Xác định một số yếu tố độc lực của enterotoxigenic escherichia coli ETEC gây tiêu chảy trên heo con ở đồng bằng sông cửu long

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ NGUYỄN THỊ HẠNH CHI MSHV: 62031105 XÁC ĐỊNH MỘT SỐ YẾU TỐ ĐỘC LỰC CỦA ENTEROTOXIGENIC ESCHERICHIA COLI (ETEC) GÂY TIÊU CHẢY TRÊN HEO CON Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC NGÀNH: VI SINH VẬT HỌC MÃ NGÀNH: 62 42 01 07 2015 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ NGUYỄN THỊ HẠNH CHI MSHV: 62031105 XÁC ĐỊNH MỘT SỐ YẾU TỐ ĐỘC LỰC CỦA ENTEROTOXIGENIC ESCHERICHIA COLI (ETEC) GÂY TIÊU CHẢY TRÊN HEO CON Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC NGÀNH: VI SINH VẬT HỌC MÃ NGÀNH: 62 42 01 07 CÁN BỘ HƯỚNG DẪN PGS.TS HÀ THANH TOÀN PGS.TS LÝ THỊ LIÊN KHAI 2015 CHẤP THUẬN CỦA HỘI ĐỒNG Luận án này, với đề tựa “Xác định số yếu tố độc lực Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) gây bệnh tiêu chảy heo Đồng Sông Cửu Long”, nghiên cứu sinh Nguyễn Thị Hạnh Chi thực hướng dẫn PGS.TS Hà Thanh Toàn PGS.TS Lý Thị Liên Khai Luận án bảo vệ Hội đồng chấm luận án cấp Trường thơng qua ngày 03 tháng 10 năm 2015 phịng 106 Viện Nghiên cứu Phát triển Công nghệ Sinh học – Trường Đại học Cần Thơ CÁN BỘ HƯỚNG DẪN PGS.TS HÀ THANH TOÀN PGS.TS LÝ THỊ LIÊN KHAI CHỦ TỊCH HỘI ĐỒNG PGS.TS TRẦN NHÂN DŨNG LỜI CẢM TẠ Trong suốt thời gian học tập thực đề tài hồn thành luận án, tơi ln nhận giúp đỡ nhiều tập thể cá nhân Nhân dịp này, tơi khơng biết nói ngồi lời cảm ơn chân thành đến người quan tâm, lo lắng giúp đỡ thời gian qua Trước tiên, xin gửi lời cảm ơn sâu sắc đến ba mẹ - đấng sinh thành anh chị em gia đình thân u ln nguồn động lực thúc đẩy nỗ lực phấn đấu Cảm ơn chồng gái tạo điều kiện cho tơi có thời gian học tập thật tốt Tất người thân yêu dành cho tất tình u, khuyến khích ủng hộ tơi chặng đường học tập hồn thành luận án tiến sĩ Với tất lòng biết ơn sâu sắc, xin chân thành cảm ơn PGS.TS Hà Thanh Tồn PGS.TS Lý Thị Liên Khai, tận tình hướng dẫn, giúp đỡ tơi suốt q trình học tập, thực đề tài hoàn thành luận án Đặc biệt, thầy cô người truyền cho lòng nhiệt huyết niềm đam mê khoa học, khơi dậy tự tin, nỗ lực, cố gắng khơng ngừng khơng chùn bước trước khó khăn suốt thời gian thực luận án tiến sĩ Tôi quên ủng hộ hướng dẫn tận tình thầy Hideki Hayashidani, Bộ mơn Thú y, Khoa Nông nghiệp, Đại học Nông nghiệp Kỹ thuật Tokyo, Nhật Bản, suốt thời gian Nhật trình thực luận án Tôi xin chân thành cảm ơn thầy cô dành nhiều thời gian, cơng sức giúp tơi có định hướng đắn học tập nghiên cứu Tơi ln ln ghi nhớ cơng ơn tình cảm PGS.TS Trần Đình Từ, PGS.TS Võ Ái Quấc, người thầy dõi theo nâng đỡ suốt thời thực hoàn thành luận án Xin gửi lời cảm ơn chân thành đến Ban Giám Hiệu Trường Đại học Cần Thơ, Khoa Sau Đại học, Ban lãnh đạo Viện Nghiên cứu Phát triển Công nghệ Sinh học quan tâm giúp đỡ tạo điều kiện tốt cho tơi hồn thành tiến trình học tập nghiên cứu Xin ghi nhớ công ơn quý Thầy, Cô Viện Nghiên cứu Phát triển Công nghệ Sinh học thầy cô Bộ môn Thú y, khoa Nông nghiệp Sinh học ứng dụng hết lòng truyền đạt kinh nghiệm kiến thức quý báu cho suốt thời gian học Chân thành cảm ơn thầy cô Hội đồng đánh giá luận án tiến sĩ cấp sở, cấp trường hai nhà khoa học phản biện kín đọc đóng góp ý kiến quý báu để luận án hồn chỉnh i Tơi thân cảm ơn: Các bạn, em phịng E208 Bộ mơn Thú Y, khoa Nông nghiệp Sinh học ứng dụng; phịng thí nghiệm Sinh học phân tử Viện Nghiên cứu Phát triển Công nghệ Sinh học, Đại học Cần Thơ phịng thí nghiệm Vi khuẩn học Khoa Nông nghiệp, Đại học Nông nghiệp Kỹ thuật Tokyo, Nhật Bản Các anh, chị, bạn nghiên cứu sinh, học viên cao học em sinh viên Đại học đồng hành tơi suốt q trình học tập, nghiên cứu; chia sẻ khó khăn, khuyến khích động viên tơi suốt thời gian qua Các cán Chi cục thú y tỉnh, trạm thú y huyện, ban lãnh đạo cán kỹ thuật trại, hộ chăn nuôi tỉnh An Giang, Bến Tre, Đồng Tháp, Sóc Trăng, Vĩnh Long thành phố Cần Thơ tạo điều kiện giúp đỡ việc lấy mẫu Xin chân thành cảm ơn Ban Giám Hiệu trường Đại học An Giang, Ban Chủ nhiệm Khoa Nông nghiệp – Tài nguyên Thiên nhiên, trường Đại học An Giang tạo điều kiện để tham gia học tập nâng cao trình độ chuyên môn, bạn đồng nghiệp không ngừng động viên giúp đỡ suốt thời gian học tập Cuối xin kính chúc tất người thật nhiều sức khỏe, hạnh phúc thành công! Nguyễn Thị Hạnh Chi ii TÓM LƯỢC Đề tài thực nhằm khảo sát lưu hành, khả gây bệnh khả đề kháng với kháng sinh vi khuẩn enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) gây bệnh tiêu chảy heo tỉnh/ thành thuộc Đồng sông Cửu Long (ĐBSCL) Phương pháp phân lập phản ứng huyết học sử dụng để định danh chủng E coli Tỷ lệ phân lập vi khuẩn E coli heo tiêu chảy, heo khỏe môi trường 99,45%, 98,99% 40,74% Tỷ lệ phân lập vi khuẩn E coli gây tiêu chảy heo khác khơng có ý nghĩa thống kê mùa mưa (100%) mùa nắng (98,91%), heo theo mẹ (99,23%) heo sau cai sữa (99,52%) Tuy nhiên, E coli phân lập mẫu chuồng (64,75%) cao so với mẫu nước uống (11,84%), (p