Luận án tiến sĩ: Nghiên cứu một số đặc điểm dịch tễ học của bệnh tiêu chảy thành dịch ở lợn (PED) tại miền Bắc Việt Nam

Mục đích của luận án nhằm làm rõ tình hình dịch PED ở 10 tỉnh miền Bắc, bao gồm vùng đồng bằng sông Hồng và vùng trung du- miền núi. Trên cơ sở xác định được sự lưu hành của PEDV, đặc điểm dịch tễ học được phân tích đa chiều, đi sâu tìm hiểu những biến đổi có liên quan đến đáp ứng miễn dịch trung hòa virus. Đặc biệt, phân tích mối liên hệ về gen được thực hiện trên cơ sở dữ liệu lớn nhằm làm rõ nhiều đặc điểm dịch tễ học phân tử chưa được đề cập trong nhiều nghiên cứu trước đây.

HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM ¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯ NGUYỄN TRUNG TIẾN NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC CỦA BỆNH TIÊU CHẢY THÀNH DỊCH Ở LỢN (PED) TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM LUẬN ÁN TIẾN SĨ NHÀ XUẤT BẢN ĐẠI HỌC NÔNG NGHIỆP - 2018 HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM ¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯ NGUYỄN TRUNG TIẾN NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC CỦA BỆNH TIÊU CHẢY THÀNH DỊCH Ở LỢN (PED) TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM Chuyên ngành: Dịch tễ học thú y Mã số: 9.64.01.08 Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS Nguyễn Bá Hiên HÀ NỘI - 2018 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng thân Các kết nghiên cứu trình bày luận án trung thực, khách quan chưa dùng bảo vệ để lấy học vị Tôi xin cam đoan giúp đỡ cho việc thực luận án cám ơn thông tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày tháng năm 2018 Tác giả luận án Nguyễn Trung Tiến i LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành luận án, tác giả nhận giúp đỡ tạo điều kiện nhiều người, sau lời cảm ơn chân thành tác giả: Trước hết, tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới Thầy giáo PGS.TS Nguyễn Bá Hiên, người trực tiếp hướng dẫn suốt trình nghiên cứu hồn thành luận án Nhờ có hướng dẫn nhiệt tình ý kiến đóng góp q báu thầy mà luận án tơi hồn thành Tơi xin trân trọng cảm ơn Ban Giám đốc Học viện Nông nghiệp Việt Nam, Ban Quản lý đào tạo, Ban Chủ nhiệm khoa Thú y, Bộ mơn Vi sinh vật - Truyền nhiễm, Phòng Thí nghiệm trọng điểm công nghệ sinh học Thú y, tồn thể thầy, giáo cán Khoa Thú y - Học viện Nông nghiệp Việt Nam, trang bị cho kiến thức quý báu giúp đỡ tơi hồn thành cơng trình nghiên cứu Trân trọng cảm ơn Lãnh đạo, toàn thể cán công nhân viên Trung tâm Kiểm nghiệm thuốc Thú y TW1, bạn bè đồng nghiệp tạo điều kiện thời gian, động viên, chia sẻ vật chất, tinh thần, giúp đỡ tơi q trình học tập, nghiên cứu hoàn thành luận án Hà Nội, ngày tháng năm 2018 Nghiên cứu sinh Nguyễn Trung Tiến ii MỤC LỤC Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh mục từ viết tắt vi Danh mục bảng vii Danh mục hình viii Trích yếu luận án x Thesis abstract xii Phần Mở đầu 1.1 Tính cấp thiết đề tài 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Phạm vi nghiên cứu 1.4 Những đóng góp đề tài 1.5 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài Phần Tổng quan tài liệu 2.1 Giới thiệu chung 2.2 Lịch sử bệnh tiêu chảy thành dịch lợn 2.3 Tình hình dịch PED giới Việt Nam 2.3.1 Tình hình dịch PED giới 2.3.2 Tình hình dịch PED ở Viê ̣t Nam 2.4 Căn bệnh 2.4.1 Phân loại hình thái PEDV 2.4.2 Cấu trúc phân tử virus gây bệnh 2.4.3 Đặc tính ni cấy virus 12 2.4.4 Sức đề kháng virus gây bệnh PED 12 2.4.5 Dịch tễ học lâm sàng 13 2.5 Dịch tễ học phân tử 16 2.6 Triệu chứng bệnh tích lợn mắc PED 18 2.6.1 Triệu chứng lâm sàng 18 2.6.2 Bệnh tích 19 iii 2.7 Các phương pháp chẩn đoán PEDV 20 2.7.1 Phát virus 20 2.7.2 Chẩn đoán phân biệt 23 2.7.3 Phân lập virus 24 2.8 Phòng điều trị bệnh 25 Phần Nội dung - nguyên liệu - phương pháp nghiên cứu 30 3.1 Địa điểm nghiên cứu 30 3.2 Thời gian thực đề tài 30 3.3 Nội dung nghiên cứu 30 3.3.1 Nghiên cứu tình hình dịch PED số tỉnh miền Bắc Việt Nam 30 3.3.2 Phân tích đặc điểm trình tự gen Japan_2014 518 KT266578_China_2015 519 KT989352_China_2015 520 KT989353_China_2015 521 KT989354_China_2015 522 KT989355_China_2015 523 KT989356_China_2015 524 KT989357_China_2015 525 KT989358_China_2015 526 KT989359_China_2015 527 KT989360_China_2015 528 KT989361_China_2015 529 KT989362_China_2015 530 KT989363_China_2015 531 KT989364_China_2015 532 KT989365_China_2015 533 KT989366_China_2015 534 KX982573_Vietnam_2015 535 KX982576_Vietnam_2015 536 KY070587_China_2016 537 MF152597_China_2016 538 MF152598_China_2016 539 MF152599_China_2016 540 MF152602_China_2016 541 MF152596_China_2017 542 MF152600_China_2017 543 MF152601_China_2017 544 MF152603_China_2017 545 MF152604_China_2017 546 MF152605_China_2017 547 KU133269_China_2015 548 KC140102_China_2012 549 KU975404_China_2015 550 KR265813_USA_2014 107 551 KR514323_China_2015 552 KM975741_USA_2014 553 KF840561_China_2013 554 KF840562_China_2013 555 KU133263_China_2012 556 KT388411_China_2014 557 KU133234_China_2014 558 KJ778615_USA_2013 559 KJ778616_USA_2013 560 KT313036_China_2015 561 KJ645661_USA_2013 562 KJ158152_China_2011 563 KJ645648_USA_2013 564 KJ645649_USA_2013 565 KX064280_China_2014 566 KU982980_USA_2015 567 KF761675_China_2013 568 KM225245_China_2012 569 KM225246_China_2012 570 KM225247_China_2012 571 KM225248_China_2012 572 KM225249_China_2012 573 KM225250_China_2012 574 KM225251_China_2012 575 KM225252_China_2012 576 KJ645641_USA_2013 577 KM196109_Canada_2014 578 KU985229_Netherlands_2015 579 KT388412_China_2014 580 KU975403_China_2015 581 KU982967_USA_2015 582 KU982969_USA_2015 583 KP641661_USA_2014 584 KJ645700_Mexico_2014 585 KM189366_Canada_2014 586 KM077139_USA_2014 587 KR265840_USA_2014 588 KJ645638_USA_2013 589 KJ645639_USA_2013 590 KP403954_Ukraine_2014 591 KU982966_USA_2015 592 KU982972_USA_2015 593 KU982976_USA_2015 594 KT895907_Austria_2015 595 KU133246_China_2015 596 KU975405_China_2014 597 KU975416_China_2015 598 KJ408801_USA_2014 599 KR265843_USA_2014 600 KJ645662_USA_2013 601 KJ645663_USA_2013 602 KJ645650_USA_2013 603 KJ645651_USA_2013 604 KR265766_Mexico_2014 605 KR265810_USA_2014 606 KR514318_China_2013 607 KJ645640_USA_2013 608 KR265828_USA_2014 609 KJ645664_USA_2013 610 KJ645665_USA_2013 611 KJ645666_USA_2013 612 JN825712_China_2011 613 KP768390_Taiwan_2007 614 KR265781_USA_2014 615 KR265784_USA_2014 616 KX534205_China_2015 617 KR265809_USA_2014 618 KJ645668_USA_2013 619 KJ645706_USA_2013 620 KJ645642_USA_2013 621 KU133250_China_2013 622 KU133253_China_2013 623 KR265821_USA_2014 624 KU847996_China_2015 625 KJ645704_USA_2013 626 KU133265_China_2015 627 KU975412_China_2014 628 KU982975_USA_2015 629 KR265792_USA_2014 630 KJ645701_USA_2014 631 KR095279_China_2015 632 KR265773_USA_2014 633 KR265797_USA_2014 634 KJ645669_USA_2013 635 KJ645670_USA_2013 636 KU975411_China_2014 637 KR265841_USA_2014 638 KR265842_USA_2014 639 KR265814_USA_2014 640 KY111278_Italy_2016 641 KU975419_China_2015 642 KJ645667_USA_2013 643 KJ645672_USA_2013 644 KJ645673_USA_2013 645 KJ645645_USA_2013 646 KF452322_USA_2013 647 KP276244_Taiwan_2014 648 KP276245_Taiwan_2014 649 KP276246_Taiwan_2014 650 KU133232_China_2014 651 KF294256_China_2012 652 KP202365_USA_2014 653 KF738263_China_2012 654 KJ645695_USA_2013 655 KJ645696_USA_2013 656 KJ645702_USA_2014 657 KR265791_USA_2014 658 KF267450_USA_2013 659 KM975739_USA_2013 660 KU558702_USA_2013 661 KP276250_Taiwan_2014 662 KP276251_Taiwan_2014 663 KP276252_Taiwan_2014 664 KR265811_USA_2014 665 KX812523_China_2016 666 KF738258_China_2012 667 KR265844_USA_2014 668 KJ645671_USA_2013 669 KJ645674_USA_2013 670 KF738264_China_2012 671 KR265819_USA_2014 672 KR265812_USA_2014 673 KM975740_USA_2013 674 KT591944_USA_2013 675 KT860508_USA_2013 676 KU133262_China_2013 677 KR265767_USA_2014 678 KM609207_China_2011 679 KF724936_Thailand_2012 680 KF724938_Thailand_2013 681 KJ526096_China_2013 682 KP870124_China_2013 683 KJ741221_Korea_2014 684 KJ741222_Korea_2014 685 KJ741223_Korea_2014 686 KJ741224_Korea_2014 687 KJ741225_Korea_2014 688 KM924403_Korea_2014 689 KM924404_Korea_2014 690 KM924405_Korea_2014 691 KM924406_Korea_2014 692 KM924407_Korea_2014 693 KM924408_Korea_2014 694 KM924409_Korea_2014 695 KM924410_Korea_2014 696 KM924411_Korea_2014 697 KT428878_China_2014 698 KC242905_China_2012 699 KC242906_China_2012 700 KX708903_Vietnam_2015 701 KY775047_China_2016 702 KY775048_China_2016 703 KY775049_China_2016 704 KY775050_China_2016 705 GU180142_Korea_2008 706 GU180143_Korea_2008 707 JN184634_Korea_2009 708 JN184635_Korea_2009 709 JX647847_China_2011 