Đang tải... (xem toàn văn)
Thông tin tài liệu
Ngày đăng: 03/07/2021, 10:22
Xem thêm:
Từ khóa liên quan
Mục lục
DANH MỤC CÁC BẢNG
DANH MỤC CÁC HÌNH
CÁC KÝ HIỆU VIẾT TẮT TRONG LUẬN ÁN
CHƯƠNG 2: CƠ SỞ Ý THUYẾT VÀ PHƯƠNG PHÁP TÍNH
2.1. MÔ PHỎNG ĐỘNG ỰC CƠ HỌC PHÂN TỬ (MM/MD)5-9
2.1.1. Mẫu cơ học phân tử (MM)
2.1.2 Phương pháp động lực phân tử MD
2.2.2. Cơ sở của các phương pháp tính gần đúng lượng tử
2.3. PHƯƠNG PHÁP QM/MM (HYBRID QUANTUM MECHANICS/MOLECULAR MECHANICS)11,12,15,22,25,40
2.3.1. Phương pháp lai hóa QM/MM trong ONIOM
CHƯƠNG 3: CHUẨN BỊ INPUT VÀ CÁC ĐIỀU KIỆN NGHIÊN CỨU CHO HỆ CỤ THỂ
3.1. ĐIỀU KIỆN TÍNH VỚI PHƯƠNG PHÁP MM/MD
3.1.1. Nghiên cứu đặc điểm của tâm hoạt động và khe hẹp g n tâm hoạt động SER403 của PBP2a
3.1.2. Nghiên cứu tính linh động của protein và phối tử
3.1.3. Tính năng lượng tự do gắn kết của methicillin và nitrocefin lên các cấu trúc khác nhau của protein PBP2a*
3.2. ĐIỀU KIỆN TÍNH VỚI PHƯƠNG PHÁP QM/MM (ONIOM)
3.2.1. Các mô hình tâm hoạt hóa
3.2.2. Các mô hình enzym
CHƯƠNG 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.1. KẾT QUẢ TÍNH MM/MD
Tài liệu cùng người dùng
Tài liệu liên quan