Ứng dụng giải trình tự gen toàn bộ vùng mã hoá (exome) phát hiện biến thể mới trên gen acyl-CoA dehydrogenase chuỗi rất dài (ACADVL) ở bệnh nhân bệnh cơ tim

7 49 0
Ứng dụng giải trình tự gen toàn bộ vùng mã hoá (exome) phát hiện biến thể mới trên gen acyl-CoA dehydrogenase chuỗi rất dài (ACADVL) ở bệnh nhân bệnh cơ tim

Đang tải... (xem toàn văn)

Thông tin tài liệu

Bệnh cơ tim vô căn (cardiomyopathy) là nhóm bệnh đa gen gây rối loạn ở nguyên bào cơ tim, dẫn đến suy tim, loạn nhịp tim hoặc đột tử. Các nhóm bệnh đã được phân loại bao gồm: bệnh cơ tim giãn nở (DCM), bệnh cơ tim phì đại (HCM), bệnh cơ tim hạn chế (RCM) và bệnh cơ tim thất phải gây loạn nhịp (ARVC).

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG Ứng dụng giải trình tự gen tồn vùng mã hố (exome) phát biến thể gen acyl-CoA dehydrogenase chuỗi dài (ACADVL) bệnh nhân bệnh tim Nguyễn Thị Huỳnh Nga* , Bùi Chí Bảo**,***, Nguyễn Minh Hiệp**** Phạm Thị Thu Trang*****, Vũ Nguyễn Thanh Tùng**, Võ Văn Thành Niệm** Lương Thị Thắm*****, Hà Thị Thanh Ngà***** Khoa Sinh học, Trường Đại học Đà Lạt, Thành phố Đà Lạt * Trung tâm Y Sinh học Phân tử, Trường Đại học Y Dược, Thành phố Hồ Chí Minh ** Đơn vị Sinh học Phân tử Di truyền, Bệnh viện Nhi đồng 2, Thành phố Hồ Chí Minh *** Trung tâm Cơng nghệ xạ, Viện nghiên cứu hạt nhân, Thành phố Đà Lạt **** Khoa Sau Đại học, Trường Đại học Đà Lạt, Thành phố Đà Lạt ***** TÓM TẮT Cơ sở nghiên cứu: Ở nhóm bệnh tim vơ căn, trùng lặp biểu lâm sàng gây hạn chế cho việc chẩn đốn điều trị, đó, việc nghiên cứu di truyền gen gây bệnh cần thiết Phương pháp nghiên cứu: Chúng ứng dụng kỹ thuật giải trình tự hệ (NGS) nhằm khảo sát 142 gen có liên quan đến bệnh tim bệnh nhân thuộc Bệnh viện Nhi đồng Kết quả: Bằng chiến lược giải trình tự tồn vùng mã hố (WES), qua q trình phân tích sàng lọc phân tử, chúng tơi xác định 63 biến thể thuộc 19 gen, bao gồm 27 biến thể đồng hợp tử 36 biến thể dị hợp tử Tần số biến thể gen TTN chiếm nhiều với 13 biến thể Tiếp theo gen SYNE1 MYPN có biến thể Mỗi gen NDUFV2 SCN5A có biến thể, gen COX15 SYNE2 có biến thể Chúng xác định biến thể gen DMD, KCNE1, NEBL, RBM20 biến thể gen ACADVL, AKAP9, CAV3, DSC2, DSG2, DSP, MYH6 NEXN Trong đó, có biến thể đột biến dị hợp tử c.197G>A gen ACADVL Kết luận: Các kết nghiên cứu di truyền góp phần vào việc chẩn đốn phân tử tầm soát bệnh tim mạch triệt để ĐẶT VẤN ĐỀ Bệnh tim vô (cardiomyopathy) nhóm bệnh đa gen gây rối loạn nguyên bào tim, dẫn đến suy tim, loạn nhịp tim đột tử [1] Các nhóm bệnh phân loại bao gồm: bệnh tim giãn nở (DCM), bệnh tim phì đại (HCM), bệnh tim hạn chế (RCM) bệnh tim thất phải gây loạn nhịp (ARVC) [2] Những bệnh có tính đa dạng di truyền liên quan đến đột biến số lượng lớn gen, nhiều loại gen trùng lặp với bệnh lý tim khác [2] Sự trùng lặp biểu lâm sàng bệnh tim mạch gây hạn chế cho việc chẩn đốn điều trị Giải trình tự Sanger kỹ thuật chẩn đốn TẠP CHÍ TIM MẠCH HỌC VIỆT NAM - SỐ 86.2019 55 NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG phân tử xác rối loạn chủ yếu liên quan đến gen gây bệnh đơn lẻ [3] Tuy nhiên, phương pháp sàng lọc thời gian cho mức độ không đồng di truyền cao Cho đến nay, với 100 gen liên quan đến bệnh tim xác định, giải hiệu cách xếp trình tự thơng tin cao, gọi giải trình tự hệ (NGS) Trong đó, kỹ thuật giải trình tự gen tồn vùng mã hố (WES) ứng dụng công nghệ NGS nhằm xác định biến thể tất vùng mã hoá (exome) gen mục tiêu theo loại bệnh biết, giúp sàng lọc, chẩn đoán đánh giá biến thể [4,5] MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Trong nghiên cứu này, thiết kế “Pan 146 Cardiomyo” tùy chỉnh có chứa 142 gen liên quan đến bệnh tim Chúng tiến hành sàng lọc phân tử đối tượng nghiên cứu nhằm tìm biến thể liên quan đến bệnh tim tương ứng, góp phần vào việc chẩn đốn phân tử bệnh tim xác hơn, nhằm xác định sớm trình phát triển loạn nhịp tim quản lý lâm sàng tốt bệnh nhân tim ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU Đối tượng Bệnh nhân tim mạch: lập hồ sơ hội chứng, di truyền quản lý lâm sàng Bệnh viện Nhi đồng Thành phố Hồ Chí Minh Phương pháp tách chiết tinh DNA tổng số DNA từ 200 µl mẫu máu bệnh nhân tách chiết tinh kit Qiagen theo hướng dẫn nhà sản xuất Sau tách chiết, mẫu DNA đo máy NanoDrop có nồng độ khoảng 100 - 200 ng/μL giá trị OD 260/280 khoảng 1.8 - 1.9 Mẫu DNA sau chuyển giải trình tự tồn vùng mã hóa hệ 56 thống HiSeq 4000 (Illumina) công ty Macrogen Phương pháp chuẩn bị thiết kế mẫu hệ gen Phân mảnh sử dụng tảng Illumina sau: 1µg gDNA cắt thành 100-900 bp mảnh với Covaris E210 (Covaris, Inc., Woburn, MA) để chạy thư viện NGS Thư viện cho giải trình tự dựa nguyên tắc số mẫu dò (probe) thiết kế cho hệ gen cho nhóm gen mục tiêu Agilent SureSelectRT Reagent Chúng tơi tạo số lượng mẫu dò cho nhóm gen mục tiêu 142 gen bệnh tim Đây mẫu dò thư viện ký hiệu “Pan 146 Cardiomyo” Trong bước chúng tơi thu thập trình tự mã hóa (exon) tồn 142 gen, sau sử dụng phần mềm Afident Probe Library Select để chạy tìm mẫu dò Tổng cộng có 2.072.000 mẫu dò bao phủ cho 142 gen đặt hàng riêng cho nhóm nghiên Thư viện định lượng PCR định lượng (qPCR) cách sử dụng Bộ định lượng thư viện Kapa (Kapa Biosystems, Inc., Wilmington, MA) 7900HT (Applied Biosystems, Foster City, CA) Giải trình tự thực máy HiSeq 4000 với kit TruSeq 3000/4000 SBS Kit v3 (protocol HiSeq 3000/4000 System User Guide Part # 15066496, Rev A HCS 3.3.20) Dữ liệu sau xuất gửi dạng file *.Fastq KẾT QUẢ Thơng tin nhóm đối tượng nghiên cứu Tất mẫu nghiên cứu thu thập Bệnh viện Nhi đồng TP Hồ Chí Minh chẩn đốn có biểu mắc bệnh tim đồng ý bệnh nhân Nhiều nghiên cứu cho thấy có mối liên hệ mật thiết bệnh tim bệnh lý da độ vững cầu nối bám định phần lớn protein liên kết tế bào tim da [6 - 8] Do đó, chúng tơi tiến hành khảo sát đối tượng bệnh nhân có bệnh lý da TẠP CHÍ TIM MẠCH HỌC VIỆT NAM - SỐ 86.2019 NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG Bảng Thông tin nhóm đối tượng nghiên cứu Gen (số lượng biến thể) ĐỒNG HỢP/DỊ HỢP Biến thể tiềm STT Mã số Giới tính NH-1 Nam COX15 (1) HET; MYPN (1) HOM; SCN5A (1) HET; MYPN (1) HOM; SYNE1 (7) HOM, HET; SYNE2 (1) HET; TTN (1) HOM SYNE2 (1) HET NH-2 Nam AKAP9 (1) HET; NDUFV2 (1) HOM; SYNE1 (1) HET; TTN (1) HOM NH-3 Nam DSC2 (1) HET; NDUFV2 (1) HET; TTN (1) HET DSC2 (1) HET NH-4 Nam DSG2 (1) HET; NDUFV2 (1) HOM; SCN5A (1) HOM; TTN (1) HOM DSG2 (1) HET - AKAP9 (1) HET; SYNE1 (1) HET ARVC-1 Nam CAV3 (1) HET; DMD (2) HET; DSP (1) HET; KCNE1 (1) HOM; MYH6 (1) HET; NEBL (1) HET; RBM20 (1) HOM; SCN5A (1) HET; TTN (6) HET ARVC-2 Nam KCNE1 (1) HOM; NEBL (1) HET; RBM20 (1) HOM; SCN5A (1) HOM - ARVC-3 Nam COX15 (1) HET; MYPN (1) HET; NDUFV2 (1) HOM; SCN5A (1) HET; SYNE2 (1) HET MYPN (1) HET; SYNE2 (1) HET SD-1 Nam COX15 (1) HOM; MYPN (5) HOM; NDUFV2 (1) HET; SYNE1 (1) HET; SYNE2 (2) HET; TTN (2) HET, HOM MYPN (2) HOM; SYNE1 (1) HET; SYNE2 (2) HET SCID-1 Nam ACADVL (1) HET; COX15 (1) HET; NEXN (1) HET; TTN ACADVL (1) HET; (1) HOM NEXN (1) HET ARVC (arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy): bệnh nhân tim thất phải gây loạn nhịp; HET (heterozygous): dị hợp tử; HOM (homozygous): đồng hợp tử; NH (normal human): đối tượng nghiên cứu không biểu bệnh; SCID (severe combined immunodeficiency): bệnh nhân có hội chứng suy giảm miễn dịch kết hợp nghiêm trọng; SD (skin disorder): bệnh nhân có bệnh lý da Quy trình giải trình tự gen tồn vùng mã hố (exome) lọc biến thể Chúng thiết kế pan 146 cardiomyo tùy chỉnh có chứa 142 gen Bảng điều khiển gen tùy chỉnh bao gồm tất exon gen vị trí nối Chúng tơi ứng dụng phương pháp giải trình tự gen hệ Illumina Bằng cách sử dụng bảng điều khiển tùy chỉnh, chúng tơi xác định TẠP CHÍ TIM MẠCH HỌC VIỆT NAM - SỐ 86.2019 57 NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG số liệu đột biến gen biến dị di truyền vùng mã hoá liên quan đến bệnh tim đối tượng nghiên cứu Dung lượng giải trình tự mẫu vào khoảng 5,9 Gbp, depth coverage từ 65x đến 105x Phần lớn lần đọc có chất lượng base cao, với Q30 (Phred-score) 96% Chuẩn bị DNA, thu nhận, xếp, tạo mẫu dò Ổn định khung nền, lập đồ nhận diện biến thể Loại trừ biến thể sai lệch cuối đoạn NGS Loại trừ biến ngồi mục tiêu Có báo cáo biến thể gây bệnh trước đây? (ANNOVAR, NCBI, Pan cardiomyo) Có Nguyên nhân đột biến Kh Phân tích tần số allen thấp, đa hình đơn công bố, vùng bảo tồn gây hư tổn protein (ExAC database, 1000 Genomes, Exome Variant Server, Ensembl genome browser, PolyPhen2, SIFT/SIFTIndel, Provean, MutationTaster ôn g Loại trừ biến thể xuất với tần số cao Loại trừ biến thể đa hình cơng bố Loại trừ biến thể vùng bảo tồn thấp không dự đoán gây hư tổn protein Loại trừ biến thể xuất allen nguyên nhân gây bệnh đột biến allen gen Đột biến Hình Quy trình phân tích lọc biến thể NCBI (National Center for Biotechnology Information): Trung tâm Thông tin Công nghệ sinh học Quốc gia), Pan cardiomyo: panel bệnh tim, PolyPhen (Polymorphism Phenotyping): phân tích tính đa hình kiểu hình, SIFT: (Sorting Intolerant From Tolerant): cơng cụ dự đốn chức Kết đánh giá biến thể Trong số đối tượng nghiên cứu, phát 63 biến thể thuộc 19 gen Trong có 27 biến thể dạng đồng hợp tử 36 biến thể dị hợp tử Có biến thể thuộc nhiễm sắc thể X dạng dị hợp tử Trong 63 biến thể có 43 biến thể thuộc loại nonsynonymous (chiếm 68,2%), 14 biến thể missense (chiếm 22,2%), biến thể splice region (chiếm 4,8%), biến thể stopgain (chiếm 1,6%), biến thể upstream (chiếm 1,6%) biến thể frameshift (chiếm 1,6%) 58 Tần số biến thể gen TTN chiếm nhiều với 13 biến thể Tiếp theo gen SYNE1 MYPN phát có biến thể Các gen NDUFV2 SCN5A có biến thể Mỗi gen COX15 SYNE2 có biến thể Ngồi ra, xác định biến thể gen DMD, KCNE1, NEBL, RBM20 biến thể gen ACADVL, AKAP9, CAV3, DSC2, DSG2, DSP, MYH6 