Văn Khánh, 20 03, Võ Thị Thúy Huệ, 20 03, ... DNA khuyếch đại, khơng trùng với trình tự lặp lại gen Trình tự primer khơng nên q lớn, phản ứng PCR thường tối ưu với đoạn trình tự nhỏ 1kb (Phan Cự Nhân, 20 01) 2.8.2.5 Taq – polymerase Là DNA...
Ngày tải lên: 28/07/2014, 04:20
xây dựng quy trình phát hiện virus PMWaV-1
... 29 3. 2 .3 Xây dựng quy trình RT-PCR 30 3. 2 .3. 1 Khảo sát độ đặc hiệu primer 30 3. 2 .3. 2 Xác định chu kỳ nhiệt tối ưu .30 3. 2 .3. 3 Xác định nồng độ primer thích hợp 31 3. 2 .3. 4 ... trình nhiệt 45oC/45’ 45oC/45’ 45oC/45’ 94oC/2’ 94oC/2’ 94oC/2’ 94oC/2’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 52oC /1 54oC /1 56oC /1 58oC /1 58oC /1 68oC /1 30 ’’ 68oC /1 30 ’’ 68oC /1 30 ’’ ... nghiên cứu 25 3. 1. 1 Mẫu .25 3. 1. 2 Dụng cụ thiết bị 25 3. 1 .3 Hóa chất 26 3. 1 .3. 1 Hoá chất dùng cho tách chiết RNA .26 3. 1 .3. 2 Hoá chất dùng cho phản...
Ngày tải lên: 05/11/2012, 14:01
Luận văn : XÂY DỰNG QUY TRÌNH PHÁT HIỆN VIRUS PMWaV-1 GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ (Mealybug wilt) TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƯƠNG PHÁP RT-PCR part 7 doc
... 40 .1 40 .1 40 .1 40 .1 40 .1 40 .1 40 .1 40 .1 40 .1 40 .1 E Value 0.0 0. 41 6.4 6.4 6.4 6.4 6.4 6.4 6.4 6.4 6.4 6.4 6.4 6.4 gi |18 2 539 57|gb|AF 414 119 .1| AF 414 119 Pineapple mealybug wilt-associated virus -1 methyltransferase/helicase ... gi|22227|emb|X 632 05 .1| ZMCAB48 Zea mays cab48 gene for chlorop gi|62 630 0 81| gb|AC12 2 31 1. 6| Mus musculus BAC clone RP 23- 298B 23 Score (Bits) 40 .1 36 .2 36 .2 E Value 0.48 7.5 7.5 > gi |18 2 539 57|gb|AF 414 119 .1| AF 414 119 ... ACCAGCAGCTTACAATTCTTATCAAAGGGGTTTTATTTTTGAAAGTTGTAAGTTGAGCTC 33 0 6078 6 13 8 619 8 6258 6 31 8 66 Query 33 1 Sbjct 6 31 9 Query 39 1 Sbjct 637 9 Query 4 51 Sbjct 6 439 Query 511 Sbjct 6499 TATAAATGTGCAGGCGGTAGTAAACGAACCGACCGCAGCTGGATTGAGTGCTTTCATAAC...
Ngày tải lên: 28/07/2014, 04:20
Luận văn : XÂY DỰNG QUY TRÌNH PHÁT HIỆN VIRUS PMWaV-1 GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ (Mealybug wilt) TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƯƠNG PHÁP RT-PCR part 6 doc
... BLAST trình tự D1, D2 STT Tên trình tự gi |18 2 539 57|gb|AF 414 119 .1| AF 414 119 Pineapple mealybug wilt Số Nu tương đồng 510 / 517 associated virus -1, complete cds gi|8977608|emb|AL 13 7 017 .9| Human DNA ... 28/ 517 RP 11- 120J1 on chromosome Contains the 3' end of a novel gene and a CpG island, complete sequence gi |34 49 517 1|gb|AC14 030 7 .3| Mus musculus BAC clone RP 23- 20/ 517 38 9D15 from chromosome 19 , ... RT-PCR tối ưu cho phát PMWaV -1: chu kỳ 10 chu kỳ 35 chu kỳ chu kỳ 45oC/45’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 68oC/8’ 94oC/2’ 58oC /1 54oC /1 68oC /1 30 ’’ 68oC /1 30 ’’ Sản phẩm RT-PCR giải trình tự nằm vùng gene...
Ngày tải lên: 28/07/2014, 04:20
Luận văn : XÂY DỰNG QUY TRÌNH PHÁT HIỆN VIRUS PMWaV-1 GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ (Mealybug wilt) TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƯƠNG PHÁP RT-PCR part 5 ppt
... 45 Bảng 4 .3: Kết phân tích BLAST primer 225, 226 Số Nu tương đồng STT Tên trình tự Primer 225 Primer 226 gi |18 2 539 57|gb|AF 414 119 .1| AF 414 119 Pineapple mealybug wilt associated virus -1, complete ... 20/20 gi|22227|emb|X 632 05 .1| ZMCAB48 Zea mays cab48 gene for chlorophyll a/b binding protein precurso 18 /20 - gi|62 630 0 81| gb|AC12 2 31 1. 6| Mus musculus BAC clone RP 23- 298B 23 from chromosome 6, ... phản ứng RT-PCR phát PMWaV -1 4.2.2 Kết xác định chu trình nhiệt tối ưu Ở bước đầu thực phản ứng RT-PCR, thực quy trình RT-PCR theo Sether cộng sự, (20 01) (chu trình 2) Tuy nhiên, q trình thí nghiệm,...
Ngày tải lên: 28/07/2014, 04:20
Luận văn : XÂY DỰNG QUY TRÌNH PHÁT HIỆN VIRUS PMWaV-1 GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ (Mealybug wilt) TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƯƠNG PHÁP RT-PCR part 4 pptx
... trình nhiệt 45oC/45’ 45oC/45’ 45oC/45’ 94oC/2’ 94oC/2’ 94oC/2’ 94oC/2’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 92oC /30 ’’ 52oC /1 54oC /1 56oC /1 58oC /1 58oC /1 68oC /1 30 ’’ 68oC /1 30 ’’ 68oC /1 30 ’’ ... Nước cất lần - Dung dịch TAE 1X (Tris acetat 40mM, EDTA 0,1mM, pH 8) - Thang DNA (10 0bp DNA ladder – Promega) 37 15 00 bp 10 00 bp 500 bp 10 0 bp Hình 3. 3: Thang DNA 3. 1 .3. 4 Hóa chất dùng cho điện ... 68oC /1 30 ’’ 68oC /1 30 ’’ 68oC /1 30 ’’ (45 chu kỳ) cDNA 45oC/45’ 68oC /1 30 ’’ Khuếch đại 45oC/45’ 94oC/2’ Tạo cDNA (45 chu kỳ) (45 chu kỳ) (45 chu kỳ) (10 chu kỳ) 92oC /30 ’’ 54oC /1 68oC /1 30 ’’ (35 chu kỳ)...
Ngày tải lên: 28/07/2014, 04:20
Luận văn : XÂY DỰNG QUY TRÌNH PHÁT HIỆN VIRUS PMWaV-1 GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ (Mealybug wilt) TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƯƠNG PHÁP RT-PCR part 1 pdf
... 29 3. 2 .3 Xây dựng quy trình RT-PCR 30 3. 2 .3. 1 Khảo sát độ đặc hiệu primer 30 3. 2 .3. 2 Xác định chu kỳ nhiệt tối ưu .30 3. 2 .3. 3 Xác định nồng độ primer thích hợp 31 3. 2 .3. 4 ... nghiên cứu 25 3. 1. 1 Mẫu .25 3. 1. 2 Dụng cụ thiết bị 25 3. 1 .3 Hóa chất 26 3. 1 .3. 1 Hoá chất dùng cho tách chiết RNA .26 3. 1 .3. 2 Hoá chất dùng cho phản ... RT-PCR 26 3. 1 .3. 3 Hóa chất dùng cho điện di DNA 27 3. 1 .3. 4 Hóa chất dùng cho điện di RNA 28 3. 2 Phương pháp nghiên cứu .28 3. 2 .1 Tách chiết RNA 28 3. 2.2 Điện di...
Ngày tải lên: 28/07/2014, 04:21
Nghiên cứu xây dựng quy trình phát hiện và định lượng human immonodeficiency virus – 1 trong huyết tương người bằng kỹ thuật realtime pcr
... SỬ DỤNG 15 2 .1 20 Tách chiết RNA với thuốc thử “NKRNAPREP” Nam Khoa iii 15 16 16 17 17 17 19 19 20 2 .1. 1 2 .1. 2 2.2 2.2 .1 2.2.2 2 .3 2 .3. 1 2 .3. 2 2.4 2.4 .1 2.4.2 2.5 2.5 .1 2.5.2 2.6 2.6 .1 2.6.2 ... nghiệm phát HIV1RNA mẫu 1 03 10 7 copies HIV1RNA có 15 0µl, thực sau pha Kết biểu đồ khuếch đại biểu đồ chuẩn xét nghiệm phát HIV1RNA mẫu 1 03 10 7 copies HIV1RNA có 15 0µl, thực x 41 41 42 43 43 43 44 ... 20 20 20 21 21 21 21 22 22 22 23 23 23 25 25 25 26 26 27 PHƯƠNG PHÁP XÂY DỰNG QUI TRÌNH XÉT NGHIỆM REAL-TIME PCR PHÁT HIỆN VÀ ĐỊNH LƯỢNG HIV1 28 3. 1 Mồi Taqman probe 28 3. 1. 1 Mồi 28 3. 1. 2 Taqman...
Ngày tải lên: 11/02/2015, 01:50
XÂY DỰNG QUY TRÌNH PHÁT HIỆN ĐỘT BIẾN rtA181V/T VÀ rtN236T KHÁNG ADEFOVIR CỦA VIRUS VIÊM GAN B (Hepatitis B Virus) BẰNG KỸ THUẬT REAL-TIME PCR
... - 11 , 23 R1 81- 1 > - 6,5 - - > - 6, 21 R1 81- 2 > - 6,5 - - > - 6, 21 P1 81 > - 11 , 23 > - 6, 21 > - 6, 21 - Bảng 3. 3: Năng lượng tự (∆G, kcal.mol -1) cấu trúc Hetero-dimer phản ứng F 236 R 236 P 236 ... để phát đột biến rt1 81 nên không kiểm tra cấu trúc hetero-dimer mồi ngược R1 81- 1 R1 81- 2 Bảng 3. 2: Năng lượng tự (∆G, kcal.mol -1) cấu trúc Hetero-dimer phản ứng F1 81 R1 81- 1 R1 81- 2 P1 81 F1 81 - ... > - 8 ,16 R1 81- 2 27 41, 7 59,6 - 0,07 > - 8 ,16 P1 81 25 60,0 65,6 - 1, 23 > - 9,20 F 236 28 39 ,3 58 ,1 > 0, 71 > - 3, 91 R 236 25 48,0 58,5 - 1, 61 > - 9 ,36 P 236 30 50,0 64,2 > - 1, 93 > - 9,28 Ghi chú:...
Ngày tải lên: 16/03/2013, 09:26
Xây dựng Quy trình phát hiện Escherichia Coli trong thực phẩm bằng phương pháp PCR(Polumerase Chain Reaction) và thử nghiệm ứng dụng
... -1 10-2 10 -3 10 -4 10 -5 CFU /ml 10 5 10 4 9 .1 03 9 .10 2 9 .10 1 CFU / phản ứng 10 2 10 1 10 0 10 -1 10-2 + + + _ _ Kết PCR 299bp Hình 16 Độ nhạy phản ứng PCR 1: Thang DNA ; 2: Vạch chuẩn 299bp; 3: x 10 5 ... Linh Thước 10 Bạch tuộc + + E coli 10 11 Sò lông + + E coli 11 + + E coli 12 13 Cá nục + + E coli 13 14 Teùp + + E coli 14 15 Mỡ heo + + E coli 15 16 Cá hường + + E coli 16 + + E coli 17 Ốc bươu ... coli 31 32 Đậu que + + E coli 32 33 Khoùm + + E coli 33 34 Chuoái + + E coli 34 35 Sapo + + E coli 35 36 Khoai cao + + E coli 36 Đoàn Thò Ngọc Tuyền Chợ Thủ Đức Luận văn tốt nghiệp 37 Khô mực 39 ...
Ngày tải lên: 16/03/2013, 09:26
Nghiên cứu xây dựng quy trình phát hiện nhanh virus cúm gia cầm a h5n1 trong mẫu bệnh phẩm bằng kỹ thuật multiplex reverse transcription polymerase chain reaction
... học 2 (1) : 1- 18 Lê Văn Năm (2004), “Bệnh cúm gà”, Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Thú y, 11 (1) : 81- 86 Tô Long Thành (2004), “Bệnh cúm loài chim”, Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Thú y, 11 (2): 53- 58 Tiếng ... (2007), “A Single Mutation in the PB1-F2 of H5N1 (HK/97) and 19 18 Influenza A Viruses Contributes to Increased Virulence”, PLoS Pathog, 3( 10 ), pp 14 14- 21 18 De Jong MD, Bach VC, Phan TQ, Vo MH, ... duck 1, 2, 3; h: human 1, 2, 3, 4, 5, Kỹ thuật mutiplex RT-PCR xác định cúm H5N1 30 mẫu bệnh phẩm (thu thập từ gia cầm bị bệnh vụ dịch cúm) Kết phát mẫu dương tính với cúm H5N1 (30 %) 21 mẫu âm...
Ngày tải lên: 10/02/2014, 20:39
NGHIÊN CỨU VIRUS (TMV, CMV) GÂY BỆNH TRÊN CÂY ỚT TẠI HUYỆN CỦ CHI, TP. HỒ CHÍ MINH BẰNG KỸ THUẬT ELISA VÀ XÂY DỰNG QUY TRÌNH PHÁT HIỆN CMV BẰNG KỸ THUẬT RT-PCR pot
... 28 3. 3 .3 Phát TMV CMV kỹ thuật DAS-ELISA 29 3. 3.4 Phát CMV RT-PCR 31 3. 3.4 .1 Ly trích RNA theo AurumTM Total RNA Mini Kit (Biorad) 31 3. 3.4.2 Khuếch đại RNA RT – PCR 32 3. 3.4 .3 ... 83, 3 16 66,7 24 Trung Lập Thƣợng 13 81 ,3 14 87,5 16 38 Tỷ lệ nhiễm (%) 10 0 80 86,7 76,7 93, 8 83, 3 87,5 81 ,3 66,7 60 60 CMV 40 TMV 20 Hòa Phú Nhuận Đức An Nhơn Trung Lập Tây Thượng Biểu đồ 4 .3 ... 2 .3. 1. 1 Nguồn gốc 2 .3. 1. 2 Phân loại 2 .3. 1 .3 Cấu trúc 2 .3. 1. 4 Môi giới truyền bệnh 11 2 .3. 1. 5 Triệu chứng 11 vii 2 .3. 1. 6 Biện pháp...
Ngày tải lên: 10/03/2014, 15:20
xây dựng quy trình phát hiện thịt trong thực phẩm chay bằng phương pháp pcr gen 16s ty thể
... 15 PHẦN II VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP 17 VẬT LIỆU VÀ THIẾT BỊ .18 1. 1 Vật liệu- hóa chất 18 1. 1 .1 Mẫu thực phẩm 18 1. 1.2 Mồi 18 1. 1 .3 Hóa ... 5S, 23S 16 S 5S, 23S 16 S 80S 70S 5S, 5.8S, 26S 24S 17 S 17 S 80S 72S 5S, 5.8S, 25S 21S 18 S 15 S 80S 70S 75S 5S, 5.8S, 25S 5S,(4.5S), 23S (5S), 26S 17 S 16 S 18 S 80S 55S 5S, 5.8S, 28S 16 S 18 S 12 S ... .35 3. 1 Khảo sát hoạt động mồi 35 3. 2 Kết giải trình tự 36 3. 3 Khảo sát nhiệt độ lai .39 3. 4 Khảo sát độ đặc hiệu mồi 40 3. 5 Khảo sát độ nhạy quy trình...
Ngày tải lên: 18/05/2014, 18:31
Luận văn công nghệ sinh học Tìm hiểu quy trình phát hiện Vibrio trong thủy hải sản đông lạnh
... 3. 1 Phương pháp truyền thống 26 3. 1. 1 Phương pháp định tính 26 3. 1. 1 .1 Nguyên tắc 26 3. 1. 1.2 Thiết bị dụng cụ 26 3. 1. 1 .3 Mơi trường hóa chất 26 3. 1. 1.4 ... 20 01 90,7 2002 73, 7 20 03 11 6,7 2004 2005 2 31 ,5 36 7 ,3 73. 459,2 11 0. 911 ,2 (triệu USD) Khối 20.290,8 26.659 ,1 28. 612 ,8 38 .18 6,8 lượng(tấn) Nguồn: Trung tâm tin học- Bộ Thuỷ sản 2 .1. 2 Tình hình chất ... Tìm hiểu quy trình phát Vibrio thủy hải sản đông lạnh CHƯƠNG 3: PHƯƠNG PHÁP PHÁT HIỆN VIBRIO TRONG THỦY HẢI SẢN ĐÔNG LẠNH 3. 1 Phương pháp truyền thống 3. 1. 1 Phương pháp định tính 3. 1. 1 .1 Nguyên...
Ngày tải lên: 18/06/2014, 16:25
LUẬN VĂN CÔNG NGHỆ SINH HỌC TÌM HIỂU QUY TRÌNH PHÁT HIỆN VI KHUẨN LAO KHÁNG THUỐC BẰNG KỸ THUẬT SINH HỌC PHÂN TỬ
... 1. 2.2 Tình hình b nh lao Vi t Nam 1 .3 Phân lo i ñ c ñi m vi khu n lao 10 1 .3. 1 Phân lo i 10 1 .3. 2 ð c ñi m 11 1 .3. 3 B gen c a vi khu n lao 12 1. 4 ... 39 4 .3 Quy trình phát hi n lao kháng thu c b ng phương pháp real-time PCR 4 .3. 1 M u 41 4 .3. 1. 1 Thu m u 41 4 .3. 1. 2 X lý m u 41 4 .3. 2 Tách chi t DNA 41 ... nh 13 1. 4 .1 Ngu n lây 13 1. 4.2 ðư ng xâm nhi m 13 1. 4 .3 Di n bi n nhi m b nh 13 Chương : B NH LAO KHÁNG THU C 15 2 .1 L ch s b nh lao kháng thu c 16 2.2...
Ngày tải lên: 19/06/2014, 10:02
LUẬN VĂN CÔNG NGHỆ SINH HỌC TÌM HIỂU QUY TRÌNH PHÁT HIỆN ENTEROBACTER SAKAZAKII TRONG SỮA BỘT
... Agar . 31 3. 1. 9 Phân lập Enterobacter sakazakii môi trường MacConkey 32 3. 1. 10 Khẳng định sinh hóa 33 3. 1. 10 .1 Mơi trường thuốc thử thử nghiệm sinh hóa 33 3. 1. 10.2 Phép thử ... 34 3. 1. 10.7 Thử nghiệm Nitrate .35 3. 1. 10.8 Thử nghiệm ONPG .36 3. 1. 10.9 Thử nghiệm tính di động thạch mềm 37 3. 1. 9 .10 Thử nghiệm VP (voges-proskauer) .38 3. 2 ... 34 3. 1. 10 .3 Phép thử L-Lysin decarboxylase, L-Ornithin decarboxylase 34 3. 1. 10.4 Phép thử L- arginin dihydrolase .34 3. 1. 10.5 Phép thử lên men loại đường khác 34 3. 1. 10.6 Phép...
Ngày tải lên: 19/06/2014, 10:07
LUẬN VĂN CÔNG NGHỆ SINH HỌC TÌM HIỂU QUY TRÌNH PHÁT HIỆN VI KHUẨN LAO KHÁNG THUỐC BẰNG KỸ THUẬT SINH HỌC PHÂN TỬ
... 1. 2.2 Tình hình b nh lao Vi t Nam 1 .3 Phân lo i ñ c ñi m vi khu n lao 10 1 .3. 1 Phân lo i 10 1 .3. 2 ð c ñi m 11 1 .3. 3 B gen c a vi khu n lao 12 1. 4 ... 39 4 .3 Quy trình phát hi n lao kháng thu c b ng phương pháp real-time PCR 4 .3. 1 M u 41 4 .3. 1. 1 Thu m u 41 4 .3. 1. 2 X lý m u 41 4 .3. 2 Tách chi t DNA 41 ... nh 13 1. 4 .1 Ngu n lây 13 1. 4.2 ðư ng xâm nhi m 13 1. 4 .3 Di n bi n nhi m b nh 13 Chương : B NH LAO KHÁNG THU C 15 2 .1 L ch s b nh lao kháng thu c 16 2.2...
Ngày tải lên: 19/06/2014, 13:47
Tìm hiểu quy trình phát hiện Clostridium Botulinum trong thịt
... trùng Dung dịch NaOH 1N Dung dịch HCl 1N Cồn tuyệt đối Dung dịch trypsin (Difco, 1: 250) Thuốc nhuộm gam, tím kết tinh, hay xanh methylene 3. 1 .3 Quy trình phân tích 3. 1 .3. 1 Chuẩn bị mẫu trước ... photpho (11 6 -11 7 mg%), kali ( 212 -259 mg%) Fe ( 1, 1-2 ,3 mg %) tập trung nhiều gan Vì yếu tố có Cu, Zn, Coban Lượng Canxi thịt thấp (10 -15 mg%) Vitamin: Thịt nguồn vitamin nhóm B chủ yếu B1 tập trung ... rắn mơi trường cho vào ống nghiệm 20x150mm thể tích 15 ml hay cho 10 0ml vào lọ dung tích 17 0ml có vạch chia Hấp tiệc trùng ống nghiệm 12 10C 10 phút lọ 15 phút 12 1 0C pH=7 Bảo - quản 50C Thêm Tripsin...
Ngày tải lên: 27/06/2014, 18:54