1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

NGHIÊN CỨU QUAN HỆ CẤU TRÚC HOÁ HỌC VÀ HOẠT TÍNH (QSAR) ESTROGEN CỦA BISPHENOL A VÀ CÁC DẪN XUẤT

153 103 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 153
Dung lượng 4,98 MB

Nội dung

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - Vũ Văn Đạt NGHIÊN CỨU QUAN HỆ CẤU TRÚC HOÁ HỌC VÀ HOẠT TÍNH (QSAR) ESTROGEN CỦA BISPHENOL - A VÀ CÁC DẪN XUẤT LUẬN ÁN TIẾN SĨ HÓA HỌC Hà Nội - 2019 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - Vũ Văn Đạt NGHIÊN CỨU QUAN HỆ CẤU TRÚC HỐ HỌC VÀ HOẠT TÍNH (QSAR) ESTROGEN CỦA BISPHENOL - A VÀ CÁC DẪN XUẤT Chun ngành: Hóa lí thuyết Hóa lí Mã số: 62 44 01 19 (Mã số mới: 9440112.04) LUẬN ÁN TIẾN SĨ HÓA HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS LÊ KIM LONG GS.TS LÂM NGỌC THIỀM XÁC NHẬN NCS ĐÃ CHỈNH SỬA THEO QUYẾT NGHỊ CỦA HỘI ĐỒNG ĐÁNH GIÁ LUẬN ÁN Người hướng dẫn khoa học Chủ tịch hội đồng đánh giá Luận án Tiến sĩ GS.TS Lâm Ngọc Thiềm GS.TSKH Đặng Vũ Minh Hà Nội - 2019 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng Các số liệu, kết luận án trung thực chƣa đƣợc cơng bố cơng trình khác Tác giả Vũ Văn Đạt LỜI CẢM ƠN Với lòng kính trọng biết ơn sâu sắc em xin chân thành cảm ơn thầy giáo hướng dẫn PGS.TS Lê Kim Long GS.TS Lâm Ngọc Thiềm tận tình hướng dẫn, động viên giúp đỡ em suốt thời gian làm luận án Em xin chân thành cảm ơn thầy cô Trung tâm Ứng dụng Tin học Hóa học; Bộ mơn Hóa lý; Khoa Hóa học, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội tạo điều kiện thuận lợi, hướng dẫn, giúp đỡ em để hồn thành luận án Tôi chân thành cảm ơn số nhà khoa học đơn vị: Trường Đại học Giáo dục, Đại học Quốc gia Hà Nội; Viện Kỹ thật Nhiệt đới, Viện Hàn Lâm KH&CN Việt Nam; Viện Hóa học - Vật liệu, Viện Khoa học Cơng nghệ Qn sự; Khoa Hóa học, Trường Đại học Sư phạm Hà Nội có trao đổi học thuật để có kết tốt luận án này, bên cạnh khơng thể khơng kể đến động viên giúp sức hỗ trợ tuyệt vời gia đình, bạn bè, bạn đồng nghiệp thời gian qua Trân trọng./ Hà Nội, ngày tháng năm 2019 Tác giả Vũ Văn Đạt MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN LỜI CẢM ƠN DANH MỤC CÁC BẢNG DANH MỤC CÁC HÌNH CÁC KÝ HIỆU VIẾT TẮT TRONG LUẬN ÁN MỞ ĐẦU 1 Lý chọn đề tài Mục đích .2 Đối tƣợng phạm vi nghiên cứu Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài Những điểm luận án Bố cục luận án CHƢƠNG I TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan Bisphenol - A 1.1.1 Ứng dụng Bisphenol - A công nghiệp .6 1.1.2 Cơ chế gây độc BPA người sinh vật 1.2 Tổng quan nghiên cứu QSAR 11 1.2.1 Nghiên cứu QSAR khoa học thực tiễn 11 1.2.2 Quy trình nghiên cứu ngun tắc xây dựng mơ hình QSAR 13 1.2.2.1 Quy trình nghiên cứu QSAR 13 1.2.2.2 Các nguyên tắc OECD 14 1.3 Tổng quan sở lý thuyết phƣơng pháp tính lƣợng tử 16 1.3.1 Lý thuyết phiếm hàm mật độ (DFT-Density Functional Theory) [34] 18 1.3.1.1 Mật độ trạng thái electron 18 1.3.1.2 Mơ hình Thomas - Fermi 18 1.3.2 Các định lý Hohenberg - Kohn [34] 19 1.3.3 Phương trình Kohn - Sham [34] 20 1.3.4 Phiếm hàm mật độ phụ thuộc vào thời gian 24 1.3.5 Bộ hàm sở 25 1.3.5.1 Bộ sở kiểu Pople 27 1.3.5.2 Bộ sở kiểu Dunning hay gọi sở phù hợp tương quan (Correlation Consistent basis set) 27 1.4 Các phƣơng pháp toán học nghiên cứu QSAR 28 1.4.1 Phương pháp hồi quy 28 1.4.2 Phương pháp mạng neural nhân tạo 29 1.5 Tổng quan sinh học thực nghiệm nghiên cứu QSAR 33 1.5.1 Các phương pháp phân tích thực nghiệm .33 1.5.2 Hiệu ứng sinh học dạng hoạt tính nghiên cứu QSAR 34 1.5.3 Hệ thống liệu sinh học quốc tế khoa học nghiên cứu QSAR 34 1.5.4 Tình hình nghiên cứu QSAR BPA dẫn xuất nước 35 CHƢƠNG II ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 41 2.1 Đối tƣợng nghiên cứu phân tích sinh học 41 2.2 Tính tốn thơng số hóa lƣợng tử Chƣơng trình Gaussian 44 2.2.1 Bộ thơng số hóa lượng tử 44 2.2.2 Phương pháp tính B3LYP Chương trình Gaussian 46 2.3 Phƣơng pháp xây dựng đánh giá mơ hình 47 2.3.1 Lựa chọn thông số cấu trúc 47 2.3.2 Phương pháp hồi quy đa biến tuyến tính Chương trình STATGRAPHICS Centurion 15 49 2.3.3 Phương pháp mạng neural nhân tạo (ANN) Các chương trình xây dựng mạng ANN 50 2.3.4 Kiểm tra đánh giá mơ hình QSAR 52 CHƢƠNG III KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 55 3.1 Tính tốn thơng số cấu trúc phân tử BPA dẫn xuất 55 3.1.1 Lựa chọn hàm sở tính tốn cấu trúc phân tử BPA dẫn xuất 55 3.1.2 Tính tốn thơng số đặc trưng phân tử BPA dẫn xuất phần mềm GAUSSIAN 61 3.1.3 Nhận xét thay đổi thông số cấu trúc lượng phân tử chất khảo sát 67 3.2 Xây dựng mơ hình QSAR phân tích quan hệ cấu trúc - hoạt tính estrogen BPA dẫn xuất 80 3.2.1 Xây dựng mơ hình QSAR phương pháp hồi qua đa biến tuyến tính 80 3.2.2 Mơ hình QSAR sử dụng phương pháp mạng neural nhân tạo 89 3.3 Luận giải chế biểu hoạt tính estrogen Thiết kế phân tử 97 3.3.1 Luận giải chế biểu hoạt tính estrogen 97 3.3.2 Thiết kế phân tử 102 3.3.3 Kiểm tra hoạt tính estrogen phân tử phần mềm tính tốn mơ hình QSAR 104 KẾT LUẬN 106 KIẾN NGHỊ 108 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH KHOA HỌC CỦA TÁC GIẢ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN 109 TÀI LIỆU THAM KHẢO 110 PHỤ LỤC 123 DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Một số đặc điểm tính chất hóa lý BPA Bảng 1.2 Tổng quan liệu độc tính BPA mơi trường nước [44] 10 Bảng 1.3 Tổng quan liệu độc tính BPA mơi trường nước mặn [44] 11 Bảng 1.4 Sơ lược phương pháp nghiên cứu sinh học thực nghiệm 33 Bảng 1.5 Một số dạng thông số hoạt tính thường sử dụng nghiên cứu QSAR 34 Bảng 2.1 Cấu tạo phân tử chất nghiên cứu [60] 41 Bảng 2.2 Dữ liệu thực nghiệm hoạt tính sinh học chất nghiên cứu [60] 44 Bảng 2.3 Các thông số lượng tử khảo sát để xây dựng mơ hình 45 Bảng 3.1 Các thơng số cấu trúc hình học phân tử BPA 57 Bảng 3.2 Các thông số lượng phân tử BPA 57 Bảng 3.3 Điện tích ngun tử carbon vòng thơm BPA (Vị trí đánh số nguyên tử carbon vòng thơm xem Hình 2.1) 57 Bảng 3.4 So sánh phổ IR BPA theo tính toán lý thuyết thực nghiệm 60 Bảng 3.5 Một vài thơng số cấu trúc hình học phân tử 63 Bảng 3.6 Các thông số lượng chất khảo sát 64 Bảng 3.7 Mật độ electron tính tốn theo phương pháp B3LYP với hàm 6-31+G* 65 Bảng 3.8 Phần trăm đóng góp thành phần vào mức lượng HOMO, LUMO 66 Bảng 3.9 Hệ số tương quan Pearson biến 82 Bảng 3.10 Các thông số cấu trúc chọn để xây dựng mơ hình QSAR 83 Bảng 3.11 Các thông số thống kê số mơ hình có hệ số Ra2 cao 84 Bảng 3.12 Kết phân tích hồi quy mơ hình QSAR xây dựng từ 11 biến độc lập 85 Bảng 3.13 Giá trị hoạt tính dự đốn sử dụng mơ hình MLR 87 Bảng 3.14 Các thông số cấu trúc chọn để xây dựng mơ hình 92 Bảng 3.15 Giá trị MSE mơ hình ANN với số neural lớp ẩn 93 Bảng 3.16 Giá trị hoạt tính estrogen dự đốn 95 Bảng 3.17 Các thông số cấu trúc, lượng đặc trưngcủa 06 phân tử thiết kế 104 Bảng 3.18 Giá trị hoạt tính estrogen dự đoán phân tử 105 DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1 Cấu trúc 3D phân tử BPA Hình 1.2 Sản lượng tồn cầu BPA qua năm [44] .7 Hình 1.3 Sơ đồ tổng quát