Đồ án tốt nghiệp: Phân lập và định danh vùng gen ITS của nấm men nhiễm bệnh trên da chó nuôi tại TP. Hồ Chí Minh

do an.pdf

MỤC LỤC
DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT
DANH MỤC CÁC BẢNG VÀ HÌNH ẢNH
MỞ ĐẦU
CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU
- 1.1. Tình hình nuôi chó
  - 1.1.1. Thống kê về số lượng chó trên thế giới
  - 1.1.2. Tình hình nuôi chó ở Việt Nam
- 1.2. Tổng quan về bệnh ngoài da
  - 1.2.1. Bệnh ngoài da trên chó
  - 1.2.2. Bệnh ngoài da của người
- 1.3. Các tác nhân gây bệnh
  - 1.3.1. Vi khuẩn
    - 1.3.1.1. Một số nhóm vi khuẩn gây bệnh ngoài da thường gặp
    - 1.3.1.2. Các biểu hiện do nhóm vi khuẩn gây ra
    - 1.3.1.3. Khả năng lây lan sang người
  - 1.3.2. Nấm men
    - 1.3.2.1. Các loài nấm men thường gây bệnh trên da chó
    - 1.3.2.2. Các biểu hiện bệnh do nhóm nấm men gây ra
    - 1.3.2.3. Khả năng lây lan sang người
  - 1.3.3. Nấm sợi
    - 1.3.3.1. Một số nhóm nấm mốc gây bệnh thường gặp.
    - 1.3.3.2. Bệnh và các biểu hiện bệnh do các nhóm nấm mốc gây ra
- 1.4. Tổng quan về nấm men
  - 1.4.1. Hình thái của tế bào nấm men
  - 1.4.2. Dinh dưỡng và sinh trưởng của nấm men
  - 1.4.3. Sinh sản của nấm men
  - 1.4.4. Nấm men gây bệnh
- 1.5. Những nghiên cứu trên thế giới về nấm men gây bệnh
- 1.6. Định danh nấm men
  - 1.6.1. Định danh nấm men bằng phương pháp truyền thống
    - 1.6.1.1. Quan sát các đặc điểm hình thái
    - 1.6.1.2. Khảo sát các đặc tính sinh lí, sinh thái
  - 1.6.2. Định danh nấm men bằng sinh học phân tử
    - 1.6.2.1 Đoạn gen rDNA
    - 1.6.2.2. Nhân gen và Kỹ thuật giải trình tự trong định danh loài
CHƯƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP
- 2.1. Vật liệu và thiết bị
  - 2.1.1. Dụng cụ
  - 2.1.2. Thiết bị
  - 2.1.3. Vật liệu
    - 2.1.3.1. Nguồn phân lập
    - 2.1.3.2. Hóa chất
- 2.2. Phương pháp nghiên cứu
  - 2.2.1. Phân lập nấm men gây bệnh
  - 2.2.2. Quan sát hình thái nấm men
    - 2.2.2.1. Quan sát tế bào nấm men
    - 2.2.2.2. Quan sát khuẩn ty thật khuẩn ty giả
  - 2.2.3. Sử dụng sinh học phân tử định danh nấm men
    - 2.2.3.1. Tách chiết DNA
    - 2.2.3.2. Điện di
    - 2.2.3.3. Phản ứng PCR (Polymerase Chain Reaction)
    - 2.2.3.4. Giải trình tự và định danh mẫu nấm men
CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN
- 3.1. Kết quả hình thái học nấm men
  - 3.1.1 Kết quả khuẩn lạc
  - 3.1.2. Kết quả hình ảnh tế bào sinh dưỡng
  - 3.1.3. Kết quả quan sát tế bào sinh sản
  - 3.1.4. Kết quả quan sát khuẩn ty
- 3.2. Kết quả li trích, thu nhận và nhân bản đoạn gen ITS rDNA của nấm men
  - 3.2.1. Kết quả ly trích và thu nhận bộ gen của nấm men
  - 3.2.2. Kết quả nhân bản đoạn gen bảo tồn ITS rDNA của nấm men
- 3.3. Kết quả so sánh vùng gen bảo tồn ITS rDNA của nấm men trên ngân hàng gen NCBI và thiết lập cây phân loài
  - 3.3.1. Kết quả Giải trình tự vùng gen ITS rDNA của 4 mẫu nấm men
  - 3.3.2. Kết quả so sánh trình tự ITS rDNA trên ngân hàng gen NCBI và xây dựng cây phân loài
- 4.1. Kết luận
- 4.2. Đề nghị
Tài liệu tham khảo

phuluc.pdf

A. Hình ảnh các trang thiết bị phục vụ nghiên cứu
B. Kết quả so sánh trình tự ITS rDNA của 4 mẫu nấm men với ngân hàng gen NCBI
- Kết quả so sánh M9-5 với Trichosporon asahii trên trình tự đoạn gen ITS 5.8S rDNA.
- Kết quả so sánh M11-1 với Meyerozyma guilliermondii KAML05 trên trình tự đoạn gen ITS 5.8S rDNA.
- Kết quả so sánh M23-2 với Pichia guilliermondii WM 02.91trên trình tự đoạn gen ITS 5.8S rDNA.