Xác định mô hình thống kê di truyền phù hợp, ước tính giá trị giống và đánh giá khuynh hướng di truyền một số tính trạng sinh sản của lợn landrace, yorkshire

- - TRẦN THỊ MINH HOÀNG XÁ ĐỊNH MƠ HÌNH THỐNG KÊ DI TRUYỀN PHÙ HỢP, ƯỚC TÍNH GIÁ TRỊ GIỐ G À ĐÁ G ÁK Y ƯỚNG DI TRUYỀN MỘT SỐ TÍNH TRẠNG SINH SẢN CỦA LỢN LANDRACE, YORKSHIRE LUẬN ÁN TIẾN SỸ NÔNG NGHI P HÀ N I, 2020 - - TRẦN THỊ MINH HỒNG XÁ ĐỊNH MƠ HÌNH THỐNG KÊ DI TRUYỀN PHÙ HỢP, ƯỚC TÍNH GIÁ TRỊ GIỐ G À ĐÁ G ÁK Y ƯỚNG DI TRUYỀN MỘT SỐ TÍNH TRẠNG SINH SẢN CỦA LỢN LANDRACE, YORKSHIRE NGÀNH: DI TRUYỀN VÀ CHỌN GIỐNG VẬT NUÔI MÃ SỐ: 62 01 08 ƯỜ ƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS NGUYỄN HỮU TỈNH PGS.TS NGUYỄ HÀ N I, 2020 Ă ỨC LỜ AM ĐOA ôi xin cam đoan công trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu trình bày luận án trung thực, khách quan chưa để bảo vệ học vị ôi xin cam đoan giúp đỡ cho việc thực luận án cám ơn, thơng tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày tháng năm 2020 Tác giả luận án Trần Thị Minh Hoàng i LỜ ẢM Ơ Nhân dịp hoàn thành luận án, xin trân trọng cảm ơn TS Nguyễn Hữu Tỉnh PGS.TS Nguyễn Văn Đức hai thầy hướng dẫn khoa học tận tình giúp đỡ, hướng dẫn tơi suốt q trình thực luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn chân thành tới tập thể Ban Giám đốc Viện Chăn nuôi, Phòng Khoa học, Đào tạo Hợp tác quốc tế, thầy giáo, cô giáo giúp đỡ mặt, tạo điều kiện thuận lợi cho hồn thành luận án Đồng thời, tơi xin chân thành cảm ơn lãnh đạo cán Bộ m n i t yền - Giống ật nuôi l n ủng hộ, động viên tạo điều kiện giúp đỡ tơi mặt q trình hồn thành luận án T i xin cám ơn Ban giám đốc đội ngũ kỹ thuật, công nhân trại heo giống Bình Minh (thuộc Trung tâm Nghiên cứu Phát triển Chăn n i heo Bình Thắng - Phân viện Chăn n i Nam bộ), Công ty giống lợn hạt nhân Dabaco Công ty Khang Minh An giúp đỡ t i để hoàn thành đề tài T i xin chân thành cảm ơn tồn thể gia đình, bạn bè đồng nghiệp tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ mặt, động viên khuyến khích tơi hồn thành luận án Hà Nội, ngày tháng năm 2020 Trần Thị Minh Hoàng ii MỤ LỤ Trang LỜI CAM A i LỜI CẢM ƠN ii M C L C iii DANH M C CHỮ VIẾT TẮT vii DANH M C BẢNG ix DANH M C HÌNH xii MỞ ẦU Chương TỔNG QUAN TÀI LI U 1.1 Cơ sở lý luận vấn đề nghiên cứu 1.1.1 Ảnh hưởng số yếu tố cố định đến suất sinh sản 1.1.1.1 Ảnh hưởng trại giống 1.1.1.2 Ảnh hưởng năm 1.1.1.3 Ảnh hưởng mùa vụ 1.1.1.4 Ảnh hưởng lứa đẻ 1.1.2 Giá trị giống phương pháp ước tính 1.1.2.1 Giá trị giống 1.1.2.2 Ước tính giá trị giống phương pháp BLUP 10 1.1.2.3 Mức độ xác giá trị giống ước tính yếu tố ảnh hưởng đến mức độ xác 13 1.1.3 Các mơ hình thống kê sử dụng phổ biến ước tính thành phần phương sai, tham số di truyền giá trị giống tính trạng suất lợn phương pháp BLUP 19 1.1.3.1 Mơ hình vật giống (Animal model) 20 1.1.3.2 Mơ hình lặp lại (The repeatability model) với ảnh hưởng ngoại cảnh thường trực khác chung 20 1.1.3.3 Mơ hình lặp lại với ảnh hưởng ngoại cảnh chung ngẫu nhiên 22 1.1.3.4 Mô hình lặp lại với ảnh hưởng mẹ 23 iii 1.1.4 Khuynh hướng di truyền 25 1.2 Tổng quan nghiên cứu nước 27 1.2.1 Nghiên cứu nước 27 1.2.1.1 Yếu tố cố định điều chỉnh mơ hình phân tích thống kê di truyền 27 1.2.1.2 Ước tính giá trị giống phương pháp BLUP ứng dụng chọn lọc đánh giá khuynh hướng di truyền số tính trạng sinh sản lợn 31 1.2.2 Nghiên cứu nước 37 1.2.2.1 Yếu tố cố định điều chỉnh mơ hình phân tích thống kê di truyền 37 1.2.2.2 Ước tính giá trị giống phương pháp BLUP ứng dụng chọn lọc đánh giá khuynh hướng di truyền số tính trạng sinh sản sở giống lợn Việt Nam 39 Chương VẬT LI U, N I DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 49 2.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 49 2.2 Nội dung nghiên cứu 49 2.2.1 Phân tích ảnh hưởng số yếu tố cố định đến tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa 49 2.2.2 Ước tính phương sai thành phần hệ số di truyền tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa 49 2.2.3 Ước tính giá trị giống tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ, khối lượng toàn ổ cai sữa số chọn lọc SPI 50 2.2.4 ánh giá khuynh hướng di truyền tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ, khối lượng toàn ổ cai sữa số chọn lọc SPI 50 2.3 ối tượng điều kiện nghiên cứu 50 2.3.1 Cơ sở A 50 2.3.2 Cơ sở B 51 2.2.3 Thu thập liệu 53 iv 2.4 Phương pháp nghiên cứu xử lý số liệu 54 2.4.1 Phân tích ảnh hưởng số yếu tố cố định đến tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa 54 2.4.2 Ước tính phương sai thành phần hệ số di truyền tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa 56 2.4.3 Ước tính giá trị giống tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ, khối lượng toàn ổ cai sữa số chọn lọc SPI 58 2.4.4 ánh giá khuynh hướng di truyền tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ, khối lượng toàn ổ cai sữa số chọn lọc SPI 59 Chương KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 61 3.1 Phân tích ảnh hưởng số yếu tố cố định đến tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa 61 3.2 Ước tính phương sai thành phần hệ số di truyền tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa 68 3.2.1 ối với đàn giống Landrace sở A 68 3.2.2 ối với đàn giống Landrace sở B 73 3.2.3 ối với đàn giống Yorkshire sở A 79 3.2.4 ối với đàn giống Yorkshire sở B 84 3.3 Ước tính giá trị giống tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ, khối lượng toàn ổ cai sữa số chọn lọc SPI 94 3.3.1 Giá trị giống ước tính tính trạng số sơ sinh sống 94 3.3.2 Giá trị giống ước tính tính trạng số cai sữa/ổ 101 3.3.3 Giá trị giống ước tính tính trạng khối lượng toàn ổ cai sữa 105 3.3.4 Chỉ số chọn lọc SPI dựa giá trị giống ước tính tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa 109 3.4 ánh giá khuynh hướng di truyền tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ, khối lượng toàn ổ cai sữa số chọn lọc SPI 112 v 3.4.1 Khuynh hướng di truyền tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa đàn giống sở A 112 3.4.2 Khuynh hướng di truyền tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng toàn ổ cai sữa đàn giống sở B 117 3.4.3 Khuynh hướng di truyền số chọn lọc S đàn giống sở A sở B 122 KẾT LUẬ Ề NGHỊ 126 Kết luận 126 ề nghị 127 DANH M RÌ Ã Ố ĨLÊ QUA ẾN LUẬN ÁN 128 TÀI LI U THAM KHẢO 1289 vi DA MỤ Ữ ẾT TẮT a Ảnh hưởng di truyền trực tiếp cá thể (giá trị giống) BLUP Best Linear Unbiased Predictions (dự đốn tuyến tính khơng chệch tốt nhất) c Ảnh hưởng chung mẹ cs cộng CS Cai sữa GTG Giá trị giống ước tính HYS àn/trại giống x năm sinh x mùa vụ/tháng đẻ K L Khoảng cách lứa đẻ KHDT Khuynh hướng di truyền KLSS Khối lượng toàn ổ sơ sinh KL21 Khối lượng toàn ổ 21 ngày tuổi KLCS Khối lượng toàn ổ cai sữa L Landrace m Ảnh hưởng di truyền từ mẹ MC Móng Cái ML Dày mỡ lưng ML90 Dày mỡ lưng lúc đạt 90 kg ML100 Dày mỡ lưng lúc đạt 100 kg MH Mơ hình MLI Maternal Line Index – số dòng mẹ P xác suất pe Ảnh hưởng thường trực lứa đẻ SCSS Số sơ sinh/ổ SCSSS Số sơ sinh sống/ổ SCCS Số cai sữa/ổ SPI Sow Productive Index - số nái sinh sản T90 Tuổi đạt khối lượng 90 kg T100 Tuổi đạt khối lượng 100 kg vii TBDT L TKL Tiến di truyền Tuổi đẻ lứa đầu ăng khối lượng/ngày TLN Tỷ lệ nạc TLNS Tỷ lệ ni sống Top5% Nhóm 5% cá thể có tiềm di truyền cao (GTG) Top10% Nhóm 10% cá thể có tiềm di truyền cao (GTG) Top25% Nhóm 25% cá thể có tiềm di truyền cao (GTG) TSI Terminal Sire Index – số đực cuối TTTA Tiêu tốn thức ăn Y Yorkshire viii ... XÁ ĐỊNH MƠ HÌNH THỐNG KÊ DI TRUYỀN PHÙ HỢP, ƯỚC TÍNH GIÁ TRỊ GIỐ G À ĐÁ G ÁK Y ƯỚNG DI TRUYỀN MỘT SỐ TÍNH TRẠNG SINH SẢN CỦA LỢN LANDRACE, YORKSHIRE NGÀNH: DI TRUYỀN VÀ CHỌN GIỐNG VẬT NUÔI MÃ SỐ:... thiếu cơng tác giống Chính vậy, đề tài ? ?Xác định mơ hình thống kê di truyền phù hợp, ước tính giá trị giống đánh giá kh ynh hướng di truyền số tính trạng sinh sản lợn Landrace, Yorkshire? ?? cần... tích thống kê di truyền rên sở chọn mơ hình phù hợp cho việc phân tích phương sai thành phần, xác định hệ số di truyền, ước tính giá trị giống khuynh hướng di truyền tính trạng sinh sản đàn lợn