Xác định chỉ thị phân tử liên kết với gen kháng bệnh xanh lùn ở cây bông cỏ

         2013       Chuyên ngành C  : 62 62 01 11      2013 i   án l   . 3 3   ii            Ban       -     Trung Tâm Tài nguyên    , Ban      3 3   iii   i  ii M iii  vi  vii  ix  1 1  1 2  3 3  3 4 n án 4 5  4   5 1.1  5 1.1.1 Gossypium L.) 5 1.1.2 bông 7 1.1.3               13 1.1.4  19 1.2  20 1.2.1  20 1.2.2  23 1.2.3 Nguyên nhân  25 1.2.4  29 iv 1.2.5  31 1.3  Gossypium L.) 33 1.3.1  33 1.3.2  39 1.3.3             41 1.4   45 CH 47 2.1  47 2.2  49 2.3  50 2.3.1  50 2.3.2  50 2.4  51 2.4.1 bông  51 2.4.2  55 2.4.3   56 2.4.4           và xác  2 58  62 3.1  62 3.1.1   62 v 3.1.2             65 3.1.3   68 3.2   79 3.2.1  79 3.2.2   1 , F 2 , BC 1 F 1 80 3.3  87 3.3.1              87 3.3.2    2 91 3.3.3  97 3.4   104 3.4.1  104 3.4.2          1 F 1 108  114 1  114 2  114 D 116 T 117 P 138 vi  ADN Acid Deoxyribo Nucleic Axít Deoxyribonucleic ARN Acid Ribonucleic Axít ribonucleic AFLP Amplified Fragment Length Polymorphism   A,C,G,T Adenine, Cytosine, Guanine, Thyamine BSA Bulked Segregant Analysis Phân tích phân ly nhóm bp Base pair  CAPS Cleaved Amplified Polymorphic Sequences    cM Centimorgan  CRM Comprehensive reference map  cs.  CTAB EST ISSR Cetyltrimethylammonium bromide Expressed Sequence Tag Inter-Simple Sequence Repeat    H Observerd Heterogeneity  MAS Marker Assisted Selection  NBS-LRR Nucleotide binding site  leucine rich repeat  nucleotit   LG Linkage group  RIL Recombinant inbred lines  PIC Polymorphism Information Content en PCR Polymerase chain reaction  QTLs Quantitative trait loci  RAPD Randomly amplified polymorphic DNA  RFLP Restriction fragment length polymorphisms   RGAs Resistance gene analog Nh SFR Super Fine Resolution  SSRs Simple sequence repeats  SNP Single nucleotide polymorphisms  nucleotit vii  TT  Trang 2.1  47 2.2  51 2.3  51 2.4  52 2.5 Thàn 53 2.6  55 2.7  57 3.1   63 3.2              67 3.3  69 3.4  (1978) 75 3.5   78 3.6  80 3.7   82 3.8   84 3.9        B10 và dòng KXL002 89 3.10  97 viii 3.11    1 F 1 (B10xKXL002)xB10 110 3.12  Kxl trên  1 F 1 (B10xKXL002)xB10 112 3.13  Kxl trên  1 F 1 (KXL002xB10)xB10 112 [...]... thiết lập bản đồ gen kháng và xác định chỉ thị gen kháng bệnh xanh lùn ở cây bông cỏ Nghệ n là một kết quả mới trong l nh vực nghiên cứu hệ gen cây bông nói chung và di truyền tính kháng bệnh xanh lùn nói riêng ở giống bông cỏ iệc xác định di truyền tính kháng bệnh và các chỉ thị phân tử R liên kết với gen kháng bệnh xanh lùn ở giống bông cỏ Nghệ n không chỉ nhằm xác định nguồn gen mà còn mở ra khả năng... giống bông kháng bệnh xanh lùn ở nước ta 3 Mụ ê ủa đ ề tài “ ác định ch thị phân tử liên kết g n kháng bệnh xanh lùn cây bông cỏ" được chúng tôi thực hiện nhằm tìm hiểu cơ sở di truyền tính kháng bệnh xanh lùn ở cây bông ở mức phân tử, cung cấp cơ sở khoa học cho công tác chọn t o giống kháng bệnh nhờ sự trợ giúp của chỉ thị phân tử, góp phần tăng hiệu quả của công tác phòng trừ bệnh trong sản xuất bông. .. chỉ thị phân tử - ở cây R ây là công trình đầu tiên ở nước ta xác định được vị trí gen kháng bệnh xanh lùn trên bản đồ di truyền ở dòng bông cỏ địa phương XL00 có nguồn gốc thu thập t i Nghệ n - ây cũng là công