1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae

72 410 1
Tài liệu đã được kiểm tra trùng lặp

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 72
Dung lượng 1,02 MB

Nội dung

Khóa phân loại hình thái đóng một vai trò quan trọng trong việc định danh cá bột và cá con thuộc họ Pangasiidae vốn có ý nghĩa về kinh tế đối với vùng Đồng Bằng Sông Cửu Long. Tuy nhiên, phƣơng pháp này cho độ chính xác nhất định. Vì vậy chúng tôi phân tích sự khác nhau ở mức độ di truyền cụ thể là vùng 16S rRNA (xấp xỉ 568 bp) trên DNA ty thể (mt DNA) ở 3 loài (đã có sẵn dữ liệu trên ngân hàng gene) để hỗ trợ phƣơng pháp định danh hình thái. Trong nghiên cứu này, chúng tôi thực hiện phân loại bằng hình thái 976 mẫu cá thu từ tháng 6/2006 đến tháng 9/2006 trên hai nhánh sông Tiền và sông Hậu. Kết quả họ Pangasiidae chiếm 36,56% so với tổng mẫu thu đƣợc năm 2006; 3 loài phân tích (P. hypophthalmus, P. larnaudii, P. macronema) chiếm 33,63% so với tổng mẫu Pangasiidae thu đƣợc nhƣng số lƣợng chỉ chiếm 11,36% so với tổng lƣợng cá thể họ Pangasidae. Các mẫu cá năm 2006 sau khi khi phân tích hình thái không phân tích đƣợc DNA (do DNA bị hủy trong formal), 26 cá thể từ 64 mẫu cá bột thu từ 22/6/2007 đến tháng 30/6/2007 đƣợc bổ sung của 3 loài nêu trên với kích thƣớc khác nhau (từ 15 mm – 30 mm), giải trình tự và đối chiếu với các trình tự chuẩn trên ngân hàng genbank để kiểm tra lại độ tin cậy của phƣơng pháp phân tích hình thái. Kết quả đạt đƣợc nhƣ sau:  Trình tự 8/9 mẫu loài P. hypophthalmus tƣơng đồng 100% với trình tự 3 kiểu gen P. hypophthalmus trên ngân hàng gene (DQ334282, DQ334285, DQ334287). Riêng mẫu H1 có một đột biến thay thế nucleotide ở vị trí thứ 26 so với tám kiểu gene tham khảo trên ngân hàng gene.  Trình tự 9 mẫu phân tích loài P. macronema giống từ 99% - 100% trình tự P. macronema trên ngân hàng gene (DQ334314).  Trình tự 8 mẫu loài P. larnaudii tƣơng đồng 100% với trình tự 3 kiểu gen P. larnaudii trên ngân hàng gene (DQ334303, DQ334312; DQ334313). Tóm lại, qua kết quả so sánh trình tự của 26 mẫu thuộc 3 loài phân tích với trình tự dữ liệu chuẩn trên ngân hàng gene đã khẳng định đƣợc khoá phân loại hình thái đối với các loài mà chúng tôi đƣa ra là phù hợp

BỘ GIÁO DỤC ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC ********000******** KHA LUN TT NGHIỆP ỨNG DỤNG KHA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae Ngành học: CÔNG NGHỆ SINH HỌC Niên khóa: 2003 – 2007 Sinh viên thực hiện: NGUYỄN KIỀU DỢI Thành phố Hồ Chí Minh Tháng 8/2007 BỘ GIÁO DỤC ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC ********000******** ỨNG DỤNG KHA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae Giáo viên hƣớng dẫn: Sinh viên thực hiện: TS. NGUYỄN VĂN HẢO NGUYỄN KIỀU DỢI ThS. NGUYỄN VIẾT DŨNG KS. NGUYỄN NGUYỄN DU Thành phố Hồ Chí Minh Tháng 8/2007 iii LỜI CẢM TẠ Tôi xin chân thành cảm ơn Ban Giám Hiệu Trƣờng Đại Học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh, Ban chủ nhiệm Bộ Môn Công Nghệ Sinh Học, cùng tất cả quý thầy cô đã tạo điều kiện tốt truyền đạt kiến thức cho tôi trong suốt thời gian học tại trƣờng. Tôi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc đến thầy Nguyễn Văn Hảo đã tận tình chỉ bảo tạo điều kiện tốt nhất để tôi hoàn thành luận văn tốt nghiệp. Xin chân thành cảm ơn Chƣơng Trình Thuỷ Sản Ủy Hội Sông MêKông đã hỗ trợ kinh phí cho tôi thực hiện đề tài này. Tôi đặc biệt cảm ơn anh Nguyễn Nguyễn Du, anh Nguyễn Viết Dũng đã tận tâm, nhiệt tình