nghiên cứu QSAR 12 Hình 1.4 Khái quát phạm vi khai thác ứng dụng QSAR 13 Hình 1.5 Sơ đồ nghiên cứu QSAR 14 Hình 1.6 Cấu tạo neural nhân tạo 29 Hình 1.7 Sơ đồ cấu tạo mạng neural nhân tạo lớp 31 Hình 1.8 Sơ đồ kỹ thuật lan truyền ngược 32 Hình 2.1 Minh họa cấu trúc phân tử chất liệu khảo sát [60] 42 Hình 2.2 Sơ đồ nghiên cứu hoạt tính estrogen 44 Hình 2.3 Trình tự tính tốn thơng số hóa lượng tử sử dụng phần mềm Gaussian 09 Gaussview 06 47 Hình 2.4 Giao diện phần mở rộng Neuro Solutions Excel 51 Hình 2.5 Các loại mạng NeuroBuilder 51 Hình 2.6 Cửa sổ khởi tạo mạng neural nhân tạo Matlab 52 Hình 3.1 Cửa sổ thiết lập tính tốn phần mềm Gaussian 56 Hình 3.2 Cấu trúc 3D phân tử BPA chương trình Gaussian 09 56 Hình 3.3 Một phần phổ IR BPA tính tốn theo hàm TZVP, 6-31+G* CC-PVDZ 59 Hình 3.4 Một phần phổ hồng ngoại BPA [87] 59 Hình 3.5 Cấu trúc khơng gian phân tử TBBPA 62 Hình 3.6 Hình dạng orbital HOMO LUMO số phân tử chất nghiên cứu (isovalue = 0,02) 68 Hình 3.7 Sự thay đổi giá trị lượng EHOMO, ELUMO ΔE theo chiều tăng hoạt tính estrogen 71 The Leadscope Toxicity Database contains information of over 400,000 toxicity study results for Leadscope 180,000 chemical compounds Toxicological data can http://www.leadscope.com/toxic be accessed by chemical structure (including exact ity_database/ match, substructure, and similarity), by type of study, toxic effect, species, sex, dosage, duration, or route of exposure Is a nonprofit organization that specializes in the development of expert computer systems for toxicity Lhasa Limited https://www.lhasalimited.org/ and metabolism prediction Facilitates collaborative data sharing projects in the pharmaceutical, cosmetics, and chemistry-related industries (LNHPD) The Licensed Natural Product Database contains Licensed Natural Health Products information on natural health products that Health Database Canada has issued a product license Licensed https://www.canada.ca/en/healt products have been evaluated by Health Canada and h-canada/services/drugs-health- found to be safe, effective, and of high quality under products.html the recommended conditions of use THƯ VIỆN Y HỌC MỸ Hệ thống tìm kiếm thơng tin vầ cấu trúc hóa học, http://chem.sis.nlm.nih.gov/che dạng độc tính khác 370000 hợp chất midplus/ hóa học СHEMINFO Nguồn liệuvề độc tính an tồn sinh thái http://www.ccohs.ca/products/d hợp chất hóa học thuộc trung tâm bảo vệ sức atabases/cheminfo.html khỏe an toàn nghề nghiệp (Canada) АРИПС ''Опасные вещества'' Nguồndữliệu điệntửcủaLiênBangNga, chứathơngtinvề độctínhcủatrên 3800 hợpchấthóahọc http://www.rpohv.ru/online/ 125 Phụ lục Hình ảnh Orbital HOMO, LUMO 23 phân tử khảo sát STT HOMO LUMO 126 127 10 11 128 12 13 14 15 129 16 17 18 19 130 20 21 22 23 131 Phụ lục Kết xây dựng mơ hình QSAR sử dụng phép hồi quy đa biến tuyến tính sử dụng 11 biến độc lập: C1, C11, C12, C13, C2, C6, C7, ΔE, EHOMO, µ, ω Multiple Regression - DataFull.LgEC50 Dependent variable: DataFull.LgEC50 Independent variables: DataFull.C1 DataFull.C11 DataFull.C12 DataFull.C13 DataFull.C2 DataFull.C6 DataFull.C7 DataFull.DeltaE DataFull.EHOMO DataFull.Miu DataFull.Omega Standard T Parameter Estimate Error Statistic P-Value CONSTANT 24,2544 9,07595 2,67238 0,0217 DataFull.C1 283,77 47,4379 5,98192 0,0001 DataFull.C11 141,207 27,0734 5,2157 0,0003 DataFull.C12 -9,9028 1,92129 -5,15424 0,0003 DataFull.C13 130,615 25,603 5,10154 0,0003 DataFull.C2 -16,8382 2,80423 -6,00458 0,0001 DataFull.C6 146,406 40,1944 3,64246 0,0039 DataFull.C7 4,54629 2,54031 1,78966 0,1010 DataFull.DeltaE -8,76526 1,75027 -5,00796 0,0004 DataFull.EHOMO -3,82339 1,0806 -3,53821 0,0046 DataFull.Miu 5,01066 0,787842 6,35998 0,0001 DataFull.Omega -5,74805 1,19523 -4,80917 0,0005 Analysis of Variance Source Sum of Squares Df Mean Square F-Ratio P-Value Model 25,9266 11 2,35697 9,79 0,0003 Residual 2,64946 11 0,24086 Total (Corr.) 28,5761 22 132 R-squared = 90,7284 percent R-squared (adjusted for d.f.) = 81,4568 percent Standard Error of Est = 0,490775 Mean absolute error = 0,276563 Durbin-Watson statistic = 2,25488 (P=0,5752) Lag residual autocorrelation = -0,177272 The StatAdvisor The output shows the results of fitting a multiple linear regression model to describe the relationship between DataFull.LgEC50 and 11 independent variables The equation of the fitted model is DataFull.LgEC50 = 24,2544 + 283,77*DataFull.C1 + 141,207*DataFull.C11 - 9,9028*DataFull.C12 + 130,615*DataFull.C13 - 16,8382*DataFull.C2 + 146,406*DataFull.C6 + 4,54629*DataFull.C7 - 8,76526*DataFull.DeltaE 3,82339*DataFull.EHOMO + 5,01066*DataFull.Miu - 5,74805*DataFull.Omega Since the P-value in the ANOVA table is less than 0,05, there is a statistically significant relationship between the variables at the 95,0% confidence level The R-Squared statistic indicates that the model as fitted explains 90,7284% of the variability in DataFull.LgEC50 The adjusted R-squared statistic, which is more suitable for comparing models with different numbers of independent variables, is 81,4568% The standard error of the estimate shows the standard deviation of the residuals to be 0,490775 This value can be used to construct prediction limits for new observations by selecting the Reports option from the text menu The mean absolute error (MAE) of 0,276563 is the average value of the residuals The DurbinWatson (DW) statistic tests the residuals to determine if there is any significant correlation based on the order in which they occur in your data file Since the P-value is greater than 0,05, there is no indication of serial autocorrelation in the residuals at the 95,0% confidence level In determining whether the model can be simplified, notice that the highest P-value on the independent variables is 0,1010, belonging to DataFull.C7 Since the P-value is greater or equal to 0,05, that term is not statistically significant at the 95,0% or higher confidence level Consequently, you should consider removing DataFull.C7 from the model 133 Phụ lục Kết xây dựng mơ hình QSAR sử dụng phép hồi quy đa biến tuyến tính sử dụng 10 biến độc lập: C1, C11, C12, C13, C2, C6, ΔE, EHOMO, µ, ω Multiple Regression - DataFull.LgEC50 Dependent variable: DataFull.LgEC50 Independent variables: DataFull.C1 DataFull.C11 DataFull.C12 DataFull.C13 DataFull.C2 DataFull.C6 DataFull.DeltaE DataFull.EHOMO DataFull.Miu DataFull.Omega Standard T Parameter Estimate Error Statistic P-Value CONSTANT 31,6935 8,77747 3,61078 0,0036 DataFull.C1 292,701 51,3223 5,70319 0,0001 DataFull.C11 158,384 27,5407 5,75092 0,0001 DataFull.C12 -10,4344 2,06508 -5,05281 0,0003 DataFull.C13 131,757 27,8454 4,73172 0,0005 DataFull.C2 -15,1931 2,88221 -5,27133 0,0002 DataFull.C6 182,188 37,9349 4,80264 0,0004 DataFull.DeltaE -9,28815 1,87743 -4,94726 0,0003 DataFull.EHOMO -3,78452 1,17537 -3,21986 0,0074 DataFull.Miu 4,50892 0,801006 5,62907 0,0001 DataFull.Omega -4,86291 1,18376 -4,10801 0,0015 Analysis of Variance Source Sum of