trình đầu tiên xác định được các chỉ thị với gen kháng bệnh xanh lùn trên cây bông cỏ, trong đó có R liên kết chỉ thị liên kết ở hai phía của gen kháng có thể sử dụng trong chọn t o giống kháng. .. bông ở nước ta Những mục tiêu cụ thể của đề tài như sau: - Xác định được di truyền tính kháng bệnh xanh lùn ở cây bông cỏ 4 - Xác định được chỉ thị phân tử R liên kết với gen kháng bệnh xanh lùn ở cây bông cỏ 4 Nhữ g đó g góp mớ ủa l ậ á - Lần đầu tiên ở iệt Nam, đề tài đã thiết lập được bản đồ di truyền gồm 14 nhóm liên kết tương ứng với 1 nhi m sắc thể trên hệ gen bông cỏ Châu Á G arboreum dựa trên chỉ. .. hiện đề tài 2.2 uy trình xác định nhóm liên kết genome và khoảng cách di truyền giữa các chỉ thị 2.3 R 50 59 uy trình xác định vị trí gen kháng trên bản đồ nhi m sắc thể và các chỉ thị liên kết với gen kháng 2.4 3.1 3.2 3.3 60 Quy trình kiểm tra sự có m t của gen kháng ở các cá thể BC1F1 61 nh rệp bông gây h i trên cây bông luồi D16-2 Thí nghiệm đánh giá bệnh của các dòng/giống bông trong nhà lưới ,T... vị trí chỉ thị liên kết L 6, L R BNL 101 59 và BNL 569 trên các nhóm 7 với bản đồ liên kết trên hệ gen của a và cs (2008) 3.22 ị trí gen kháng bệnh trên nhi m sắc thể số 10 được xác định với các chỉ thị 3.23 103 R liên kết hân tích kiểu gen một số cá thể của quần thể BC 1F1 với chỉ thị NAU1169 trên gel agarose SFR 3,5% 3.24 106 109 hân tích kiểu gen một số cá thể của quần thể BC1F1 với chỉ thị BNL3646... ) 96 3.18 So sánh vị trí chỉ thị R trên các nhóm liên kết 1 a, b với bản đồ liên kết trên hệ gen 3.17 (G.arboreum) của o sánh vị trí chỉ thị a ( 008) [11 ] R trên các nhóm liên kết L 98 với bản đồ liên kết trên hệ gen 3.19 o sánh vị trí chỉ thị 99 R trên các nhóm liên kết L 6, LGA11 với bản đồ liên kết trên hệ gen 3.20 100 nh điện di sản phẩm CR của các mồi BNL 59, BNL405 với các cá thể của quần thể... nhờ chỉ thị phân tử (Rahman và cs., 2008; Zhang và cs., 2008) Tuy nhiên, đối với bệnh xanh lùn ở bông, cho đến nay vẫn còn rất ít các công trình nghiên cứu về di truyền tính kháng bệnh, cũng như lập bản đồ phân tử gen kháng phục vụ cho công tác chọn t o giống bông vải kháng bệnh c dù đa phần các giống bông đang được trồng lấy sợi trên thế giới là bông tứ bội, nhưng trong các ngân hàng gen cây bông, bông. .. nhanh chóng của công nghệ chỉ thị phân tử, nhiều locut gen kháng sâu, bệnh, chống chịu với các điều kiện bất lợi của môi trường và các locut quy định tính tr ng về năng suất, chất lượng đã được định vị trên bản đồ genome của cây bông vải (Gossypium L.) Trong số các chỉ thị phân tử, chỉ thị số lượng R là một thế hệ chỉ thị mới, thân thiện với người sử dụng và R có m t trong hệ gen bông đủ lớn để sử dụng... 1.2.1 Bệnh xanh lùn hại bông và lịch s phát hiện Trong các lo i bệnh h i bông, bệnh xanh lùn (cotton blue disease CBD) là lo i bệnh gây h i quan trọng ở cây bông vải Bệnh này có rất nhiều tên gọi khác nhau ở các quốc gia phát hiện ra nó như bệnh xanh lá, bệnh cuốn lá, bệnh khảm, bệnh khảm gân Tuy nhiều tên gọi, nhưng triệu chứng mô tả bệnh t i các vùng đều thống nhất Bệnh xanh lùn tuy không phổ biến . Câ 1.1.1 Ngun gc, xut x và phân loi ngun gen bông (Gossypium L.)   . (Chen và cs., 2007). 1.1.2 ng v c, thành phn và trình t genome cây bông 