Nghiên cứu bệnh viêm ruột do Parvovirus trên chó tại một số tỉnh thành Đồng bằng sông Cửu Long

170 131 2
Nghiên cứu bệnh viêm ruột do Parvovirus trên chó tại một số tỉnh thành Đồng bằng sông Cửu Long

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

Chương 1: GIỚI THIỆU 1.1 Tính cấp thiết của luận án Bệnh viêm ruột do Canine Parvovirus type 2 (CPV-2) gây ra trên chó là một bệnh truyền nhiễm cấp tính (Kelly, 1978; Appel et al., 1979; Hoelzer et al., 2008). CPV-2 được coi là mối đe dọa nhất đối với chó con từ sau cai sữa đến sáu tháng tuổi. Tuy nhiên, các đợt bùng phát bệnh viêm ruột và tử vong trên chó trưởng thành do CPV-2 gây ra cũng đã được ghi nhận (Decaro et al., 2008). Bệnh xảy ra trên tất cả các giống chó, ở mọi lứa tuổi và không phân biệt giới tính (Castro et al., 2007; Gombac et al., 2008). Bệnh diễn tiến nhanh, làm chủ nuôi chó khó phát hiện sớm, khi phát hiện là chó đã bệnh nặng khó điều trị. Các triệu chứng chính của bệnh gồm sốt, nôn mửa, tiêu chảy phân lỏng có lẫn máu tươi với mùi tanh hôi khó chịu dẫn đến chó mất nhiều máu, nhiều nước và chất điện giải, rối loạn chuyển hoá, trụy tim mạch, hôn mê rồi chết (Sherding, 2000; Joshi et al., 2001; Ramprabhu et al., 2002; Miranda et al., 2016). Bệnh xuất hiện vào cuối thập niên 1970 và lan nhanh chóng trên toàn thế giới (Appel et al., 1979; Truyen, 2000). Từ đó đến nay, nhiều nhà khoa học trên thế giới đã nghiên cứu để hiểu rõ genotype của CPV-2 gây bệnh viêm ruột trên chó giúp cho công tác phòng và trị bệnh được hữu hiệu. CPV-2 là một loại virus nhỏ có khả năng đề kháng cực tốt (Houston et al., 1996), với 3 biến thể là genotype CPV-2a (Carman et al., 1984; McCanslish, 1998), CPV-2b (Ybanez et al., 1995; McCanslish, 1998) và genotype CPV-2c (Rance, 2000; Nandi et al., 2009). Trong 3 biến thể trên, genotype CPV- 2c có một mô hình kháng nguyên khá khác biệt (Cavalli et al., 2008). Tại Việt Nam, các nghiên cứu trước đây cho thấy CPV-2b được xác định là genotype chính và CPV-2c chiếm tỷ lệ 12,5% đang lưu hành trên đàn chó tại Hồ Chí Minh và Hà Nội (Ikeda et al., 2000; Nakamura et al., 2004). Sau đó, có sự hoán chuyển tỷ lệ lưu hành giữa các genotype của CPV-2 trên quẩn thể chó nuôi tại thành phố Hồ Chí Minh, từ genotype chính là CPV-2b nay chuyển sang CPV-2c là genotype chính và phát hiện genotype mới là New CPV-2a chiếm tỷ lệ 6,67% (Dung Nguyen Van et al., 2017). Đồng thời, các tác giả trên đã lập cây phát sinh loài các genotype của CPV-2 đang lưu hành và kết quả nghiên cứu là nguồn tài liệu, khoa học quý báu giúp ngành thú y kiểm soát bệnh viêm ruột do CPV-2 trên chó tại địa bàn nghiên cứu. Theo Chi cục Chăn nuôi và Thú y thành phố Cần Thơ, Đồng Tháp Tiền Giang, và Bến Tre, tại thời điểm (12/2018), tại Đồng bằng sông Cửu Long, nhu cầu nuôi thú cưng của người dân ngày càng cao; trong đó chó là loài vật được người dân ưa chuộng nuôi làm thú cưng. Đối với người cao tuổi, người độc thân neo đơn, trẻ con,… thân thiện và xem thú cưng là bầu bạn mỗi ngày, thậm chí có khi còn xem thú cưng là một thành viên trong gia đình. Mặc dù tỷ lệ bệnh viêm ruột trên chó do CPV-2 là 43,3% (Dung Nguyen Van et al., 2017) và tỷ lệ điều trị khỏi triệu chứng bệnh là khá cao 86,3% (Lê Minh Thành, 2009). Nhưng khi thú cưng bệnh, những