1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Xây dựng quy trình định lượng nồng độ BKV-DNA bằng kỹ thuật real-time PCR và phân tích đặc điểm di truyền phân tử của virus BK ở bệnh nhân ghép thận

99 24 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Cấu trúc

  • LÊ THỊ BẢO QUYÊN

  • XÂY DỰNG QUY TRÌNH ĐỊNH LƯỢNG NỒNG ĐỘ

  • BKV-DNA BẰNG KỸ THUẬT REAL-TIME PCR VÀ PHÂN TÍCH ĐẶC ĐIỂM DI TRUYỀN PHÂN TỬ

  • CỦA VIRUS BK Ở BỆNH NHÂN GHÉP THẬN

  • LÊ THỊ BẢO QUYÊN

  • XÂY DỰNG QUY TRÌNH ĐỊNH LƯỢNG NỒNG ĐỘ BKV-DNA BẰNG KỸ THUẬT REAL-TIME PCR VÀ PHÂN TÍCH ĐẶC ĐIỂM DI TRUYỀN PHÂN TỬ

  • CỦA VIRUS BK Ở BỆNH NHÂN GHÉP THẬN

    • Cán bộ hướng dẫn: TS. Hoàng Xuân Sử

    • TS. Mai Thị Đàm Linh

  • MỞ ĐẦU

  • Chương 1

  • TỔNG QUAN TÀI LIỆU

    • 1.1. Dịch tễ học

    • 1.2. Tổng quan về BKV

      • 1.2.1. Lịch sử phát hiện BKV

      • 1.2.2. Đặc điểm sinh học

    • 1.3. Mối quan hệ giữa BKV và bệnh lý ghép thận

      • 1.3.1. Mối tương quan giữa nồng độ BKV-DNA và bệnh lý ghép thận

      • 1.3.2. Độc lực kiểu gen BKV và bệnh lý ghép thận

    • 1.4. Các phương pháp xét nghiệm chẩn đoán BKV

      • 1.4.1. Tế bào học

    • Việc chẩn đoán sớm BKVN sau ghép thận ban đầu còn gặp nhiều khó khăn và thách thức do triệu chứng lâm sàng không đặc hiệu, nhiều trường hợp có thể nhầm với giai đoạn thải ghép cấp khi sử dụng các thuốc ức chế miễn dịch chống thải ghép.

      • 1.4.2. Sinh thiết thận

      • 1.4.3. Chẩn đoán sinh học phân tử

    • 1.5. Tình hình nghiên cứu BKV

      • 1.5.1. Tình hình nghiên cứu phát triển kit

      • 1.5.2. Tình hình nghiên cứu hiện trạng nhiễm BKV

    • 1.6. Phương pháp xây dựng cây chủng loại phát sinh

      • 1.6.1. Định nghĩa

      • 1.6.2. Đặc điểm của các phương pháp xây dựng cây chủng loại

      • 1.6.3. Ứng dụng cây chủng loại phát sinh trong xác định genotype BKV

  • Chương 2

  • VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

    • 2.1. Nguyên liệu

      • 2.1.1. Mẫu nghiên cứu

      • 2.1.2. Các vật liệu

      • 2.1.3. Hóa chất

    • 2.2. Thiết bị chính

    • 2.3. Phương pháp nghiên cứu

      • 2.3.1. Sơ đồ nghiên cứu

      • 2.3.2. Xây dựng quy trình định lượng nồng độ BKV-DNA bằng kỹ thuật real-time PCR

        • 2.3.2.1. Tách chiết DNA tổng số

        • 2.3.2.2. Phương pháp PCR

        • 2.3.2.3. Tinh sạch PCR

        • 2.3.2.4. Phương pháp điện di

        • 2.3.2.5. Tách dòng gen

        • 2.3.2.6. Thiết lập bộ mẫu chuẩn DNA

        • 2.3.2.7. Tối ưu hóa kỹ thuật real-time PCR

        • 2.3.2.8. Đánh giá kỹ thuật real-time PCR

        • 2.3.2.9. Xác định vai trò BKV-DNA với bệnh thận do BKV

      • 2.3.3. Phân tích đặc điểm di truyền BKV ở bệnh nhân ghép thận

        • 2.3.3.2. Phân tích đa hình đơn nucleotide (SNP: Single Nucleotide Polymorphism)

  • Chương 3

  • KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN

    • 3.1. Xây dựng quy trình định lượng BKV-DNA bằng real-time PCR

      • 3.1.1. Tách dòng vùng gen VP1

      • 3.1.2. Thiết lập bộ mẫu chuẩn

      • 3.1.3. Thiết kế mồi và probe cho real-time PCR

      • 3.1.4. Tối ưu kỹ thuật real-time PCR

      • 3.1.5. Đánh giá kỹ thuật real-time PCR

      • 3.1.6. Quy trình xác định tải lượng virus BK trong máu và nước tiểu ở bệnh nhân ghép thận

    • 3.2. Xác định vai trò BKV-DNA với bệnh thận do BKV

      • 3.2.1. Xác định tỷ lệ lưu hành BKV ở bệnh nhân ghép thận bằng kỹ thuật real-time PCR

      • 3.2.2. Xác định giá trị ngưỡng BKV-DNA dự đoán BKVN

      • 3.2.3. Đánh giá vai trò BKV-DNA với các yếu tố lâm sàng

    • 3.3. Phân tích đặc điểm di truyền phân tử BKV

      • 3.3.1. Xác định kiểu gen BKV lưu hành tại Việt Nam

      • 3.3.2. Phân tích các vị trí SNP-BKV trên vùng gen VP1 ở bệnh nhân ghép thận

      • 3.3.3. Đánh giá vai trò của kiểu gen BKV với bệnh thận do BKV

  • KẾT LUẬN

  • KIẾN NGHỊ

  • TÀI LIỆU THAM KHẢO

Nội dung

Luận văn được thực hiện với mục tiêu nhằm xây dựng quy trình xác định tải lượng BK virus trong máu và nước tiểu của bệnh nhân ghép thận bằng kỹ thuật real-time PCR. Xác định tỷ lệ lưu hành và kiểu gen BKV, kết hợp phân tích các đặc điểm di truyền phân tử của BKV ở những bệnh nhân ghép thận tại Việt Nam. Mời các bạn cùng tham khảo.

Ngày đăng: 15/07/2021, 11:27

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN