HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG MÁY REALTIME PCR

  Hệ thống hoạt động chỉ ra thiết bị mới trong 1-2 phút đợi tin nhắn  Hiển thị trên màn hình máy tính và bắt đầu quá trình cài đặt driver sử dụng Found New Hardware Wizard Chú ý!. Thự

CÔNG TY TNHH THIẾT BỊ B.D.E

HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG

MÁY REALTIME PCR

DTPRIME 4M1 DTLITE 5S1 DTLITE 4S1

PHẦN I – TỔNG QUAN

1 Tổng quan thiết bị

2 Hệ thống điều khiển và hiển thị

Hệ thống điều khiển và hiển thị bao gồm bàn phím điều khiển bằng tay và màn hình LCD hiển thị quy trình chạy khuếch đại

Push-button trên màn hình menu hiển thị các chức năng của Push-button và đưa ra chế độ hoạt động Push-button của bộ phận điều khiển gia nhiệt hoạt động theo chỉ dẫn bên dưới:

 Mở và đóng bộ phận gia nhiệt và đặt ống vào khay gia nhiệt trước khi chạy PCR 



 Xác định chính xác vị trí các bộ phận gia nhiệt bên dưới.

Khi thiết bị hoạt động dưới sự điều khiển của máy tính, mở và đóng nắp có thể sử dụng

trong cửa sổ Running của phần mềm RealTime_PCR

Màn hình LCD hiển thị thông tin chương trình khuếch đại và quy trình chạy như hình dưới:

Cài đặt phần mềm theo 2 bước:

1 Cài đặt driver thiết bị

2 Cài đặt phần mềm

2.1 Cài đặt Driver thiết bị

 Bật PC và đợi cho hệ thống khởi động xong 

 Hệ thống hoạt động chỉ ra thiết bị mới trong 1-2 phút (đợi tin nhắn 

Hiển thị trên màn hình máy tính) và bắt đầu quá trình cài đặt driver sử dụng Found New Hardware Wizard

Chú ý! Khi cài đặt driver trên PC với Windows 7, Windows 8 hoặc Windows 10, Found New Hardware Wizard sẽ không tự động xuất hiện Thực hiện theo các chỉ dẫn bên dưới:

 Sau khi kết nối thiết bị với máy tính, mở cửa sổ Device Manager, sau đó click chuột phải vào DT-964 và lựa chọn Update driver trong danh sách.



 Trong cửa sổ Driver Updating lựa chọn Manual driver search and installation, click



Browse, lựa chọn folder Drivers_DT96x_W32_2014 (cho phiên bản 32-bit) hoặc folder

Drivers_DT96x_W64_2014 (cho phiên bản 64-bit)



 Click Next và hoàn tất quá trình cài đặt driver như miêu tả bên dưới.

Hiển thị Wizard cho cài đặt driver

 Lựa chọn No, not this time và click 

Lựa chọn loại cài đặt

 Lựa chọn Install from a list of specific location và click 

Tìm folder Drivers_DT96x trên CD

 Chọn đường dẫn đến thư mục bằng cách chọn Add this location to the search và click



Lựa chọn folder Drivers_DT96x trên CD

 Trong cửa sổ Browse For Folder lựa chọn Drivers_DT96x folder trên CD và click

 Chắc chắn rằng các bước thực hiện là đúng và nhấn 

Lựa chọn inf-file trên CD

Lựa chọn phiên bản cuối cùng của driver và bỏ qua tin nhắn xác nhận The driver has no digital signature lựa chọn driver bằng nhấn

Thêm cài đặt cho Driver_DT96x

 Xác nhận lựa chọn driver bằng nhấn 

 Lựa chọn đường dẫn đến file trên CD bằng nhấn 

Lựa chọn đường dẫn đến file to Dt964R.sys trên CD

 Cửa sổ Locate file tìm thấy ở Drivers DT96x trên CD, lựa chọn và nhấn 

Xác nhận lựa chọn file Dt964R.sys trên CD

 Chắc chắn rằng đường dẫn đến file trên cửa sổ là đúng, nhấn .



 Sau khi tin nhắn cài đặt driver hoàn tất hiển thị, nhấn .

Hoàn thành cài đặt Driver Nếu cài đặt driver hoàn tất, hệ thống hiển thị lời nhắn

 Cài đặt Wizard xuất hiện.