NEXN (Hình 2) Trong đó, có biến thể đột biến dị hợp tử c.197G>A gen ACADVL TẠP CHÍ TIM MẠCH HỌC VIỆT NAM - SỐ 86.2019 NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG 14 Số lượng biến thể 12 10 Gen Hình Biểu đồ thể tần số xuất biến thể đối tượng nghiên cứu Ở đối tượng nghiên cứu, xác định tổng cộng 63 biến thể xuất 19 gen Số lượng biến thể gen TTN cao với 13 biến thể, gen SYNE1 với biến thể, gen MYPN với biến thể Mỗi gen NDUFV2 SCN5A có biến thể Mỗi gen COX15 SYNE2 có biến thể Các gen DMD, KCNE1, NEBL RBM20 có biến thể Các gen ACADVL, AKAP9, CAV3, DSC2, DSG2, DSP, MYH6 NEXN có biến thể BÀN LUẬN Hiện cơng nghệ giải trình tự NGS cách tiếp cận mạnh mẽ để khám phá toàn diện đột biến di truyền hàng loạt bệnh lý người [9] Trong đó, kỹ thuật WES ứng dụng công nghệ NGS nhằm xác định biến thể tất vùng mã hóa hệ gen WES ngày sử dụng rộng rãi nghiên cứu bệnh hiểm nghèo, khó chẩn đốn, khơng phát rõ ngun nhân ung thư, tim mạch, thần kinh, v.v [10 - 13] Trong nghiên cứu này, sử dụng phần mềm thuật toán tin sinh học để xác định biến đổi di truyền có liên quan đến bệnh tim bệnh lý khác ảnh hưởng đến hệ tim mạch Đối với nhóm đối tượng nghiên cứu khơng có biểu bệnh lý tim (nhóm NH), cơng nghệ giải trình tự NGS xác định 10 gen AKAP9, COX15, DSC2, DSG2, MYPN, NDUFV2, SCN5A, SYNE1, SYNE2, TTN với 23 biến thể gây bệnh tim (Bảng 1) Gen SYNE1 phát có nhiều biến thể với biến thể, gen TTN có biến thể xuất tất đối tượng khảo sát Kết cho thấy phổ xuất đột biến liên quan đến bệnh tim cao, tương ứng với nguy tiền ẩm mắc bệnh nhóm đối tượng trên, thể loại bệnh lý tim gồm bệnh ARVC, DCM HCM Ở nhóm bệnh nhân ARVC, có 13 gen xác định bao gồm CAV3, COX15, DMD, DSP, KCNE1, MYH6, MYPN, NDUFV2, NEBL, RBM20, SCN5A, SYEN2, TTN với 24 biến thể (Bảng 1) Trong gen TTN chiếm số lượng biến thể nhiều với biến thể gen SCN5A với biến thể, xuất bệnh nhân Mỗi gen KCNE1, NEBL, RBM20 xác định có biến thể gen lại có biến thể Đáng lưu ý gen CAV3, COX15, KCNE1, MYH6, MYPN, NDUFV2, NEBL, RBM20 thường không xuất bệnh lý ARVC, điều cho thấy trùng lặp nhiều kiểu gen kiểu hình bệnh tim Một bệnh nhân SD mang bệnh lý da mà chúng tơi nghi ngờ có liên quan đến bệnh tim mạch phát có gen gồm COX15, MYPN, NDUFV2, SYNE1, SYNE2, TTN với 12 biến thể (Bảng 1) Gen mang nhiều biến thể MYPN với biến thể, gen SYNE2 gen TTN với biến thể Bệnh nhân mang số lượng biến thể gây bệnh tim cao số nhóm đối tượng nghiên cứu khảo sát Kết cho thấy bệnh nhân có nguy cao mắc bệnh tim mạch TẠP CHÍ TIM MẠCH HỌC VIỆT NAM - SỐ 86.2019 59 NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG Bệnh nhân cuối mang hội chứng SCID xác định có gen ACADVL, COX15, NEXN TTN với biến thể có khả gây bệnh tim (Bảng 1) Đáng lưu ý tìm thấy đột biến nonsynonymous dạng dị hợp tử c.197G>A gen ACADVL Gen ACADVL mã hoá cho enzyme acyl-CoA dehydrogenase chuỗi dài (ACADVL) nằm nhiễm sắc thể 17p13.1 [14] Đột biến xảy exon thứ 3, G thay A vị trí 197 cDNA, dẫn đến việc thay đổi amino acid vị trí 66, nơi Gly(G) thay cho Asp(D) protein ACADVL Đột biến có tần số allen 0.0328 theo ExAC Đột biến có khả ảnh hưởng đến bệnh tim mạch bệnh SCID [15 - 17] Đây nguyên nhân dẫn đến rối loạn chuyển hóa acid béo, đường quan trọng để sản xuất lượng cho tim [18] KẾT LUẬN Kết nghiên cứu di truyền cơng trình cho thấy rõ vai trò biến thể liên quan đến bệnh lý tim, góp phần vào việc chẩn đốn phân tử tầm soát bệnh tim mạch triệt để Việc giải trình tự sàng lọc phân tử người bình thường bệnh nhân tim mạch quan trọng, giúp cho việc xác định sớm trình phát triển loạn nhịp tim quản lý lâm sàng tốt bệnh nhân tim LỜI CẢM ƠN * Nghiên cứu tài trợ Quỹ phát triển khoa học công nghệ Quốc gia (NAFOSTED) đề tài mã số 106-YS.01-2016.39 ABSTRACT Whole exome sequencing identified a novel acyl-CoA dehydrogenase very long chain (ACADVL) gene mutation in a cardiomyopathy patient Background: In cardiomyopathies (CMs), a heterogenous group of disorders that affects the heart muscle, phenotypic overlap among the inherited cardiovascular diseases (CVDs) limits the ability to establish a diagnosis based solely on clinical features Objectives: To provide a genetic study of pathogenic genes of cardiomyopathies Methods: We developed a next generation sequencing (NGS) assay to analyze a panel of 142 known cardiomyopathy genes in Vietnamese patients from Children Hospital Results: Whole exome sequencing (WES) - a technique which determines the variations of all coding regions (exons) of the known genes - validated a total of 63 rare variants in 19 cardiomyopathy genes among the studied Vietnamese unrelated patients Of 63 variants identified, 27 variants were homozygous and the other 36 ones were heterozygous Among the 63 variants, TTN gene variants accounted the most for 13 mutations, which are known to be benign Other groups of and mutations belong to SYNE1 and MYPN genes, respectively Ten out of 69 mutations distributed equally to NDUFV2 and SCN5A gene variants We detected variants for each gene of COX15 and SYNE2 genes and variants for each gene of DMD, KCNE1, NEBL and RBM20 A single variant was detected for ACADVL, AKAP9, CAV3, DSC2, DSG2, DSP, MYH6 and NEXN genes Especially, among them, we found a novel heterozygous nonsynonymous mutation c.197G>A on the ACADVL gene Conclusions: These genetic results support the “pan-cardiomyopathy panel” approach, by which the molecular diagnosis of cardiomyopathies, early identification of arrhythmia development and better clinical management of cardiomyopathic patients are applied 60 TẠP CHÍ TIM MẠCH HỌC VIỆT NAM - SỐ 86.2019 NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG TÀI LIỆU THAM KHẢO Sisakian H Cardiomyopathies: Evolution of pathogenesis concepts and potential for new therapies World J Cardiol 2014; 6: 478 - 494 Simpson S, Rutland P, Rutland CS Genomic Insights into Cardiomyopathies: A Comparative Cross-Species Review Vet Sci 2017; 4: 19 Chen L, Cai Y, Zhou G et al Rapid Sanger sequencing of the 16S rRNA gene for identification of some common pathogens PLoS One 2014; 9: e88886 Faita F, Vecoli C, Foffa I et al Next generation sequencing in cardiovascular diseases World J Cardiol 2012; 4: 288 - 295 Morini E, Sangiuolo F, Caporossi D et al Application of next generation sequencing for personalized medicine for sudden cardiac death Front Genet 2015; 6: 55 Alcalai R, Metzger S, Rosenheck S et al A recessive mutation in desmoplakin causes arrhythmogenic right ventricular dysplasia, skin disorder and woolly hair J Am Coll Cardiol 2003; 42: 319 - 327 McKoy G, Protonotarios N, Crosby A et al Identification of a deletion in plakoglobin in arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy with palmoplantar keratoderma and woolly hair (Naxos disease) Lancet 2000; 355: 2119 - 2124 Norgett EE, Hatsell SJ, Carvajal-Huerta L et al Recessive mutation in desmoplakin disrupts desmoplakin-intermediate filament interactions and causes dilated cardiomyopathy, woolly hair and keratoderma Hum Mol Genet 2000; 9: 2761 - 2766 Di Resta C, Galbiati S, Carrera P et al Next-generation sequencing approach for the diagnosis of human diseases: open challenges and new opportunities EJIFCC 2018; 29: - 14 10 Qiao D, Ameli A, Prokopenko D et al Whole exome sequencing analysis in severe chronic obstructive pulmonary disease Hum Mol Genet 2018; 27: 3801 - 3812 11 Goh G, Choi M Application of whole exome sequencing to identify disease-causing variants in inherited human diseases Genomics Inform 2012; 10: 214 - 219 12 Haskell GT, Adams MC, Fan Z et al Diagnostic utility of exome sequencing in the evaluation of neuromuscular disorders Neurol genet 2018; 4: e212 13 Golbus JR, Puckelwartz MJ, Dellefave-Castillo L et al Targeted analysis of whole genome sequence data to diagnose genetic cardiomyopathy Circ Cardiovasc Genet 2014; 7: 751 - 759 14 Schiff M, Mohsen AW, Karunanidhi A et al Molecular and cellular pathology of very-long-chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency Mol Genet Metab 2013; 109: 21 - 27 15 Boemer F, Fasquelle C, d'Otreppe S et al A next-generation newborn screening pilot study: NGS on dried blood spots detects causal mutations in patients with inherited metabolic diseases Sci rep 2017; 7: 17641 16 Strauss AW, Powell CK, Hale DE et al Molecular basis of human mitochondrial very long chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency causing cardiomyopathy and sudden death in childhood Proc Natl Acad Sci USA 1995; 92: 10496 - 10500 17 Tucci S, Flögel U, Hermann S et al Development and pathomechanisms of cardiomyopathy in very long-chain acyl-CoA dehydrogenase deficient (VLCAD(-/-)) mice Biochim Biophys Acta, 1842: 677 - 685 18 Gregersen N, Andresen BS, Corydon MJ et al Mutation analysis in mitochondrial fatty acid oxidation defects: exemplified by acyl-CoA dehydrogenase deficiencies, with special focus on genotype-phenotype relationship Hum Mutat 2001; 18: 169 - 189 TẠP CHÍ TIM MẠCH HỌC VIỆT NAM - SỐ 86.2019 61 ... cộng 63 biến thể xuất 19 gen Số lượng biến thể gen TTN cao với 13 biến thể, gen SYNE1 với biến thể, gen MYPN với biến thể Mỗi gen NDUFV2 SCN5A có biến thể Mỗi gen COX15 SYNE2 có biến thể Các gen. .. cao, gọi giải trình tự hệ (NGS) Trong đó, kỹ thuật giải trình tự gen tồn vùng mã hố (WES) ứng dụng cơng nghệ NGS nhằm xác định biến thể tất vùng mã hoá (exome) gen mục tiêu theo loại bệnh biết,... với 24 biến thể (Bảng 1) Trong gen TTN chiếm số lượng biến thể nhiều với biến thể gen SCN5A với biến thể, xuất bệnh nhân Mỗi gen KCNE1, NEBL, RBM20 xác định có biến thể gen lại có biến thể Đáng

Ngày đăng: 15/05/2020, 19:40

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan