Tỷ lệ và yếu tố nguy cơ sinh gien carbapenemase ở vi khuẩn gram âm kháng carbapenem trên bệnh nhân h i sức cấp cứu

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC BỘ Y TẾ DƢ C THÀNH PH H CH MINH - TRANG H NG THÙ DƢƠNG TỶ LỆ VÀ YẾU T NGU CƠ SINH GIEN CARBAPENEMASE Ở VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM TRÊN BỆNH NHÂN H I SỨC CẤP CỨU LUẬN VĂN CHU ÊN KHOA CẤP II THÀNH PH H CHÍ MINH – NĂM 2020 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC BỘ Y TẾ DƢ C THÀNH PH H CH MINH - TRANG H NG THÙ DƢƠNG TỶ LỆ VÀ YẾU T NGU CƠ SINH GIEN CARBAPENEMASE Ở VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM TRÊN BỆNH NHÂN H I SỨC CẤP CỨU CHUYÊN NGÀNH: HỒI SỨC CẤP CỨU MÃ SỐ: CK 62 72 31 01 LUẬN VĂN CHU ÊN KHOA CẤP II NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC TS.BS HOÀNG LAN PHƢƠNG THÀNH PH H CHÍ MINH – NĂM 2020 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu, kết luận văn trung thực chƣa đƣợc cơng bố cơng trình khác Trang Hồng Thùy Dƣơng MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN MỤC LỤC DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT DANH MỤC CÁC BẢNG DANH MỤC CÁC HÌNH DANH MỤC CÁC SƠ ĐỒ ĐẶT VẤN ĐỀ MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU .4 CHƢƠNG I: TỔNG QUAN TÀI LIỆU .5 1.1 VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM 1.1.1 Vi khuẩn Gram âm .5 1.1.2 Kháng sinh carbapenem .6 1.1.3 Cơ chế đề kháng kháng sinh nhóm carbapenem vi khuẩn Gram âm 1.2 CƠ CHẾ ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH BẰNG CÁCH SINH GIEN CARBAPENEMASE 1.2.1 Phân loại theo chức 1.2.2 Phân loại theo cấu trúc phân tử 10 1.2.3 Carbapenemase 10 1.3 YẾU TỐ NGUY CƠ SINH GIEN CARBAPENEMASE TRÊN VI KHUẨN GRAM ÂM 15 1.4 KỸ THUẬT PHÁT HIỆN VI KHUẨN GRAM ÂM SINH GIEN CARBAPENEMASE 16 1.4.1 Phƣơng pháp phát carbapenemase dựa kiểu hình .17 1.4.2 Phƣơng pháp phát carbapenemase dựa kiểu gien: 19 1.5 THÁCH THỨC ĐIỀU TRỊ VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM21 1.6 YẾU TỐ ẢNH HƢỞNG ĐẾN TỬ VONG TRÊN BỆNH NHÂN NHIỄM VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM 24 1.7 MỘT SỐ NGHIÊN CỨU TRONG VÀ NGOÀI NƢỚC VỀ TỶ LỆ ĐỀ KHÁNG CARBAPENEM VÀ SINH GIEN CARBAPENEMASE 25 CHƢƠNG II: ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .28 2.1 ĐỐI TƢỢNG NGHIÊN CỨU 28 2.1.1 Thời gian địa điểm tiến hành nghiên cứu 28 2.1.2 Tiêu chuẩn chọn bệnh 28 2.1.3 Tiêu chuẩn loại trừ 28 2.2 PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 28 2.2.1 Thiết kế nghiên cứu 28 2.2.2 Cỡ mẫu .28 2.2.3 Tiến hành nghiên cứu .29 2.2.4 Định nghĩa biến số 35 2.2.5 Xử lý số liệu .38 2.2.6 Vấn đề y đức 39 CHƢƠNG III: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU .41 3.1 ĐẶC ĐIỂM CHUNG CỦA DÂN SỐ NGHIÊN CỨU 41 3.1.1 Giới tính 41 3.1.2 Tuổi 41 3.1.3 Chỉ số khối thể 42 3.1.4 Bệnh 42 3.1.5 Điểm Charlson 43 3.1.6 Độ nặng bệnh .43 3.1.7 Tiền nằm viện tháng trƣớc, tiền suy giảm miễn dịch 44 3.1.8 Nơi chuyển đến 44 3.1.9 Xử trí tuyến trƣớc .45 3.1.10 Khoa chuyển đến 45 3.1.11 Điều trị khoa Hồi sức 46 3.1.12 Kết cục điều trị .46 3.2 TỶ LỆ SINH GIEN CARBAPENEMASE Ở VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM 47 3.2.1 Mẫu bệnh phẩm 47 3.2.2 Vi