Chất lượng XNSHPT • Môi trường XN – XNSHPT là gì? • DNA/RNA/protein? – Môi trường, hóa chất, dụng cụ thí nghiệm, v.v…: sạch, vô trùng • Mục đích, kiến thức xét nghiệm: – Tham khảo tài liệu (ISO?) – Phải qua huấn luyện sử dụng máy móc • Máy móc: – Hiệu năng máy móc – Lập trình chương trình • Các sai lầm trong một XN SHPT – Sai lầm loại 1 là loại sai lầm khi kết quả nghiên cứu cho thấy có sự khác biệt (như giả thuyết đặt ra), nhưng thực tế là không có sự khác biệt. – Sai lầm loại 2 là kết quả nghiên cứu cho thấy không có mối quan hệ giữa các yếu tố, nhưng thực tế thì có.
MỘT SỐ LƯU Ý ĐỂ ĐẢM BẢO VÀ KIỂM TRA CHẤT LƯỢNG XÉT NGHIỆM SINH HỌC PHÂN TỬ Nguyen Le Thanh (MRes) thanhnl@pnt.edu.vn November 2018 BM HS-SHPT YH 1 GIỚI THIỆU CHUNG November 2018 BM HS-SHPT YH Chất lượng XNSHPT • Mơi trường XN – XNSHPT gì? • DNA/RNA/protein? – Mơi trường, hóa chất, dụng cụ thí nghiệm, v.v…: sạch, vơ trùng • Mục đích, kiến thức xét nghiệm: – Tham khảo tài liệu (ISO?) – Phải qua huấn luyện sử dụng máy móc • Máy móc: – Hiệu máy móc – Lập trình chương trình • Các sai lầm XN SHPT – Sai lầm loại loại sai lầm kết nghiên cứu cho thấy có khác biệt (như giả thuyết đặt ra), thực tế khác biệt – Sai lầm loại kết nghiên cứu cho thấy khơng có mối quan hệ yếu tố, thực tế có November 2018 BM HS-SHPT YH Các bước quy trình XN Sample collection (Blood, urine, feaces, tissue, etc.) Sample treatment, record, & storage Analysis (Diagnostic tests) Report & Diagnosis November 2018 BM HS-SHPT YH (1) Thu thập mẫu • Mẫu gì? • Lúc nào? • Trước phát bệnh? • Sau phát bệnh? • Như nào? November 2018 BM HS-SHPT YH (2) Xử lý bảo quản mẫu • Tinh loại bỏ tạp chất • Di chuyển vận chuyển • Chất chống đông? November 2018 BM HS-SHPT YH (3) PP phân tích Bảng 7.1 Một số ví dụ XN SHPT y học lâm sàng Mục đích Ví dụ XN SHPT November 2018 Tầm sốt nguy Kiểm tra dấu hiệu xơ nang Tầm soát Định tính định type HPV Chẩn đốn Tiên lượng Hướng điều trị Phân loại Xác định ung thư vú tình vào Nhiễm trạng phân nhóm đột biến vi sử dụng khuẩn gen (OncoType lao KRAS, Dx hay BRAF, Mamma Her2 Print) BM HS-SHPT YH Theo dõi Định lượng (đo tải lượng) siêu vi viêm gan C (3) PP phân tích • Định tính • PCR • Real-time PCR • Lai PT • Định lượng tuyệt đối • Real-time PCR Đường tiêu chuẩn • Định lượng tương đối • Real-time PCR gen tham chiếu • Nghiên cứu di truyền học • Giải trình tự DNA November 2018 BM HS-SHPT YH (3) PP phân tích • Các đối chứng – Chứng dương gì? – Chứng âm gì? November 2018 BM HS-SHPT YH (3) PP Phân tích: Đối chứng • Nhóm kiểm tra nhóm chứng: – Nhóm kiểm tra: Xem phản ứng có thay đổi – Nhóm chứng: Khơng tạo thay đổi • Chứng dương: – Phản ứng biết trước, chắn xảy có thay đổi • Chứng âm: – Không ứng dụng thay đổi – Để làm gì? • False positive/False negative: Dương giả/Âm giả November 