Đánh giá hiệu quả của thử nghiệm blue carba so với thử nghiệm mcim trong việc phát hiện enterobacteriaceae tiết carbapenemase

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC TP HỒ CHÍ MINH ———— NGUYỄN THỊ HƯƠNG LAN ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ CỦA THỬ NGHIỆM BLUE-CARBA SO VỚI THỬ NGHIỆM mCIM TRONG VIỆC PHÁT HIỆN Enterobacteriaceae TIẾT CARBAPENEMASE LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT Y HỌC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH – 2019 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC TP HỒ CHÍ MINH - NGUYỄN THỊ HƯƠNG LAN ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ CỦA THỬ NGHIỆM BLUE-CARBA SO VỚI THỬ NGHIỆM mCIM TRONG VIỆC PHÁT HIỆN Enterobacteriaceae TIẾT CARBAPENEMASE Ngành: Kỹ Thuật Xét Nghiệm Y Học Mã số: 872 06 01 LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS.BS VÕ THỊ CHI MAI TS.BS.TRƯƠNG THIÊN PHÚ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH – 2019 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Tất sở liệu, tài liệu tham khảo đề tài hoàn toàn trung thực tuân theo yêu cầu đề tài nghiên cứu Luận văn chưa cơng bố cơng trình nghiên cứu khác Tác giả luận văn Nguyễn Thị Hương Lan MỤC LỤC Lời cam đoan i Danh mục viết tắt vi Danh mục bảng viii Danh mục biểu đồ x Danh mục hình xi Tóm tắt luận văn xii Abstract xiv ĐẶT VẤN ĐỀ CÂU HỎI NGHIÊN CỨU MỤC TIÊU CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 TỔNG QUAN VỀ ĐỐI TƯỢNG VI SINH VẬT NGHIÊN CỨU 1.1.1 Đại cương 1.1.2 Tính chất ni cấy 1.1.3 Khả gây bệnh 1.1.4 Các loại vi khuẩn thường gặp 1.1.5 Mức độ đề kháng kháng sinh 1.2 TỔNG QUAN VỀ KHÁNG SINH 1.2.1 Đại cương kháng sinh 1.2.2 Hiện tượng đề kháng kháng sinh 1.3 CƠ CHẾ ĐỀ KHÁNG CỦA VI KHUẨN VỚI KHÁNG SINH 12 1.3.1 Vi khuẩn tiết enzim để phá hủy hoạt tính kháng sinh 12 1.3.2 Vi khuẩn thay đổi khả thẩm thấu màng tế bào kháng sinh 15 1.3.3 Vi khuẩn làm thay đổi điểm tác động kháng sinh 15 1.3.4 Vi khuẩn thay đổi đường biến dưỡng tránh tác động kháng sinh 17 i 1.4 CARBAPENEM VÀ CƠ CHẾ KHÁNG CARBAPENEM 18 1.4.1 Đại cương carbapenem 18 1.4.2 Cơ chế hoạt động 21 1.4.3 Các chế kháng carbapenem 23 1.5 CARBAPENEMASE 25 1.5.1 Carbapenemase lớp A 25 1.5.2 Carbapenemase lớp B 26 1.5.3 Carbapenemase lớp D 26 1.6 THỰC TRẠNG VỀ PHƯƠNG PHÁP PHÁT HIỆN CRE, CÁC THỬ NGHIỆM PHÁT HIỆN CARBAPENEMASE 27 1.6.1 Các phương pháp phát CRE 27 1.6.2 Một số thử nghiệm phát carbapenemase 28 1.6.3 Hướng điều trị nhiễm khuẩn vi khuẩn kháng carbapenem 32 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 34 2.1 ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 34 2.1.1 Thiết kế nghiên cứu 34 2.1.2 Địa điểm nghiên cứu 34 2.1.3 Dân số mục tiêu 34 2.1.4 Cỡ mẫu 34 2.1.5 Kỹ thuật chọn mẫu 34 2.1.6 Tiêu chí chọn mẫu 35 2.2 QUÁ TRÌNH THỰC HIỆN 35 2.2.1 Quy trình thực thử nghiệm Blue-Carba 35 2.2.2 Quy trình thực thử nghiệm mCIM 38 2.2.3 Quy trình thực thử nghiệm real-time PCR 42 2.3 PHƯƠNG PHÁP THU THẬP SỐ LIỆU 49 2.4 PHẦN MỀM XỬ LÝ SỐ LIỆU 49 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 50 3.1 TỶ LỆ CÁC VI KHUẨN MỤC TIÊU 50 3.1.1 Tỷ lệ vi khuẩn Enterobacteriaceae gây bệnh thường gặp 50 3.1.2 Tỷ lệ vi khuẩn Enterobacteriaceae gây bệnh thường gặp kháng carbapenem tiết carbapenemase 51 3.2 SO SÁNH KẾT QUẢ PHÁT HIỆN Enterobacteriaceae TIẾT CARBAPENEMASE CỦA THỬ NGHIỆM BLUE-CARBA SO VỚI THỬ NGHIỆM mCIM 52 3.2.1 Kết so sánh chung 52 3.2.2 Kết so sánh riêng vi khuẩn mục tiêu 53 3.3 KẾT QUẢ PHÂN LỚP CARBAPENEMASE 55 3.3.1 Kết thử nghiệm real-time PCR chung 55 3.3.2 Kết thử nghiệm real-time PCR với vi khuẩn mục tiêu 57 3.3.3 Kết thử nghiệm real-time PCR với kiểu gen 59 3.3.4 Kết phân lớp carbapenemase thử nghiệm Blue-Carba 64 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 72 4.1 ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ CỦA THỬ NGHIỆN BLUE-CARBA SO VỚI THỬ NGHIỆM mCIM 78 4.1.1 Đối với vi khuẩn Enterobacter spp 79 4.1.2 Đối với vi khuẩn E.coli 79 4.1.3 Đối với vi khuẩn K.pneumoniae 79 4.2 SỰ BẤT TƯƠNG ĐỒNG GIỮA BCT VÀ THỬ NGHIỆM mCIM SO VỚI KẾT QUẢ CỦA THỬ NGHIỆM REAL-TIME PCR 79 4.2.1 Đối với chủng vi khuẩn E coli 80 4.2.2 Đối với chủng vi khuẩn K pneumoniae 80 4.3 ĐÁNH GIÁ KẾT QUẢ CỦA BCT VÀ THỬ NGHIỆM mCIM SO VỚI KẾT QUẢ REAL-TIME PCR 81 4.3.1 Khẳng định kết dương tính với carbapenemase BCT 81 4.3.2 Đánh giá khả phân lớp carbapenemase BCT 84 4.3.3 Mục đích sử dụng thử nghiệm Blue-Carba 85 KẾT LUẬN 90 KIẾN NGHỊ 91 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC i DANH MỤC VIẾT TẮT Tiếng anh Tiếng việt AMR: Antimicrobial resistance Kháng kháng sinh BA: Blood Agar Thạch máu CDC: Centers for Disease Control and Trung tâm Kiểm sốt Phịng Prevention ngừa dịch bệnh CLSI: Clinical and Laboratory Standards Viện tiêu chuẩn lâm sàng Institute, USA CPE: phịng thí nghiệm, Hoa Kỳ Carbapenemase - producing Vi khuẩn đường ruột sinh enzim carbapenemase Enterobacteriaceae CRE: Carbapenem - resistant Vi khuẩn đường ruột kháng Enterobacteriaceae carbapenem DAEC (Diffusely adherent E coli) E coli gây kết dính lan tỏa DNA: Deoxyribonucleic acid EAEC (Enteroaggregative E coli) E coli gây kết dính đường ruột EDTA: Ethylendiamin Tetraacetic Acid EHEC: Enterohemorrhagic E coli E coli gây xuất huyết đường ruột EIEC: Enteroinvasive E coli E coli xâm lấn đường ruột EPEC: Enteropathogenic E coli E coli gây bệnh đường ruột ESBL: Extended-Spectrum β-lactamases β-lactamase phổ rộng ETEC: Enterotoxigenic E coli E coli sinh độc tố ruột EUCAST: The European Committee on Ủy ban châu Âu thử nghiệm Antimicrobial Succeptibility Testing tính nhạy cảm kháng sinh FDA: Food and Drug Administration Cục Quản lý Thực phẩm .i Dược (Hoa Kỳ) GARP-VN: Global Antibiotic Resistance Dự án Hợp tác toàn cầu Partnership Viet Nam kháng kháng sinh GARP Việt Nam Đơn vị Nghiên cứu Lâm sàng ĐH Oxford mCIM: Modified Carbapenem Inactivation Phương pháp bất hoạt Method carbapenem cải tiến MDR: Multi Drug Resistance Đa kháng thuốc MHA: Mueller Hinton Agar Thạch MH MHT: Modified Hodge Test Thử nghiệm Hodge cải tiến MIC: Minimum Inhibitory Concentration Nồng độ ức chế tối thiểu PABA: Para-Amino-Benzoic Acid PBP: Penicillin-Binding Protein Protein gắn Penicillin PCR: Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi polymerase PDR: Pan Drug Resistance Kháng thuốc toàn VITEK MS (MALDI-TOF technology): VITEK khối phổ (kỹ thuật VITEK Mass spectrometry Assisted Laser Desorption (Matrix MALDI-TOF) Ionization Time-of-Flight technology) VRE: Vancomycin-Resistant Enterococcus Enterococcus Vancomycin WHO: World Health Organization Tổ chức y tế giới XDR: Extended Drug Resistance Kháng diện rộng kháng ii DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1: Kháng sinh nhóm β-lactam 20 Bảng 1.2: Cách đọc kết thử nghiệm đĩa kết hợp MASTDISCS® ID (D70C+D71C + temocillin) 30 Bảng 2.1: Kết thử nghiệm Blue – Carba 38 Bảng 2.2: Chương trình khuếch đại 45 Bảng 2.3: Điều kiện đọc kết MBL (VIM,IMP,NDM) Real-TM 46 Bảng 2.4: Điều kiện đọc kết KPC/OXA Real-TM 46 Bảng 2.5: Phân tích kết real-time PCR MDR MBL (VIM,IMP,NDM) 47 Bảng 2.6: Phân tích kết real-time PCR MDR KPC/OXA 48 Bảng 3.1: Tỷ lệ vi khuẩn họ Enterobacteriaceae gây bệnh thường gặp 50 Bảng 3.2: Phát vi khuẩn họ Enterobacteriaceae tiết carbapenemase 51 Bảng 3.3: Kết thử nghiệm Blue-Carba thử nghiệm mCIM 53 Bảng 3.4: Kết phát vi khuẩn Enterobacter spp tiết carbapenemase 53 Bảng 3.5: Kết phát vi khuẩn E coli tiết carbapenemase 54 Bảng 3.6: Kết phát vi khuẩn K pneumoniae tiết carbapenemase 55 Bảng 3.7: Sự phân bố kiểu gen carbapenemase 56 Bảng 3.8: Số kiểu gen carbapenemase vi khuẩn Enterobacter spp 57 Bảng 3.9: Số kiểu gen carbapenemase vi khuẩn E coli 58 Bảng 3.10: Số kiểu gen carbapenemase vi khuẩn K pneumoniae 58 Bảng 3.11: Tỷ lệ vi khuẩn tiết KPC 59 Bảng 3.12: Tỷ lệ vi khuẩn tiết NDM 60 Bảng 3.13: Tỷ lệ vi khuẩn tiết OXA-48 60 Bảng 3.14: Tỷ lệ vi khuẩn tiết đồng thời kiểu gen VIM+NDM 61 Bảng 3.15: Tỷ lệ vi khuẩn tiết đồng thời kiểu gen IMP+NDM 62 Bảng 3.16: Tỷ lệ vi khuẩn tiết đồng thời kiểu gen IMP+OXA-48 62 Bảng 3.17: Tỷ lệ vi khuẩn tiết đồng thời kiểu gen NDM+OXA-48 63 Bảng 3.18: Tỷ lệ vi khuẩn chưa xác định kiểu gen 64 Bảng 3.19: Thời gian xác định kết thử nghiệm Blue-Carba 64 Bảng 3.20: Xác định kết BCT với kiểu gen KPC 65 Bảng 3.21: Xác định kết BCT với kiểu gen NDM 66 Bảng 3.22: Xác định kết BCT với kiểu gen OXA-48 66 Bảng 3.23: Xác định kết BCT với kiểu gen VIM+NDM 67 Bảng 3.24: Xác định kết BCT với kiểu gen IMP+NDM 68 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-079 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-086 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-089 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-093 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-095 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-099 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-100 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-106 K pneumoniae - 120 - CRE-109 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-113 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-114 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-118 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-119 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-120 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-123 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-125 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-132 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-133 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-135 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-141 K pneumoniae +++ 15 +++ >=16.0 >=16.0 CRE-144 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-145 K pneumoniae +++ 15 +++ >=16.0 >=16.0 CRE-146 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-147 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-148 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-150 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-151 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-152 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-158 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-159 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-170 K pneumoniae +++ 30 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-185 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-186 K pneumoniae - 120 - >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-188 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-190 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-194 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-202 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-205 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-207 K pneumoniae +++ 30 ++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-208 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-210 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-211 K pneumoniae +++ 30 ++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-212 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-213 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-216 K pneumoniae +++ 30 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-217 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-220 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-221 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-222 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-223 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-224 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-225 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-227 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-228 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-232 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 CRE-233 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-235 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-236 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-237 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-240 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-241 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 CRE-242 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-247 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-248 K pneumoniae +++ 15 +++ >=8.0 >=16.0 >=16.0 CRE-249 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC 5: KẾT QUẢ THỬ NGHIỆM REAL-TIME PCR (MDR MBL) STT MÃ SỐ MẪU FAM HEX ROX CY5 (VIM) (IMP) (IC) (NDM) M-001 (MDR MBL Cho Ray) 26.5 M-002 (MDR MBL Cho Ray) 25.6 M-003 (MDR MBL Cho Ray) 26.6 M-004 (MDR MBL Cho Ray) 25.7 11.2 M-005 (MDR MBL Cho Ray) 30.3 13.1 M-006 (MDR MBL Cho Ray) 27.7 12.4 M-009 (MDR MBL Cho Ray) 26.1 M-010 (MDR MBL Cho Ray) 26.8 11.3 M-011 (MDR MBL Cho Ray) 26.9 7.6 10 M-012 (MDR MBL Cho Ray) 28.4 12.6 11 M-013 (MDR MBL Cho Ray) 26.7 10.7 12 M-016 (MDR MBL Cho Ray) 28.4 11.3 13 M-017 (MDR MBL Cho Ray) 26.1 14 M-018 (MDR MBL Cho Ray) 26.6 15 M-019 (MDR MBL Cho Ray) 27.1 12.3 16 M-020 (MDR MBL Cho Ray) 27.1 9.8 17 M-022 (MDR MBL Cho Ray) 26.4 18 M-024 (MDR MBL Cho Ray) 26.7 19 M-026 (MDR MBL Cho Ray) 26.6 20 M-029 (MDR MBL Cho Ray) 25.4 11.2 21 M-030 (MDR MBL Cho Ray) 25.4 11.3 22 M-031 (MDR MBL Cho Ray) 25.2 11.1 23 M-032 (MDR MBL Cho Ray) 25.2 11.1 24 M-033 (MDR MBL Cho Ray) 27.5 25 M-034 (MDR MBL Cho Ray) 27.4 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 10.4 18.1 8.6 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 26 M-037 (MDR MBL Cho Ray) 26.3 9.2 27 M-038 (MDR MBL Cho Ray) 26.5 9.5 28 M-039 (MDR MBL Cho Ray) 25.6 11.2 29 M-040 (MDR MBL Cho Ray) 27.5 8.2 30 M-041 (MDR MBL Cho Ray) 25.2 31 M-042 (MDR MBL Cho Ray) 26.2 12.4 32 M-043 (MDR MBL Cho Ray) 25.3 10.4 33 M-044 (MDR MBL Cho Ray) 26.7 10.4 34 M-045 (MDR MBL Cho Ray) 28.4 10.2 35 M-046 (MDR MBL Cho Ray) 27.1 11.1 36 M-047 (MDR MBL Cho Ray) 27.3 8.6 37 M-048 (MDR MBL Cho Ray) 26.8 11.4 38 M-049 (MDR MBL Cho Ray) 26.7 13.2 39 M-050 (MDR MBL Cho Ray) 25.7 40 M-051 (MDR MBL Cho Ray) 26.4 7.4 41 M-056 (MDR MBL Cho Ray) 28.2 12.1 42 M-057 (MDR MBL Cho Ray) 26.6 43 M-060 (MDR MBL Cho Ray) 26.1 8.8 44 M-061 (MDR MBL Cho Ray) 28.5 8.5 45 M-062 (MDR MBL Cho Ray) 26.5 10.2 46 M-064 (MDR MBL Cho Ray) 27.8 47 M-070 (MDR MBL Cho Ray) 28.3 48 M-076 (MDR MBL Cho Ray) 26.5 49 M-081 (MDR MBL Cho Ray) 28.8 50 M-082 (MDR MBL Cho Ray) 28.9 51 M-084 (MDR MBL Cho Ray) 52 M-087 (MDR MBL Cho Ray) 25.7 9.0 53 M-092 (MDR MBL Cho Ray) 26.9 32.2 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 33.5 9.4 26.5 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 54 M-096 (MDR MBL Cho Ray) 34.6 26.5 55 M-098 (MDR MBL Cho Ray) 29.4 56 M-108 (MDR MBL Cho Ray) 26.9 57 M-112 (MDR MBL Cho Ray) 25.6 8.4 58 M-115 (MDR MBL Cho Ray) 31.2 10.3 59 M-117 (MDR MBL Cho Ray) 26.3 8.7 60 M-124 (MDR MBL Cho Ray) 27.4 8.7 61 M-130 (MDR MBL Cho Ray) 27.4 8.8 62 M-131 (MDR MBL Cho Ray) 26.2 9.1 63 M-134 (MDR MBL Cho Ray) 26.6 9.3 64 M-138 (MDR MBL Cho Ray) 26.4 9.0 65 M-140 (MDR MBL Cho Ray) 26.4 66 M-142 (MDR MBL Cho Ray) 26.5 67 M-149 (MDR MBL Cho Ray) 27.2 68 M-156 (MDR MBL Cho Ray) 27.3 69 M-157 (MDR MBL Cho Ray) 26.6 70 M-160 (MDR MBL Cho Ray) 71 8.3 9.5 25.7 7.9 M-162 (MDR MBL Cho Ray) 26.5 7.5 72 M-163 (MDR MBL Cho Ray) 26.2 73 M-165 (MDR MBL Cho Ray) 26.4 74 M-167 (MDR MBL Cho Ray) 26.5 9.2 75 M-169 (MDR MBL Cho Ray) 27.5 9.1 76 M-171 (MDR MBL Cho Ray) 27.7 7.8 77 M-173 (MDR MBL Cho Ray) 26.4 8.5 78 M-174 (MDR MBL Cho Ray) 26.1 8.6 79 M-175 (MDR MBL Cho Ray) 25.7 11.3 80 M-176 (MDR MBL Cho Ray) 28.7 6.8 81 M-177 (MDR MBL Cho Ray) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 35.5 8.8 34.0 34.5 34.0 26.8 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 82 M-178 (MDR MBL Cho Ray) 26.3 83 M-179 (MDR MBL Cho Ray) 26.2 8.8 84 M-189 (MDR MBL Cho Ray) 26.5 8.0 85 M-195 (MDR MBL Cho Ray) 26.0 9.4 86 M-197 (MDR MBL Cho Ray) 27.2 87 M-198 (MDR MBL Cho Ray) 27.1 88 M-199 (MDR MBL Cho Ray) 24.6 89 M-200 (MDR MBL Cho Ray) 27.4 90 M-214 (MDR MBL Cho Ray) 27.4 91 M-238 (MDR MBL Cho Ray) 26.1 92 M-239 (MDR MBL Cho Ray) 27.3 93 M-245 (MDR MBL Cho Ray) 27.2 94 M-250 (MDR MBL Cho Ray) 26.1 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 11.2 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC 6: KẾT QUẢ THỬ NGHIỆM REAL-TIME PCR (MDR KPC/OXA) STT MÃ SỐ MẪU FAM HEX ROX (VIM) (IMP) (IC) K-001 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 9.2 26.2 K-002 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10.6 26.1 K-003 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 9.9 27.1 K-004 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10.8 28.3 K-005 (MDR KPC/OXA Cho Ray) K-006 (MDR KPC/OXA Cho Ray) K-009 (MDR KPC/OXA Cho Ray) K-010 (MDR KPC/OXA Cho Ray) K-011 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10 K-012 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 27.0 11 K-013 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 27.9 12 K-016 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 25.6 13 K-017 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 11.4 26.7 14 K-018 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 7.5 28.3 15 K-019 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.3 16 K-020 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.5 17 K-022 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 18 K-024 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 19 K-026 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 9.4 26.3 20 K-029 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10.4 25.3 21 K-030 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 22 K-031 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 23 K-032 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 24 K-033 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 25 K-034 (MDR KPC/OXA Cho Ray) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 27.8 12.4 12.2 27.2 25.4 27.4 8.1 10.9 35.1 28.2 28.2 26.1 12.0 25.5 25.1 12.2 28.4 27.5 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 26 K-037 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.5 27 K-038 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.4 28 K-039 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 29 K-040 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 30 K-041 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 31 K-042 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 25.3 32 K-043 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 25.4 33 K-044 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 34 K-045 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.5 35 K-046 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 29.6 36 K-047 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 29.2 37 K-048 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 25.6 38 K-049 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 25.2 39 K-050 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 40 K-051 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 27.5 41 K-056 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.3 42 K-057 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 11.1 27.7 43 K-060 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 7.4 26.5 44 K-061 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.1 45 K-062 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.5 46 K-064 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 9.6 29.8 47 K-070 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10.3 27.6 48 K-076 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 9.6 28.2 49 K-081 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10.5 28.4 50 K-082 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 51 K-084 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 52 K-087 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 53 K-092 (MDR KPC/OXA Cho Ray) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 11.5 25.6 26.8 9.6 7.6 10.4 25.5 26.4 25.3 29.6 9.6 27.8 26.1 7.4 26.1 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 54 K-096 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 55 K-098 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 9.5 27.2 56 K-108 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 8.1 27.3 57 K-112 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 8.5 25.7 58 K-115 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 59 K-117 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 60 K-124 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.4 61 K-130 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.2 62 K-131 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.6 63 K-134 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 27.4 64 K-138 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.5 65 K-140 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 66 K-142 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 67 K-149 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 68 K-156 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 69 K-157 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 70 K-160 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.1 71 K-162 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.1 72 K-163 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10.5 27.4 73 K-165 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10.4 27.2 74 K-167 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.5 75 K-169 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 28.2 76 K-171 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.5 77 K-173 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.6 78 K-174 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.4 79 K-175 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.0 80 K-176 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 26.1 81 K-177 (MDR KPC/OXA Cho Ray) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 25.8 26.3 9.5 9.2 26.0 27.2 26.3 10.0 28.8 26.3 10.2 10.4 26.6 27.3 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 82 K-178 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 10.2 27.4 83 K-179 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 9.4 27.1 84 K-189 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 8.7 26.3 85 K-195 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 9.1 26.9 86 K-197 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 12.0 28.4 87 K-198 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 11.0 27.5 88 K-199 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 89 K-200 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 13.1 27.4 90 K-214 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 12.9 27.3 91 K-238 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 11.3 26.7 92 K-239 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 35.5 27.3 93 K-245 (MDR KPC/OXA Cho Ray) 94 K-250 (MDR KPC/OXA Cho Ray) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 25.1 19.4 27.3 11.1 26.1 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC 7: DANH SÁCH BỆNH NHÂN ĐƯỢC LẤY MẪU TẠI BỆNH VIỆN CHỢ RẪY STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 HỌ BUI THI DAO LIEN HIEP LE THI NGOC LE XUAN LE THI BACH TRAN ĐANG PHAN VAN LE VAN TOAN VO VAN NGUYEN THI TRAN VAN PHAM THUY DO VAN BE NGUYEN VAN NGUYEN THI DINH THI THACH MINH TRAN TRONG NGUYEN THANH DUONG THI NGUYEN VAN VO VAN NGUYEN HOANG VU THI NGUYEN HAI LE CONG LE THI HOANG MANH THACH PHAM VAN TRAN THI TRAN THI NGUYEN THI TO VAN QUOC KROY TRINH THI PHAM VAN NGUYEN MINH TÊN GIỚI NĂM SINH SỐ NHẬP VIỆN U G Đ T K K C E B P C L T B M M N S T U T B N L B T S H H T Y D M D S P S V NỮ NỮ NỮ NAM NỮ NAM NAM NAM NAM NỮ NAM NỮ NAM NAM NỮ NỮ NAM NAM NAM NỮ NAM NAM NAM NỮ NAM NAM NỮ NAM NAM NAM NỮ NỮ NỮ NAM NAM NỮ NAM NAM 1959 1965 1957 1994 1968 1991 1977 1997 1951 1931 1971 1981 1986 1992 1947 1955 2002 1959 1940 1944 1954 1951 1969 1970 1960 1934 1985 1969 1943 1933 1953 1930 1951 1994 1998 1953 1942 1967 2180075894 2180064960 2180059224 2180078559 2180078881 2180069802 2180078788 2180069383 1180069951 2180069038 2180069694 2180080983 2180078494 2180080834 Ngoại trú 2180080422 2180078891 Ngoại trú 2180079356 2180079646 2180081260 2180080939 2180081108 2180077681 2180045856 2180082556 2180079458 2180081643 2180083501 Ngoại trú 2180085298 2180081978 2180084935 2180083415 2180085646 2180086262 2180085227 2180085791 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 LE THI PHAM VAN DO VAN NGUYEN THI NGOC NGUYEN THI NGUYEN DUONG PH VO VAN NGUYEN HAI NGUYEN HOANG VO THI KIM VO VAN NGUYEN VAN KA NGUYEN MINH NGUYEN THI BUI VAN NGUYEN ANH CU THI DUONG THANH DNH THI HOANG TO THI PHAN VU MAI VAN TRAN VAN VU THI VU THI NGUYEN THI NGUYEN VAN CHAU THI TRAN THI KIM NGO MANH ONG TAI NGUYEN VAN NGUYEN VAN NGUYEN MINH NGUYEN THI LUONG THI HUYEN NGO CONG HUYNH VAN DO VAN NGUYEN VAN PHAM VAN NGUYEN VAN T D N A U T L B S Y P H N C H S D H S A A U C B B H H T G T A T S H C T T C H T T T C A Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn NỮ NAM NAM NỮ NỮ NỮ NAM NAM NAM NỮ NAM NAM NỮ NAM NỮ NAM NAM NỮ NAM NỮ NAM NỮ NAM NAM NAM NỮ NỮ NỮ NAM NỮ NỮ NAM NAM NAM NAM NAM NỮ NỮ NAM NAM NAM NAM NAM NAM 1987 1973 1942 1948 1952 1993 1953 1960 1944 1965 1931 1956 1978 1937 1981 1960 1963 1949 1971 1947 1951 1931 1963 1951 1945 1995 1995 1944 1920 1960 1992 1958 1978 1964 1976 2001 1955 1986 1946 1980 1946 1944 1963 1956 2180079075 2180085475 2180083040 2180086523 2180085948 2180085621 2180084566 2180045856 2180074507 2180082976 2180084760 2180087411 2180086578 2180088274 2180084561 2180085964 2180086213 2180088111 2180082425 2180080744 2180088834 2180088598 2180065990 2180087253 2180083185 2180086725 2180086725 2180088365 1180079077 2180089073 2180091028 2180091169 2180087898 2180082798 Ngoại trú 2180092454 2180088001 2180089500 2180091989 2180089576 2180089609 2180091046 2180067916 2180093025 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 TRAN VAN NGUYEN VAN KA TRAN THANH TRAN THANH PHAN HOANG NONG QUANG BUI VAN VO VAN HUYNH THI THU TRAN THANH VO MINH NGUYEN THI NGUYEN VAN BUI THI KIM PHAN THI TRAN QUANG TRAN THI NGUYEN THI BACH NGUYEN PHU LE QUANG TRAN MINH ONG THI TRAN THI CAO VAN THI LE HUU TRAN THI VO ĐINH TRAN THANH NGUYEN THI THU THI HUYNH TAN TRAN THI DO THI NGUYEN VAN HO HUE HUYNH VAN TRAN VAN TRAN THI DO PHUONG HUYNH VAN HUYNH VAN TRAN THAI V V N N N M T N H T C G L D T T C H C Đ T H M K C K T N T Đ H V B M H D H M X M T X C B Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn NAM NAM NỮ NỮ NỮ NAM NAM NAM NAM NỮ NAM NAM NỮ NAM NỮ NỮ NAM NỮ NỮ NAM NAM NAM NỮ NỮ NAM NỮ NAM NỮ NAM NAM NỮ NỮ NAM NỮ NỮ NAM NỮ NAM NAM NỮ NAM NAM NAM NAM 1928 1970 1978 1978 1978 1974 1970 1985 1968 1974 1955 1976 1942 1971 1974 1955 1935 1972 1957 1955 1960 1954 1977 1928 1968 1969 1983 1967 1967 1934 1976 1978 1986 1938 1945 1960 1951 1957 1972 1930 1948 1929 1936 1963 2180091106 2180081189 2180086578 2180094084 2180094084 2180087009 2180093549 2180094041 2180091133 2180085574 2180091569 2180096397 2180093714 2180095932 2180081099 2180096780 2180093884 2180090305 2180094027 2180094726 2180097083 2180077220 2180093597 2180098131 Ngoại trú 2180092600 2180100243 2180095230 2180095539 2180100498 2180097435 2180098603 2180096407 2180100679 2180096816 2180096741 2180095733 2180096024 2180102613 2180090093 2180102631 2180103327 2180103470 2180103119 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 DOAN NGUYEN VAN NGUYEN THI NGO QUANG DOAN CHI TRUONG PHU DO THI HUYNH VAN HUA HOANG DUONG VAN PHAM THI LA THI BICH LAM MINH KRA JAN LEN NGUYEN NGOC QU HO VAN NGUYEN VAN NGUYEN THI NGUYEN MINH PHAM VAN NGUYEN VAN NGUYEN VAN PHUNG OAI NGUYEN VAN HUYNH THI YEN NGUYEN VAN NGUYEN THI KIM LUONG VAN DANG DINH DUONG TAN NGUYEN VAN BE NGUYEN THANH LAM MINH BUI VAN CAO VAN NGO THI THU DANG THAI LE THI TRAN THI VU QUANG TRAN THI NGUYEN THI NGUYEN THI T T M H T P T G E D T T D D V H D L H D T L N T N G L H T L T L D C H H B T S H E T H M Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn NAM NAM NỮ NAM NAM NAM NỮ NAM NAM NAM NỮ NỮ NAM NAM NAM NAM NAM NỮ NAM NAM NAM NAM NAM NAM NỮ NAM NỮ NAM NAM NAM NAM NAM NAM NAM NAM NỮ NAM NỮ NỮ NAM NỮ NỮ NỮ NỮ 1996 1965 1938 1982 1994 1972 1937 1956 1955 1958 1978 1989 2002 1974 1989 1962 1952 1930 1987 1956 1955 1968 1964 1939 1988 1938 1948 1973 1937 1984 1958 1997 2002 1942 1951 1972 1963 1956 1963 1969 1971 1946 1997 1934 2180101558 2180103429 Ngoại trú 2180088966 2180101290 2180101863 1180089676 2180091799 2180100045 2180104965 2180104314 2180084276 2180103460 2180102462 2180097719 2180100986 2180103985 2180086803 2180103319 2180103080 2180106405 2180115416 2180113647 2180109972 Ngoại trú 2180112453 2180097658 2180109617 2180105121 2180112401 2180111172 2180115108 2180103460 2180111612 2180114192 2180113212 2180109511 2180113607 2180122229 2180117302 2180120537 2180121399 2180125347 2180123608 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 HOANG VAN NGUYEN THI NGUYEN VAN HO HA THI NGUYEN THI TRAN VAN LA THI MINH TRUONG NGOC CAO THI DIEU DO TIEN THAI KIM TRAN VAN TRAN DIEU DANG VAN HUYNH THI BICH PHAM THI TRAN THI KIM HUA KIM S L D H C M N L T A T N D H T T X L C Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn NAM NỮ NAM NAM NỮ NỮ NAM NỮ NỮ NỮ NAM NAM NAM NAM NAM NỮ NỮ NỮ NỮ 1976 1971 1959 1927 1950 1934 1963 1986 1987 1967 1955 1936 1959 1972 1967 1943 1967 1977 1947 2180124729 2180124656 2180123822 2180122256 2180129194 2180123608 2180128816 2180128005 2180123347 2180124241 2180128361 2180127324 2180126598 2180129866 2180126711 2180115208 2180122354 2180130122 2180128655 ... kháng carbapenem tiết carbapenemase 51 3.2 SO SÁNH KẾT QUẢ PHÁT HIỆN Enterobacteriaceae TIẾT CARBAPENEMASE CỦA THỬ NGHIỆM BLUE- CARBA SO VỚI THỬ NGHIỆM mCIM 52 3.2.1 Kết so sánh... Kết thử nghiệm real-time PCR với kiểu gen 59 3.3.4 Kết phân lớp carbapenemase thử nghiệm Blue- Carba 64 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 72 4.1 ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ CỦA THỬ NGHIỆN BLUE- CARBA SO VỚI THỬ... BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC TP HỒ CHÍ MINH - NGUYỄN THỊ HƯƠNG LAN ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ CỦA THỬ NGHIỆM BLUE- CARBA SO VỚI THỬ NGHIỆM mCIM TRONG VIỆC PHÁT HIỆN Enterobacteriaceae