ngày điều trị chưa khỏi hoặc không điều trị khỏi bệnh, sẽ là những ngày không tránh khỏi làm chủ nuôi lo lắng, sa sút tinh thần,... Tuy nhiên, hiện tại, chưa có nghiên cứu về căn bệnh do Pavovirus trong phạm vi rộng cấp khu vực như khu vực ĐBSCL. Do vậy, việc nghiên cứu căn bệnh này tại khu vực ĐBSCL là cần thiết giúp cho công tác phòng và can thiệp bệnh được chủ động hơn nhằm giảm thiệt hại về kinh tế và đặc biệt là hạn chế được tổn thất về tình cảm của con người đối với thú cưng. Xuất phát từ thực tế trên, nghiên cứu bệnh viêm ruột do Parvovirus trên chó tại một số tỉnh thành ĐBSCL được tiến hành.

TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ KHOA NÔNG NGHIỆP NGUYỄN THỊ YẾN MAI NGHIÊN CỨU BỆNH VIÊM RUỘT DO PARVOVIRUS TRÊN CHĨ TẠI MỘT SỐ TỈNH THÀNH ĐỒNG BẰNG SƠNG CỬU LONG LUẬN ÁN TIẾN SĨ NGÀNH BỆNH LÝ HỌC VÀ CHỮA BỆNH VẬT NUÔI 2020 1.25%; genotypes CPV-2b, genotypes new CPV-2a and genotypes new CPV-2b have not been detected yet There were high homologeneity in molecular genetic characteristics among study genotypes of CPV-2 together; with genotypes of CPV-2 on gene banks (Genbank), with genotypes of CPV-2 in vaccines on gene banks Establishing of phylogenetic tree of genotypes of CPV-2 in the Mekong Delta The genotypes CPV-2c in the study were closely related to the genotypes SD-14-12 (KR611522.1) and YANJI-1 (KP749854.1) from China and Korea Genotype TG40 in Tien Giang was identified as genotype CPV2a in the same subgroup with genotypes new CPV-2a from countries such as: Uruguay: UY306 (KM457135.1), UY243 (KM457102.1), UY364 (KM457143.1) ; China: CPV / CN / SD9 / 2014 (KR002802.1), CPV / CN / SD18 / 2014 (KR002804.1), SC02 / 2011 (JX660690.1) All of three vaccines due to CPV-2, circulating in the Mekong Delta have a protection period of 12 months after vaccination, with a protection rate of 100% (in turn, the antibody titer was V1: 224, V2: 225 and V3 was 227.5 HI titer Key words: Canine Parvovirus type 2, circulation, genotype, Can Tho city, Dong Thap, Tien Giang, Ben Tre vii LỜI CAM KẾT Tôi xin cam kết Luận án hoàn thành dựa kết nghiên cứu kết luận khoa học cơng trình nghiên cứu chưa công bố luận án cấp khác Học viên thực Nguyễn Thị Yến Mai viii MỤC LỤC Chấp thuận hội đồng ii Lời cảm tạ iii Tóm tắt iv Abstract vi Lời cam kết viii Mục lục ix Danh sách bảng xii Danh sách hình xv Danh sách chữ viết tắt xvii Chương 1: Giới thiệu 1.1 Tính cấp thiết luận án 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Ý nghĩa khoa học luận án 1.4 Những điểm luận án Chương 2: Tổng quan tài liệu 2.1 Tình hình nghiên cứu nước nước việc nhiễm bệnh viêm ruột CPV-2 chó 2.1.1 Tình hình nghiên cứu ngồi nước 2.1.2 Tình hình nghiên cứu nước 10 2.2 Bệnh CPV-2 chó 12 2.2.1 Đặc điểm mầm bệnh 12 2.2.2 Sinh bệnh học 16 2.2.3 Triệu chứng lâm sàng 18 2.2.4 Bệnh tích 20 ix 2.2.5 Chẩn đoán 21 2.2.6 Phòng bệnh 26 2.2.7 Điều trị 27 2.3 Vaccine phòng bệnh chó 27 2.4 Đáp ứng miễn dịch sau tiêm vaccine động vật 32 Chương 3: Phương pháp nghiên cứu 37 3.1 Nội dung nghiên cứu 37 3.2 Thời gian địa điểm nghiên cứu 37 3.3 Vật liệu nghiên cứu 37 3.3.2 Vật liệu thí nghiệm nội dung 38 3.3.3 Vật liệu thí nghiệm nội dung 38 3.3.4 Vật liệu thí nghiệm, mẫu vật sinh phẩm nội dung 39 3.4 Phương pháp