hƣớng dẫn trong suốt thời gian tôi thực hiện đề tài. Xin chân thành cảm ơn anh Lâm Ngọc Châu, anh Nguyễn Văn Phụng phòng Nguồn Lợi Thủy Sản cùng chị Trì Thanh Thảo, anh Cao Thành Trung, anh Chu Quang Trọng phòng Thí Nghiệm Sinh Học Phân Tử đã quan tâm giúp đỡ, tạo điều kiện cho tôi hòan thành tốt đề tài. Sau cùng tôi xin cảm ơn gia đình cùng bạn bè thân yêu lớp Công Nghệ Sinh Học k29 đã chia sẽ cùng tôi những vui buồn trong thời gian học cũng nhƣ hết lòng hỗ trợ, giúp đỡ tôi trong thời gian thực tập. Sinh viên thực hiện NGUYỄN KIỀU DỢI iv ABSTRACT Morphological study plays important role in post-larvae fish taxonomy of the family Pangasiidae that contributes significantly to economy of the MeKong River Basin. However, this method bring limit true results. therefore we analysised the level of genetic diversity (A partial region of mitochondrial 16S rRNA gene, approximately 568 base pairs) of three catfish species to support morphological method. In this study, 976 specimens, originating from Mekong and Bassac River (from june 2006 to september 2006) were analysed morphologically. The result, the family Pangasiidae rate of 36,56% per in total specimens in 2006; three species (P. hypophthalmus, P. larnaudii, P. macronema) rate of 33,63% per in total Pangasiidae specimens and individual rate of 11,36% per in total number Pangasiidae. All Pangasiidae specimens of 2006 don’t analysised DNA because DNA was broke by formol. 26 individuals (size from 15 mm to 30 mm) from 64 specimens (6/2007) were add from three species: P. hypophthalmus, P. larnaudii, P. macronema. All specimens were sequenced and compared with standard sequence in genbank. This result, Sequences of 8/9 samples P. hypophthalmus similary with P. hypophthalmus (DQ334282, DQ334385, DQ334287). The exception of H1 sample, with one mutation at site nucleotide 26 to GenBank (DQ334282 – DQ334289); Sequences of 9 samples P. macronema similary from 99% to 100% sequences of P. macronema to GenBank (DQ334314); Sequences of 8 samples P. larnaudii similary 100% sequences of three haplotypes P. larnaudii (DQ334303, DQ334312, DQ334313). All in all, findings from this study demonstrated that morphological method correspond with three species P. hypophthalmus, P. larnaudii, P. macronema. v TM TẮT Khóa phân loại hình thái đóng một vai trò quan trọng trong việc định danh bột con thuộc họ Pangasiidae vốn có ý nghĩa về kinh tế đối với vùng Đồng Bằng Sông Cửu Long. Tuy nhiên, phƣơng pháp này cho độ chính xác nhất định. Vì vậy chúng tôi phân tích sự khác nhau ở mức độ di truyền cụ thểvùng 16S rRNA (xấp xỉ 568 bp) trên DNA ty thể (mt DNA) ở 3 loài (đã có sẵn dữ liệu trên ngân hàng gene) để hỗ trợ phƣơng pháp định danh hình thái. Trong nghiên cứu này, chúng tôi thực hiện phân loại bằng hình thái 976 mẫu thu từ tháng 6/2006 đến tháng 9/2006 trên hai nhánh sông Tiền sông Hậu. Kết quả họ Pangasiidae chiếm 36,56% so với tổng mẫu thu đƣợc năm 2006; 3 loài phân tích (P. hypophthalmus, P. larnaudii, P. macronema) chiếm 33,63% so với tổng mẫu Pangasiidae thu đƣợc nhƣng số lƣợng chỉ chiếm 11,36% so với tổng lƣợng thể họ Pangasidae. Các mẫu năm 2006 sau khi khi phân tích hình thái không phân tích đƣợc DNA (do DNA bị hủy trong formal), 26 thể từ 64 mẫu bột thu từ 22/6/2007 đến tháng 30/6/2007 đƣợc bổ sung của 3 loài nêu trên với kích thƣớc khác nhau (từ 15 mm – 30 mm), giải trình tự đối chiếu với các trình tự chuẩn trên ngân hàng genbank để kiểm tra lại độ tin cậy của phƣơng pháp phân tích hình thái. Kết quả đạt đƣợc nhƣ sau:  Trình tự 8/9 mẫu loài P. hypophthalmus tƣơng đồng 100% với trình tự 3 kiểu gen P. hypophthalmus trên ngân hàng gene (DQ334282, DQ334285, DQ334287). Riêng mẫu H1 có một đột biến thay thế nucleotide ở vị trí thứ 26 so với tám kiểu gene tham khảo trên ngân hàng gene.  Trình tự 9 mẫu phân tích loài P. macronema giống từ 99% - 100% trình tự P. macronema trên ngân hàng gene (DQ334314).  Trình tự 8 mẫu loài P. larnaudii tƣơng đồng 100% với trình tự 3 kiểu gen P. larnaudii trên ngân hàng gene (DQ334303, DQ334312; DQ334313). Tóm lại, qua kết quả so sánh trình tự của 26 mẫu thuộc 3 loài phân tích với trình tự dữ liệu chuẩn trên ngân hàng gene đã khẳng định đƣợc khoá phân loại hình thái đối với các loài mà chúng tôi đƣa ra là phù hợp. vi MỤC LỤC ĐỀ MỤC TRANG Lời cảm tạ III Abstract IV Tóm tắt . V Mục lục . VI Danh sách các chữ viết tắt IX Danh sách các hình . X Danh sách các bảng biểu đồ XI Chƣơng 1. MỞ ĐẦU . 1 1.1. Đặt vấn đề . 1 1.2. Mục tiêu đề tài 2 1.3. Nội dung đề tài . 2 Chƣơng 2. TỔNG QUAN . 3 2.1. Tình hình nghiên cứu định danh các loài . 3 2.1.1. Nghiên cứu thế giới . 3 2.1.2. Nghiên cứu trong nƣớc 4 2.2. Phƣơng pháp định danh hình thái định loại một số loài bột con thuộc họ Pangasiidae 5 2.3. Phƣơng pháp sinh học phân tử ứng dụng định loại một số loài 8 2.3.1. Phƣơng pháp RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) . 8 2.3.2. Phƣơng pháp RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) 8 2.3.3. Phƣơng pháp AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) 8 2.3.4. Phân tích DNA ty thể (mtDNA) 9 vii 2.3.5. Phƣơng pháp PCR 11 2.3.6. Phƣơng pháp giải trình tự bằng hệ thống sắc ký tự động 12 Chƣơng 3. VẬT LIỆU PHƢƠNG PHÁP . 13 3.1. Thời gian địa điểm thực hiện . 13 3.2. Vật liệu . 13 3.2.1. Mẫu 13 3.2.2. Hóa chất . 13 3.2.4. Thiết bị dụng cụ 14 3.3. Phƣơng pháp . 15 3.3.1. Phƣơng pháp thu định danh hình thái mẫu bột 15 3.3.2. Phƣơng pháp tách chiết mtDNA bằng phenol-chloroform 16 3.3.3. Phƣơng pháp PCR khuếch đại vùng 16S trên mtDNA 16 3.3.4. Phƣơng pháp điện di acid nucleotide trên gel agarose 17 3.3.5. Phƣơng pháp giải trình tự 18 3.3.6. Phƣơng pháp so sánh các trình tự 18 3.4. Bố trí thí nghiệm . 18 3.4.1. Định danh phân loại bằng hình thái các loài bột thuộc họ Pangasiidae . 18 3.4.1.1. Giai đoạn định tính 18 3.4.1.2. Giai đoạn định lƣợng 20 3.4.2. Ghi nhận các điểm đặc trƣng của bột trƣớc khi phân tích DNA . 21 3.4.3. Xác định phân tích vùng 16S rRNA trên mtDNA 22 Chƣơng 4. KẾT QUẢ THẢO LUẬN 23 4.1. Kết quả định danh phân loại bằng hình thái các loài bột thuộc họ Pangasiidae . 23 4.1.1. Kết quả hình thái phân loại 23 4.1.2. Kết quả giai đoạn định tính 25 viii 4.1.2.1. Phân tích mẫu xuất hiện họ Pangasiidae so với tổng mẫu thu đƣợc năm 2006 25 4.1.2.2. Phân tích mẫu xuất hiện loài nghiên cứu so với tổng mẫu Pangasiidae 27 4.1.3. Kết quả giai đoạn định lƣợng 29 4.1.3.1. Tỉ lệ số lƣợng thể của 3 loài phân tích các loài khác 29 4.1.2.4. Tỉ lệ số lƣợng thể của mỗi loài phân tích so với tổng lƣợng thể họ Pangasiidae . 31 4.2. Ghi nhận các điểm đặc trƣng của bột trƣớc khi phân tích DNA . 33 4.3. Xác định phân tích vùng 16S rRNA trên mtDNA . 34 4.3.1. Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA . 34 4.3.2. Phân tích trình tự vùng 16S rRNA trên mtDNA của các mẫu 38 4.3.2.1. Định danh 9 mẫu thuộc loài P. macronema 38 4.3.2.2. Định danh 9 mẫu thuộc loài P. hypophthalmus 40 4.3.2.3. Định danh 8 mẫu thuộc loài P. larnaudii. . 42 Chƣơng 5. KẾT LUẬN ĐỀ NGHỊ . 44 5.1. Kết luận 44 5.2. Tồn tại . 45 5.3. Đề xuất 45 TÀI LIỆU THAM KHẢO . 46 PHỤ LỤC 50 ix DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT bp Cặp bazơ DNA Deoxyribonucleic acid mtDNA Mitochondrial DNA rRNA Ribosomal Ribonucleotide acid S Svedberg – đơn vị đo lƣờng vận tốc lắng PCR Polymerase chain reaction RFLP Restriction Fragment Length Lolymorphism RAPD Random Amplified Polymorphic DNA AFLP Amplified Fragment Length Polymorphism Taq Thermus aquaticus UI Unit UV Ultra violet P. hypophthalmus Pangasianodon hypophthalmus P. larnaudii Pangasius larnaudii P. macronema Pangasius macronema ĐBSCL Đồng Bằng Sông Cửu Long Ctv Cộng tác viên x DANH SÁCH CÁC HÌNH HÌNH TRANG Hình 2.1. Pangasianodon hypophthalmus Sauvage (1878), 15 mm . 6 Hình 2.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866. 16 mm. 6 Hình 2.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851. 15 mm. 7 Hình 2.4: H.2.5a. Cấu tạo tổng quát của ty thể. 9 Hình 2.5. Các picks màu quan sát trên máy Scan . 12 Hình 4.1. Pangasianodon hypophthalmus (Sauvage, 1878), 17 mm 33 Hình 4.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866. 20 mm . 34 Hình 4.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851. 15 mm . 34 Hình 4.4. Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA trên mtDNA từ một số mẫu năm 2006 năm 2005 . 35 Hình 4.5: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA trên mtDNA từ vài mẫu đại diện 38 Hình 4.6: Các điểm khác nhau về trình tự vùng 16S rRNA trên mtDNA của 9 mẫu P. macronema . 39 Hình 4.7: Sự tƣơng đồng trình tự vùng 16S rRNA trên mtDNA của 9 mẫu P. hypophthalmus 41 Hình 4.8: Sự tƣơng đồng trình tự vùng 16S rRNA trên mtDNA của 8 mẫu P. larnaudii . 43

Ngày đăng: 03/09/2013, 10:00

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
1. Bộ Thủy Sản Viện Nghiên Cứu Nuôi Trồng Thủy Sản II, 2005. Tuyển Tập Nghề Cá Sông Cửu Long, 2005. NXB Nông Nghiệp Sách, tạp chí
Tiêu đề: Tuyển Tập Nghề Cá Sông Cửu Long, 2005
Nhà XB: NXB Nông Nghiệp
2. Mai đình Yên và cộng sự, 1962. Một số dẫn liệu về hình thái và phân loại học cá bột (ấu trùng) và cá con vớt được trên sông Hồng. NXB Khoa Học và Kỹ Thuật, Hà Nội Sách, tạp chí
Tiêu đề: Một số dẫn liệu về hình thái và phân loại học cá bột (ấu trùng) và cá con vớt được trên sông Hồng
Nhà XB: NXB Khoa Học và Kỹ Thuật
3. Mai Đình Yên, Vũ Trung Tạng, Bùi Lai, Trần Mai Thiên, 1979. Ngư loại học. NXB Đại Học và Trung Học Chuyên Nghiệp, Hà Nội Sách, tạp chí
Tiêu đề: Ngư loại học
Nhà XB: NXB Đại Học và Trung Học Chuyên Nghiệp
4. Mai Đình Yên, Nguyễn Văn Thiện, Lê Hoàng Yến, Nguyễn Văn Trọng, 1985. Định loại các loài cá nước ngọt Nam Bộ. NXB Khoa Học và Kỹ Thuật Hà Nội Sách, tạp chí
Tiêu đề: Định loại các loài cá nước ngọt Nam Bộ
Nhà XB: NXB Khoa Học và Kỹ Thuật Hà Nội
5. Nguyễn Bạch Loan, 1998. Đặc điểm phân loại và sinh học của một số loài cá họ cá tra Pangasiidae ở hạ lưu sông MeKong, Việt Nam. Luận án thạc sĩ ngàng nuôi trồng thủy sản Sách, tạp chí
Tiêu đề: Đặc điểm phân loại và sinh học của một số loài cá họ cá tra Pangasiidae ở hạ lưu sông MeKong
6. Nguyễn Hửu Phụng và Nguyễn Bạch Loan, 1999. Thành phần lòai và phân bố của họ cá tra Pangasiidae ở lưu vực sông MeKong, Việt Nam Sách, tạp chí
Tiêu đề: Pangasiidae
7. Nguyễn Văn Hảo, 2005. Cá Nước Ngọt Việt Nam Tập II. NXB Nông Nghiệp Hà Nội Sách, tạp chí
Tiêu đề: Cá Nước Ngọt Việt Nam Tập II
Nhà XB: NXB Nông Nghiệp Hà Nội