Squares Df Mean Square F-Ratio P-Value Model 25,1552 10 2,51552 8,82 0,0004 Residual 3,4209 12 0,285075 Total (Corr.) 28,5761 22 134 R-squared = 88,0288 percent R-squared (adjusted for d.f.) = 78,0528 percent Standard Error of Est = 0,533924 Mean absolute error = 0,325089 Durbin-Watson statistic = 2,21104 (P=0,5331) Lag residual autocorrelation = -0,179868 The StatAdvisor The output shows the results of fitting a multiple linear regression model to describe the relationship between DataFull.LgEC50 and 10 independent variables The equation of the fitted model is DataFull.LgEC50 = 31,6935 + 292,701*DataFull.C1 + 158,384*DataFull.C11 - 10,4344*DataFull.C12 + 131,757*DataFull.C13 - 15,1931*DataFull.C2 + 182,188*DataFull.C6 - 9,28815*DataFull.DeltaE 3,78452*DataFull.EHOMO + 4,50892*DataFull.Miu - 4,86291*DataFull.Omega Since the P-value in the ANOVA table is less than 0,05, there is a statistically significant relationship between the variables at the 95,0% confidence level The R-Squared statistic indicates that the model as fitted explains 88,0288% of the variability in DataFull.LgEC50 The adjusted R-squared statistic, which is more suitable for comparing models with different numbers of independent variables, is 78,0528% The standard error of the estimate shows the standard deviation of the residuals to be 0,533924 This value can be used to construct prediction limits for new observations by selecting the Reports option from the text menu The mean absolute error (MAE) of 0,325089 is the average value of the residuals The DurbinWatson (DW) statistic tests the residuals to determine if there is any significant correlation based on the order in which they occur in your data file Since the P-value is greater than 0,05, there is no indication of serial autocorrelation in the residuals at the 95,0% confidence level In determining whether the model can be simplified, notice that the highest P-value on the independent variables is 0,0074, belonging to DataFull.EHOMO Since the P-value is less than 0,05, that term is statistically significant at the 95,0% confidence level Consequently, you probably don't want to remove any variables from the model 135 Phụ lục Bảng code xây dựng mạng neural nhân tạo với nơ ron lớp ẩn function [Y,Xf,Af] = ANN9_2(X,~,~) %MYNEURALNETWORKFUNCTION neural network simulation function % % Generated by Neural Network Toolbox function genFunction, 16-Aug-2018 10:14:22 % % [Y] = myNeuralNetworkFunction(X,~,~) takes these arguments: % % X = 1xTS cell, inputs over TS timesteps % Each X{1,ts} = Qx10 matrix, input #1 at timestep ts % % and returns: % Y = 1xTS cell of outputs over TS timesteps % Each Y{1,ts} = Qx1 matrix, output #1 at timestep ts % % where Q is number of samples (or series) and TS is the number of timesteps %#ok % ===== NEURAL NETWORK CONSTANTS ===== % Input x1_step1.xoffset = [-6.557851;0.632798;-11016.217005;0.357836843360894;0.244;-0.248;-0.229;-0.224;-0.095;-0.479]; x1_step1.gain = [2.25113897783545;0.677506316052631;0.000191600940862666;30.297363655955; 38.4615384615385;3.3500837520938;3.6563071297989;74.0740740740741;30.3030 303030303;4.47427293064877]; x1_step1.ymin = -1; 136 % Layer b1 = [1.7142383007523105;1.2205766980576827;-0.59824707495594609;0.52470455867849919;-0.21765534482401669;-0.097030541116999575;1.0126574278902898;-0.92146104071096968;-1.896620245960535]; IW1_1 = [-1.0143192549311815 -0.071658146045728927 -0.92939490615607556 0.48740205272354409 -0.096188537157307505 0.081848904729943953 0.86049124195448712 -0.35861725213630347 -0.60824179299133541 0.045332872678160344;0.30068438278888182 0.056285100149345152 0.2090929586793227 0.77514736526279004 1.2997383181343267 0.056180201010967733 0.88385257704610509 0.64040641417590383 0.23465043406343303 0.70950853009984616;0.032156150422349025 0.25181503924124243 0.30252030380424494 0.44874059959316936 1.3037643158451557 0.59049127152908132 -0.1394838769081731 0.19880077877146549 -0.1836099271038254 0.81637062050647691;1.0477531965305222 0.2231061909224282 0.41223602340184379 -0.3410631229129415 0.65890696924744663 1.2150985056972179 -0.010831036133775306 -0.75381324951585926 0.79760976414883056 -0.2084178511531109;0.45173278750621654 0.60295980352571321 -0.67933968068270389 -0.67205892828132985 0.54197084793373318 -0.84785016590901996 -0.074120719279807012 0.68001993799036908 0.65861414535819285 -0.71181544770366256;2.4496831662562588 0.76525859352514791 -0.43969521367318171 1.3335227073135383 -0.56301942812322325 0.37616295562183732 0.28028466388448514 0.084096647075761866 2.3422652512386777 0.61768533400211767;-0.044852327348129085 -1.0461195157908654 0.45653898125617653 0.62744889841434226 -0.3282017201363151 0.006700455171954051 0.3593601110883784 -0.55869790082650161 1.4073592718925134 0.7815779962064302;-0.56801761222986025 0.54789816452255502 0.92193272434467177 -1.2026167834393413 0.68610624783215712 0.29610502036493797 -0.86274859574545448 0.53747525783380956 -0.07318951980594629 0.69243281816726421;0.1132713644010053 -0.35492893430329198 0.083640705518877409 0.065800918120958479 -0.058796123671821035 0.91699903896160695 0.5000574156820714 1.0929871644695188 1.2186720905690434 0.47615172763883906]; 137 % Layer b2 = 0.61817412136196892; LW2_1 = [-0.69962521486545914 1.1583894894930369 0.88339070867298619 0.14541160573806972 0.31195376488861859 1.6543680235602147 0.30882917741116489 -0.2058499462355563 0.53740962897059075]; % Output y1_step1.ymin = -1; y1_step1.gain = 0.493827160493827; y1_step1.xoffset = -6.04; % ===== SIMULATION ======== % Format Input Arguments isCellX = iscell(X); if ~isCellX, X = {X}; end; % Dimensions TS = size(X,2); % timesteps if ~isempty(X) Q = size(X{1},1); % samples/series else Q = 0; end % Allocate Outputs Y = cell(1,TS); % Time loop for ts=1:TS % Input X{1,ts} = X{1,ts}'; Xp1 = mapminmax_apply(X{1,ts},x1_step1); % Layer a1 = tansig_apply(repmat(b1,1,Q) + IW1_1*Xp1); 138 % Layer a2 = repmat(b2,1,Q) + LW2_1*a1; % Output Y{1,ts} = mapminmax_reverse(a2,y1_step1); Y{1,ts} = Y{1,ts}'; end % Final Delay States Xf = cell(1,0); Af = cell(2,0); % Format Output Arguments if ~isCellX, Y = cell2mat(Y); end end % ===== MODULE FUNCTIONS ======== % Map Minimum and Maximum Input Processing Function function y = mapminmax_apply(x,settings) y = bsxfun(@minus,x,settings.xoffset); y = bsxfun(@times,y,settings.gain); y = bsxfun(@plus,y,settings.ymin); end % Sigmoid Symmetric Transfer Function function a = tansig_apply(n,~) a = / (1 + exp(-2*n)) - 1; end % Map Minimum and Maximum Output Reverse-Processing Function function x = mapminmax_reverse(y,settings) x = bsxfun(@minus,y,settings.ymin); x = bsxfun(@rdivide,x,settings.gain); x = bsxfun(@plus,x,settings.xoffset); end 139 ... đình, bạn bè, bạn đồng nghiệp thời gian qua Trân trọng./ Hà Nội, ngày tháng năm 2019 Tác giả Vũ Văn Đạt MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN LỜI CẢM ƠN DANH MỤC CÁC BẢNG DANH MỤC CÁC HÌNH CÁC KÝ HIỆU VIẾT TẮT... tế thuộc danh mục Scopus Luận án gồm 107 trang (không bao gồm tài liệu tham khảo phụ lục) với 26 Bảng số liệu, 45 Hình, 119 Tài liệu tham khảo 05 Phụ lục Chƣơng I TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan Bisphenol... KIẾN NGHỊ 108 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH KHOA HỌC CỦA TÁC GIẢ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN 109 TÀI LIỆU THAM KHẢO 110 PHỤ LỤC 123 DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Một