Cài đặt Wizard cho RealTime_PCR

Lựa chọn folder cài đặt phần mềm Có thể lựa chọn cài đặt RealTime_PCR trong folder mặc định

hoặc lựa chọn folder trên ổ cứng bằng nhấn

Lựa chọn Folder để cài đặt phần mềm

 Lựa chọn folder cài đặt nhấn 

 Lựa chọn tên folder, đường tắt RealTime_PCR sẽ được tạo và nhấn 

Lựa chọn folder để tạo đường dẫn

 Cửa sổ xác nhận sẽ xuất hiện, phần mềm sẵn sàng được cài đặt Kiểm tra lựa chọn và nhấn



Cửa sổ xác nhận Sau khi cài đặt hoàn tất, theo dõi cửa sổ bên dưới Nhấn để thoát khỏi cài đặt Wizard

Hoàn tất quá trình cài đặt Wizard cho RealTime_PCR

Chú ý! TĐể đảm bảo điều kiện hoạt động của thiết bị,Server_RTDevice bao gồm phần mềm

tượng hiển thị trên màn hình PC

Click chuột phải vào biểu tượng, màn hình hiên thị như bên dưới:

Show List_Device hiển thị danh sách các thiết bị kết nối với PC

3 Hướng dẫn hoạt động

3.1 Bật nguồn thiết bị và hiển thị RealTime_PCR

Kiểm tra liệu tằng thiết bị đã được kết nối với máy tính thông qua cáp nối USB hay chưa Sau đó bật thiết

bị và PC

Bắt đầu phần mềm RealTime_PCR Trong cửa sổ này lựa chọn chế độ hoạt động Guest được mặc định

(không khuyến cáo sử dụng) Lựa chọn toán tử khác bằng cách lựa chọn phím chỉ hướng và thêm toán tử

(nhấn phím chỉ hướng và kéo xuống dòng cuối cùng) Gõ tên Operator và lựa chọn Directory ở file chạy protocol và các kết quả khảo nghiệm sẽ được lưu trữ Nhấn OK và lựa chọn Device operation

Cửa sổ bắt đầu RealTime_PCR

RealTime_PCR is launched trong chế độ Device operation của cửa sổ chạy chương trình với việc chỉ ra

trạng thái thiết bị được hiển thị Trong dòng trạng thái , cửa sổ thiết bị có sẵn được

hiển thị trong List of devices

Cửa sổ kết nối các thiết bị Lựa chọn thiết bị để bắt đầu bằng cách nhấn

Thiết bị sẽ kết nối với PC và đưa ra dòng trạng thái hoạt động bằng hiển thị

Sau quá trình tự kiểm tra, dòng trạng thái sẽ thay đổi thành và thiết bị đã sẵn sàng hoạt động

Hướng dẫn chi tiết của quá trình bắt đầu và hoạt động của phần mềm RealTime_PCR được miêu tả trong

phần II của hướng dẫn sử dụng Software guidance

Ý nghĩa dòng trạng thái hiển thị:

– thiết bị đã được bật và sẵn sàng hoạt động (nền xanh lá)

– thiết bị đã được bật, tuy nhiên nó chưa sẵn sàng hoạt động (nền vàng) – đây là quá trình để máy ổn định Sau quá trình làm ổn định máy (không quá 10 phút), màu nền sẽ chuyển từ vàng sang xanh lá

– thiết bị bị ngắt kết nối, nó không được kết nối với PC qua cáp USB2.0 A-B hoặc

không được lựa chọn trong cửa sổ List of devices

Trong chế độ làm việc chỉ với 1 thiết bị, kết nối hoặc ngắt kết nối của thiết bị bằng cách nhấn

và trong cửa sổ List of devices, nó hiển thị tự động trong RealTime_PCR,

và trong khi hoạt động, cửa sổ này có thể mở bằng cách nhấn Preferences/ List of devices ở thanh menu

Trong chế độ làm việc với nhiều thiết bị, mỗi thiết bị yêu cầu đưa ra phần mền RealTime_PCR của nó trong cửa sổ cá nhân Trong trường hợp hoạt động của một số thiết bị có thể được điều khiển đồng thời Dòng trạng thái ngày giờ hiển thị , số seri của thiết bị và phiên bản của phần mềm