2018 BM HS-SHPT YH 10 November 2018 BM HS-SHPT YH 16 Điện di (+) • • • (-) Chứng dương: thang DNA/RNA (marker/ladder) Chứng âm: nước Để làm gì? November 2018 BM HS-SHPT YH 17 Xét Nghiệm: Chạy điện di PCR 01 mẫu máu để phát trình tự 419kb IS6110 M tuberculosis November 2018 BM HS-SHPT YH 18 Xét Nghiệm: Chạy điện di PCR 01 mẫu máu để phát trình tự 419kb IS6110 M tuberculosis (+) PCR S1 S2 S3 (-) PCR H2O Thang November 2018 BM HS-SHPT YH 19 Trường hợp 1: Khơng có band November 2018 BM HS-SHPT YH 20 Trường hợp 2: Có thang, nước (chứng âm điện di) hoạt động/Khơng có band H2O November 2018 BM HS-SHPT YH 21 Trường hợp (+) November 2018 H2O BM HS-SHPT YH 22 Trường hợp (-) (+) November 2018 BM HS-SHPT YH H2O 23 Trường hợp (-) (+) November 2018 BM HS-SHPT YH H2O 24 Trường hợp (-) (+) November 2018 BM HS-SHPT YH H2O 25 Ý • Hạn chế ngoại nhiễm, nội nhiễm • Hạn chế, kiểm soát, kiểm tra đối chiếu tượng dương giả âm giả November 2018 BM HS-SHPT YH 26 (4) Tổng hợp kết đưa phân tích chẩn đốn • Kỹ thuật phân tích? Cần phải ý gì? • Tham khảo: (a) (b) (c) (d) (e) (f) (g) (h) November 2018 Độ xác thực Độ xác Đường tuyến tính Chất gây cản trở Độ nhạy phân tích Độ đặc hiệu phân tích Giới hạn phát Giới hạn đo BM HS-SHPT YH 27 (4) Tổng hợp kết đưa phân tích chẩn đốn • Xác nhận phân tích có mục tiêu xác định diện hay không nguyên nhân/nguồn gốc (nếu có) cho sai sót kỹ thuật xảy phân tích mẫu bệnh phẩm • Xác nhận lâm sàng có mục tiêu xác định nguồn gốc cho biến thiên sinh học xảy phân tích mẫu bệnh phẩm Quy trình ảnh hưởng đến việc kết XN SHPT có thật có ý nghĩa mặt y học lâm sàng hay không Tải FULL (61 trang): https://bit.ly/3fYLVAX Dự phòng: fb.com/TaiHo123doc.net November 2018 BM HS-SHPT YH 28 (4) Tổng hợp kết đưa phân tích chẩn đốn • Một số sai sót kỹ thuật: – Thiết kế thí nghiệm – Chất lượng mẫu – Chất ức chế – Thiếu sót QLCL (QC – quality control) – Phân tích liệu Tải FULL (61 trang): https://bit.ly/3fYLVAX Dự phòng: fb.com/TaiHo123doc.net November 2018 BM HS-SHPT YH 29 (4) Tổng hợp kết đưa phân tích chẩn đốn • Trong phịng thí nghiệm tới lâm sàng? • Bối cảnh: – Dân cư – Tình trạng bệnh bệnh nhân 6368134 November 2018 BM HS-SHPT YH 30 ... hợp kết đưa phân tích chẩn đốn • Một số sai sót kỹ thuật: – Thiết kế thí nghiệm – Chất lượng mẫu – Chất ức chế – Thiếu sót QLCL (QC – quality control) – Phân tích liệu Tải FULL (61 trang): https://bit.ly/3fYLVAX... HS-SHPT YH (2) Xử lý bảo quản mẫu • Tinh loại bỏ tạp chất • Di chuyển vận chuyển • Chất chống đông? November 2018 BM HS-SHPT YH (3) PP phân tích Bảng 7.1 Một số ví dụ XN SHPT y học lâm sàng Mục... (3) PP Phân tích: Độ nhạy độ đặc hiệu • Độ nhạy? – Độ nhạy xét nghiệm tỷ lệ trường hợp thực có bệnh có kết xét nghiệm dương tính tồn trường hợp có bệnh – Độ nhạy = số dương tính thật/ (số dương