Tài liệu Xử lý kết quả thí nghiệm - Ứng dụng IRRISTAT 4.0 cho Window doc

Xử Lý KếT QUả THí NGHIệM ứng dụng IRRISTAT 4.0 for Windows Analysis Experimental Data Using IRRISTAT 4.0 for Windows Phạm Tiến Dũng Kasetsart University, Thailand, 2001 Thanks! Thank to the help of Thailand Government’s finances in the Faculty Staff and Student Exchaenges Program between Kasetsart University (KU) and Hanoi Agricultural University (HAU), the arrangement of the KU International Programs, HAU International Office, the Individuals such as Professor Doctor Dang Vu Binh, Associate Professor Doctor Chitapa Ketewan, Doctor Tran Duc Vien, Associate Professor Doctor Suwapong Swasdiphanich, Associate Professor Doctor Rangsarid Kaveeta, Mr Choosak Jompuk, Mr. Piya Kittipadakul and others that I had a good chance to study in Thailand and to compose this book. On this occasion I have great thanks to the institutions and individuals mentioned above. Pham Tien Dung Hanoi Agricultural University, Vietnam Cám ơn! Nhờ sự giúp đỡ về tài chính của Chính phủ Thai lan trong khuôn khổ chương trình trao đổi cán bộ và học sinh các khoa giữa Đại học Kaetsart (KU) Thai lan và Đại học Nông nghiệp Hà nội (HAU), Phòng Quan hệ Quốc tế KU, Phòng Quản lý Khoa học và Quan hệ Quốc tế HAU, Giáo sư Tiến sỹ Đặng Vũ Bình, Phó giáo sư, Tiến sỹ Chitapa Ketewan, Tiến sỹ Trần Đức Viên, Phó Giáo sư, Tiến sỹ Suwapong Swasdiphanich, Phó Giáo sư, Tiến sỹ Rangsarid Kaveeta, ông Choosak Jomput, ông Piya Kittipadakul và những người giúp việc khác mà tôi đ• có cơ hội tốt cho nghiên cứu ở Thái lan và biên soạn cuốn sách này. Nhân dịp này tôi xin cảm ơn tất cả các tổ chức và cá nhân trên đ• tạo điều kiện giúp đỡ tôi. Phạm Tiến Dũng Đại học Nông nghiệp I Hà nội Comments Considering about this book, I believe that Doctor Dung had worked very hard to have the book. This is one of the products that Doctor Dung has gained in the period of three months working at Agronomy Department, Kasetsart University in the Faculty Staff and Student Exchange Program Between Kasetsart University and Hanoi Agricultural University. Contents of the book are simple, understandable and very useful to the Agricultural Researchers using for their experimental data analysis. Like in our Department of Agronomy, the book should be put into teaching practice to your agricultural students. I wish you more successful. November 5th, 2001 Associate Professor Doctor Suwapong Swasdiphanich Head of Department of Agronomy Faculty of Agriculture, Kasetsart University, Thailand Contents Nội dung Trang Phần I: Giới thiệu ( Introduction to ) IRISTAT 4.0 I. Các cửa sổ Window 2 II. Menus 6 III. Job Specification Components 13 IV. Ngẫu nhiên hoá và tạo sơ đồ thí nghiệm ( Randomization and Layout ) 18 Phần II. Quản lý file số liệu ( Data and file Management )23 I. Bộ số liệu mẫu ( Sample data set ) 23 II. Tạo file số liệu ( Data creation ) 24 Phần III. Một số mẫu phân tích phương sai ( Some samples of Analysis of variance ) 47 I. Thí nghiệm một nhân tố ( Sigle factor Experiment ) 47 1.1 Mô hình kiểu hoàn toàn ngẫu nhiên 47 ( Completely Randomized Design: CRD) 1.2. Mô hình kiểu khối ngẫu nhiên đầy đủ 52 ( Randomized Complete Block Design, RCB ). 1.3. Thiết kế Ô vuông La tin ( Latin Square Design, LS ) 55 1.4. Thí nghiệm bố trí kiểu Lattice – Lattice cân đối 59 ( Lattice Design - Balanced Lattice ) II. Thí nghiệm hai nhân tố ( Two factors Experiment ) 65 2.1 Thiết kế khối ngẫu nhiên đầy đủ (Factorial experiment ) 65 2.2 Thí nghiệm thiết kế kiểu chia ô lớn, ô nhỏ (Split-plot). 70 2.3 Thí nghiệm kiểu chia băng ( Strip-Plot Design ) 76 III. Thí nghiệm 3 yếu tố bố trí kiểu chia ô lớn, ô vừa, ô nhỏ (Split-split- plot). 82 IV. Phân tích số liệu qua nhiều nơi ( Analysis over Sites ) 91 V. Phân tích số liệu qua nhiều năm ( Analysis over Yeas ) 95 Phần IV. Phân tích hồi qui ( Regreesion Analysis ) 4.1. Hồi qui tuyến tính đơn ( Simple Liner Regreesion ) 100 4.2. Hồi qui bội tuyến tính ( Multiple Liner Regreesion ) 104 Giới thiệu Đây la cuốn sách thực hành để phân tích các kết quả thực nghiệm bằng IRRISTAT 4.0 trong Window. Rất tiện lợi cho người sử dụng vì có hình ảnh minh hoạ các bước cụ thể cho người sử dụng làm theo. Đặc biệt với những người không am hiểu nhiều về máy tính cũng như kiến thức về thống kê cũng có thể sử dụng được. Nội dung cơ bản gồm 2 phần: 1. Giới thiệu khái quát những nội dung và chức năng cơ bản của IRRISTAT 4.0 trong Window. 2. Một số mẫu phân tích phương sai, hồi qui cơ bản thường được sử dụng trong nghiên cứu nông nghiệp như các thí nghiệm 1 nhân tố, nhiều nhân tố theo các kiểu thiết kế khác nhau, thí nghiệm làm nhiều năm, thí nghiệm làm ở nhiều nơi, phân tích hồi qui đường thẳng 1 biến và nhiều biến. Sách này sẽ rất hữu ích cho sinh viên và các nhà nghiên cứu trong lĩnh vực nông nghiệp. INTRODUCTIONS This is a practising book for Analysis experimental data by IRRISTAT 4.0 for Windows. It is very convinience and easy to users because it was written mainly by figures step by step. Expecially, those who do not know well about computer techniques and statistical knowledges can use. The book has two parts: 1. Some genaral introductions of the contents, funtions of IRRISTAT 4.0 for Windows. 2. Some sample models of analysing of variance and regression following different experimental designs that are often used in agricultural research such as: single-factor experiment; two factor experiment; three factor experiment; experiment by sites; experiment by years and regression analysis. This book will be very useful for students and researchers in agricultural fields. References. 1. Biometrics Unit, International Rice Research Institute. IRRISTAT 4.0 Window, Tutorial Manual. 2. KWANCHAI A. GOMEZ, ARTURO A. GOMEZ, 1984. Statistical Procedures for Agricultural Research. Copyright 1984 by John Wiley& Sons, Inc. 3. Choosak Jompuk. 1998. Computer Application in Agronomy Research. Agronomy Department, Faculty of Agriculture, Kasetsart University. 221 p. (in Thai). Phần I Giới thiệu IRRISTAT 4.0 IRRISTAT là một chương trình máy tính để quản lý số liệu và phân tích thống kê cơ bản các số liệu thí nghiệm. Nó có thể chạy trong bất kỳ hệ thống hoạt động nào của Window 32 bít. Để cài đặt chương trình vào máy tính, h•y chạy file SETUP. EXE. trên đĩa cài đặt. Khởi động chương trình, h•y chạy file IRRISTAT.EXE, hoặc nháy biểu tượng đ• được cài đặt. IRRISTAT được biên soạn chủ yếu để phân tích các số liệu thu được từ thí nghiệm đồng ruộng, nhưng có nhiều nội dung có thể sử dụng để phân tích các số liệu từ các nguồn nghiên cứu khác Các mô hình phân tích chính và các chức năng khác bao gồm: 1. Quản lý số liệu bằng spreadsheet 2. Trang ghi kết quả 3. Phân tích phương sai 4. Phân tích hồi qui 5. Phân tích ảnh hưởng của giống và môi trường 6. Phân tích di truyền số lượng 7. Phân tích riêng rẽ nơi nghiên cứu 8. Phân tích mô hình chia nhóm 9. Vẽ đồ thị 10. Ngẫu nhiên hoá sơ đồ thí nghiệm, phương sai của trung bình nhiều nhân tố, và đa thức trực giao. Môi trường làm việc của IRRISTAT Khi kết thúc chương trình, người học phải biết làm quen với các chức năng cơ bản của IRRISTAT như các cửa sổ Window, các danh mục nội dung, Các hợp phần chức năng đặc biệt và các thao tác file. I. Các cửa sổ Window Trong IRRISTAT có 4 cửa sổ chính của Window. A. Cửa sổ window chính (Main window) Cửa sổ chính window của IRRISTAT sẽ cung cấp cho người sử dụng các menu và các thanh công cụ như hình dưới đây; B. Cửa sổ quản lý số liệu (Data Editor) Data editor trình bày số liệu dưới dạng hàng và cột. Mỗi hàng là một trường hợp và mỗi cột là một biến. Bạn có thể ghi số liệu mới vào những chỗ trống trên hàng số liệu hoặc nhập số liệu từ file của trang văn bản hoặc file Excel và file dbase. Bạn có thể mở đồng thời một hoặc nhiều file số liệu. Số file được mở nhiều hay ít phụ thuộc khả năng nhớ của máy tính. Text Editor Trong Text Editor cũng có thể tạo file ASCII . File lệnh và các kết quả phân tích thống kê cũng được tóm tắt trong Text Editor. Graph Window Trong Graph Window cho phép vẽ các loại đồ thị II. Menus Mỗi cửa sổ Window trong IRRISTAT có các menu riêng của nó và có các lựa chọn thích hợp cho cửa sổ đó. A. Main Window Menus Sử dụng menu file để mở file, người ta sử dụng Data Editor hoặc Text Editor ( phụ thuộc vào kiểu file), cũng có thể save the log file, save-as the log file hoặc là in the log file từ đây. Sử dụng menu Edit để cut, copy, past hoặc xoá the Log window Sử dụng menu Analysis để chạy các phân tích thống kê, bao gồm các thống kê mô tả, phân tích phương sai phân tích hồi qui, phân tích GxE của thí nghiệm giống, phân tích quantitative trait loci, phân tích Single site, phân tích Pattern và vẽ scatter. Sử dụng menu Utilities để xây dựng thiết kế thí nghiệm, tạo các thí nghiệm tổng quát có trung bình bình phương và các hệ số tương phản đa thức trực giao. Sử dụng menu Window để thay đổi các cửa Window khác nhau trong IRRISTAT hoặc sắp xếp lại các trình bày của Window. Sử dụng menu Help để tìm hệ thống trợ giúp của IRRISTAT B. Data Editor Menus Sử dụng menu File để xây dựng, cất giữ, mở lại, và in file số liệu; để nhập số liệu từ Excel Workbook, từ Text file, và Dbase file; và đưa số liệu từ file có đuôi SYS sang Excel hoặc Text file. Sử dụng menu Edit để cut, copy, và dán các giá trị trong datasheet. Sử dụng Options để sửa chữa các đề mục, chuyển đổi số liệu, xếp hạng, tạo các mục, thêm, bớt, nhập số liệu, xoá biến và đặt độ chính xác riêng cho số liệu. [...]... Low N-rate SCU 4: Low N-rate USG 5: Low N-rate USG/urea 6: High N-rate Urea 7: High N-rate SCU 8: High N-rate USG 9: High N-rate USG/urea Số liệu đựơc thể hiện như sau: Tạo file số liệu Bước đầu tiên phân tích số liệu trong IRRISTAT là chuyển đổi số liệu vào file có đuôI SYS bằng Data Editor Có thể lấy file số liệu từ file trong ASCII, excel, dbase hoặc vào số liệu trực tiếp cho Data Editor Data Editor...Sử dụng Tools để sắp xếp trật tự số liệu, chuyển đổi d•y số liệu song song hoặc ngược lại Sử dụng menu Window để sắp xếp lại một hoặc nhiều cửa Window khác Sử dụng menu Help để tìm kiếm hệ thống trợ giúp của IRRISTAT C Text Editor Menus Sử dụng menu File để tạo, mở, in và cất gĩư text file , để tóm tắt các kết quả thống kê và ra lệnh Sử dụng Edit để sửa chữa file văn bản Sử dụng menu Format... = 4 Trea (unadj) K2 - 1=15 Block (adj) K2 - 1=15 Intrablock error ( k-1)(K2 - 1)=45 Mean squareF Trea.