3.2 Chuẩn bị thiết bị cho PCR

Thiết bị đã sẵn sàng chạy PCR và được kiểm tra mỗi lần sau khi bật nguồn thiết bị Trong khi bộ tản nhiệt, tấm gia nhiệt và nhiệt độ của nắp được kiểm tra giá trị thường xuyên

3.2.1 Kiểm tra cài đặt hình học

Hướng dẫn chi tiết của các kiểm tra cài đặt hình học được miêu tả ở phần II của hướng dẫn sử dụng

Software guidance

Hình ảnh của tấm giếng gia nhiệt phác thảo ranh giới của một vùng đo phải bao gồm các điểm sáng Nếu các vòng tròn bị dịch chuyển tương đối so với điểm sáng, việc hiệu chỉnh hình học cần phải được thực hiện như hình dưới:

a)

Kiểm tra cài đặt hình học

3.2.2 Cài đặt đo quang

Cửa sổ cài đặt phơi sáng

Hướng dẫn cài đặt chi tiết được miêu tả ở phần II của Software guidance

3.2.3 Kiểm tra độ sạch của tấm giếng gia nhiệt

Trong khi kiểm tra các thiết lập hình học, người ta phải tăng giá trị phơi sáng lên 2 lần so với giá trị hoạt động Không được có những điểm sáng trên hình ảnh của các tấm giếng gia nhiệt bị trống Trong trường hợp ngược lại, cần làm sạch giếng bị ô nhiễm bằng bông và cồn

Nên kiểm tra độ sạch của các giếng trước khi đặt ống nghiệp, strip hoặc khay trộn PCR

Người dùng phải tiến hành vệ sinh thường xuyên đối với thiết bị, theo dõi phần hướng dẫn bảo trì

maintenance procedure

3.2.4 Đo độ cao của ống kiểm tra

Chú ý! Chiều cao của ống kiểm tra phải được đo mỗi lần khi sử dụng loại mới

 Nhấn và đặt ống hoặc strip vào tấm nhiệt 



 Lựa chọn Preference/Device diagnostics/Measure chiều cao của ống trong thanh menu và đợi tin nhắn hiển thị: 

 Lưu giá trị đo bằng nhấn .

Chú ý! Dể đo chiều cao ống, sử dụng ít nhất 32 ống hoặc 4 strips

3.3 Tạo Protocol

3.3.1 Bổ sung protocol

Để chạy protocol thực hiện theo các bước:

 Bằng việc sử dụng hướng dẫn Test để lưu các thông số chuẩn 



 Sử dụng RUN protocol để lưu mẫu trước đó 

Trong trường hợp chạy protocol, nhập vào dữ liệu theo:

 Chỉ ra mã của mỗi ống thử nghiệm.



 Loại của mỗi ống thử nghiệm (mẫu, chuẩn hoặc điều khiển +/- );



 Số bản sao của mỗi mẫu 

 Nồng độ của mẫu hiệu chuẩn 

Hướng dẫn tạo protocol được miêu tả chi tiết ở phần II của Software guidance

Cửa sổ bổ sung protocol

3.3.2 Tạo/chỉnh sửa chương trình

Nếu được yêu cầu, tiến hành theo các bước

3.4 Đặt ống kiểm tra với mẫu

Đặt hoặc chuyển ống kiểm chuẩn cùng với mẫu, làm theo các bước:

3 Đặt mẫu vào trong giếng của tấm gia nhiệt

4 Nhấn trong cửa sổ Start run hoặc nhấn phím điều khiển thiết bị bằng tay, đợi

cho đến khi tấm gia nhiệt ổn định ở vị trí làm việc

Chú ý! Chắc chắn cài đặt ít nhất 16 ống kiểm tra để tránh có sự hư hỏng Nếu ít hơn số lượng đó, nên đặt thêm các ống không chứa mẫu vào

3.5 Bắt đầu chương trình

Sau khi thiết bị được kết nối với máy tính, trạng thái của thiết bị sẽ được hiển thị màu vàng

hoặc màu xanh , bắt đầu chương trình bằng cách nhấn

Khi chạy chương trình, lựa chọn tên file và định dạng dữ liệu để lưu kết quả phép đo

Chú ý! NếuStart programđược chọn trong khi thiết bị đang trong quá trình ổn định (chỉ thị màu vàng trong dòng trạng thái ), trong cửa sổ Temperature Profile hiển thị lời nhắn nhấp nháy

xuất hiện

Tin nhắn tương tự sẽ xuất hiện trên màn hình của thiết bị Khi máy đã ổn định, thiết bị sẽ tự động thực hiện chương trình

Trong trường hợp cần thiết, thực hiện theo bước sau:

1 Trong cửa sổ Running:

2 Đóng cứa sổ chương trình bằng nhấn ở góc trên bên phải

3 Khi chương trình khuếch đại kết thúc, thiết bị sẽ bật sang chế độ nghỉ, đèn trên màn hình menu nhấp nháy

3.6 Chạy chương trình khuếch đại

Chạy chương trình được điều khiển bằng phần mềm RealTime_PCR

Nếu yêu cầu, bạn có thể:

 Ngưng chạy chương trình;

Trong trường hợp thông báo Holding… nhấp nháy và đánh dấu nhiệt độ lưu trữ sẽ xuất hiện trên

đồ thị thể hiện đường cong của ma trận nhiệt độ và thời gian thực hiện chương trình khuếch đại

Thông báo hoàn tất quá trình khuếch đại

Thông báo tương tự sẽ xuất hiện trên màn hình của thiết bị

Khi nhiệt độ đạt tới giá trị gần của nhiệt độ giữ, cửa sổ xuất hiện trên màn hình thông báo rằng quá trình đã hoàn thành và chuyển sang chế độ Holding

Chế độ lưu trữ

Bằng cách nhấn ОК, bạn đã chuyển RealTime_PCR tới Archive viewer (bảng Data analysis)

Nếu tùy chọn Turn off device after the run không được kích hoạt, chương trình khuếch đại hoàn thành

sẽ chuyển đến chế độ nghỉ, đèn sẽ nhấp nháy trên menu hiển thị

Để thoát chế độ này, chạy RealTime_PCR và kết nối thiết bị trong cửa sổ List of devices

2 Mục đích và điều kiện sử dụng

2.1 Mục đích Phần mềm máy Realtime PCR

Phần mềm này được thiết kế để điều khiển hoạt động phát hiện DTprime máy luân nhiệt và DTlite (dưới đây là chuỗi thiết bị DT)

Hoạt động dưới đây được trình bày sử dụng Phần mềm máy Realtime PCR:

1 Tạo công thức đĩa

2 Kiểm tra tạo ra và chỉnh sửa;

3 Tạo ra, giới thiệu và kiểm soát chương trình phóng đại;

4 Phân tích dữ liệu đo quang học;

5 Báo cáo dữ liệu phân tích;

6 Kiểm tra cấp số nhân và cài đặt quang học cho thiết bị;

7 Cài đặt và chuẩn đoán công cụ

1 Phần mềm được thiết kế để điều khiền hoạt động của chuỗi công cụ DT Phần mềm giao diện tự động điều chỉnh công cụ được lựa chọn

2 Có 2 loại phần mềm được thực hiện không phụ thuộc windows: Hoạt động thiết bị và tài liệu xem cho phép hoạt động đồng thời với thiết bị (khởi động/bắt đầu/phân tích RUN chạy hiện tại) và phân tích kết quả trước chạy

3 Khả năng làm việc với một vài thiết bị cùng một thời tiểm:phần mềm máy realtime PCR được khởi

động của sổ khác để điều khiển mỗi thiết bị bao gồm “mode nhiều cửa sổ” Mode này cho phép kiểm soát

đồng thời hoạt động của một vài thiết bị

4 Trường hợp không thể bắt đồng mode nhiều của sổ windows , lựa chọn công việc ở “cửa sổ đơn”

là có thể Đây là mode của phần mềm Realtime PCR, cho phép làm việc với nhiều thiết bị trong cùng 1 cửa

sổ Nó có thể hữu ích trong các phòng thí nghiệm với nhiều thiết bị , cái mà không thể kết nối máy tích cùng một lúc Trong trường hợp, các thiết bị được bắt đầu qua phần mềm Realtime PCR, và sau đó không kết nối với phần mềm và chạy độc lập

5 Khả khi giới thiệu độ giảm nhiệt độ đứng hoặc ngang qua hệ matrix cho thiết bị khuôn cứng

6 Khả khi cài đặt nhiệt độ không phụ thuộc nhiệt độ cho mỗ 6 phần cho thiết bị với 6 hệ matrix

7 Khả khi giới thiệu dôc đứng hoặc cài đặt không phụ thuộc nhietej độ mỗi 3 loại cho thiết bị với 3 matrix

8 Hai phương pháp thay thế để phân tích đường cong tích lũy DNA trong PCR: Ngưỡng (Ct) và Hình học (Cp), dựa trên các cách tiếp cận khác nhau để xác định chu trình chỉ thị khuếch đại Theo mặc định, khi phân tích phép đo quang học, RealTime_PCR sử dụng phương thức Hình học (Cp)

2.3 Yêu cầu về PC

Các yêu cầu của PC được mô tả trong phần 1.5 của Phần I hướng dẫn vận hành

3 Chuẩn bị cho công việc

3.1 Cài đặt phần mềm RealTime_PCR

Quy trình được mô tả trong Phần 3.3 của Phần I hướng dẫn vận hành

3.2 Nâng cấp phần mềm

3.3 Chuẩn bị thiết bị để vận hành

 Các nhà sản xuất bộ dụng cụ phải cung cấp các giá trị phơi sáng tối ưu

 Việc đo chiều cao ống phải được thực hiện trong trường hợp sử dụng các ống có độ cao khác nhau trong phòng thí nghiệm

 Kiểm tra độ tinh sạch của các giếng đơn vị nhiệt phải được thực hiện định kỳ trong phòng thí nghiệm để loại trừ khả năng thu được các kết quả không đáng tin cậy như là nguyên nhân của sự gia tăng huỳnh quang nền

3.4 Mô tả menu phần mềm RealTime_PCR

Hình 1 Cửa sổ RealTime_PCR trong chế độ vận hành Thiết bị Mục lục chính của phần mềm RealTime_PCR (Hình 1) bao gồm bốn phần:

2 Phần kiểm tra được thiết kế để tạo và chỉnh sửa các kiểm tra và bao gồm các lệnh sau (phần này

dành cho công việc ở chế độ "Thao tác thiết bị", trong chế độ "Trình xem kho lưu trữ", phần này không có sẵn):

 Tạo / Chỉnh sửa kiểm tra

 Sao chép nhóm kiểm tra

3 Mục Tùy chọn được thiết kế để hiển thị và chỉnh sửa cài đặt công cụ Chế độ "Hoạt động thiết bị"

Loại _AnalyseExpo:

Đường cong nóng chảy: Xác định các khu vực "làm mịn" của cấu hình nóng chảy

Expo_coef: một yếu tố xác định số lần phơi nhiễm thứ hai nhỏ hơn lần đầu tiên

Lọc dữ liệu thô (Filter_RawData): sự hiện diện của bộ lọc kỹ thuật số trong phân tích dữ liệu gốc và sử

dụng phân tích bổ sung về "tích lũy" cuối cùng Biên giới hiệu lực trong việc mô tả đường cong PCR với sigmoid

Lưu vào SD: lưu dữ liệu đo quang trên thẻ SD (không được khuyến nghị)

PCR_settings: xác định ranh giới bên trái của tìm kiếm cho "điểm Take_of" trong trường hợp phân tích

PCR Hệ số giảm Cp so với vị trí cực đại của đạo hàm bậc hai trong PCR sigmoid

Giao thức nhập (RUN) từ LIS (Hệ thống thông tin phòng thí nghiệm)

Kết quả xuất: các cài đặt chung cho việc xuất kết quả được xác định, cũng như các tính năng của đầu ra báo cáo trong LIS

Mẫu tên kết quả: đặt tên của giao thức (RUN) được lưu theo mẫu được xác định trước

4 Phần Trợ giúp được thiết kế để hiển thị trợ giúp về phần mềm RealTime_PCR và mô tả phiên bản hiện tại của nó:

3.5 Chạy phần mềm RealTime_PCR

Phần mềm RealTime_PCR có thể được khởi chạy theo hai cách:

1 Sử dụng menu Bắt đầu của hệ điều hành Windows:

Bắt đầu → Tất cả các chương trình → RealTime_PCR → RealTime_PCR

2 Sử dụng biểu tượng trên màn hình nền (khi phần mềm được cài đặt, biểu tượng này được đặt trên màn hình tự động)