710 KP870117_China_2012 711 KP870118_China_2012 712 KP870119_China_2012 713 KJ451039_Korea_2013 714 KJ451040_Korea_2013 715 KJ451041_Korea_2013 716 KJ451042_Korea_2013 717 KJ451043_Korea_2013 718 KJ451044_Korea_2013 719 KJ451046_Korea_2013 720 KJ451045_Korea_2013 721 KJ662670_Korea_2013 722 KM392231_USA_2013 723 KM392232_USA_2013 724 KM392228_USA_2013 725 KM392229_USA_2013 726 KM392230_USA_2013 727 KM924412_Korea_2013 728 KP455313_Vietnam_2013 729 KP455314_Vietnam_2013 730 KR078300_USA_2013 731 KP870128_China_2013 732 KP870129_China_2013 733 KP870136_China_2014 734 KP870137_China_2014 735 KP870138_China_2014 736 KP870139_China_2014 737 KP890336_China_2014 738 KX708897_Vietnam_2015 739 KX708898_Vietnam_2015 740 KY000559_Thailand_2008 741 KY828922_Thailand_2008 742 GU180144_Korea_2009 743 GU180145_Korea_2009 744 GU180146_Korea_2009 745 JX145339_China_2011 746 JX489155_China_2011 747 KF724937_Thailand_2011 748 KX981899_Thailand_2011 749 JX560761_China_2012 750 KC242898_China_2012 108 751 KC242899_China_2012 752 KC242900_China_2012 753 KJ777677_China_2012 754 KJ777678_China_2012 755 KJ451036_Korea_2013 756 KP870121_China_2013 757 KP870122_China_2013 758 KR818832_China_2013 759 KJ588062_Korea_2014 760 KJ588063_Korea_2014 761 KJ588064_Korea_2014 762 KM924420_Korea_2014 763 KM924421_Korea_2014 764 KM924422_Korea_2014 765 KM924423_Korea_2014 766 KM924424_Korea_2014 767 KM924425_Korea_2014 768 KY775040_China_2016 769 KY775041_China_2016 770 KY775045_China_2016 771 KY775046_China_2016 772 KM609206_China_2012 773 KP870120_China_2013 774 KP870125_China_2013 775 KP870130_China_2013 776 KP870140_China_2013 777 KJ451047_Korea_2014 778 KJ451048_Korea_2014 779 KM924413_Korea_2014 780 KM924414_Korea_2014 781 KM924415_Korea_2014 782 KM924416_Korea_2014 783 KM924417_Korea_2014 784 KM924418_Korea_2014 785 KM924419_Korea_2014 786 KP455315_Vietnam_2014 787 KP455316_Vietnam_2014 788 KP455317_Vietnam_2014 789 KP455318_Vietnam_2014 790 KP455319_Vietnam_2014 791 KP455320_Vietnam_2014 792 KM609210_China_2014 793 KM609211_China_2014 794 KP870131_China_2014 795 KP870132_China_2014 796 KU363117_Japan_2014 797 KU363118_Japan_2014 798 KU363119_Japan_2014 799 KU363120_Japan_2014 800 KU363121_Japan_2014 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 KR003452_Belgium_2015 KX708901_Vietnam_2015 KX708902_Vietnam_2015 KY825240_Korea_2016 KY825242_Korea_2016 KY775051_China_2016 KX708894_Vietnam_2016 MF737355_Korea_2001 KF779469_Korea_2008 GU180147_Korea_2009 GU180148_Korea_2009 JQ979290_China_2011 KC242904_China_2012 KF724935_Thailand_2012 KP870114_China_2012 KP765609_China_2013 KP870126_China_2013 KP870135_China_2014 KX981897_Thailand_2014 KX981898_Thailand_2014 KX981900_Thailand_2015 MF346935_China_2016 KY775055_China_2016 JQ979289_China_2011 KM609204_China_2011 KM392224_USA_2013 KM392225_USA_2013 KR078299_USA_2013 KP870133_China_2014 KP870134_China_2014 KY775044_China_2016 KC242901_China_2012 KC242902_China_2012 KF384500_China_2012 KM609203_China_2012 KM609208_China_2012 KP870113_China_2012 KJ020932_China_2013 KJ451037_Korea_2013 KF760557_China_2013 KM609209_China_2013 KP870123_China_2013 KM403155_Korea_2014 KM403156_Korea_2014 KM403157_Korea_2014 KM403158_Korea_2014 KM242131_China_2014 KM924426_Korea_2014 KM924427_Korea_2014 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 KM609212_China_2014 KM609213_China_2014 KY928065_China_2016 KY607767_China_2016 KY963963_Korea_2016 KY775038_China_2016 KY775039_China_2016 KY775042_China_2016 KY775043_China_2016 JQ979291_China_2011 JX188454_China_2011 KC196276_China_2011 KC242903_China_2012 KJ451038_Korea_2013 KX839246_China_2013 KT428879_China_2014 KU363111_Japan_2014 KU363112_Japan_2014 KU363113_Japan_2014 KU363114_Japan_2014 KU363115_Japan_2014 KU363116_Japan_2014 KX981440_China_2016 KX066126_China_2011 KC242911_China_2012 KC242912_China_2012 KM392226_USA_2013 KM392227_USA_2013 KP870127_China_2013 KR873431_Korea_2014 KR873434_Korea_2014 KR873435_Korea_2014 KU975389_China_2014 KU836638_UK_2000 KP870115_China_2012 KP870116_China_2012 KX708895_Vietnam_2015 KX708904_Vietnam_2015 KX708905_Vietnam_2015 KX708906_Vietnam_2015 KX708907_Vietnam_2015 KY775035_China_2016 KY775036_China_2016 KY775037_China_2016 KY775052_China_2016 KY775053_China_2016 KY775054_China_2016 JQ979287_China_2011 JQ979288_China_2011 109 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 KC242908_China_2012 KC242909_China_2012 KC242910_China_2012 KY486713_China_2015 KY486714_China_2015 KX708896_Vietnam_2015 KX708899_Vietnam_2015 KX708900_Vietnam_2015 KJ960178_Vietnam_2013 KJ960179_Vietnam_2013 KJ960180_Vietnam_2013 Danh mục trình tự gen ORF3 sử dụng nghiên cứu (mã số GenBank, tên chủng) 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 KP455972_HUA.PED63_Vietnam KP455969_HUA.PED55_Vietnam KP455970_HUA.PED58_Vietnam KP455971_HUA.PED60_Vietnam KP455973_HUA.PED67_Vietnam KP455974_HUA.PED68_Vietnam KP455968_HUA.PED47_Vietnam KP455967_HUA.PED45_Vietnam KT941120_HUA.14PED96_Vietnam KJ960180_VN/KCHY.310113_Vietnam KJ960179_VN/VAP1113.1_Vietnam KJ960178_VN/JFP1013.1_Vietnam KU977500_CH/SXYC KP281639_HBHA1 KU645771_CH/HJ/2015 KR138437_AY2 KP281640_FJGS KX010473_GZLB KU977483_CH/HNHB.3 KU645787_CH/YZ1/2015 KU645784_CH/WZ2/2014 KU645783_CH/WZ1/2014 KX010468_GZZAI1 KX010466_GZKY KU645774_CH/KF/2015 KU641642_GD/MM/2015 KU641640_LN/SY/2015 KU645773_CH/JY/2015 KU641665_JX/2015/1224 KU977488_CH/HNKF.1 KU641655_HuB/YC/2015 KU641645_SH/SG/2015 KJ857454_KDGN13.295BG KU645777_CH/NH/2015 KT968515_14JM.278 KT968514_14JM.238 KR138439_NC5 KM890287_XC/2013 KU977485_CH/HNHB.5 KU645781_CH/QX3/2014 KT968513_14JM.204 KT968512_14JM.40 KX852337_HLJ/ZD.1/16 KX852325_HLJ/ZD.2/16 KX852324_HLJ/ZD.3/16 KT968516_14JM.295 JQ678037_FJ/FZ/11 JN676145_Fj KU363132_JKa.295fSde194Co25 KU363130_JKa.295fSde215Co6 KU363129_JKa.295fSde197Co5 KU363128_JKa.295fSde197Co4 KU363127_JMi.277/fSde197Co28 KU363126_JMi.277/fSde197Co27 KU363125_JMi.277/fSde197Co26 KU363131_JKa.295fSde197Co8 KU645776_CH/MZ/2014 KP281654_HeBXT5 KP281625_HBJZ1 KP281613_HeBXT2 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 KP281612_HeBXT1 KX010465_GZ.GZ KX010462_GZ.KF8 KX010461_GZGL KM213254_ZJ13XS0401 KM213251_ZJ13LY1201 KM213250_ZJ14NB0401 KP281609_HNZZ KM213253_ZJ13SX1101 KC120792_P32 KC120785_P6 KC120780_P84 KP222521_MY1 JX501333_CH/XC/12 KC161191_JSDT2011 KC161190_JSDT2.2012 KM048303_CH/HeN/JZ.2013 KJ646567_FJ.ZP KP222531_CQ3 KP222522_CQ2 KP222528_FJLY3 KP281621_HeNPY1 KP281622_HeNPY2 KP222526_GH2 KC120788_P13 KP222532_MX1 KM048302_CH/HeN/FQ.2014 KP281624_HeBBD2 JQ430684_PF5 JQ430683_PF4 JQ430681_PF2 JQ305138_SH5.ORF3 JQ305137_SH4.ORF3 JQ305135_SH2.ORF3 KU641639_BJ/2015/111 KJ857453_KDGG13.6IC KJ857452_KDCN13.2DJ KX010471_GZHX133 KX010464_GZZY KX010463_GZ.HX132 KU641646_HeB/2015/516 KU641637_HLJ2015/DP1.1 KR138440_DeY2 KR138438_DeY1 KX852330_HLJ/MDJ.1/16 KX852329_HLJ/MDJ.2/16 KX852328_HLJ/MDJ.3/16 KU363124_JMi.277/fSde197Co13 KU363122_JMi.277/fSnorCo11 KU977484_CH/HNHB.4 KU977481_CH/HNHB.1 KM048307_CH/HeN/ZK.2014 KP281610_BJLS KR078319_CH/HeN/PY.2015 KP222523_YC1 KP281628_HBHG2 KP281627_HBHG1 KU363123_JMi.277/fSde197Co12 KU977494_CH/HNNY.3 KU641650_TJ/2015/525 110 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 KU641641_HeB/CC/2015 KU641638_SD/QD/2015 KJ646573_FJ.LY1 KJ646572_FJ.LY KU645788_CH/YZ2/2015 KU645767_CH/CG/2014 KU977493_CH/HNNY.2 KX852323_HLJ/ZD.4/16 KP222524_LS7 KP222520_DY3 KP222519_ZD1 KP222518_PJ3 KP281626_HBJZ2 KP281623_HeBBD1 KP281614_HeNZZ1 KP222527_QS2 KJ646563_FJ.SM KU977499_CH/HNZMD KM890281_LB/2013 JX878382_JS120103 JN547396_CH/PDSBF/11 JN547391_CH/ZMDZY/11 KP281611_HBYC KU977492_CH/HNNY.1 KU977482_CH/HNHB.2 KU977487_CH/HNHB.7 KU977495_CH/HNPY KX852327_HLJ/QQHE.1/16 KX852326_HLJ/DQ.1/16 KU977498_CH/HNXX KM890291_ZK/2013 KM890285_WH/2013 KU645782_CH/SS/2015 KU641675_JL/2015/720 JQ027027_CH/XJUrumqi/2011 KU977497_CH/HNXC KU641667_SX/2015/121 KU641644_SC/CD/2015 KC161188_AHQJ2012 KP281642_HeBJA2 KC294277_GDJM.1205 KC294279_GDFS.1203 KC294283_GDZH.1111 KU977491_CH/HNLY KU641673_HLJ/2015/1230 KU641663_HLJ/2015/1231 KU641652_HLJ/2015/1228 KX760095_HA1 KU641649_HLJ/2015/116 KU645770_CH/DF3/2014 KU645768_CH/DF1/2014 KP222530_MY3 KM890279_GS/2013 JX501331_CH/CY/12 JQ664731_CH/HBXX3/11 KU645769_CH/DF2/2014 KM048299_CH/HeN/CY.2013 JN584170_CH/HBXX2/11 KM213252_SH131202 JQ430680_PF1 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 JQ305134_SH1.ORF3 KM386647_XJ.DB2 KF495657_2013AHCH JQ664299_CH/SH/2011 KJ642645_NJ KF495662_2013AHDY KF478915_2013ANMAS JN547400_CH/ZKXH/11 