nghiên cứu 40 3.4.1 Nội dung 40 3.4.2 Nội dung 47 3.4.4 Nội dung 54 3.5 Phương pháp phân tích số liệu 62 Chương 4: Kết thảo luận 63 4.1 Xác định tỷ lệ nhiễm bệnh viêm ruột CPV-2 chó đến khám điều trị số phòng mạch Thú y tỉnh thành ĐBSCL 63 4.1.1 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột 63 4.1.2 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo lứa tuổi 65 4.1.3 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo giới tính 66 4.1.4 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo giống 67 4.1.5 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo tiêm phòng 68 4.1.6 Tần suất xuất triệu chứng lâm sàng điển hình chó bệnh viêm ruột CPV-2 69 4.1.7 Hiệu điều trị triệu chứng bệnh viêm ruột CPV-2 chó 74 x 4.2 Xác định genotype CPV-2 gây bệnh viêm ruột chó đến khám điều trị số phòng mạch Thú y tỉnh thành ĐBSCL 76 4.3 Xác định đánh giá độ tương đồng đặc điểm di truyền học phân tử genotype CPV-2 thực địa (ĐBSCL) với genotype CPV-2 gây bệnh viêm ruột chó ngân hàng gene (Genbank); với genotype CPV-2 gây bệnh viêm ruột chó vaccine ngân hàng gene NCBI 84 4.4 Đánh giá khả bảo hộ loại vaccine Parvovirus chó lưu hành số tỉnh thành ĐBSCL 113 4.4.1 So sánh hàm lượng kháng thể sau tiêm phòng loại vaccine phòng bệnh viêm ruột CPV-2 chó số tỉnh thành ĐBSCL 114 4.4.2 So sánh hàm lượng kháng thể sau tiêm phòng loại vaccine phòng bệnh viêm ruột CPV-2 chó theo nhóm giống số tỉnh thành ĐBSCL 116 Chương 5: Kết luận đề nghị 118 5.1 Kết luận 118 5.2 Đề nghị 119 Tài liệu tham khảo 120 Phụ lục Phụ lục 12 Phụ lục 23 Phụ lục 24 xi DANH SÁCH BẢNG Bảng Tên bảng Trang Bảng 2.1 Tổng quan thị trường vaccine 27 Bảng 3.1 Trình tự tham khảo CPV-2 sử dụng vẽ 39 phát sinh loài Bảng 3.2 Số mẫu thực 41 Bảng 3.3 Cặp mồi VP2 GMCOM (Gurpreet Kaur et al., 2015) 48 Bảng 3.4 Thành phần phản ứng PCR 48 Bảng 3.5 Chu kỳ nhiệt PCR khuếch đại vùng gene VP2 49 Bảng 3.6 Thành phần phản ứng PCR giải trình tự 51 Bảng 3.7 Chu kỳ nhiệt phản ứng PCR giải trình tự sản phẩm 51 DNA Bảng 3.8 Nucleotide tham chiếu (Dung Nguyen Van et al., 2017) 52 Bảng 3.9 Sơ đồ bố trí thí nghiệm 54 Bảng 3.10 Mối tương quan kết Asan Easy Test ® CPV 60 Ab kít với phản ứng ngưng kết hồng cầu (HI test) Bảng 4.1 Tỷ lệ chó bệnh viêm ruột CPV-2 qua kit CPV Ag test 63 Bảng 4.2 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo lứa tuổi 65 Bảng 4.3 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo giới tính 66 Bảng 4.4 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo giống 67 Bảng 4.5 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo tiêm 68 phòng Bảng 4.6 Tần suất xuất triệu chứng lâm sàng điển hình chó 70 mắc bệnh viêm ruột CPV-2 (n=123) Bảng 4.7 Hiệu điều trị hỗ trợ phục hồi triệu chứng bệnh viêm 74 ruột CPV-2 chó Bảng 4.8a Kết giải trình tự genotype CPV-2 gây bệnh chó 77 thành phố Cần Thơ Bảng 4.8b Kết giải trình tự genotype CPV-2 gây bệnh chó 78 Đồng Tháp Bảng 4.8c Kết giải trình tự genotype CPV-2 gây bệnh chó 79 Tiền Giang Bảng 4.8d Kết giải trình tự genotype CPV-2 gây bệnh chó 80 Bến Tre Bảng 4.9 Kết xác định genotype CPV-2 gây bệnh chó 82 (CPV -2a, CPV -2b, CPV -2c, New CPV-2a New CPV 2b) xii Bảng 4.10 Tỷ lệ tương đồng (%) nucleotide gene VP2 87 genotype phân lập từ thành phố Cần Thơ với genotype giới