Ngày đăng: 05/12/2019, 20:20

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
1. Đặng Ứng Vận (2007), “Giáo trình Hoá tin cơ sở”, Nhà xuất bản Đại học Quốc gia Hà Nội Sách, tạp chí
Tiêu đề: Giáo trình Hoá tin cơ sở
Tác giả: Đặng Ứng Vận
Nhà XB: Nhà xuất bản Đại học Quốc gia Hà Nội
Năm: 2007
2. Đặng Ứng Vận (1998), “Tin học ứng dụng trong hóa học”. Nhà xuất bản giáo dục Sách, tạp chí
Tiêu đề: Tin học ứng dụng trong hóa học
Tác giả: Đặng Ứng Vận
Nhà XB: Nhà xuất bản giáo dục
Năm: 1998
3. Lâm Ngọc Thiềm (chủ biên), Phạm Văn Nhiêu, Lê Kim Long, (2007). “Cơ sở Hoá học Lượng tử”, Nhà xuất bản KH và KT, tr 334 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Cơ sở Hoá học Lượng tử”
Tác giả: Lâm Ngọc Thiềm (chủ biên), Phạm Văn Nhiêu, Lê Kim Long
Nhà XB: Nhà xuất bản KH và KT
Năm: 2007
4. Lê Kim Long, Lâm Ngọc Thiềm, Vũ Hùng Sinh (2003). “Ứng dụng hình học phân hình mô phỏng quá trình polyme hoá”, Tạp chí Hoá Học, T.41, No 1, tr 42 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Ứng dụng hình học phân hình mô phỏng quá trình polyme hoá”, "Tạp chí Hoá Học
Tác giả: Lê Kim Long, Lâm Ngọc Thiềm, Vũ Hùng Sinh
Năm: 2003
5. Lâm Ngọc Thiềm (2018), “Phương pháp tính lượng tử trong hóa học”, Nhà xuất bản ĐHQG HN, tr 580 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Phương pháp tính lượng tử trong hóa học”
Tác giả: Lâm Ngọc Thiềm
Nhà XB: Nhà xuất bản ĐHQG HN
Năm: 2018
6. Nguyễn Hữu Thọ, Lâm Ngọc Thiềm (2008), “Khảo sát đường phản ứng NO + NH 2 bằng phương pháp tính DFT.B3LYP”, Tạp chí Hoá học và Ứng dụng. Số 01(73), tr.36-39.Tiếng Anh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Khảo sát đường phản ứng NO + NH2 bằng phương pháp tính DFT.B3LYP”", Tạp chí Hoá học và Ứng dụng
Tác giả: Nguyễn Hữu Thọ, Lâm Ngọc Thiềm
Năm: 2008
7. A. Adad, M. Larif, R. Hmamouchi, M. Bouachrine, T. Lakhlifi (2014), J. Comp. Meth. Mol. Des,4(3), pp. 72-83 Sách, tạp chí
Tiêu đề: J. Comp. Meth. Mol. Des
Tác giả: A. Adad, M. Larif, R. Hmamouchi, M. Bouachrine, T. Lakhlifi
Năm: 2014
8. A. Golbraikh, A. Tropsha (2002), “Beware of q2!”, J. Mol. Graphics Model, 20 pp. 269-276 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Beware of q2!”, "J. Mol. Graphics Model
Tác giả: A. Golbraikh, A. Tropsha
Năm: 2002
9. A. Holas, N.H. March, in: R. Nalewajski (1996), “Density Functional Theory: Topics in Current Chemistry”, vol. 180, Springer - Heidelberg Sách, tạp chí
Tiêu đề: Density Functional Theory: Topics in Current Chemistry
Tác giả: A. Holas, N.H. March, in: R. Nalewajski
Năm: 1996
10. A. Inoue, T.Kawai, M.Iimura, H.Sugimoto, H.Kawakami (1996). J. Med. Chem, 39, 4460 Sách, tạp chí
Tiêu đề: J. Med. "Chem
Tác giả: A. Inoue, T.Kawai, M.Iimura, H.Sugimoto, H.Kawakami
Năm: 1996
12. A.Cappelli, M.Anzini, S.Vomero, P.G.De Benedetti, M.C.Menziani, G.Giorgi, C.Manzoni (1997),J. Med. Chem, 40, 2910 Sách, tạp chí
Tiêu đề: J. Med. Chem
Tác giả: A.Cappelli, M.Anzini, S.Vomero, P.G.De Benedetti, M.C.Menziani, G.Giorgi, C.Manzoni
Năm: 1997
13. Abdul Rasheed. Md (2014), “Bisphenol A and its effect on human health: a review”, World journal of pharmacy and pharmaceutical sciences, 3 (8), pp. 164-172 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bisphenol A and its effect on human health: a review”, "World journal of pharmacy and pharmaceutical sciences
Tác giả: Abdul Rasheed. Md
Năm: 2014
14. Alexandru T. Balaban (1999), “From chemical topology to three- dimensinoal geometry”, Kluwer Academic Publishers Sách, tạp chí
Tiêu đề: From chemical topology to three-dimensinoal geometry
Tác giả: Alexandru T. Balaban
Năm: 1999
15. Altaf Hussain Pandith, S. Giri, P.K. Chattaraj (2010), “A comparative study of two quantum chemical descriptors in predicting toxicity of aliphatic compounds towards tetrahymena pyriformis”, Organic chemistry international, doi:10.1155/2010/545087 Sách, tạp chí
Tiêu đề: A comparative study of two quantum chemical descriptors in predicting toxicity of aliphatic compounds towards tetrahymena pyriformis”, "Organic chemistry international
Tác giả: Altaf Hussain Pandith, S. Giri, P.K. Chattaraj
Năm: 2010
16. Anna Kjerstine Rosenmai, Marianne Dybdahl, Mikael Pedersen, Barbara Medea Alice van Vugt-Lussenburg, Eva Bay Wedebye, Camilla Taxvig&Anne Marie Vinggaard (2014) “Are structural analogues to Bisphenol A safe alternatives?”, Texicological Sciences, Volume 139, Issue 1, pp. 35-47 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Are structural analogues to Bisphenol A safe alternatives
17. B. Santra (2010), “Density-Functional Theory Exchange-Correlation Functionals for Hydrogen Bonds in Water (M.Sc. thesis)”, Berlin Sách, tạp chí
Tiêu đề: Density-Functional Theory Exchange-Correlation Functionals for Hydrogen Bonds in Water (M.Sc. thesis)
Tác giả: B. Santra
Năm: 2010
18. B.P. Nigam (1994), “Gell-Mann-Low equation: Relation between the fifth-order vacuum-polarization coefficients”, Physcical review D, 50(8), pp. 5447-5449 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Gell-Mann-Low equation: Relation between the fifth-order vacuum-polarization coefficients
Tác giả: B.P. Nigam
Năm: 1994
19. Baskin I.I, Halberstam N.M, Artemenko N.V; Palyulin V.A, ZefirovN.S (2002), “NASAWIN - a universal software for QSPR/QSAR studies: EuroQSAR Designing Drugs andCrop Protectants: processes, problems and solutions” Blackwell Publishing, pp. 260-263 Sách, tạp chí
Tiêu đề: NASAWIN - a universal software for QSPR/QSAR studies: EuroQSAR Designing Drugs andCrop Protectants: processes, problems and solutions
Tác giả: Baskin I.I, Halberstam N.M, Artemenko N.V; Palyulin V.A, ZefirovN.S
Năm: 2002
22. Benigni R, Guiliani A, Franke R, Gruska A (2000), “Quantitative structure-activity relationships of mutagenic and carcinogenic aromatic amines”, Chem Rev, 100, pp. 3697-3714 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Quantitative structure-activity relationships of mutagenic and carcinogenic aromatic amines”, "Chem Rev
Tác giả: Benigni R, Guiliani A, Franke R, Gruska A
Năm: 2000
23. Chalasinski, G. and Szczesniak, M (1994), “Origins of structure and energetics of van der waals clusters from ab initio calculations”, Chemical Reviews, 94, pp. 1723-1765 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Origins of structure and energetics of van der waals clusters from ab initio calculations”, "Chemical Reviews
Tác giả: Chalasinski, G. and Szczesniak, M
Năm: 1994

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w