Développement dun portail web pour le criblage virtuel sur la grille de calcul

Institut de la Francophonie pour l’Informatique M´ emoire de fin d’´ etudes pour l’obtention du diplˆ ome de Master II Informatique Option : R´ eseaux et Syst` emes Communicants D´ eveloppement d’un portail web pour le criblage virtuel sur la grille de calcul Promotion 17-RSC R´ edig´ e par : Louacheni Farida Sous l’encadrement de : Dr.Nguyen Hong Quang Dr.Doan Trung Tung Dr.Bui The Quang 20 novembre 2014 Remerciements Ce travail de stage de fin d’´etudes a ´et´e effectu´e au sein du Laboratoire MSI `a l’Institut de la Francophonie pour l’Informatique, sous la direction du Docteur Nguyen Hong Quang, auquel je tiens `a exprimer ma profonde gratitude, et ma vive reconnaissance pour m’avoir confi´e ce sujet J’adresse mes plus vifs remerciements au Dr.Doan Tung Tung et Dr.Quang Bui The de m’avoir encadr´e et prodigu´e maints conseils Je suis tr`es reconnaissante `a tous les enseignants de l’IFI pour la qualit´e de l’enseignement qu’ils nous ont offerts Ma reconnaissance infinie ` a mes tr`es chers parents qui m’ont enseign´e la pers´ev´erance dans mes ´etudes, qui m’ont toujours ´et´e d’un grand secours par leur soutient et leur encouragement, ainsi mes adorables soeurs et mon tr`es cher fr`ere et mon ami Yacine-Malek Enfin, un immense merci ` a mes amis qui m’ont toujours soutenue i R´ esum´ e ` l’heure actuelle, la grille de calcul est en train de devenir une force motrice maA jeure pour de nouvelles approches pour la collaboration de science `a grande ´echelle Plusieurs programmes nationaux et internationaux eScience ont favoris´e la collaboration entre chercheurs de diff´erents domaines scientifiques Dans le domaine biom´edicale, plus pr´ecisement dans la recherche de nouveaux m´edicaments pour les maladies infectieuses La grille de calcul a initi´e plusieurs projets ` a grande ´echelle dans les approches de criblage de m´edicaments in-silico Le projet WISDOM a ´et´e parmi les premiers projets dans le domaine public qui a fait usage de la grille tout en permettant le docking in-silico pour simuler l’interaction de m´edicaments potentiels avec des prot´eines cibles Le docking in-silico est la premi`ere ´etape dans le processus de criblage virtuel, il est consid´er´e comme l’une des approches les plus prometteuses afin acc´el´erer et de r´eduire les coˆ uts de d´eveloppement de nouveaux m´edicaments pour les maladies n´eglig´ees Bien que, de nombreuses applications ont ´et´e d´evelopp´ees pour permettre le criblage virtuel dont le but d’acc´el´erer le processus de recherche des m´edicaments Une barri`ere critique de ces programmes est leur complexit´e en terme d’utilisation et de pr´evoir des proc´edures concises pour les utilisateurs r´eguliers L’objectif de ce travail est de d´evelopper un portail web conviviale pour effectuer le criblage virtuel, et de d´eployer un tr`es grand nombre de docking sur la grille de calcul Pour atteindre ce but, la grille de calcul a ´et´e utilis´e pour acc´el´erer la recherche et la d´ecouverte de nouveaux m´edicaments in-silico et traitements pour les maladies infectieuses ii ... effectuer le criblage virtuel, et de d´eployer un tr`es grand nombre de docking sur la grille de calcul Pour atteindre ce but, la grille de calcul a ´et´e utilis´e pour acc´el´erer la recherche et la. .. esum´ e ` l’heure actuelle, la grille de calcul est en train de devenir une force motrice maA jeure pour de nouvelles approches pour la collaboration de science `a grande ´echelle Plusieurs programmes... infectieuses La grille de calcul a initi´e plusieurs projets ` a grande ´echelle dans les approches de criblage de m´edicaments in-silico Le projet WISDOM a ´et´e parmi les premiers projets dans le domaine