KC342818_CH9 KC342815_CH5 KJ857443_KDGG12KAN KJ857439_KDGG10YO KJ857436_KDGG10DA KJ857437_KDGG10HA KC344848_NPKPED0108 KC344846_V1PED0108 JQ664303_CH/JLGZL/2011 JX880078_ZJ JQ664302_CH/JLCC/2011 KX852334_HLJ/HG.4/16 KX852333_HLJ/JMS.1/16 KX852332_HLJ/JMS.2/16 KX852331_HLJ/JMS.3/16 KX852335_HLJ/HG.3/16 KC342821_CH22 KC342816_CH7 KC342817_CH8 JQ664301_CH/HBQHD/2011 JQ027031_CH/HLJQQHE.1/2011 JQ027026_CH/HLJHRB/2011 KU645775_CH/LY/2015 KM213255_ZJ14HZ0301 JX910247.2 JX910245.2 JX645187_AHSX JX910248_AHYS KF495660_2013AHLX KC120794_P37 JX477096_AHHN JX501743_AHSZ KC161198_JSTS2012 KC161192_JSHZJU2012 JQ027030_CH/SDRZ/2011 KP281641_HeBJA1 KP281638_HeBBD4 KP281635_HeBBD3 KM890310_SQ/2013 JQ735952_CH/BJSY/2011 KC120799_P229 KC120798_P718 KC148525_CH/TJ.2012 JX910241_AHFD JX501744_AHFR KC342811_CH1 KC120796_P82 KC120793_P35 KC120782_P10 JQ678039_FJ/NP/11 KM890283_NY/2013 JQ735951_CH/SDQD/2011 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 JQ027032_CH/ZJHZ.1/2011 JX878384_ZJ KM048305_CH/HeN/SQ.2012.1 KM048304_CH/HeN/RZ.2013 KJ646575_FJ.QZ KJ646574_FJ.FQ KJ646571_FJ.LY KJ646565_FJ.YX KJ646564_FJ.YX JN547399_CH/ZKFG/11 JN547394_CH/ZKHFQ/11 JQ678038_FJ/FQ/11 KJ646577_FJ.FQ1 KJ646576_FJ.FQ2 KJ646569_FJ.PT JN547392_CH/XXHJ/11 KC688871_CH.HZ.11.1 KC120791_P17 JX880080_ZJ JN547393_CH/XCYL/11 JN584172_CH/XCYL2/11 KC342820_CH17 JX880077_ZJ KJ646568_FJ.QK KM048300_CH/HeN/DF.2012.1 KF495663_2013AHLA KF495659_2013AHHB KC161186_AH2011 JQ027028_CH/HLJHG/2011 JQ027022_CH/FJND.2/2011 JQ027021_CH/FJND.1/2011 JQ027020_CH/BJYQ/2011 KC342819_CH13 KC161199_JSYC2012 KM890284_WG/2013 KC294280_TJNH.1203 KP281651_HBHA2 KP281650_ZJHZ4 KU641654_SD/YT/2015 KU641647_HeN/MY/2015 KC342824_CH27 KM048308_CH/HeN/ZMD.2012 KM048298_CH/HeN/AY.2012.2 KM890282_LH/2013 JX880075_ZJ JN584171_CH/NYWL/11 KM048306_CH/HeN/SQ.2012.2 KC120790_P16 JX880081_ZJ KY679910_SDSX16 JN547398_CH/PDSXX/11 KX852338_HLJ/HG.1/16 KX852322_HLJ/HG.2/16 KC816534_CH.HZ.11.2 KC161187_AHDX2012 KC161193_JSHZM2012 KC161189_JSBJ2012 KC294278_GDHZ.1202 KM048301_CH/HeN/DF.2012.3 JX880076_ZJ 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 KJ857447_KDJN12JU KJ857442_KDGN10WC KJ857438_KDGG10KA KC344847_SBPED0211 KJ857445_KDJN12JNJ KJ857444_KDCN12KH KC344845_STPED0810 JX880079_ZJ JN547401_CH/XXYY/11 JX501332_CH/TY/12 JQ664300_CH/SDLY/2011 KC342812_CH2 KU977490_CH/HNKF.3 KU977489_CH/HNKF.2 KP281620_HeNXX KP281649_ZJHZ3 KP281647_ZJHZ1 KP281646_FJAX2 KP281645_FJAX1 KP281648_ZJHZ2 KC294282_GDZQ.1202 JX878383_SC KX010469_GZMR JN547397_CH/KFQX/11 KJ857448_KDJN12YG KJ857440_KDJN10NJ KJ857446_KDJN12GAM KC294281_GDZQ.1204 KP281644_HeNPY4 KP281643_HeNPY3 KX852336_HLJ/HEB.1/16 KP222525_SH5 KJ857434_GW06CHC KJ857433_GB06SY KJ857430_IC05TK KJ857432_GN05DJ KJ857429_CJ98 EU054929_DR13 HQ537438_M1763 HQ537434_BI981 HQ537433_BI976 HQ537435_BI1108 HQ537455_PFF1051 HQ537448_CPF259 HQ537441_V2501 HQ537439_M2227 HQ537454_CPF531 HQ537444_VF131 HQ537442_MF78 HQ537437_e1642 HQ537436_M1595 HQ537443_BIF118 HQ537440_M2366 HQ537456_CPF1074 HQ537452_PFF513 HQ537451_PFF381 HQ537449_PFF285 HQ537446_CPF193 HQ537445_PFF188 HQ537453_PFF514 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 111 HQ537450_CPF299 HQ537447_BIF256 JQ664298_CH/GXWP/2011 KJ857451_KDJN13.1003SW KJ857450_KDGN13DJ KJ857441_KDGN10HOR KJ857435_KDGG10AN KJ857449_KDGG13HWN EU792474_Chinju99 JQ678040_FJ/PT/11 KU645772_CH/HY/2015 KP281619_HeNXC2 KP281618_HeNXC1 KJ646566_FJ.ZP KP222529_PZ1 KU977496_CH/HNSMX KP281636_HeNJZ1 KP281637_HeNJZ2 KP281615_HeNZZ2 KC342825_CH28 KJ646570_FJ.ND JX501329_CH/AY/11 JX910246_AHFY JX910244_AHBB JX910243_AHLX JX910242_AHLA KF495661_2013AHBB KC120802_P1 KC120787_P9 KC120784_P4 KC120779_P14 KP281634_HeNKF2 KP281633_HeNKF1 KP281632_HeNXY2 KC161196_JSSX2011 KF476059_CHJCH KF476057_CHLSHAN KF476049_CHXY.02 KF476052_CHXIP.01 KF476058_CHXIP.03 KT388434_P1 KT388432_P10 KT388429_P40 KT388428_P50 KT388427_P60 KT388426_P70 KT388423_P100 KT388422_P110 KT388425_P80 KT388424_P90 KT388430_P30 KT388433_P5 JQ664304_CH/HBBD/2011 JQ027023_CH/GDQY/2011 JQ039903_CH/GD/2011 JQ027029_CH/GXQZ/2011 JQ027025_CH/GXWM/2011 JQ027024_CH/GXNN/2011 KX010472_GZ.RHH KX010470_GZRHG 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 KM890289_YC/2013 JX878381_AH KC120789_P15 JX501330_CH/CG/11 JN980697_CHGD.01 KY607768_JS201603 KX010467_GZ.TW3 JQ305099_CH/HLJHH.2/2011 KC344843_6PED0108 KU977486_CH/HNHB.6 KU977480_CH/HNAY KU641676_SH/2015/921 KU641671_HLJ/GQ/2015 KU641670_AH/XZ/2015 KU641669_FJ/FZ/2015 KU641668_HeB/2015/121 KU641666_HeB/TS/2015 KU641664_ShX/YA/2015 KU641662_SX/LL/2015 KU641661_HeB/HS/2015 KU641660_HLJ/852/2015 KU641659_HuN/2015/1210 KU641658_JX/2015/1221 KU641657_AH/HF/2015 KU641656_LN/DL/2015 KU641653_SD/2015/415 KU641651_SD/LC/2015 KU641648_SH/2015/122 KU641643_HLJ/QQHR/2015 KU645785_CH/XX/2015 KU645780_CH/QX2/2014 KU645779_CH/QX1/2014 KX010474_GZGY.01 KT799999_CH.HuN.20140416 KT799995_CH.HeB.20140324 KT968511_14JM.01 KR138441_NC10 KM890292_ZM/2013 KM890286_WS/2013 KM890280_HX/2013 KP281631_HeNXY1 KP281630_HeNZZ4 KP281629_HeNZZ3 KU641672_SH/2015/124 KU641674_LN/TA/2015 KR078318_CH/HeN/XC.2014 KP281653_HeBXT4 KP281652_HeBXT3 KP281616_HeNPDS1 KP281617_HeNPDS2 KU641677_BJ/2015/516 KF495658_2013AHFD KC342823_CH26 KC342822_CH25 KC120801_P18 KC120800_P19 KC120797_P83 KC120795_P81 KC120786_P7 KC120783_P2 ...HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM ¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯ NGUYỄN TRUNG TIẾN NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC CỦA BỆNH TIÊU CHẢY THÀNH DỊCH Ở LỢN (PED) TẠI... thực đề tài 30 3.3 Nội dung nghiên cứu 30 3.3.1 Nghiên cứu tình hình dịch PED số tỉnh miền Bắc Việt Nam 30 3.3.2 Phân tích đặc điểm trình tự gen