Xây dựng quy trình xét nghiệm chẩn đoán bệnh brucella tại phõng xét nghiệm vi sinh thuộc đơn vị nghiên cứu lâm sàng đại học oxford thành phố hồ chí minh

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - HUỲNH THANH THẢO XÂY DỰNG QUY TRÌNH XÉT NGHIỆM CHẨN ĐỐN BỆNH BRUCELLA TẠI PHÕNG XÉT NGHIỆM VI SINH THUỘC ĐƠN VỊ NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG ĐẠI HỌC OXFORD THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT Y HỌC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH – 2019 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - HUỲNH THANH THẢO XÂY DỰNG QUY TRÌNH XÉT NGHIỆM CHẨN ĐỐN BỆNH BRUCELLA TẠI PHÕNG XÉT NGHIỆM VI SINH THUỘC ĐƠN VỊ NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG ĐẠI HỌC OXFORD THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH Ngành: Kỹ thuật xét nghiệm y học Mã số: 8720601 LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT Y HỌC Ngƣời hƣớng dẫn khoa học: TS HỒ ĐẶNG TRUNG NGHĨA TS LÊ SỸ SÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH – NĂM 2019 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu hoàn toàn trung thực chưa cơng bố cơng trình khác Tác giả luận văn HUỲNH THANH THẢO i MỤC LỤC Trang LỜI CAM ĐOAN i MỤC LỤC ii DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT iv DANH MỤC BẢNG v DANH MỤC BIỂU ĐỒ vii DANH MỤC HÌNH viii ĐẶT VẤN ĐỀ CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan bệnh Brucella người 1.3 Các phương pháp chẩn đoán bệnh Brucella 23 1.4 Phản ứng kết hợp kháng nguyên – kháng thể 27 CHƢƠNG 2: ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 30 2.1 Thiết kế nghiên cứu 30 2.2 Đối tượng nghiên cứu 30 2.3 Tiêu chuẩn chọn mẫu 30 2.4 Kiểm soát sai lệch lựa chọn 31 2.5 Cỡ mẫu 32 2.6 Phương pháp xử lý phân tích số liệu 32 2.7 Định nghĩa biến số 32 2.8 Phương tiện nghiên cứu 34 2.9 Phương pháp nghiên cứu 38 2.10 Các quy trình xét nghiệm sử dụng nghiên cứu 41 2.11 Đạo đức nghiên cứu 51 CHƢƠNG : KẾT QUẢ 52 3.1 Xây dựng quy trình xét nghiệm chẩn đốn bệnh Brucella 52 i 3.2 Mô tả số đặc điểm dịch tễ học yếu tố liên quan đến tình trạng nhiễm Brucella 58 CHƢƠNG 4: BÀN LUẬN 66 4.1 Xây dựng quy trình xét nghiệm chẩn đốn bệnh Brucella 66 4.2 Mô tả số đặc điểm dịch tễ học yếu tố liên quan đến tình trạng nhiễm Brucella 73 4.3 Hạn chế đề tài 76 KẾT LUẬN 77 KIẾN NGHỊ 80 v DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT  Từ ti ng Việt ATSH An toàn sinh học KN Kháng nguyên KT Kháng thể  Từ ti ng Anh BA blood agar BCV Brucella chemical vaccine CT Computed Tomography ELISA indirect enzyme-linked immusorbent assay IU LPS lipopolysaccharide PCR polymerase chain reaction RBT Rose Bengal test SAT serum agglutination test SMZ sulfamethoxazol TMP trimethoprim v DANH MỤC BẢNG Trang Bảng 1.1 Triệu chứng 500 bệnh nhân mắc bệnh Brucella chủng B.menlitensis Bảng 2.1 Máy móc thiết bị sử dụng 35 Bảng 2.2 Dụng cụ vật tư tiêu hao 36 Bảng 2.3 Thuốc nhuộm Gram 37 Bảng 2.4 Thuốc nhuộm Ziehl-Neelsen 38 Bảng 3.1 Tỉ lệ nhiễm vi khuẩn Brucella xét nghiệm RBT cấy máu 52 Bảng 3.2 Kết pha loãng huyết xét nghiệm RBT 53 Bảng 3.3 So sánh kết pha loãng huyết RBT kết cấy máu 54 Bảng 3.4 Kết nhuộm Gram Ziehl-Neelsen cải tiến đối mẫu cấy máu dương tính 55 Bảng 3.5 Kết định danh vi khuẩn 55 Bảng 3.6 Độ tương hợp hai xét nghiệm Rose Bengal cấy máu 56 Bảng 3.7 Dữ liệu thô từ thử nghiệm RBT 57 Bảng 3.8 Dữ liệu thống kê RBT để chẩn đoán nhiễm Brucella so với nuôi cấy định danh vi khuẩn 57 Bảng 3.10 Tỉ lệ nhiễm Brucella theo giới tính 62 vi Bảng 3.11 Tỉ lệ nhiễm Brucella theo độ tuổi 62 Bảng 3.12 Tỉ lệ nhiễm Brucella theo nơi cư trú 64 Bảng 3.13 Tỉ lệ nhiễm Brucella với nguy tiếp xúc nguồn bệnh 65 vii DANH MỤC BIỂU ĐỒ Trang Biểu đồ 3.1 Biểu đồ phân bố giới tính 58 Biểu đồ 3.2 Biểu đồ phân bố nhóm tuổi 59 Biểu đồ 3.3 Tỉ lệ dân số nghiên cứu theo nơi cư trú 60 Biểu đồ 3.4 Tỉ lệ dân số theo yếu tố nguy 61 viii DANH MỤC HÌNH Trang Hình 1.1 Tình hình phân bố bệnh Brucella giới Hình 1.2 Tình hình phân bố bệnh Brucella Việt Nam Hình 1.3 Chụp cộng hưởng từ (MRI) bệnh nhân nam 63 tuổi 11 Hình 1.4 Hình ảnh nhuộm Ziehl – Neelsen vi khuẩn Brucella (bên trái) Chamydia abortus (bên phải) 24 Hình 2.1 Kết RBT dương tính (bên trái) & âm tính (bên phải) 43 Hình 2.2 Hình ảnh nhuộm Gram Brucella 46 Hình 2.3 Hình ảnh nhuộm Zielh-Neelsen Brucella 49 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 39 Hong S H., Choi J.-Y., Lee J W., et al (2009), "MR imaging assessment of the spine: infection or an imitation?", Radiographics, 29 (2), pp 599612 40 Irmak H., Buzgan T., EVIRGEN Ö., et al (2004), "Use of the Brucella IgM and IgG flow assays in the serodiagnosis of human brucellosis in an area endemic for brucellosis", The American journal of tropical medicine and hygiene, 70 (6), pp 688-694 41 Köhler S., Foulongne V., Ouahrani-Bettache S., et al (2002), "The analysis of the intramacrophagic virulome of Brucella suis deciphers the environment encountered by the pathogen inside the macrophage host cell", Proceedings of the National Academy of Sciences, 99 (24), pp 15711-15716 42 Konstantinidis A., Minas A., Pournaras S., et al (2007), "Evaluation and comparison of fluorescence polarization assay with three of the currently used serological tests in diagnosis of human brucellosis", Eur J Clin Microbiol Infect Dis, 26 (10), pp 715-21 43 KÖSE Ş., SENGER S S., AKKOÇLU G., et al (2014), "Clinical manifestations, complications, and treatment of brucellosis: evaluation of 72 cases", Turkish journal of medical sciences, 44 (2), pp 220-223 44 Lalsiamthara J., Lee J H (2017), "Development and trial of vaccines against Brucella", Journal of veterinary science, 18 (S1), pp 281-290 45 Lamontagne J., Forest A., Marazzo E., et al (2009), "Intracellular adaptation of Brucella abortus", Journal of proteome research, (3), pp 15941609 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 46 Lopez-Gi I., Garcia-Yoldi D., Marin C., et al (2008), "Evaluation of a multiplex PCR assay (Bruce-ladder) for molecular typing of all Brucella species, including the vaccine strains", Journal of clinical microbiology, 46 (10), pp 3484-3487 47 López-Gi I., García-Yoldi D., Marín C M., et al (2011), "New Bruceladder multiplex PCR assay for the biovar typing of Brucella suis and the discrimination of Brucella suis and Brucella canis", Veterinary microbiology, 154 (1-2), pp 152-155 48 Malik S., Sarwar I., Rauf A., et al (2018), "Seroprevalence of brucellosis among patients presenting with non–specific symptoms at Ayub teaching hospital Abbottabad", Journal of Ayub Medical College Abbottabad, 30 (4), pp 565-569 49 Mambres D H., Boarbi S., Michel P., et al (2017), "Imported human brucellosis in Belgium: Bio and molecular typing of bacterial isolates, 1996-2015", PloS one, 12 (4), pp e0174756 50 Manish K., Chand P., Rajesh C., et al (2013), "Brucellosis: an updated review of the disease", Indian Journal of Animal Sciences, 83 (1), pp 3-16 51 Mantur B G., Amarnath S K (2008), "Brucellosis in India—a review", Journal of biosciences, 33 (4), pp 539 52 Mantur B G., Biradar M S., Bidri R C., et al (2006), "Protean clinical manifestations and diagnostic challenges of human brucellosis in adults: 16 years' experience in an endemic area", Journal of medical microbiology, 55 (7), pp 897-903 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 53 Mert A., Ozaras R., Tabak F., et al (2003), "The sensitivity and specificity of Brucella agglutination tests", Diagnostic Microbiology and infectious disease, 46 (4), pp 241-243 54 Minda A G., Gezahegne M K (2016), "A review on diagnostic methods of brucellosis", Journal of Veterinary Science and Technology, (3) 55 Morata P., Queipo-Ortuno M., Reguera J., et al (2001), "Diagnostic yield of a PCR assay in focal complications of brucellosis", Journal of clinical microbiology, 39 (10), pp 3743-3746 56 Moreno E (2014), "Retrospective and prospective perspectives on zoonotic brucellosis", Frontiers in microbiology, 5, pp 213 57 Musallam I., Abo-Shehada M., Hegazy Y., et al (2016), "Systematic review of brucellosis in the Middle East: disease frequency in ruminants and humans and risk factors for human infection", Epidemiology & Infection, 144 (4), pp 671-685 58 Mustafa A S., Habibi N., Osman A., et al (2017), "Species identification and molecular typing of human Brucella isolates from Kuwait", PloS one, 12 (8), pp e0182111 59 Neta A V C., Stynen A P., Paixao T A., et al (2008), "Modulation of the bovine trophoblastic innate immune response by Brucella abortus", Infection and immunity, 76 (5), pp 1897-1907 60 Nielsen K (2018), "Animal Brucellosis: 0", CRC press Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 61 Njeru J., Wareth G., Melzer F., et al (2016), "Systematic review of brucellosis in Kenya: disease frequency in humans and animals and risk factors for human infection", BMC public health, 16 (1), pp 853 62 Pappas G (2010), "The changing Brucella ecology: novel reservoirs, new threats", International journal of antimicrobial agents, 36, pp S8-S11 63 Prakash P., Bhansali S., Gupta E., et al (2012), "Epidemiology of brucellosis in high risk group & PUO patients of Western–Rajasthan", National Journal of Community Medicine, (1), pp 61-65 64 Ramachandran P S., Wilson M R (2018), "Diagnostic Testing of Neurologic Infections", Neurologic clinics, 36 (4), pp 687-703 65 Rezaee M A., Rashidi A., Motaharinia Y., et al (2012), "Seroprevalence study of brucellosis among high-risk groups in comparison with other people of the population in Sanandaj (West of Iran)", African Journal of Microbiology Research, (9), pp 1985-1989 66 Rossetti C A., Arenas-Gamboa A M., Maurizio E (2017), "Caprine brucellosis: A historically neglected disease with significant impact on public health", PLoS neglected tropical diseases, 11 (8), pp e0005692 67 Rossetti C A., Drake K L., Adams L G (2012), "Transcriptome analysis of HeLa cells response to Brucella melitensis infection: a molecular approach to understand the role of the mucosal epithelium in the onset of the Brucella pathogenesis", Microbes and infection, 14 (9), pp 756767 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 68 Rossetti C A., Drake K L., Siddavatam P., et al (2013), "Systems biology analysis of Brucella infected Peyer's patch reveals rapid invasion with modest transient perturbations of the host transcriptome", PloS one, (12), pp e81719 69 Roushan M R H., Ebrahimpour S (2015), "Human brucellosis: An overview", Caspian journal of internal medicine, (1), pp 46 70 Roushan M R H., Mohraz M., Hajiahmadi M., et al (2006), "Efficacy of gentamicin plus doxycycline versus streptomycin plus doxycycline in the treatment of brucellosis in humans", Clinical infectious diseases, 42 (8), pp 1075-1080 71 Rubach M P., Halliday J E., Cleaveland S., et al (2013), "Brucellosis in low-income and middle-income countries", Current opinion in infectious diseases, 26 (5), pp 404 72 Ruiz-Mesa J D., Sanchez-Gonzalez J., Reguera J M., et al (2005), "Rose Bengal test: diagnostic yield and use for the rapid diagnosis of human brucellosis in emergency departments in endemic areas", Clin Microbiol Infect, 11 (3), pp 221-5 73 Sathyanarayan M., Suresh D., Sonth S., et al (2011), "A comparative study of agglutination tests, blood culture & ELISA in the laboratory diagnosis of human brucellosis", Int J Biol Med Res., (2), pp 569572 74 Shell W., Sayed M., Samy A., et al., "Using real-time polymerase chain reaction as an alternative rapid method for enumeration of colony Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh count in live Brucella vaccines, Veterinary World, 10 (6): 610-615" 2017 Abstract 75 Shome R., Kalleshamurthy T., Shankaranarayana P B., et al (2017), "Prevalence and risk factors of brucellosis among veterinary health care professionals", Pathogens and global health, 111 (5), pp 234-239 76 Singh A., Gupta V K., Kumar A., et al (2013), "16S rRNA and omp31 gene based molecular characterization of field strains of B melitensis from aborted foetus of goats in India", The Scientific World Journal, 2013 77 Smith M E., Bhimji S S (2018), "Brucellosis", StatPearls [Internet], StatPearls Publishing 78 Sophie R., Michael L., Marcel B., et al (2004), "Prevention of laboratoryacquired brucellosis", Clinical Infectious Diseases, 38 (12), pp e119e122 79 Spinu I., Vasilescu T (1962), "The Presence of Human and Animal Brucellosis in North Vietnam", Microbiologia, Parazitologia si Epidemiologia, (5), pp 459-69 80 Teng Y.-H., Teng J.-J., Chao S., et al (2017), "Comparison of the Rose Bengal Plate and the Complement Fixation Tests with the Tube Agglutination Test for Diagnosis of Human Brucellosis", Open Journal of Clinical Diagnostics, (03), pp 73 81 Tiller R V., Gee J E., Frace M A., et al (2010), "Characterization of novel Brucella strains originating from wild native rodent species in North Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Queensland, Australia", Applied and environmental microbiology, 76 (17), pp 5837-5845 82 Tuon F F., Gondolfo R B., Cerchiari N (2017), "Human‐ to‐ human transmission of Brucella–a systematic review", Tropical Medicine & International Health, 22 (5), pp 539-546 83 Uluş M., Yaman Y., Yapıcı F., et al (2011), "Clinical and laboratory features, complications and treatment outcome of brucellosis in childhood and review of the literature", Turkish Journal of Pediatrics, 53 (4) 84 Vilchez G., Espinoza M., D’Onadio G., et al (2015), "Brucellosis in pregnancy: clinical aspects and obstetric outcomes", International journal of infectious diseases, 38, pp 95-100 85 Whatmore A M., Koylass M S., Muchowski J., et al (2016), "Extended multilocus sequence analysis to describe the global population structure of the genus Brucella: phylogeography and relationship to biovars", Frontiers in microbiology, 7, pp 2049 86 Winchell J M., Wolff B J., Tiller R., et al (2010), "Rapid identification and discrimination of Brucella isolates by use of real-time PCR and highresolution melt analysis", Journal of clinical microbiology, 48 (3), pp 697-702 87 Wyatt H V (2009), "Brucellosis and Maltese goats in the Mediterranean", Journal of Maltese history, (2) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 88 Yilmaz S., Avcu G., Beyazal M., et al (2016), "A rare cause of seizures: brucellar brain abscess", Brazilian Journal of Infectious Diseases, 20 (3), pp 310-311 89 Yong T B., Hashim R., Noor A M., et al (2015), "Identification of Brucella spp isolated from human brucellosis in Malaysia using high-resolution melt (HRM) analysis", Diagnostic microbiology and infectious disease, 81 (4), pp 227-233 90 Yu Chen X H., et al., (2015), "Both PON1 QQ192R and CYP2C19*2 influence platelet reponse to clopidogrel and ischemic events in Chinese patients undergoing percuteaneous coronary intervention", Int J Clin Exp Med, (6), pp.: 92669274 91 Yu W L., Nielsen K (2010), "Review of detection of Brucella spp by polymerase chain reaction", Croatian medical journal, 51 (4), pp 306313 92 Yumuk Z., O'Callaghan D (2012), "Brucellosis in Turkey an overview", Int J Infect Dis, 16 (4), pp e228-35 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC Phụ lục 1: QUY TRÌNH ĐIỀU CHẾ MƠI TRƢỜNG THẠCH MÁU CỪU Mục đích Hướng dẫn cho nhân viên quy trình điều chế mơi trường phục vụ cho nuôi cấy vi sinh Tài liệu tham khảo CM 0854 Oxoid LTD England Trách nhiệm Kỹ thuật viên phụ trách điều chế môi trường chịu trách nhiệm điều chế môi trường phục vụ cho xét nghiệm thường quy nuôi cấy vi khuẩn, vi nấm, làm phản ứng sinh hóa định danh, làm kháng sinh đồ, giữ chủng Micro Lab, chương trình nghiên cứu Oucru Phải đảm bảo nguyên tắc vô trùng kỹ thuật điều chế loại môi trường theo quy trình, cơng thức soạn thảo Vật liệu trang thi t bị - Sterile water - Môi trường Sheep Blood Agar Base: 40 gram/1000 mL - Máu cừu - Tube vơ trùng - Ống chích 20 mL - Petri nhựa - Đèn gaz - Cầu bình 500 mL - Cân Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh - Đĩa cân - Dao cân - Lod vi sóng - Autoclave Quy trình điều ch A Cân môi trường - Bật nguồn điện, cân lên Off, nhấn nút Power để yên 15 – 20 chế độ Standby - Dùng bình cầu 500 mL, cho vào Sterile water vừa đủ 465 mL Cân sau chờ đủ thời gian chờ, nhấn nút Power, để đĩa cân lên bàn cân nhấn Tare cho cân vị trí 0.00 gram - Dùng dao cân cân 20.15 gram môi trường Sheep Blood Agar Base ( 0.15 gram trừ hao dính mơi trường vào đĩa cân dao cân) cho vào cầu bình có 465 mL Sterile water, dùng dao cân khuấy - Cho vào lị vi sóng đun từ 15 – 20 phút cho môi trường tan - pH: 0.73 - Vặn nắp vừa phải Đem Autoclave 121oC/ 15 phút B Chiết máu cừu - Trong chờ Autoclave, chiết máu cừu để pha chế môi trường Số lượng máu cừu 7% - Chọn chai máu cừu mới, tươi, tube hấp vơ trùng Đốt đèn gaz, lấy gịn vơ trùng thấm alcool iod sát trùng nút chai máu cừu, hơ đèn gaz Dùng ống chích 20 mL rút máu cừu cho vào tube vô trùng đủ 35 mL (Tất thực kỹ thuật vô trùng) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh - Chuẩn bị hộp petri nhựa - Môi trường Autoclave xong, để nguội từ 45 – 50oC C Đổ môi trường - Đốt đèn gaz, mở nắp chai môi trường BA, sát trùng xung quanh miệng cầu bình đèn gaz, để yên chút cho nhựa miệng cầu bình nguội lại, cho máu cừu vào, lắc cho vào hộp Petri nhựa 22 mL/ hộp - Dùng đèn gaz đốt bề mặt hộp môi trường BA để sát trùng bề mặt làm tan bọt (nếu có) - Rãi hộp môi trường BA mặt bàn để môi trường mau đông - Lật hộp môi trường BA lại ghi tên môi trường gồm: BA + số máu cừu + ngày pha chế lên góc hộp BA (TD: BA 10/9), sử dụng nhãn TOMY số 113 in tên mơi trường dán lên góc hộp BA - Cho hộp môi trường BA vào tủ ấm 35oC ủ qua đêm - Sáng hôm sau, lấy hộp môi trường BA kiểm tra đĩa, lọa bỏ hộp ngoại nhiễm ( hộp ngoại nhiễm đem Autoclave, xử lý rác thải y tế) - Chọn 01 hộp môi trường BA để gửi nội kiểm Tỉ lệ nội kiểm 5% - Cho hộp môi trường BA vào túi nylon Kiểm tra chất lƣợng - Bảo đảm nguyên tắc vô trùng kỹ thuật điều chế Sau ủ tủ ấm 35oC chọn 01 hộp chuyển sang Micro Lab để thực nội kiểm Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Bảo quản - Cất giữ kho lạnh – 8oC - Mỗi ngày chuyển hộp môi trường BA sang tủ lạnh Micro Lab nhiệt độ – oC để sử dụng - Hạn sử dụng: 01 tháng An toàn - Thực đứng quy trình thao tác vận hành Autoclave, lị hấp khơ Bảo đảm an tồn lao động Lƣu ý thêm - Sterile water vừa đủ - Máu cừu mới, tươi - Làm nguội môi trường BA từ 45 - 50 oC để cho máu cừu vào không làm môi trường sậm màu - Không để môi trường BA nguội 45 oC cho máu cừu vào môi trường dễ bị đông - Môi trường BA dễ bị ngoại nhiễm, ý đến kỹ thuật vô trùng pha chế môi trường chiết máu cừu vào tube - Nên tiệt trùng phòng đèn cực tím trước pha chế mơi trường BA Tn thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Phụ lục 2: TÍNH CHẤT SINH HĨA ĐỊNH DANH BRUCELLA MENLITENSIS TRONG THẺ GN CỦA HỆ THỐNG VITEK COMPACT  47 tính chất sinh hóa thẻ GN để định danh vi khuẩn Brucella menlitensis: STT Xét nghiệm sinh hóa Vi t tắt K t Ala-Phe-Pro-ARYLAMIDASE APPA (- /+) ADONITOL ADO (-) L-Pyrrolydonyl- PyrA (-) ARYLAMIDASE L-ARABITOL IARL (-) D-CELLOBIOSE dCEL (-) BETA-GALACTOSIDASE BGAL (-) H2S PRODUCTION H2S (-) BETA-N-ACETYL- BNAG (-) AGLTp (-) GLUCOSAMINIDASE 10 Glutamyl Arylamilase pNA 11 D-GLUKOSE dGLU (-) GAMMA-GLUTAMYL- GGT (-) FERMENTATION/GLUKOSE OFF (-) GAMMA-GLUTAMYL- GGT (-) 12 13 14 TRANSFERASE TRANSFERASE Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 15 FERMENTATION/GLUKOSE OFF (-) 17 BETA-GLUKOSIDASE BGLU (-) 18 D-MALTOSE dMAL (-) 19 D-MANNITOL dMAN (-) 20 D-MANNOSE dMNE (-) 21 BETA-XYLOSIDASE BXYL (-) BETA-Alanine arlylamidase Balap (-) ProA (+) 22 pNA 23 L-Proline ARYLAMIDASE 26 LIPASE LIP (-) 27 PALATINOSE PLE (-) 29 Tyrosine ARYLAMILASE TyrA (+) 31 UREASE URE (+) 32 D-SORBITOL dSOR (-) 33 SACCHAROSE/SUCROSE SAC (-) 34 D-TAGATOSE dTAG (-) 35 D-TREHALOSE dTRE (-) 36 CITRATE (SODIUM) CIT (-) 37 MALONATE MNT (-) 39 5-KETO-D-GLUCONATE 5KG (-) 40 L-LACTATE alkalinisation ILATk (- /+) 41 ALPHA-GLUCOSIDASE AGLU (- /+) 42 SUCCUNATE alkalinisation SUCT (-) 43 Beta-N-ACETYL- NAGA (-) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh GALACTOSAMINIDASE 44 ALPHA-GALACTOSIDASE AGAL (-) 45 POSPHATASE PHOS (-) 46 Glycine ARYLAMIDASE GlyA (- /+) ORNITHINE ODC (-) 47 DECARBOXYLASE 48 LYSINE DECARBOXYLASE LDC (-) 53 L-HISTIDINE assimilation IHISa (-) 56 COURMARATE CMT (-) 57 BETA-GLUCORONIDASE BGUR (-) O/129 RESISTANCE (comp O129R (-) GGAA (-) 58 59 vibrio.) Glu-Gly-ArgARYLAMIDASE 61 L-MALATEassimilation IMLTa (-) 62 ELLMAN ELLM (-) 64 L-LACTATE assimilation ILATa (-) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn ... TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - HUỲNH THANH THẢO XÂY DỰNG QUY TRÌNH XÉT NGHIỆM CHẨN ĐỐN BỆNH BRUCELLA TẠI PHÕNG XÉT NGHIỆM VI SINH THUỘC ĐƠN VỊ NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG ĐẠI HỌC OXFORD. .. nghiệm vi sinh thuộc đơn vị nghiên cứu lâm sàng đại học Oxford thành phố Hồ Chí Minh? ?? MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Xây dựng quy trình xét nghiệm chẩn đốn bệnh Brucella Mơ tả số đặc điểm dịch tễ học yếu... nghiên cứu đơn vị nghiên cứu lâm sàng Đại học Oxford thành phố Hồ Chí Minh bệnh vi? ??n bệnh Nhiệt đới thành phố Hồ Chí Minh 2.2 Đối tƣợng nghiên cứu 2.2.1 Dân số mục tiêu: Mẫu máu bệnh nhân sốt kéo