Mục đích cơ bản của luận án này là cung cấp đặc điểm hình thái nhận diện của các loài dơi thuộc giống Myotis và giống Pipistrellus ở một số tỉnh thuộc miền Bắc Việt Nam. Cung cấp dẫn liệu về tiếng kêu siêu âm và di truyền phân tử của một số loài dơi thuộc giống Myotis và giống Pipistrellus ghi nhận đƣợc ở khu vực nghiên cứu trong thời gian thực hiện đề tài.
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT - - NGUYỄN VĂN VIẾT NGHIÊN CỨU PHÂN LOẠI CÁC LOÀI DƠI THUỘC GIỐNG MYOTIS VÀ GIỐNG PIPISTRELLUS (CHIROPTERA: VESPERTILIONIDAE) Ở MỘT SỐ TỈNH MIỀN BẮC VIỆT NAM DỰA TRÊN ĐẶC ĐIỂM HÌNH THÁI, TIẾNG KÊU SIÊU ÂM VÀ DI TRUYỀN PHÂN TỬ LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Hà Nội - 2019 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT - - NGUYỄN VĂN VIẾT NGHIÊN CỨU PHÂN LOẠI CÁC LOÀI DƠI THUỘC GIỐNG MYOTIS VÀ GIỐNG PIPISTRELLUS (CHIROPTERA: VESPERTILIONIDAE) Ở MỘT SỐ TỈNH MIỀN BẮC VIỆT NAM DỰA TRÊN ĐẶC ĐIỂM HÌNH THÁI, TIẾNG KÊU SIÊU ÂM VÀ DI TRUYỀN PHÂN TỬ Chuyên ngành: Động vật học Mã số: 42 01 03 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Ngƣời hƣớng dẫn khoa học : GS.TS Lê Vũ Khôi Ngƣời hƣớng dẫn khoa học 2: PGS.TS Vũ Đình Thống Hà Nội - 2019 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi Các kết trình bày luận án trung thực, chưa sử dụng luận văn luận án khác Tác giả Nguyễn Văn Viết LỜI CẢM ƠN Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới GS.TS Lê Vũ Khơi PGS.TS Vũ Đình Thống, ngƣời thầy tận tình hƣớng dẫn tơi suốt q trình nghiên cứu hồn thành luận án Tơi xin gửi lời cảm ơn chân thành sâu sắc tới PGS TS Vũ Đình Thống, TS Nguyễn Trƣờng Sơn, Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam; ThS Đào Nhân Lợi, khoa Nông Lâm, Trƣờng Đại học Tây Bắc chia sẻ mẫu cho nghiên cứu Tôi xin chân thành cảm ơn tới Ban Giám hiệu, cán phòng Đào tạo đồng nghiệp Trƣờng Cao đẳng Hải Dƣơng; Ban lãnh đạo Viện Sinh thái Tài nguyên Sinh vật; cán Phòng Bảo tàng Động vật, Phòng Động vật có xƣơng sống, Phòng Động vật đất, Phòng Hành - Tổng hợp, phận Đào tạo thuộc Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam tạo điều kiện giúp đỡ thời gian nghiên cứu Tôi xin cảm ơn lãnh đạo cán phòng Hệ thống phân tử Di truyền bảo tồn, Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật; Tổ Hệ gen học miễn dịch thuộc phòng Hệ gen học ngƣời thuộc Viện nghiên cứu Hệ gen, Viện Hàn lâm Khoa học Cơng nghệ Việt Nam; Phòng thí nghiệm Di truyền học Phòng Sinh học phân tử-Tế bào, Khoa Sinh học Bảo tàng Sinh học, Trƣờng Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc Gia Hà Nội việc giải trình tự ADN chia sẻ mẫu nghiên cứu Tôi xin cảm ơn lãnh đạo cán chi cục Kiểm lâm Tỉnh Hải Dƣơng, Hải Phòng, Quảng Ninh, Bắc Giang, Sơn La, Lai Châu, Điện Biên, Hà Giang, Tuyên Quang, Bắc Cạn, Lạng Sơn, Phú Thọ, Hòa Bình, Ninh Bình tạo điều kiện q trình điều tra thực địa Cuối cùng, tơi xin gửi lời cảm ơn đến gia đình: Bố, mẹ, vợ, con, anh chị em… ủng hộ, động viên, giúp đỡ tơi suốt q trình thực luận án MỤC LỤC MỞ ĐẦU Lý chọn đề tài Mục tiêu đề tài luận án Nội dung nghiên cứu đề tài luận án Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài luận án Những đóng góp đề tài luận án CHƢƠNG TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 1.1 Khái quát nghiên cứu phân loại dơi giới 1.1.1 Phân loại Dơi (Chiroptera) 1.1.2 Phân loại giống Myotis giống Pipistrellus 12 1.2 Khái quát nghiên cứu dơi Việt Nam 20 1.2.1 Lƣợc sử nghiên cứu 20 1.2.2 Tình hình nghiên cứu tiếng kêu siêu âm di truyền phân tử loài dơi Việt Nam 23 1.2.3 Nghiên cứu phân loại giống Myotis 25 1.2.4 Nghiên cứu phân loại giống Pipistrellus 29 CHƢƠNG II ĐỊA ĐIỂM, VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 32 2.1 Địa điểm thời gian nghiên cứu 32 2.2 Dụng cụ, hóa chất vật liệu nghiên cứu 33 2.3 Phƣơng pháp nghiên cứu 34 2.3.1 Phƣơng pháp thu mẫu 34 2.3.2 Phƣơng pháp xử lí mẫu 35 2.3.3 Phƣơng pháp ghi phân tích tiếng kêu siêu âm 39 2.3.4 Phƣơng pháp phân tích ADN 40 CHƢƠNG III KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN 41 3.1 Thành phần loài dơi thuộc giống Myotis giống Pipistrellus khu vực nghiên cứu 41 3.2 Những loài dơi ghi nhận cho khu vực nghiên cứu Việt Nam 42 3.2.1 Loài Myotis altarium Thomas, 1911 42 3.2.2 Dạng loài Myotis cf montivagus 47 3.2.3 Dạng loài Myotis cf laniger 54 3.3 Đặc điểm hình thái nhận dạng loài thuộc giống Myotis giống Pipistrellus thuộc vùng nghiên cứu 59 3.3.1 Đặc điểm hình thái ngồi 59 3.3.2 Đặc điểm hình thái sọ 68 3.3.3 Đặc điểm sụn ngọc hành 77 3.4 Đặc điểm tiếng kêu siêu âm số loài thuộc giống Myotis giống Pipistrellus ghi nhận đƣợc trình nghiên cứu 79 3.4.1 Giống Myotis 79 3.4.2 Giống Pipistrellus 81 3.5 Đặc điểm di truyền phân tử 83 3.6 Đặc điểm nhận dạng loài dơi thuộc giống Myotis giống Pipistrellus số tỉnh miền Bắc Việt Nam 85 3.6.1 Myotis chinensis Tomes, 1857 85 3.6.2 Myotis pilosus Peters, 1869 88 3.6.3 Myotis montivagus Dobson, 1874 91 3.6.4 Myotis indochinensis Nguyen et al, 2013 94 3.6.5 Myotis annectans Dobson, 1871 96 3.6.6 Myotis muricola Gray, 1846 99 3.6.7 Myotis siligorensis Horsfield, 1855 102 3.6.8 Myotis laniger Peters, 1870 105 3.6.9 Myotis annamiticus Kruskop, Tsytsulina, 2001 107 3.6.10 Myotis horsfieldii Temminck, 1840 109 3.6.11 Myotis hasseltii Temminck, 1840 111 3.6.12 Pipistrellus paterculus Thomas, 1915 113 3.6.13 Pipistrellus abramus Temminck, 1840 115 3.6.14 Pipistrellus tenuis Temminck, 1840 118 3.6.15 Pipistrellus coromandra Gray, 1838 120 3.6.16 Pipistrellus javanicus Gray, 1838 122 3.7 Khóa định loại lồi thuộc giống Myotis giống Pipistrellus miền Bắc Việt Nam 125 3.7.1 Giống Myotis 125 3.7.2 Giống Pipistrellus 127 KẾT LUẬN 128 KIẾN NGHỊ 129 TÀI LIỆU THAM KHẢO 130 DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1 Số loài dơi ghi nhận Việt Nam số nghiên cứu trƣớc 22 Bảng 1.2 Các loài dơi khu hệ dơi Việt Nam đƣợc ghi nhận từ năm 2006 đến 23 Bảng 1.3 Thành phần loài dơi thuộc giống Myotis Việt Nam số nghiên cứu trƣớc 26 Bảng 1.4 Thông số tiếng kêu siêu âm số loài thuộc giống Myotis Việt Nam số nghiên cứu trƣớc 28 Bảng 1.5 Thành phần loài dơi thuộc giống Pipistrellus Việt Nam số nghiên cứu trƣớc 30 Bảng 1.6 Thông số tiếng kêu siêu âm số loài thuộc giống Pipistrellus Việt Nam số nghiên cứu trƣớc 31 Bảng 2.1: Các cặp mồi đƣợc sử dụng phân tích ADN 40 Bảng 3.1 Thành phần loài dơi thuộc giống Myotis giống Pipistrellus ghi nhận đƣợc khu vực nghiên cứu 41 Bảng 3.2 Một số thông số loài M altarium nghiên cứu số nghiên cứu trƣớc 43 Bảng 3.3 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc lồi M altarium nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 45 Bảng 3.4 Một số số hình thái ngồi, hình thái sọ, lồi Myotis cf montivagus loài M montivagus 51 Bảng 3.5 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc lồi M cf montivagus nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 53 Bảng 3.6 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc lồi M cf laniger nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 58 Bảng 3.7 Các số FA, E, Cr HF loài thuộc giống Pipistrellus nghiên cứu 59 Bảng 3.8 Các số FA, E, Cr HF 14 loài dạng loài thuộc giống Myotis nghiên cứu 60 Bảng 3.9: Vị trí tƣơng đối chiều dài cẳng tay so với mút mõm mút tai số loài thuộc giống Myotis nghiên cứu 63 Bảng 3.10 Vị trí tƣơng đối chiều dài tai so với mút mõm số loài thuộc giống Myotis 66 Bảng 3.11 Một số số hộp sọ 14 loài dạng loài thuộc giống Myotis nghiên cứu 69 Bảng 3.12 Một số số hộp sọ loài thuộc giống Pipistrellus nghiên cứu 70 Bảng 3.13 Một số số thuộc giống Myotis nghiên cứu 74 Bảng 3.14 Một số số thuộc giống Pipistrellus nghiên cứu 75 Bảng 3.15 Tƣơng quan chiều cao thuộc hàm trên, hàm dƣới loài thuộc giống Myotis nghiên cứu 76 Bảng 3.16 Tƣơng quan chiều cao thuộc hàm trên, hàm dƣới loài thuộc giống Pipistrellus nghiên cứu 76 Bảng 3.17 Một số thông số tiếng kêu siêu âm loài M pilosus, M chinensis, M siligorensis M muricola ghi nhận đƣợc trình nghiên cứu 80 Bảng 3.18 Một số thơng số siêu âm lồi P javanicus, P abramus P coromandra ghi nhận đƣợc nghiên cứu 81 Bảng 3.19 Kết so sánh trình tự gen COI gen 16S loài thuộc giống Myotis giống Pipistrellus nghiên cứu với trình tự gen tƣơng ứng ngân hàng gen 84 Bảng 3.20 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc loài M chinensis nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 86 Bảng 3.21 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc lồi M pilosus nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 89 Bảng 3.22 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc lồi M montivagus nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 92 Bảng 3.23 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc loài M annectans nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 97 Bảng 3.24 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc lồi M muricola nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 100 Bảng 3.25 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc loài M siligorensis nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 103 Bảng 3.26 Kết so sánh trình tự gen 16S lồi P abramus nghiên cứu với trình tự số gen 16S ngân hàng gen 116 Bảng 3.27 Kết so sánh trình tự gen COI thuộc loài P tenuis nghiên cứu với số trình tự gen COI ngân hàng gen 119 Bảng 3.28 Kết so sánh trình tự gen COI lồi P javanicus nghiên cứu với trình tự số gen COI ngân hàng gen 123 DANH MỤC HÌNH Hình 1.1 Các kiểu tín hiệu siêu âm dơi (theo Hill & Smith, 1984) [107] 10 Hình 1.2 Hình thái tai bề mặt hàm hàm dƣới bên trái giống Myotis (A,C) giống Pipistrellus (B,D) (Theo Kruskop, 2013) [137] 14 Hình 2.1 Sơ đồ điểm tiến hành điều tra khảo sát thực địa thu mẫu dơi 32 Hình 2.2: Thu mẫu dơi lƣới mờ 34 Hình 2.3: Thu mẫu dơi bẫy thụ cầm 35 Hình 2.4: Cách đo số số hình thái ngồi dơi 36 Hình 2.5: Cách đo số số sọ dơi 37 Hình 3.1 Kết phân tích sai khác kích thƣớc (I), hình dạng (II) loài M altarium (x), M annectans (o), M montivagus (□), M indochinensis (∆) phƣơng pháp PCA theo số 44 Hình 3.2 Kết phân tích mức độ đóng góp số kích thƣớc (I) hình dạng (II) vào khác biệt loài M altarium, M annectans, M indochinensis M montivagus 44 Hình 3.3 Hình thái hộp sọ, (A), hình thái (C), cấu trúc tiếng kêu siêu âm (D) vùng phân bố (B) loài M altarium Việt Nam 46 Hình 3.4 Hình thái sọ, lồi M cf montivagus (A) M montivagus (B) 49 Hình 3.5 Kết phân tích sai khác kích thƣớc (I), hình dạng (II) lồi M cf montivagus (□) với loài M montivagus (∆), M muricola (o) phân tích PCA theo số FA, E, HF, Cr HB 52 Hình 3.6 Kết phân tích mức độ đóng góp số kích thƣớc (I) hình dạng (II) vào sai khác loài M cf montivagus, M montivagus M muricola.52 Hình 3.7 Hình thái hộp sọ loài M cf laniger (A) loài M laniger (B) 56 Hình 3.8 Kết phân tích khác biệt kích thƣớc (I), hình dạng (II) loài M cf laniger (□) loài M laniger (o) phân tích PCA theo số 57 Hình 3.9 Kết phân tích mức độ đóng góp vào sai khác loài M cf montivagus loài M laniger theo số kích thƣớc (I) hình dạng (II) 57 Hình 3.10 Cách đo vị trí tƣơng đối cẳng tay so với mút mõm, mút tai 62 Hình 3.11 Các kiểu hình thái tai lồi thuộc giống Myotis 64 Hình 3.12 Các kiểu hình thái mấu tai lồi thuộc giống Pipistrellus nghiên cứu 67 Hình 3.13 Các kiểu hình thái xƣơng gò má loài thuộc giống Myotis nghiên cứu 71 Hình 3.14 Các kiểu hình thái đƣờng gân hộp sọ loài thuộc giống Myotis nghiên cứu 71 Hình 3.15 Hình thái mặt hộp sọ loài thuộc giống Pipistrellus 73 Hình 3.16 Hình thái sụn ngọc hành loài P abramus (A), P paterculus (B), P javanicus (C), P tenuis P coromandra (D) 78 ... vực nghiên cứu dựa đặc điểm hình thái 3 Nội dung nghiên cứu đề tài luận án Xác định đặc điểm hình thái nhận diện loài dơi thuộc giống Myotis giống Pipistrellus khu vực nghiên cứu Nghiên cứu đặc. .. nhận diện loài dơi thuộc giống Myotis giống Pipistrellus số tỉnh thuộc miền Bắc Việt Nam Cung cấp dẫn liệu tiếng kêu siêu âm di truyền phân tử số loài dơi thuộc giống Myotis giống Pipistrellus. .. (CHIROPTERA: VESPERTILIONIDAE) Ở MỘT SỐ TỈNH MIỀN BẮC VIỆT NAM DỰA TRÊN ĐẶC ĐIỂM HÌNH THÁI, TIẾNG KÊU SIÊU ÂM VÀ DI TRUYỀN PHÂN TỬ Chuyên ngành: Động vật học Mã số: 42 01 03 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH