Bài giảng Công nghệ Gene: Chương 4 Kỹ thuật phân tích đa hình, cung cấp cho người học những kiến thức như: Kỹ thuật RAPD; Kỹ thuật RFLD; Kỹ thuật AFLD. Mời các bạn cùng tham khảo!
11/4/2021 CHƯƠNG KỸ THUẬT PHÂN TÍCH ĐA HÌNH NGUYỄN NGỌC PHƯƠNG THẢO 117 NỘI DUNG 11/4/2021 Kỹ thuật RAPD Kỹ thuật RFLD Kỹ thuật AFLD Ứng dụng TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 118 59 11/4/2021 CHỈ THỊ PHÂN TỬ (DNA MARKER) • Chỉ thị phân tử (bằng DNA): đoạn gene/DNA vị trí xác định nhiễm sắc thể sử dụng để xác định cá thể/chủng • Sự khác biệt trình tự DNA: biến thể (đa dạng di truyền-đa hình) nhận diện 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 119 ĐA DẠNG DI TRUYỀN (GENOMIC VARIANTS) 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao https://www.garvan.org.au/research/kinghorn-centre-for-clinical-genomics/learn-about-genomics/dna-base/collection1/small-variants 120 60 11/4/2021 ĐA DẠNG DI TRUYỀN (GENOMIC VARIANTS) 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao https://www.garvan.org.au/research/kinghorn-centre-for-clinical-genomics/learn-about-genomics/dna-base/collection1/small-variants 121 ĐA DẠNG DI TRUYỀN (GENOMIC VARIANTS) 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 122 61 11/4/2021 ĐA DẠNG DI TRUYỀN (GENOMIC VARIANTS) 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 123 MỤC ĐÍCH CỦA KỸ THUẬT PHÂN TÍCH ĐA DẠNG DI TRUYỀN • Xác định khác biệt di truyền cá thể mà khơng cần đến giải trình tự • Phân tích đối tượng mẫu lớn • Tạo thị phân tử cho loài 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 124 62 11/4/2021 MỘT SỐ ỨNG DỤNG PHÂN TÍCH ĐA HÌNH “Xây dựng thị phân tử RAPD để quản lý tuyển chọn giống đầu dòng làm sở chọn giống đột biến hoa salem Lâm Đồng” https://www.vista.gov.vn/news/ket-qua-nghien-cuu-trien-khai/xay-dung-bo-so-lieu-rapd-de-quan-ly-va-tuyen-chon-giong-daudong-lam-co-so-chon-giong-dot-bien-hoa-salem-tai-lam-dong-2633.html 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 125 MỘT SỐ ỨNG DỤNG PHÂN TÍCH ĐA HÌNH “Ứng dụng thị phân tử phân biệt loại sâm giới” • Cơng cụ RFLP, RAPD • Phân biệt: P ginseng với P americana P grandiflorus https://vjst.vn/vn/_layouts/15/ICT.Webparts.TCKHCN/mt_poup/Intrangweb.aspx?IdNews=1255 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 126 63 11/4/2021 Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) • Sử dụng PCR • Đoạn mồi ngẫu nhiên: kích thước nhỏ 10bp • Nhiệt độ bắt cặp Ta thấp 35oC • Kiểm tra chiều dài hỗn hợp sản phẩm https://www.youtube.com/watch?v=i5_ecgyY3dY TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 11/4/2021 127 Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) • Xác định đa dạng di truyền trình tự DNA tương đồng • Ngun tắc: khác biệt di truyền cá thể tạo xố vị trí cắt giới hạn Sự khác biệt là: chiều dài sản phẩm sau cắt giới hạn GATTCGAGATTCGA Enzyme cắt giới hạn GATTTGAGATTCGA Enzyme cắt giới hạn 11/4/2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao https://www.youtube.com/watch?v=swQ_pm4cR5o 128 64 11/4/2021 Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) Kết hợp RAPD RFLP = PCR + R.E Các bước: Cắt giới hạn DNA (bằng enzyme cắt giới hạn R.E) Gắn đoạn adapters tương thích đầu cắt RE PCR Southern blot 11/4/2021 https://www.youtube.com/watch?v=YJNZQm7b7-s TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 129 CHƯƠNG PCR CÁC ỨNG DỤNG TRONG KỸ THUẬT DI TRUYỀN TS Nguyễn Ngọc Phương Thảo Email: Thao.nnp@vlu.edu.vn 130 65 ... https://www.vista.gov.vn/news/ket-qua-nghien-cuu-trien-khai/xay-dung-bo-so-lieu-rapd-de-quan-ly-va-tuyen-chon-giong-daudong-lam-co-so-chon-giong-dot-bien-hoa-salem-tai-lam-dong-2633.html 11 /4/ 2021 TS Nguyen... https://www.garvan.org.au/research/kinghorn-centre-for-clinical-genomics/learn-about-genomics/dna-base/collection1/small-variants 121 ĐA DẠNG DI TRUYỀN (GENOMIC VARIANTS) 11 /4/ 2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao 122 61 11 /4/ 2021 ĐA... https://www.garvan.org.au/research/kinghorn-centre-for-clinical-genomics/learn-about-genomics/dna-base/collection1/small-variants 120 60 11 /4/ 2021 ĐA DẠNG DI TRUYỀN (GENOMIC VARIANTS) 11 /4/ 2021 TS Nguyen Ngoc Phuong Thao