khuẩn phân lập 48 3.2.3 Thời gian phát vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem từ nhập viện 48 3.2.4 Tỷ lệ sinh gien carbapenemase nhóm vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem .48 3.2.5 Tỷ lệ sinh gien carbapenemase Acinetobacter baumannii 49 3.2.6 Tỷ lệ sinh gien carbapenemase Klebsiella pneumoniae 49 3.2.7 Tỷ lệ sinh gien carbapenemase Pseudomonas aeruginosa .50 3.3 CÁC YẾU TỐ NGUY CƠ ẢNH HƢỞNG ĐẾN KHẢ NĂNG SINH GIEN CARBAPENEMASE 51 3.3.1 Đặc điểm dân số nhóm sinh gien khơng sinh gien carbapenemase 51 3.3.2 Kết cục điều trị nhóm sinh gien khơng sinh gien carbapenemase 53 3.3.3 Hồi quy logistic đơn biến yếu tố ảnh hƣởng đến khả sinh gien carbapenemase 53 3.3.4 Hồi quy logistic đa biến yếu tố ảnh hƣởng đến khả sinh gien carbapenemase 55 3.4 MỨC ĐỘ NHẠY CẢM VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM VỚI CÁC KHÁNG SINH KHÁC NGỒI NHĨM CARBAPENEM 56 3.4.1 Mức độ nhạy cảm kháng sinh A baumannii kháng carbapenem 56 3.4.2 Mức độ nhạy cảm kháng sinh K pneumoniae kháng carbapenem 57 3.4.3 Mức độ nhạy cảm kháng sinh P aeruginosa kháng carbapenem .58 3.4.4 Kháng sinh sử dụng trƣớc sau có kết vi sinh 58 3.4.5 Mối liên quan gien carbapenemase đề kháng kháng sinh 60 3.5 CÁC YẾU TỐ ẢNH HƢỞNG ĐẾN TỬ VONG CỦA VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM 61 3.5.1 Đặc điểm dân số nhóm tử vong nhóm sống 61 3.5.2 Đặc điểm vi sinh nhóm sống tử vong 62 3.5.3 Hồi quy logistic đơn biến yếu tố ảnh hƣởng đến tử vong 64 3.5.4 Hồi quy đa biến yếu tố ảnh hƣởng đến tử vong .65 CHƢƠNG IV: BÀN LUẬN .68 4.1 ĐẶC ĐIỂM CHUNG CỦA NHÓM NGHIÊN CỨU 68 4.1.1 Giới 68 4.1.2 Tuổi 69 4.1.3 Chỉ số khối thể 69 4.1.4 Bệnh 70 4.1.5 Điểm Charlson 70 4.1.6 Độ nặng bệnh thời điểm nhập khoa 70 4.1.7 Tiền nằm viện tháng trƣớc, tiền suy giảm miễn dịch 71 4.1.8 Nơi chuyển đến 72 4.1.9 Xử trí tuyến trƣớc 72 4.1.10 Khoa chuyển đến 72 4.1.11 Điều trị khoa Hồi sức 72 4.1.12 Kết cục điều trị .73 4.2 TỶ LỆ SINH GIEN CARBAPENEMASE Ở VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM 74 4.2.1 Mẫu bệnh phẩm 74 4.2.2 Vi khuẩn phân lập 75 4.2.3 Thời gian phát vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem từ nhập viện 76 4.2.4 Tỷ lệ sinh gien carbapenemase nhóm vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem .76 4.2.5 Tỷ lệ sinh gien carbapenemase A baumannii 77 4.2.6 Tỷ lệ sinh gien carbapenemase K pneumoniae 77 4.2.7 Tỷ lệ sinh gien carbapenemase P aeruginosa 78 4.3 CÁC YẾU TỐ NGUY CƠ ẢNH HƢỞNG ĐẾN KHẢ NĂNG SINH GIEN CARBAPENEMASE 79 4.3.1 Đặc điểm chung dân số nhóm sinh gien không sinh gien carbapenemase 79 4.3.2 Kết cục điều trị nhóm sinh gien không sinh gien carbapenemase 81 4.3.3 Yếu tố nguy ảnh hƣởng khả sinh gien carbapenemase vi khuẩn Gram âm kháng carbapenem 82 4.4 MỨC ĐỘ NHẠY CẢM VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM VỚI CÁC KHÁNG SINH KHÁC NGỒI NHĨM CARBAPENEM 83 4.4.1 Mức độ nhạy cảm kháng sinh A baumannii kháng carbapenem 83 4.4.2 Mức độ nhạy cảm kháng sinh K pneumoniae kháng carbapenem 84 4.4.3 Mức độ nhạy cảm kháng sinh P aeruginosa kháng carbapenem .85 4.4.4 Kháng sinh sử dụng trƣớc sau có kết vi sinh 86 4.4.5 Mối liên quan gien carbapenemase đề kháng kháng sinh 87 4.5 CÁC YẾU TỐ ẢNH HƢỞNG ĐẾN TỬ VONG TRÊN BỆNH NHÂN NHIỄM VI KHUẨN GRAM ÂM KHÁNG CARBAPENEM 88 4.5.1 Đặc điểm dân số nhóm tử vong nhóm sống 88 4.5.2 Đặc điểm vi sinh nhóm sống tử vong 89 4.5.3 Các yếu tố ảnh hƣởng đến tử vong hồi quy đơn biến đa biến 91 KẾT LUẬN .93 HẠN CHẾ 95 KIẾN NGHỊ 96 DANH MỤC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT TIẾNG VIỆT Chữ viết tắt BV Nghĩa tiếng Việt Bệnh viện TIẾNG ANH Chữ viết tắt ADN Nghĩa tiếng Anh Acid Deoxyribonucleic APACHE II Acute Physiology, Age, and Chronic Health Evaluation II AmpC Ampicillin chromosomal cephalosporinase Carba NP Carba Nordmann-Porel CIM Carbapenem inactivation method CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute Ct Cycle threshold Extracorporeal Membrane Oxygenation Ethylene diamine tetraacetic acid Extended-spectrum β-lactamases the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing Guiana extended-spectrum German imipenemase Intermediate Imipenemase metallo--lactamase Klebsiella pneumonia carbapenemase ECMO EDTA ESBL EUCAST GES GIM I IMP KPC MALDI-TOF MS Matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry Metallo -lactamase MBL Nghĩa tiếng Việt Thang điểm lƣợng giá bệnh lý cấp tính mạn tính Phƣơng pháp Carba Nordmann-Porel Phƣơng pháp bất hoạt carbapenem Viện Chuẩn thức Lâm sàng xét nghiệm Giá trị chu kỳ ngƣỡng Oxy hố máu qua màng ngồi thể β-lactam phổ rộng Uỷ ban châu u thử nghiệm háng sinh đồ Đề kháng trung gian Phƣơng pháp hối phổ ion hóa mẫu hấp thụ dựa hỗ trợ chất lƣợng laser Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 47 Heudorf U, Büttner B, Hauri A M, Heinmüller P, Hunfeld K-P, et al (2016), "Carbapenem-resistant Gram-negative bacteria–analysis of the data obtained through a mandatory reporting system in the Rhine-Main region, Germany, 2012–2015", GMS Hygiene and Infection Control, 11, pp.1-10 48 Jain A, Hopkins K L, Turton J, Doumith M, Hill R, et al (2014), "NDM carbapenemases in the United Kingdom: an analysis of the first 250 cases", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 69 (7), pp.1777-1784 49 Kaye K S, Rice L B, Dane A L, Stus V, Sagan O, et al (2019), "Fosfomycin for injection (ZTI-01) versus piperacillin-tazobactam for the treatment of complicated urinary tract infection including acute pyelonephritis: ZEUS, a phase 2/3 randomized trial", Clinical Infectious Diseases, 69 (12), pp.2045-2056 50 Khan A U, Nordmann P (2012), "Spread of carbapenemase NDM-1 producers: the situation in India and what may be proposed", Scandinavian Journal of Infectious Diseases, 44 (7), pp.531-535 51 Kohler P P, Volling C, Green K, Uleryk E M, Shah P S, et al (2017), "Carbapenem resistance, initial antibiotic therapy, and mortality in Klebsiella pneumoniae bacteremia: a systematic review and metaanalysis", infection Control & Hospital Epidemiology, 38 (11), pp.1319-1328 52 Lasserre C, De Saint Martin L, Cuzon G, Bogaerts P, Lamar E, et al (2015), "Efficient detection of carbapenemase activity in Enterobacteriaceae by matrix-assisted laser desorption ionization− time of flight mass spectrometry in less than 30 minutes", Journal of Clinical Microbiology, 53 (7), pp.2163-2171 53 Liu C-P, Shih S-C, Wang N-Y, Wu A Y, Sun F-J, et al (2016), "Risk factors of mortality in patients with carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii bacteremia", Journal of Microbiology, Immunology and Infection, 49 (6), pp.934-940 54 Liu Y, Wang Q, Zhao C, Chen H, Li H, et al (2020), "Prospective multicenter evaluation on risk factors, clinical characteristics and outcomes due to carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii complex bacteraemia: experience from the Chinese Antimicrobial Resistance Surveillance of Nosocomial Infections (CARES) Network", Journal of Medical Microbiology, 69, pp.949-959 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 55 Livermore D, Mushtaq S, Warner M, Zhang J-C, Maharjan S, et al (2011), "Activity of aminoglycosides, including ACHN-490, against carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 66 (1), pp.48-53 56 Livermore D M, Warner M, Mushtaq S, Doumith M, Zhang J, et al (2011), "What remains against carbapenem-resistant Enterobacteriaceae? Evaluation of chloramphenicol, ciprofloxacin, colistin, fosfomycin, minocycline, nitrofurantoin, temocillin and tigecycline", International Journal of Antimicrobial Agents, 37 (5), pp.415-419 57 Lusignani L S, Presterl E, Zatorska B, Van den Nest M, Diab-Elschahawi M (2020), "Infection control and risk factors for acquisition of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae A year (2011–2016) case-control study", Antimicrobial Resistance & Infection Control, (1), pp.1-10 58 Manenzhe R I, Zar H J, Nicol M P, Kaba M (2015), "The spread of carbapenemase-producing bacteria in Africa: a systematic review", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 70 (1), pp.23-40 59 Mariappan S, Sekar U, Kamalanathan A (2017), "Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae: Risk factors for infection and impact of resistance on outcomes", International Journal of Applied and Basic Medical Research, (1), pp.32-39 60 Masi M, Réfregiers M, Pos K M, Pagès J-M (2017), "Mechanisms of envelope permeability and antibiotic influx and efflux in Gram-negative bacteria", Nature Microbiology, (3), pp.1-7 61 Mathers A J, Hazen K C, Carroll J, Yeh A J, Cox H L, et al (2013), "First clinical cases of OXA-48-producing carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in the United States: the ―menace‖ arrives in the new world", Journal of Clinical Microbiology, 51 (2), pp.680-683 62 Meletis G (2016), "Carbapenem resistance: overview of the problem and future perspectives", Therapeutic Advances in Infectious Disease, (1), pp.15-21 63 Meletis G, Exindari M, Vavatsi N, Sofianou D, Diza E (2012), "Mechanisms responsible for the emergence of carbapenem resistance in Pseudomonas aeruginosa", Hippokratia, 16 (4), pp.303-307 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 64 Meletis G, Oustas E, Botziori C, Kakasi E, Koteli A (2015), "Containment of carbapenem resistance rates of Klebsiella pneumoniae and Acinetobacter baumannii in a Greek hospital with a concomitant increase in colistin, gentamicin and tigecycline resistance", New Microbiol, 38 (3), pp.417421 65 MerieQueenan A, Bush K (2007), "Carbapenemases: the versatile Blactamases", Clinical Microbiology Review, 20 (3), pp.440-458 66 Miller S I (2016), "Antibiotic resistance and regulation of the gram-negative bacterial outer membrane barrier by host innate immune molecules", MBio, (5), pp.1-3 67 Miyakis S, Pefanis A, Tsakris A (2011), "The challenges of antimicrobial drug resistance in Greece", Clinical Infectious Diseases, 53 (2), pp.177-184 68 Mulla S, Charan J, Rajdev S (2016), "Antibiotic sensitivity pattern in blaNDM-1-positive and carbapenemase-producing Enterobacteriaceae", International Journal of Applied and Basic Medical Research, (1), pp.14-17 69 Mushi M F, Mshana S E, Imirzalioglu C, Bwanga F (2014), "Carbapenemase genes among multidrug resistant gram negative clinical isolates from a tertiary hospital in Mwanza, Tanzania", BioMed Research International, 2014, pp.1-6 70 Nordmann P, Dortet L, Poirel L (2012), "Carbapenem resistance in Enterobacteriaceae: here is the storm!", Trends in Molecular Medicine, 18 (5), pp.263-272 71 Nordmann P, Poirel L (2019), "Epidemiology and diagnostics of carbapenem resistance in gram-negative bacteria", Clinical Infectious Diseases, 69 (Supplement_7), pp.521-528 72 Organization W H, WHO publishes list of bacteria for which new antibiotics are urgently needed, 2017 73 Oteo J, Ortega A, Bartolomé R, Bou G, Conejo C, et al (2015), "Prospective multicenter study of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae from 83 hospitals in Spain reveals high in vitro susceptibility to colistin and meropenem", Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 59 (6), pp.3406-3412 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 74 Otter J, Burgess P, Davies F, Mookerjee S, Singleton J, et al (2017), "Counting the cost of an outbreak of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae: an economic evaluation from a hospital perspective", Clinical Microbiology and Infection, 23 (3), pp.188-196 75 Papadimitriou-Olivgeris M, Fligou F, Bartzavali C, Zotou A, Spyropoulou A, et al (2017), "Carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae bloodstream infection in critically ill patients: risk factors and predictors of mortality", European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, 36 (7), pp.1125-1131 76 Papadimitriou-Olivgeris M, Fligou F, Spiliopoulou A, Koutsileou K, Kolonitsiou F, et al (2017), "Risk factors and predictors of carbapenemresistant Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii mortality in critically ill bacteraemic patients over a 6-year period (2010–15): antibiotics matter", Journal of Medical Microbiology, 66 (8), pp.1092-1101 77 Papagiannitsis C C, Študentová V, Izdebs i R, Oi onomou O, Pfeifer Y, et al (2015), "Matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight mass spectrometry meropenem hydrolysis assay with NH4HCO3, a reliable tool for direct detection of carbapenemase activity", Journal of Clinical Microbiology, 53 (5), pp.1731-1735 78 Park Y S, Lee H, Lee K S, Hwang S S, Cho Y K, et al (2010), "Extensively drug-resistant Acinetobacter baumannii: risk factors for acquisition and prevalent OXA-type carbapenemases—a multicentre study", International Journal of Antimicrobial Agents, 36 (5), pp.430-435 79 Patel G, Bonomo R (2013), "―Stormy waters ahead‖: global emergence of carbapenemases", Frontiers in Microbiology, (48), pp.1-17 80 Paton R, Miles R, Hood J, Amyes S (1993), "ARI 1: β-lactamase-mediated imipenem resistance in Acinetobacter baumannii", International Journal of Antimicrobial Agents, (2), pp.81-87 81 Pepper D J, Sun J, Welsh J, Cui X, Suffredini A F, et al (2016), "Increased body mass index and adjusted mortality in ICU patients with sepsis or septic shock: a systematic review and meta-analysis", Critical Care, 20 (1), pp.181- 191 82 Poirel L, Hombrouck-Alet C, Freneaux C, Bernabeu S, Nordmann P (2010), "Global spread of New Delhi metallo-β-lactamase 1", The Lancet Infectious Diseases, 10 (12), pp.832 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 83 Poirel L, Potron A, Nordmann P (2012), "OXA-48-like carbapenemases: the phantom menace", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 67 (7), pp.1597-1606 84 Rahman M T, Uddin M S, Sultana R, Moue A, Setu M (2013), "Polymerase chain reaction (PCR): a short review", Anwer Khan Modern Medical College Journal, (1), 30-36 85 Rasmussen B A, Bush K (1997), "Carbapenem-hydrolyzing beta-lactamases", Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 41 (2), pp.223-232 86 Rasmussen B A, Bush K, Keeney D, Yang Y, Hare R, et al (1996), "Characterization of IMI-1 beta-lactamase, a class A carbapenemhydrolyzing enzyme from Enterobacter cloacae", Antimicrobial agents and chemotherapy, 40 (9), pp.2080-2086 87 Richter S E, Miller L, Needleman J, Uslan D Z, Bell D, et al ―Ris factors for development of carbapenem resistance among gram-negative rods‖ in Open Forum Infectious Diseases 2019 Oxford University Press US 88 Sagar S, Kaistha S, Das A J, Kumar R (2019), "Antibiotic Resistance: Role and Pattern in Different Class of Bacteria", Antibiotic Resistant Bacteria: A Challenge to Modern Medicine, Springer, pp.45-55 89 Sagar S, Kaistha S, Das A J, Kumar R (2019), "Extrinsic Antibiotic-Resistant Mechanism in Bacteria", Antibiotic Resistant Bacteria: A Challenge to Modern Medicine, Springer, pp.87-103 90 Simner P J, Goodman K E, Carroll K C, Harris A D, Han J H, et al (2018), "Using patient risk factors to identify whether carbapenem-resistant Enterobacteriaceae infections are caused by carbapenemase-producing organisms", Open Forum Infectious Diseases, (5), pp.1-4 91 Song S E, Lee S H, Jo E-J, Eom J S, Mok J H, et al (2016), "The prognostic value of the Charlson's comorbidity index in patients with prolonged acute mechanical ventilation: a single center experience", Tuberculosis and Respiratory Diseases, 79 (4), pp.289-294 92 Stewart A, Harris P, Henderson A, Paterson D (2018), "Treatment of infections by OXA-48-producing Enterobacteriaceae", Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 62 (11), pp.1-10 93 Tada T, Tsuchiya M, Shimada K, Nga T T T, Phu T T, et al (2017), "Dissemination of Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae clinical Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM isolates with various combinations of Carbapenemases (KPC-2, NDM-1, NDM-4, and OXA-48) and 16S rRNA Methylases (RmtB and RmtC) in Vietnam", BMC infectious diseases, 17 (1), pp.467-474 94 Tamma P D, Aitken S L, Bonomo R A, Mathers A J, van Duin D, et al (2020), "Infectious Diseases Society of America Antimicrobial Resistant Treatment Guidance: Gram-Negative Bacterial Infections", Clinical Infectious Diseases 95 Tamma P D, Goodman K E, Harris A D, Tekle T, Roberts A, et al (2017), "Comparing the outcomes of patients with carbapenemase-producing and non-carbapenemase-producing carbapenem-resistant Enterobacteriaceae bacteremia", Clinical Infectious Diseases, 64 (3), pp.257-264 96 Tängdén T, Giske C (2015), "Global dissemination of extensively drug‐ resistant carbapenemase‐producing E nterobacteriaceae: clinical perspectives on detection, treatment and infection control", Journal of Internal Medicine, 277 (5), pp.501-512 97 Thuy D B, Campbell J, Nhat L T H, Hoang N V M, Hao N V, et al (2018), "Hospital-acquired colonization and infections in a Vietnamese intensive care unit", PloS one, 13 (9), pp.1-16 98 Tischendorf J, de Avila R A, Safdar N (2016), "Risk of infection following colonization with carbapenem-resistant Enterobactericeae: a systematic review", American Journal of Infection Control, 44 (5), pp.539-543 99 Tzouvelekis L, Markogiannakis A, Psichogiou M, Tassios P, Daikos G (2012), "Carbapenemases in Klebsiella pneumoniae and other Enterobacteriaceae: an evolving crisis of global dimensions", Clinical Microbiology Reviews, 25 (4), pp.682-707 100 Walsh T R (2010), "Emerging carbapenemases: a global perspective", International Journal of Antimicrobial Agents, 36 (S3), pp.8-14 101 Wang L, Gu H, Lu X (2012), "A rapid low-cost real-time PCR for the detection of Klebsiella pneumonia carbapenemase genes", Annals of clinical microbiology and antimicrobials, 11 (1), pp.1-6 102 Wang W, Jiang T, Zhang W, Li C, Chen J, et al (2016), "Predictors of mortality in bloodstream infections caused by multidrug-resistant gramnegative bacteria: years of collection", American Journal of Infection Control, 45 (1), pp.59-64 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 103 Watanabe M, Iyobe S, Inoue M, Mitsuhashi S (1991), "Transferable imipenem resistance in Pseudomonas aeruginosa", Antimicrobial agents and chemotherapy, 35 (1), pp.147-151 104 Yigit H, Queenan A M, Anderson G J, Domenech-Sanchez A, Biddle J W, et al (2001), "Novel carbapenem-hydrolyzing β-lactamase, KPC-1, from a carbapenem-resistant strain of Klebsiella pneumoniae", Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 45 (4), pp.1151-1161 105 Zusman O, Altunin S, Koppel F, Dishon Benattar Y, Gedik H, et al (2016), "Polymyxin monotherapy or in combination against carbapenemresistant bacteria: systematic review and meta-analysis", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 72 (1), pp.29-39 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM PHỤ LỤC PHỤ LỤC 1: BẢNG THU THẬP S Họ tên (viết tắt tên) LIỆU Tuổi: Giới tính Địa (thành phố/tỉnh) Số nhập viện Ngày nhập viện Ngày xuất viện Lý nhập viện Nam  Nữ  Điều trị tuyến trƣớc  Thở máy  Phẩu thuật Thời gian điều trị Kháng sinh  Lọc máu  Khác Thủ thuật xâm lấn (CVC, dẫn lƣu…) Ngày nhập Hồi sức Ngày xuất Hồi sức Khoa chuyển đến Hồi sức  Cấp cứu  Khoa khác Chẩn đoán hi nhập Hồi sức  Nhồi máu tim  Liệt nửa ngƣời  Suy tim sung huyết Đái tháo đƣờng  Bệnh mạch máu ngoại  U (tại chổ hay di biên căn) Bệnh  Bệnh mạch máu não Bệnh thận mạn thiếu máu não thoáng (Creatinin >3mg/dL (CHARLSON qua lọc máu, ghép COMORBIDITY  Sa sút trí tuệ thận) INDEX)  Bệnh mơ liên kết  Bạch cầu cấp  Bệnh phổi mãn tính  Lymphoma  Bệnh loét dày tá  AIDS tràng  Bệnh mạch vành  Bệnh gan (xơ gan tăng áp cửa có tiền chảy máu hay khơng chảy máu, viêm gan mạn) Tiền nằm viện  Có  Khơng tháng trƣớc nhập viện Suy giảm miễn dịch  Giảm bạch cầu( < 500/µL) Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM  Ức chế miễn dịch  Sử dụng Steroid (20mg PSL; tháng)  Hóa trị tháng qua  Ghép tế bào gốc, ghép tạng Điểm APACHE II Điểm SOFA Ngõ vào Kết (soi nhuộm/ cấy) Bệnh phẩm ……… (Ngày Bệnh phẩm ……… (Ngày Bệnh phẩm ……… (Ngày Bệnh phẩm ……… (Ngày Kết KSĐ Kết real-time PCR Dƣơng  Ngày ( / / ) Tác nhân : Dƣơng  Ngày ( / / ) Tác nhân : Dƣơng  Ngày ( / / ) Tác nhân : Dƣơng  Ngày ( / / ) Tác nhân : ĐIỀU TRỊ Kháng sinh trƣớc 1/………………………, liều…… /ngày, TS… có kết PCR ngày 2/………………………, liều…… /ngày, TS…… ngày 3/………………………, liều…… /ngày, TS…… ngày 4/………………………, liều……./ngày, TS…… ngày Kháng sinh sau có 1/………………………, liều…… /ngày, TS… kết PCR ngày 2/………………………, liều…… /ngày, TS…… ngày 3/………………………, liều……./ngày, TS…….ngày 4/………………………, liều……./ngày, TS…….ngày Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM Điều trị khác  Thở máy:  Lọc máu:……  Phẩu thuật:……  Truyền máu:…  Khác KẾT CỤC Thời gian điều trị trƣớc nhập khoa Hồi sức Thời gian thở máy Thời gian kháng sinh Thời gian nằm Hồi sức Kết điều trị Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn  Dinh dƣỡng:  Nội soi:……  ECMO:……  Catheter:…… Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM KẾT QUẢ KHÁNG SINH Đ Vi khuẩn Vi khuẩn Kháng sinh MIC Kháng sinh MIC Ticarcillin/clavulanic Ticarcillin/clavulanic Piperacillin/tazobactam Piperacillin/tazobactam Cefoperazole/sulbactam Cefoperazole/sulbactam Imipenem Imipenem Meronem Meronem Amikacin Amikacin Gentamycin Gentamycin Tobramycin Tobramycin Ciprofloxacin Ciprofloxacin Levofloxacin Levofloxacin Moxifloxacin Moxifloxacin Colistin Colistin TMP/SMX TMP/SMX Doxycycline Doxycycline Tigecycline Tigecycline KẾT QUẢ REAL- TIME PCR Xét nghiệm PCR gien kháng thuốc metallo-β-lactamase Kết (MBL) Verona integron-encoded-metallo-β-lactamase (VIM) Imipenemase-metallo-β-lactamase (IMP) New Delhi metallo-β-lactamase (NDM) Kết Real-time PCR: Verona intergron-encoded-metallo-β-lactamase (VIM), Imipenemase-metallo-β-lactamase (IMP), New Delhi metallo-β-lactamase Xét nghiệm PCR gien kháng thuốc nhóm A βlactamase-Klebsiella pneumoniae (KPC) nhóm D-OXA-carbapenemase (OXA) Kết Nhóm A β-lactamase-Klebsiella pneumoniae (KPC) Nhóm D-OXA-carbapenemase (OXA) Kết Real-time PCR: nhóm A β-lactamase-Klebsiella pneumoniae (KPC) nhóm D-OXA-carbapenemases (OXA) Tn thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM PHỤ LỤC 2: THANG ĐIỂM SOFA ĐIỂM SOFA PaO2/FiO2 mmHg Tiểu cầu 103/mm3 Bilirubin (mg/dl) (mmol/l) ≥400