(adj) [K2 -1 =15] Effective error [( k-1)(K2 - 1)=45] Total K2( k+1) – 1=79 • Vào số liệu bảng trên trong IRRISTAT, kết quả ghi lạI trong File có đuôi sys được thể hiện dưới dạng sau: • Các bước phân tích trên IRRISTAT như sau: Làm tương tự như trường hợp bố trí kiểu Ô vuông Latin cho đến khi có hình... File Window 6 Kích vào OK để nhập số liệu • Free format text file Chuẩn bị tài liệu Rất tiện khi đưa headings vào việc mô tả thí nghiệm, thiết kế thí nghiệm và các thông tin khác về tàI liệu trên text file Heading có thể được đặt ởmột hoặc nhiều hàng, ở trên, dưới hoặc dọc theo lề hàng Biến có thể được đặt trong một hoặc nhiều hàng kề liền , nhưng phảI có một hàng cách giữa heading và số liệu Số liệu. .. chứa thiết kế và các số liệu thích ứng Phần thứ nhất của file ASC cho một thí nghiệm cụ thể cần có tất cả các chi tiết cho phần tính kết quả bao gồm các nội dung sau: 1 Tên thí nghiệm 2 Người nghiên cứu 3 Mô tả thiết kế cơ bản đ• dùng 4 Chi tiết điểm nghiên cứu: tên, bản đồ hướng dẫn, ngày trồng, lượng mưa, mô tả đất, ngày thu hoạch, 5 Liệt kê các công thức và phương pháp áp dụng 6 Những mất mát hoặc... nghiệm Sau khi học, người sử dụng cần biết cách ngẫu nhiên hoá và tạo một sơ đồ thí nghiệm theo một thiết kế nhất định Ví dụ mẫu Tạo một sơ đồ thí nghiệm theo thiết kế sau: Tên thí nghiệm: ảnh hưởng của tỷ lệ và nguồn đạm đến sản lượng lúa của 9 công thức bón phân và 3 lần nhắc lạI trong thiết kế khối hoàn toàn ngẫu nhiên (RCB) Phân chia các ô thí nghiệm như sau: 72 m chiều doc (A) mx4m Kích thước ô:... được đặt đến 0 Bạn phải đặt các hàng mô tả, tên biến và số liệu Số hàng được đặt ở phía trái của Preview Bạn có thể thấy phần mô tả bắt đầu từ dòng1 và kết thúc ở dòng 6, tên biến bắt đầu ở dòng 7 và kết thúc ở dòng 7, số liệu bắt đầu từ dòng 8 Số 0 tại cuối hàng của số liệu nghĩa là chương trình sẽ đọc tất cả số liệu - Kích OK để nhập tài liệu - Để nhập file dbase, các bước giống như nhập từ Excel E... của bảng Một chỉ tiêu đáng quan tâm nữa trong phân tích phương sai là xem sai số thí nghiệm bằng bao nhiêu, thí nghiệm có chính xác không H•y nhìn vào dòng cuối cùng, cột số 5 thấy số 15,1 đây chính là sai số thí nghiệm CV %, trên cơ sở con số này mà chấp nhận thí nghiệm có chính xác không tuỳ thuộc tính chất từng thí nghiệm (thường trong nông nghiệp có thể chấp nhận CV% đến 15%) 1.2 Thiết kế kiểu... liệu trực tiếp từ Data Editor Nhập số liệu từ text file, print file, excel file, và dbase file Tạo biến mới bằng cách sử dụng các phép tính số học, các hàm số, các tính toán khác Tạo biến mới từ các biến đ• có hoặc các giá trị thiếu Đưa số liệu từ file có đuôI SYS sang excel hoặc text file Bộ số liệu mẫu Một thí nghiệm phân bón được làm với 6 công thức sau: 1: Đối chứng 2: Low N-rate urea 3: Low N-rate... đồ thí nghiệm (Experimental lay out) Ngẫu nhiên hoá và sơ đồ (RANDOMIZATION AND LAYOUT) ==================================================== ================== Experimental layout for file: "C:\PROGRAM FILES \IRRISTAT\ TUTORIAL\ISDESIGN.RND" (RANDOMIZED COMPLETE BLOCK) The following field layout applies to all replications: (Note: layout is not drawn to scale) + -+ -+ -+ | 1| 2| 3| + -+ -+ -+ | . Xử Lý KếT QUả THí NGHIệM ứng dụng IRRISTAT 4. 0 for Windows Analysis Experimental Data Using IRRISTAT 4. 0 for Windows Phạm Tiến Dũng . tích các kết quả thực nghiệm bằng IRRISTAT 4. 0 trong Window. Rất tiện lợi cho người sử dụng vì có hình ảnh minh hoạ các bước cụ thể cho người sử dụng làm