8. Nguyễn Nhƣ Hiền – Trịnh Xuân Hậu, 2000. Tế Bào Học. NXB Khoa Học và Kỹ Thuật Sách, tạp chí
Tiêu đề: Tế Bào Học
Nhà XB: NXB Khoa Học và Kỹ Thuật
9. Nguyễn Văn Trọng, 1997. Trứng cá và cá con các thuỷ vực thuộc tỉnh Tiền Giang. Báo cáo Khoa Học. Viện Nghiên Cứu Nuôi Trồng Thuỷ Sản II Sách, tạp chí
Tiêu đề: Trứng cá và cá con các thuỷ vực thuộc tỉnh Tiền Giang
10. Lê Đức Trình, 2001. Sinh Học Phân Tử Của tế Bào. NXB Khoa Học và Kỹ Thuật Sách, tạp chí
Tiêu đề: Sinh Học Phân Tử Của tế Bào
Nhà XB: NXB Khoa Học và Kỹ Thuật
11. Hồ Hùynh Thùy Dương, 2003. Sinh Học Phân Tử. Tái bản lần 3, NXB Giáo Dục, Thành Phố Hồ Chí Minh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Sinh Học Phân Tử
Nhà XB: NXB Giáo Dục

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Hình 2.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866; 16 mm. - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866; 16 mm (Trang 17)
Hình 2.1. Pangasianodon hypophthalmus Sauvage, 1878; 15 mm - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.1. Pangasianodon hypophthalmus Sauvage, 1878; 15 mm (Trang 17)
Hình 2.1. Pangasianodon hypophthalmus Sauvage, 1878; 15 mm - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.1. Pangasianodon hypophthalmus Sauvage, 1878; 15 mm (Trang 17)
Hình 2.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866; 16 mm . - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866; 16 mm (Trang 17)
Hình 2.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851; 15 mm - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851; 15 mm (Trang 18)
Theo Nguyễn Văn Hảo (2005) thì mô tả hình thái đặc trƣng của một số loài cá thuộc họ Pangasiidae nhƣ sau:  - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
heo Nguyễn Văn Hảo (2005) thì mô tả hình thái đặc trƣng của một số loài cá thuộc họ Pangasiidae nhƣ sau: (Trang 18)
Hình 2.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851; 15 mm - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851; 15 mm (Trang 18)
Bảng 2.1. Số lƣợng các tia vi của P. macronema và P. siamensis (nguồn: Apichart  TermvidChakorn, 2003) - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Bảng 2.1. Số lƣợng các tia vi của P. macronema và P. siamensis (nguồn: Apichart TermvidChakorn, 2003) (Trang 18)
Hình 2.4: Hình.2.4a: cấu tạo tổng quát của ty thể (Alberts, 1994). Hình. 2.4b: cấu tạo mtDNA dạng vòng.( Sutovsky  và cộng sự, 1999). - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.4 Hình.2.4a: cấu tạo tổng quát của ty thể (Alberts, 1994). Hình. 2.4b: cấu tạo mtDNA dạng vòng.( Sutovsky và cộng sự, 1999) (Trang 20)
Hình 2.4: Hình.2.4a: cấu tạo tổng quát của ty thể (Alberts, 1994). Hình. 2.4b: cấu tạo mtDNA  dạng vòng.( Sutovsky  và cộng sự, 1999) - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.4 Hình.2.4a: cấu tạo tổng quát của ty thể (Alberts, 1994). Hình. 2.4b: cấu tạo mtDNA dạng vòng.( Sutovsky và cộng sự, 1999) (Trang 20)
Hình 2.5. Các picks màu quan sát trên máy Scan. Pick màu xanh là vị trí của bazơ Adenine (A), pick màu đỏ là vị trí của bazơ thymine (T), pick màu đen là vị trí của bazơ Guanine (G), cuối  - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.5. Các picks màu quan sát trên máy Scan. Pick màu xanh là vị trí của bazơ Adenine (A), pick màu đỏ là vị trí của bazơ thymine (T), pick màu đen là vị trí của bazơ Guanine (G), cuối (Trang 23)
Hình 2.5. Các picks màu quan sát trên máy Scan. Pick màu xanh là vị trí của bazơ Adenine (A),  pick màu đỏ là vị trí của bazơ thymine (T), pick màu đen là vị trí của bazơ Guanine (G), cuối - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 2.5. Các picks màu quan sát trên máy Scan. Pick màu xanh là vị trí của bazơ Adenine (A), pick màu đỏ là vị trí của bazơ thymine (T), pick màu đen là vị trí của bazơ Guanine (G), cuối (Trang 23)
Hình 4.1. Pangasianodon hypophthalmus (Sauvage, 1878), 17 mm. - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.1. Pangasianodon hypophthalmus (Sauvage, 1878), 17 mm (Trang 44)
Hình 4.1. Pangasianodon hypophthalmus (Sauvage, 1878), 17 mm. - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.1. Pangasianodon hypophthalmus (Sauvage, 1878), 17 mm (Trang 44)
Hình 4.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866. 20 mm. - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866. 20 mm (Trang 45)
Hình 4.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851. 15 mm - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851. 15 mm (Trang 45)
Hình 4.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866. 20 mm. - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.2. Pangasius larnaudii Bocourt, 1866. 20 mm (Trang 45)
Hình 4.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851. 15 mm - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.3. Pangasius macronema Bleeker, 1851. 15 mm (Trang 45)
Hình 4.4: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA trên mtDNA từ một số mẫu năm 2006 và năm 2005 - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.4 Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA trên mtDNA từ một số mẫu năm 2006 và năm 2005 (Trang 46)
Hình 4.4: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA trên mtDNA từ một số mẫu năm 2006 và  năm 2005 - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.4 Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA trên mtDNA từ một số mẫu năm 2006 và năm 2005 (Trang 46)
Bảng 4.1. Kích thƣớc các mẫu cá phân tích - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Bảng 4.1. Kích thƣớc các mẫu cá phân tích (Trang 48)
Bảng 4.1. Kích thước các mẫu cá phân tích - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Bảng 4.1. Kích thước các mẫu cá phân tích (Trang 48)
Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại một vùng 16S rRNA trên mtDNA từ vài mẫu cá đại điện; M : thang - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.5. Sản phẩm PCR khuếch đại một vùng 16S rRNA trên mtDNA từ vài mẫu cá đại điện; M : thang (Trang 49)
Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại một vùng 16S  rRNA trên mtDNA từ vài mẫu cá đại điện; M : thang - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.5. Sản phẩm PCR khuếch đại một vùng 16S rRNA trên mtDNA từ vài mẫu cá đại điện; M : thang (Trang 49)
trên ngân hàng gen DQ334315). Kích thƣớc các cá thể phân tích xem chi tiết ở bảng 4.1 - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
tr ên ngân hàng gen DQ334315). Kích thƣớc các cá thể phân tích xem chi tiết ở bảng 4.1 (Trang 50)
Từ kết quả trên chứng tỏ rằng, khóa phân loài dựa vào hình thái đối với loài - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
k ết quả trên chứng tỏ rằng, khóa phân loài dựa vào hình thái đối với loài (Trang 51)
Hình 4.7a - ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae
Hình 4.7a (Trang 52)

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TRÍCH ĐOẠN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w