Bảng 4.11 Tỷ lệ tương đồng (%) nucleotide gene VP2 88 genotype phân lập từ thành phố Cần Thơ với genotype vaccine tham thảo ngân hàng gene Bảng 4.12 Kết so sánh tỷ lệ tương đồng amino acid (%) 89 gegenotype phân lập từ thành phố Cần Thơ với genotype giới Bảng 4.13 Kết so sánh tỷ lệ tương đồng amino acid (%) 90 gegenotype phân lập từ thành phố Cần Thơ với genotype vaccine tham thảo ngân hàng gene Bảng 4.14 Tỷ lệ tương đồng (%) nucleotide gene VP2 94 genotype phân lập từ thành phố Đồng Tháp với genotype giới Bảng 4.15 Tỷ lệ tương đồng (%) nucleotide gene VP2 95 genotype phân lập từ Đồng Tháp với genotype vaccine tham thảo ngân hàng gene Bảng 4.16 Kết so sánh tỷ lệ tương đồng amino acid (%) 96 genotype phân lập từ Đồng Tháp với genotype giới Bảng 4.17 Kết so sánh tỷ lệ tương đồng amino acid (%) 97 genotype phân lập từ Đồng Tháp với genotype vaccine tham thảo ngân hàng gene Bảng 4.18 Tỷ lệ tương đồng (%) nucleotide gene VP2 98 genotype phân lập từ Tiền Giang với genotype giới Bảng 4.19 Tỷ lệ tương đồng (%) nucleotide gene VP2 99 genotype phân lập từ Tiền Giang với genotype vaccine tham thảo ngân hàng gene Bảng 4.20 Kết so sánh tỷ lệ tương đồng amino acid (%) 100 genotype phân lập từ Tiền Giang với genotype giới Bảng 4.21 Kết so sánh tỷ lệ tương đồng amino acid (%) 101 genotype phân lập từ Tiền Giang với genotype vaccine tham thảo ngân hàng gene Bảng 4.22 Tỷ lệ tương đồng (%) nucleotide gene VP2 104 genotype phân lập từ Bến Tre với genotype giới xiii Bảng 4.23 Tỷ lệ tương đồng (%) nucleotide gene VP2 genotype phân lập từ Bến Tre với genotype vaccine tham thảo ngân hàng gene Bảng 4.24 Kết so sánh tỷ lệ tương đồng amino acid (%) genotype phân lập từ Bến Tre với genotype giới Bảng 4.25 Kết so sánh tỷ lệ tương đồng amino acid (%) genotype phân lập từ Bến Tre với genotype vaccine tham thảo ngân hàng gene Bảng 4.26 Kiểu gene CPV-2 chó dựa khác biệt amino acid gene VP2 Bảng 4.27 Hàm lượng kháng thể (HLKT) CPV-2 chó trước sau tiêm vaccine Bảng 4.28 Hàm lượng kháng thể CPV-2 chó trước sau tiêm vaccine theo nhóm giống xiv 105 106 107 111 114 116 DANH SÁCH HÌNH Hình Danh mục hình Trang Hình 2.1 Cấu trúc virus Canine Parvovirus (Frederick, 1999) 13 Hình 2.2 Hình dạng bên ngồi tồn virion (Tsao et al., 1991) 14 Hình 2.3 Quá trình sinh bệnh học CPV-2 thể chó 18 (McCandlish, 1999) Hình 2.4 Viêm ruột Parvovirus (Dudley, 2006) 20 Hình 2.5 Cơ tim bị viêm chó tuần tuổi (Dudley, 2006) 21 Hình 2.6 Bộ kít Canine Parvovirus Ag Test 23 Hình 2.7 Bộ kít Asan Easy Test CPV Ab 24 Hình 2.8 Các kít Asan Easy Test CPV Ab thử nghiệm 25 Hình 2.9 Các vaccine phòng bệnh cho chó mèo liệt kê Bảng 30 2.1 Hình 2.10 Các vaccine phòng bệnh cho chó mèo liệt kê Bảng 31 2.1 (tt) Hình 3.1 Sơ đồ qui trình chẩn đốn bệnh 42 Hình 3.2 Cách lấy mẫu phân trực tràng 43 Hình 3.3 Khuấy mẫu phân vào dung dịch đệm 43 Hình 3.4 Nhỏ dung dịch mẫu pha vào test thử 44 Hình 3.5 Kết dương tính 44 Hình 3.6 Kết âm tính 45 Hình 3.7 Máy PCR T100 hệ thống điện di (Biorad, Mỹ) 49 Hình 3.8 Máy phân tích gene ABI 3130 50 Hình 3.9 Sơ đồ thực chung nội dung 53 Hình 3.10 Nhóm chó giống nội 55 Hình 3.11 Nhóm chó giống ngoại 55 Hình 3.12 Lấy máu tĩnh mạch chân trước chó thí nghiệm 56 Hình 3.13 Trích lấy huyết làm thí nghiệm 56 Hình 3.14 Nhãn hiệu kít ELISA xác định kháng thể Parvovirus 56 Hình 3.15 Bảng so màu Easy Test đánh giá hiệu giá kháng thể 59 Hình 3.16 Máy đọc kết ASAN EASY CHECK G-100 60 Hình 3.17 Đưa que thử dương tính với CPV-2 vào máy đọc kết 61 Hình 3.18 Thể kết 61 Hình 4.1 Tiêu chảy phân lẫn máu bết hậu mơn 64 Hình 4.2 Tiêu chảy phân lẫn máu đỏ tươi 64 Hình 4.3 Dịch ói có màu vàng đậm 72 Hình 4.4 Chó tiêu chảy phân có lẫn máu 72 Hình 4.5 Ruột chó bị viêm sưng bệnh CPV-2 73 xv Chi-Sq = 156.049, DF = 1, P-Value = 0.000 Bảng 4.27 ————— 10/8/2019 5:14:22 PM ———————————————————— Welcome to Minitab, press F1 for help Two-way ANOVA: HLKT versus Loai vaccin, Dot Source DF SS Loai vaccin Dot 3630267 Interaction 10 770 Error 162 242865 Total 179 3873907 S = 38.72 R-Sq = 93.73% MS 726053 77 1499 F 0.00 484.31 0.05 P 0.998 0.000 1.000 R-Sq(adj) = 93.07% Bảng 4.28 Two-way ANOVA: HLKT versus Giống, Vaccin Source DF SS MS F P Giống 20587 20586.8 0.93 0.336 Vaccin 2.9 0.00 1.000 Interaction 169 84.7 0.00 0.996 Error 174 3853144 22144.5 Total 179 3873907 Variable C5 N N* Mean SE Mean StDev Minimum C4 87.00 3.24 7.25 78.00 84.00 2.88 6.44 77.00 83.00 5.17 11.55 70.00 272.60 4.77 10.67 264.00 5 277.60 1.63 3.65 274.00 272.40 2.96 6.62 261.00 513.6 10.0 22.4 492.0 510.60 1.63 3.65 506.00 515.4 42.2 94.3 421.0 10 394.2 20.8 46.4 339.0 11 398.20 3.02 6.76 391.00 12 384.8 22.7 50.8 328.0 13 307.00 2.17 4.85 299.00 14 315.20 1.43 3.19 311.00 15 316.4 33.5 75.0 208.0 16 220.80 1.91 4.27 216.00 17 224.20 1.07 2.39 221.00 18 226.4 41.4 92.5 162.0 19 86.00 2.61 5.83 77.00 20 86.00 3.45 7.71 78.00 21 85.00 4.98 11.14 75.00 22 276.60 8.59 19.22 253.00 23 273.00 6.84 15.30 253.00 24 276.40 7.48 16.73 253.00 25 518.20 8.13 18.17 503.00 26 512.20 3.77 8.44 498.00 27 512.80 1.56 3.49 508.00 28 518.20 8.13 18.17 503.00 29 512.20 3.77 8.44 498.00 30 512.80 1.56 3.49 508.00 31 310.20 2.84 6.34 304.00 32 313.60 2.64 5.90 307.00 33 312.80 3.20 7.16 303.00 34 227.20 8.70 19.45 204.00 Q1 81.00 77.50 71.50 266.00 274.50 267.00 497.0 507.00 423.5 345.0 392.00 329.5 303.00 312.00 256.5 217.50 222.00 162.0 81.00 78.50 76.00 259.00 257.00 261.00 504.50 505.00 509.50 504.50 505.00 509.50 305.00 309.00 306.00 206.50 Median 85.00 85.00 85.00 268.00 276.00 275.00 511.0 511.00 507.0 410.0 398.00 416.0 308.00 316.00 307.0 219.00 224.00 166.0 87.00 86.00 83.00 276.00 279.00 279.00 506.00 514.00 513.00 506.00 514.00 513.00 307.00 313.00 313.00 235.00 Q3 94.00 90.00 93.50 281.50 281.50 276.50 531.5 514.00 611.5 435.5 404.50 424.5 310.50 318.00 381.0 225.00 226.50 321.0 90.50 93.50 95.00 294.50 286.00 290.50 538.00 518.50 516.00 538.00 518.50 516.00 317.00 318.50 319.50 244.00 35 36 5 0 225.80 229.4 0.490 16.6 1.10 37.0 225.00 165.0 225.00 198.0 225.00 247.0 227.00 252.0 PHỤ LỤC KẾT QUẢ KIỂM TRA GENOTYPE VÀ KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ MỘT PHẦN GENE CPV-2 CỦA 80 MẪU ĐƯỢC CHỌN TẠI MỘT SỐ TỈNH THÀNH ĐBSCL A KẾT QUẢ KIỂM TRA GENOTYPE Phương pháp thử nghiệm - Khuếch đại đoạn trình tự gene VP2 virus CPV cặp mồi CPVseq CPV.Fw: GGTCAACCTGCTGTCAGAAA (vị trí 2816-2835) CPV.Rv: AGGTGCTAGTTGAGATTTTTCAT (vị trí 4525-4503) Kiểm tra lại trình tự đối chiếu với 20 mẫu Cần Thơ Kiểm tra lại trình tự đối chiếu với 20 mẫu Bến Tre Kiểm tra lại trình tự đối chiếu với 20 mẫu Đồng Tháp Kiểm tra lại trình tự đối chiếu với 20 mẫu Tiền Giang B PHIẾU TRẢ KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ 80 MẪU TẠI THÀNH PHỐ CẦN THƠ, BẾN TRE, ĐỒNG THÁP VÀ TIỀN GIANG SEQUECING SERVICE INFORMATION Customer Information Customer: Nguyễn Thị Yến Mai Organization: Trường Cao đẳng Nông nghiệp Nam Bộ Email: yenmai@sac.edu.vn Tel: 0909456472 Sample Infomation Date Requested Begin 10/11/2018 Amplification-Sequencing VP2 region and aligment for serotype classification Result Sample Name CT5, CT12, CT21, CT45, CT60, CT69, CT91, CT92, CT93, CT94, CT95, CT96, CT97, CT98, CT99, CT100, CT101, CT102, CT103, CT327 BT01, BT02, BT03, BT05, BT07, BT08, BT09, BT10, BT11, BT12 BT14, BT16, BT19, BT20, BT21, BT22, BT23, BT58, BT64, BT69 DT01, DT02, DT03, DT04, DT05, DT06, DT07, DT08, DT09, DT10 PCR Tot al 1710 bp CPV type detection CPV-2c 1710 bp CPV-2c 20 1710 bp CPV-2c 20 CPV-2c 19 CPV-2a 01 DT11, DT12, DT13, DT14, DT15, DT16, DT17, DT18, DT19, DT20 TG01, TG02, TG03, TG04, TG05, TG10, TG32, TG37, TG45, TG59, TG62, TG64, TG161, TG162, TG164, TG166, TG1172, TG1 1710 bp TG40 1710 bp Ghi chú: CT: Cần Thơ; BT: Bến Tre; DT: Đồng Tháp; TG: Tiền Giang 20 C KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ MỘT PHẦN GENE CPV-2 CỦA CÁC MẪU ĐƯỢC CHỌN TẠI MỘT SỐ TỈNH THÀNH ĐBSCL VÀ TRÌNH TỰ AMINO ACID RÚT GỌN Trình tự phần gen CPV-2 mẫu chọn giải trình tự >180606_BT01-F_A04 1090 nu GGGACGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAA ACTCAAGCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTCGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAA ATTGTAACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATT TTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCC AGCAGCTATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCAC ACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTATACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGAT TGTAAACCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAA GATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGG GCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCAAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACACATGGTCAAAAA >180606_BT02-F_G12 1055 nu GGGAGAACGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCCCACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAG CAAACTCAAGCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCA CAAATTGTAACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAA ATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACT CCAGCAGCTATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGC ACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTATACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTG ATTGTAAACCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAAC AAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAA GGGCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGT >180705_CT5-F_E07 1044 nu GGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCA AGCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGT AACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAAT GTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGC TATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAAC AAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAA CCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAA AGACGTGGTGTAACTCAGATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTT AGAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGCGAGCGCAATCAGATGAAAATCGAGCAGCGAAT >180705_CT12-F_F04 1015 nu GGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAGTTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACT AAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAA GCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTG GTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGATCCAAG ATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATATCCAGAAGGAGATTGGATTCAAAAT ATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAGAAGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAACAGGAATTAACTATACTAATATATTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAA TGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAA AAGTTGCACCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAGAAATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGC CTCTTACACTACTGGTGGGAAATACTACAAA >180812_ĐT01-F_A11 1158 nu GGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCCCATTGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAA GCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGTA ACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTACATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATG TTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGCAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCT ATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACA AATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAGC CATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAAA GACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTA AAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAACC CCTGAGAGATTTACTTTATAGCCCTTCAGANNCGGGAGGTATCCGAAGGAAAT >180812_ĐT02-F_E10 1126 nu GGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCA AGCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGT AACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAAT GTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCGTCATTGATGGTTGCATTAGACAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGC TATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTACTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAAC AAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAA CCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTCCAACAAGATAAA AGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTT AAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGA AACCCTGAGAGATTTACTTTATA >180914_TG39-F_G11 1047 nu GGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCA AGCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGT AACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAAT GTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGC TATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAAC AAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAA CCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAA AGACGTGGTGTAATTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTT AAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGT >180914_TG40-F_A12 1154 nu GGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTCAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCA AGCAGACTTGTACATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACCCATGCACAAATTGT AACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAAT GTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGC TATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAAC AAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAA CCATGTAGACTAACACACACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAA AGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAATACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTT AAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCAAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACACAGGAGAAC CCCTGAAAGATTTACTTATATAGCACTTCAGAAACGGGAAGATATCCAGA Trình tự amino acid rút gọn số tỉnh thảnh ĐBSCL Thành phố Cần Thơ Bến Tre Đồng Tháp Tiền Giang PHỤ LỤC HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG MÁY ĐỌC KẾT QUẢ ASAN EASY CHECK G-100V Sau mở thiết bị lên, nhấn chạm vào biểu tượng "Standard Test" Nhấn vào biểu tượng "New" Nhập thông tin khách hàng theo thứ tự nhấn vào biểu tượng "Save" Trong trường hợp thông tin khách hàng nhập sẵn, chọn khách hàng tương ứng chạm vào biểu tượng Quét code QR Nạp que thử xét nghiệm theo hướng hình ảnh Nếu nạp trước, chạm vào biểu tượng Màn hình phân tích thể Sau phân tích, hình kết thể (như thấy hình) Trong trường hợp bạn muốn làm lại, nhấn biểu tượng "Retest" cho phân tích khác kết cho sau Nếu bạn muốn in kết với máy in, nhần biểu tượng "Print" Nếu bạn muốn lưu kết dạng PDF, kết nối thiết bị USB với máy nhấn vào biểu tượng "USB" Nếu bạn nhấn biểu tượng "OK", kết lưu dạng file PDF USB PHỤ LỤC MẪU BỆNH ÁN Ngày:……………………………………………………Số TT: Tên chủ: ………………… Đ/c:………………… ĐT: ………………… Tên chó: ………………………… Giống: ……………………………… Đặc điểm nhận dạng: …………………………………………………… Tuổi: 1- tháng , >3-6 tháng , > tháng Trọng lượng:……………………Giới tính: Phương thức chăn ni: nhốt Chế độ ni: ăn tự Tẩy giun: , thả , ăn phần khơng , có Tiêm phòng: khơng , có Bệnh sử: ………………………………………………………………… Thuốc sử dụng:……………………………………………………… Tình trạng lúc mang đến:………………………………………………… Dịch tiết: Mắt , mũi: Thể hô hấp: Bụng , lỏng: , ngực , đặc: Tần số hô hấp CĐSB:………………………………………………………………… Kết xét nghiệm nhanh ( qua kít Canine Parvovirus Ag Test ) dương tính Ngày điều trị Thuốc điều trị Triệu chứng Nhiệt độ Bỏ ăn Lừ đừ Ĩi Dịch ói nhầy nhớt Dịch ói có lẫn máu âm tính Tiêu chảy Tiêu chảy phân dịch nhầy Kết điều trị:…………………………………………………… Ngày bình phục:…………………………………………………… Tiêu chảy phân có lẫn máu ... lệ nhiễm bệnh viêm ruột CPV-2 chó đến khám điều trị số phòng mạch Thú y tỉnh thành ĐBSCL 63 4.1.1 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột 63 4.1.2 Tỷ lệ nhiễm CPV-2 chó bệnh viêm ruột theo... CPV-2c Canine Parvovirus type 2c ĐBSCL Đồng sông Cửu Long DITC Dose infectious culture DNA Desoxyribonucleic acid EIA Enzyme ImmunoAssay ELISA FPV bệnh bệnh bệnh bệnh bệnh Đồng sông Cửu Long tissue... vaccine phòng bệnh viêm ruột CPV-2 chó số tỉnh thành ĐBSCL 114 4.4.2 So sánh hàm lượng kháng thể sau tiêm phòng loại vaccine phòng bệnh viêm ruột CPV-2 chó theo nhóm giống số tỉnh thành ĐBSCL

Ngày đăng: 24/02/2020, 22:29

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan