Nghiên cứu đa dạng và đặc điểm sinh học của nấm túi họ xylariaceae ở mường phăng điện biên và cúc phương – ninh bình

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM HÀ NỘI ĐỖ ĐỨC QUẾ NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG VÀ ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC CỦA NẤM TÚI HỌ XYLARIACEAE Ở MƯỜNG PHĂNG - ĐIỆN BIÊN VÀ CÚC PHƯƠNG - NINH BÌNH Chuyên ngành: Vi sinh vật học Mã số: 62.42.01.07 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS TS VƯƠNG TRỌNG HÀO TS DƯƠNG MINH LAM HÀ NỘI - 2014 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng Các số liệu, kết nêu luận án trung thực chưa cơng bố cơng trình khác Tác giả luận án Đỗ Đức Quế LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành gửi lời cảm ơn sâu sắc đến: PGS.TS Vương Trọng Hào người thầy dìu dắt tơi bước đường nghiên cứu khoa học, thầy động viên chia sẻ lúc tơi khó khăn sống tạo điều kiện tốt để tiến hành nghiên cứu luận án TS Dương Minh Lam người thầy truyền đạt cho kiến thức kinh nghiệm q báu phân loại nấm, thầy ln bảo tận tình theo dõi sát tiến độ Đồng thời thầy tạo điều kiện tốt sở vật chất kinh phí cho tơi thực đề tài GS.TS Nguyễn Thành Đạt, GS.TS Phạm Thị Thùy, GS.TSKH Trịnh Tam Kiệt, PGS.TS Đặng Ngọc Quang, TS Trần Thị Thúy, TS Phan Duệ Thanh, TS Đoàn Văn Thược người thầy truyền đạt kiến thức cho lĩnh vực Vi sinh vật, Nấm học, Hợp chất thiên nhiên Đồng thời thầy tham gia góp ý cho tơi từ xây dựng đề cương đến q trình thực luận án giúp đỡ tơi hồn thành chuyên đề tiến sĩ, seminar khoa học Bộ môn Ths Tống Thị Mơ, Ths Trần Hữu Phong, CN Phạm Thị Hồng Hoa, CN Phạm Thị Vân tạo điều kiện thực nghiệm tốt hỗ trợ kỹ thuật suốt trình thực đề tài Ban quản lý rừng nguyên sinh Mường Phăng – Điện Biên vườn quốc gia Cúc Phương - Ninh Bình tạo điều kiện thuận lợi cho tơi tiến hành thu mẫu Ban lãnh đạo Sở Giáo dục Đào tạo tỉnh Phú Thọ, Ban Giám hiệu tập thể giáo viên trường THPT Thạch Kiệt tạo điều kiện kinh phí, thời gian ln động viên khích lệ tơi q trình học tập Ban Giám Hiệu, Phòng quản lý Sau đại học, Ban chủ nhiệm Khoa Sinh học Trường ĐHSP Hà Nội động viên tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình học tập nghiên cứu Quỹ phát triển khoa học công nghệ quốc gia (Nafosted) hỗ trợ đề tài mã số 106.07-2011.57 kinh phí cho tơi thực phần nội dung luận án Đặc biệt, xin chân thành cảm ơn gia đình dành tình yêu thương, ủng hộ động viên tạo điều kiện cho hoàn thành luận án Hà Nội, Ngày … tháng … năm 2014 NGHIÊN CỨU SINH Đỗ Đức Quế Deleted: 20 Deleted: 02 DANH MỤC CÁC KÍ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT Kí hiệu Diễn giải bp base pair (cặp bazơ) Cd Concentration of dominance ( số mức độ chiếm ưu thế) cs cộng CTAB Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide DMAP Dimethylaminopyridine DMSO Dimethyl sulfoxide ĐHSP Đại học Sư phạm EDTA Ethylene Diamine Tetra Acetate FBS Fetal Bovine Serum (Huyết thai bò) GPS Global Positioning System (hệ thống định vị) HepG2 Hepatocellular carcinoma (ung thư gan người) HIV Human immunodeficiency virus (vi rút gây suy giảm miễn dịch người) HPLC High Performance Liquid Chromatography (Sắc ký lỏng hiệu cao) ITS IU Internal transcribed spacer International unit (đơn vị quốc tế) Lu Human lung carcinoma (ung thư phổi người) MCF7 Human breast carcinoma (ung thư vú người) MHA MHB Mueller-Hinton Agar (môi trường MHA) Mueller-Hinton Broth (môi trường MHB) MTT Methylthiazolyldiphenyl-tetrazolium bromide NCBI National Center for Biotechnology Information NMR Nuclear magnetic resonance (cộng hưởng từ hạt nhân) kb kilo base kda kilo dalton KB Human epidermic carcinoma (ung thư biểu mô người) KVNC Khu vực nghiên cứu OD Optical density (mật độ quang) PCR Polymerase chain reaction PDA Potato dextrose agar (môi trường PDA) SI Index of similarity hay Sorensen’s Index STT Số thứ tự TAE Tris acetic acid EDTA buffer (dung dịch đệm TAE) Taxon Đơn vị phân loại bao gồm (loài, thứ, loài chưa định tên) TCA Trichloroacetic acid TE Tris EDTA buffer (dung dịch đệm TE) TSA Tryptic Soy Agar (môi trường TSA) TSB Tryptic Soy Broth (môi trường TSB) RNS VQG Rừng nguyên sinh Vườn quốc gia MỤC LỤC MỞ ĐẦU 1 Lý chọn đề tài Mục đích đề tài .2 Nội dung nghiên cứu .2 Đối tượng phạm vi nghiên cứu Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài .3 Những đóng góp Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Vị trí nấm túi họ Xylariaceae hệ thống phân loại đặc điểm hình thái chúng 1.1.1 Vị trí họ Xylariaceae hệ thống phân loại nấm 1.1.2 Đặc điểm hình thái nấm túi họ Xylariaceae 1.1.2.1 Chất (Stromata) .7 1.1.2.2 Thể (Perithecia) .8 1.1.2.3 Lỗ miệng (Ostioles) .9 1.1.2.4 Túi bào tử (Asci) 10 1.1.2.5 Bào tử túi (Ascospores) 12 1.1.2.6 Hình thức sinh sản vô tnh (Anamorph) .14 1.2 Tình hình nghiên cứu nấm túi họ Xylariaceae .15 1.2.1 Trên giới 15 1.2.1.1 Hệ thống phân loại 15 1.2.1.2 Đa dạng thành phần loài 21 1.2.1.3 Mối quan hệ di truyền chi, loài họ Xylariaceae 25 1.2.1.4 Các hợp chất hóa học tách chiết từ nấm túi họ Xylariaceae 28 1.2.1.5 Hoạt tnh sinh học từ nấm túi họ Xylariaceae 32 1.2.2 Ở Việt Nam 36 1.3 Đặc điểm khu vực nghiên cứu .41 1.3.1 Rừng nguyên sinh Mường Phăng 41 1.3.2 Vườn Quốc gia Cúc Phương .43 Chương 2: ĐỊA ĐIỂM, THỜI GIAN, VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .45 2.1 Địa điểm, thời gian vật liệu nghiên cứu 45 2.1.1 Địa điểm sinh cảnh KVNC .45 2.1.2 Thời gian nghiên cứu 45 2.1.3 Vật liệu nghiên cứu 48 2.1.3.1 Mẫu nghiên cứu 48 2.1.3.2 Các dòng tế bào 48 2.1.3.3 Vi sinh vật 48 2.1.3.4 Hóa chất .48 2.1.3.5 Thiết bị .49 2.1.3.6 Môi trường 50 2.2 Phương pháp nghiên cứu .50 2.2.1 Phương pháp vi sinh 50 2.2.1.1 Thu thập xử lý mẫu .50 2.2.1.2 Phương pháp phân lập nấm 51 2.2.1.3 Bảo quản chủng nấm phân lập 51 2.2.1.4 Phương pháp phân tích đặc điểm hình thái, định loại mẫu .52 2.2.1.5 Hoạt tnh kháng vi sinh vật kiểm định hợp chất hóa học .53 2.2.1.6 Hoạt tnh gây độc tế bào hợp chất hóa học 54 2.2.2 Sinh học phân tử 55 2.2.2.1 Tách chiết ADN 55 2.2.2.2 Phản ứng PCR 56 2.2.2.3 Phân tch trình tự ADN 56 2.2.3 Phương pháp hóa sinh 57 2.2.3.1 Phương pháp tách chiết chất 57 2.2.3.2 Phương pháp xác định cấu trúc hóa học 57 2.2.4 Phương pháp toán học 57 2.2.4.1 Độ phong phú loài .57 2.2.4.2 Chỉ số đa dạng sinh học loài H’ (Shannon and Weiner’s Index) 58 2.2.4.3 Chỉ số mức độ chiếm ưu hay gọi số Simpson, (Concentration of Dominance-Cd) .58 2.2.4.4 Chỉ số tương đồng (Index of similarity hay Sorensen’s Index- SI 58 Chương 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 59 3.1 Thành phần loài nấm túi họ Xylariaceae KVNC 59 3.1.1 Nhận xét chung đặc điểm hình thái cấu trúc hiển vi nấm túi họ Xylariaceae KVNC 59 3.1.1.1 Chất .59 3.1.1.2 Thể 61 3.1.1.3 Lỗ miệng 61 3.1.1.4 Túi bào tử đỉnh túi bào tử 62 3.1.1.5 Bào tử túi 63 3.1.2 Danh lục loài họ Xylariaceae KVNC .65 3.1.3 Ghi nhận cho khu hệ nấm Việt Nam 70 3.1.4 Trình tự cho khoa học Error! Bookmark not defined 3.2 Đa dạng sinh học nấm túi họ Xylariaceae KVNC 74 3.2.1 Đa dạng thành phần loài 74 3.2.2 Đa dạng sinh học loài .79 3.2.3 Đa dạng sinh học theo KVNC 81 3.2.4 Đa dạng theo mùa .84 3.2.5 Đa dạng yếu tố địa lý nấm họ Xylariaceae KVNC 85 3.2.5.1 Các loài phân bố toàn cầu 86 3.2.5.2 Các loài nhiệt đới .87 3.2 Các lồi ơn đới 3.2.6 Phươ ng thức sống nấm túi họ Xylari aceae KVNC 3.3 Mối quan hệ di truyền loài nấm túi họ Xylariaceae KVNC 91 3.3.1 Mối quan hệ di truyền taxon họ Xylariaceae KVNC 91 3.3.2 Mối quan hệ di truyền taxon chi Annulohypoxylon 95 Deleted: 71 32 Erickson, O E and Hawkworth, D L., (1993), “Outline of Ascomycetes”, Systematic Ascomycetes 13, 51-257 33 Eriksson, O E et al (2004), “Outline of Ascomycota – 2004”, Myconet 10, 1– 99 34 Eriksson, O.E (2006), “Outline of Ascomycota 2006”, Myconet 12, 1-82 35 Ellis, J B and Everhart, B M., (1888), “Synopsis of the North American species of Hypoxylon and Nummularia”, Mycol 4, 19 - 23 36 Fukai, M., et all (2012), “Hypoxylonols C−F, Benzo[j]fluoranthenes from Hypoxylon truncatum”, J Nat Prod, 75, 22−25 37 Ferdinandi, P., Godliving, M., Anthony, M M., Gunnar, J and Amelia, K (2009), “Purification and characterization of a laccase from the basidiomycete Funalia trogii (Berk.) isolated in Tanzania”, African Journal of Biochem Res, (5), 250-258 38 Fournier, J., Stadler, M., Hyde, K D and Lam, M D., (2010), “The new genus Rostrohypoxylon and two new Annulohypoxylon species from Northern Thailand”, Fungal Diversity, 40, 23 - 36 39 Guedegbe, H J., Miambi, E and Pando, A., (2009a), “Molecular diversity and host specificity of termite- associated Xylaria”, Mycologia, 101, 686– 691 40 Granmo, A., Hammelev, D., Knudsen, H., Læssøe, T., Sasa, M and Whalley, A J S., (1989), “The genus Biscogniauxia and Hypoxylon (Sphaeriales) in the Nordic countries”, Opera Bot, 100, 59 - 84 41 Hawksworth, D L (1971), “A revision of the genus Ascotricha Berk”, Mycol, 126, 1- 28 42 Hall, T A (1999), “BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT, Nucleic Acids”, Symposium Series 41, 95 – 98 43 Hawksworth, D L., (1977), “Rhopalostroma, a new genus in the Xylariaceae s.l”, Kew Bull 31, 421-431 44 Hawksworth, D.L., (2001), “The magnitude of fungal diversity: the 1.5 million species estimate revisited”, Mycol Res, 105, 1422-1432 45 Healy, P C; Hocking, A; Tran, D, N; Pit, J; Shivas, R G; Mitchell, J K; Kotiw, M and Davis, R A., (2004), “Xanthones from a microfungus of the genus Xylaria”, Phytochemistry, 65(16), 2373-2378 46 Ho, W C and Ko, W H (1997), “A simple method for obtaining singlespore isolates of fungi” Bot Bull Acard Sin, 38, 41 - 44 47 Ho, C K., Huang, Y L and Chen, C C (2002), “Garcinone E, a xanthone-derivative, has potent cytotoxic effect against hepatocellularcarcinoma cell lines”, Planta Med, 68, 975 – 979 48 Hsieh, H M., Ju, Y M and Rogers, J D., (2005), “Molecular phylogeny of Hypoxylon and closely related genera”, Mycologia, 97(4), 844- 865 49 Hyde, K D., (1996), “Fungi from palms XXVI The genus Anthostomella, with ten new species”, Nova Hedwigia, 62, 273-340 50 Jong, S C and Benjamin C R., (1971), “North American species of Nummularia”, Mycologia, 63, 862–876 51 Jong, S C and Rogers J D., (1972), “Illustrations and descriptions of conidial states of some Hypoxylon species”, Wash State Agric Exp Sta Bull, 71, – 51 52 Ju, Y M and Rogers, J D., (1990), “Astrocystis reconsidered”, Mycologia, 82, 342 - 349 53 Ju, Y M and Rogers, J D., (1994), “Kretzschmariella culmorum (Cooke) comb nov and notes on some monocot-inhabiting xylariaceous fungi”, Mycotaxon, 51, 241-255 54 Ju, Y M and Rogers, J D., (1995), “Pareutypella gen nov for two longostiolate pyrenomycetes from Taiwan”, Mycologia, 87, 891-895 55 Ju, Y M and Rogers, J D., (1996), “A revision of the genus Hypoxylon”, Mycologia Memoir no 20 APS Press, St Paul, Minnesota.U.S.A, - 365 56 Ju, Y M and Rogers, J D., (1999), “The Xylariaceae of Taiwan (excluding Anthostomella)”, Mycotaxon, 73, 343-440 57 Ju, Y M., Rogers, J D and San Martín F (1997), “A revision of the genus Daldinia”, Mycotaxon, 61, 243-293 58 Ju, Y M., Rogers, J D and Huhndorf S M (1996), “Valsaria and notes on Endoxylina, Pseudothyridaria, Pseudovalsaria, and Roussoella”, Deleted: loài Mycotaxon, 58, 419 - 481 59 Ju, Y M., Rogers, J D., San Martn, F and Granmo, A., (1998), “The Deleted: loài genus Biscogniauxia”, Mycotaxon, 66, 1- 98 60 Ju, Y M., Rogers, J D., (2001), “New and interesting Biscogniauxia taxa, with a key to the world species”, Mycol Res, 105 (9), 1123 – 1133 61 Ju, Y M and Rogers, J .D., (2002), “The genus Nemania”, Nova Hedwigia, 74, 75 - 120 62 Ju, Y M., Rogers, J .D and Hsieh, H M., (2003), “The genus Theissenia: T pyrenocrata, T cinerea sp nov., and T eurima sp nov”, Deleted: Ju, Y M, et al., (2007), Mycologia, 95, 109 –116 63 Ju, Y M., Hsieh, H M., Ho, M C., Szu, D H and Fang, M J., (2007), “Theissenia rogersii sp nov and phylogenetic position of Theissenia”, Mycologia, 99, 612 – 621 64 Ju, Y M and Hsieh, M H., (2007), “Xylaria species associated with nests of Odontotermes formosanus in Taiwan”, Mycologia, 99 (6), 936–957 Deleted: Karnchanatat A, et al 65 Karnchanatat, A., Petsom, A., Angvanich, P S., PiapukieW, J., Whalley, A J S., Reynoldsc, C D., Gadd, G M and Sihanonth, P., (2008), “A novel thermostable endoglucanase from the wood decaying fungus Daldinia eschscholzii (Ehrenb.:Fr.) Rehm”, Enzyme Microb Technol, 42, 404–413 66 Krug, J C.,Cain, R F., (1974), “New species of Hypocopra (Xylariaceae)”, Canad J Bot, 52, 809-843 67 Kendrick, B., (2000), “The fifth Kingdom Third Edition”, Focus Formatted: Czech Formatted: Czech Publishing R Pullins Company Newburyport MA 01950 USA 68 Krebs C J., (1989), “Ecological Methodology”, Harper and Row Publishers, New York, pp 654 69 Kirk, P M., Cannon, P F., David, J C and Stalpers, J A., (2001), th “Ainsworth & Bisby’s Dictionary of the fungi edition”, CABI Publishing 70 Kirk, P F., Cannon, P F., Minter, D W and Stalpers, J A., (2008), “Dictionary of the Fungi”, 10th edn CABI Publishing, Egham, UK 71 Lam, M D and Tam, T V., (2009), “Three new records of Xylariaceous fungi in Muong Phang, Dien Bien”, Journal of science of HNUE, 1, 105 – 111 72 Liers, C., Ullrich, R., Pecyna, M., Schlosser, D and Hofrichter, M., (2007), “Production, purification and partial enzymatic and molecular characterization of a laccase from the wood-roting ascomycete Xylaria polymorpha”, Enzyme Microb Technol, 41, 785-793 73 Li, P, Deng, Y P, Wei, X X and Xu J.H., (2013), “Triterpenoids from Ganoderma lucidum and their cytotoxic activities”, Nat Prod Res, 27(1),17-22 74 Læssøe, T and Spooner, B M., (1993), “Rosellinia & Astrocystis (Xylariaceae): New Species and Generic Concepts”, Kew Bulletin, Vol 49, No 1, 1-70 75 Laessøe, T., (1994), “Index Ascomycetum Xylariaceae”, Systema Ascomycetum 13, 43-112 76 Lu, B S., Hyde, K D and Yuan, Z.Q., (1999), “The genus Anthostomella in Australia”, Fungal Diversity, 3, 99-106 77 Lumbsch, H T and Huhndorf, S M., (2010), “Part One Outline of Ascomycota - 2009 Part Two Notes on Ascomycete Systematics Nos 4751– 5113, Fieldiana: Life & Earth Sciences, N.S., 1” Myconet, 14, 1–64 78 Lumbsch, H T and Huhndorf S M., (2007), “Notes on ascomycete systematics Nos 4408 – 4750”, Myconet, 13, 59 – 99 Formatted: Condensed by 0.4 pt Deleted: Vol 54 No 79 Lumbsch, H T and Huhndorf, S M., (2007), “Outline of Ascomycota2007”, Myconet, 13, - 58 80 Lee, J S., Ko, K S and Jung, H S., (2000), “Phylogenetic analysis of Xylaria based on nuclear ribosomal ITS1-5.8S-ITS2 sequences”, FEMS Microbiology Letters, 187, 89- 93 81 Ma, Z Z., Zuo, P P., Chen, W R., Tang, L J., Shen, Q., Sun, X H and Shen, Y., (1999), “Studies on the sedative and sleeping effects of Wuling mycelia and its pharmacological mechanism”, Chin Pharm J, 34, 374-377 82 Ma, H X., (2011), “Taxonomy And Molecular Phylogeny Of Several Genera Of Xylariaceae From China”, PhD Thesis Jilin Agricultural University, 11- 135 83 Martin, P., (1967a), “Studies in the Xylariaceae: I New and old concepts”, J S African Bot, 33, 205-238 84 Martin, P., (1967b), “Studies in the Xylariaceae: II Rosellinia and the Primocinerea section of Hypoxylon”, J S African Bot, 33, 315-328 85 Martin, P., (1968a), “Studies in the Xylariaceae: III South African and foreign species of Hypoxylon sect Entoleuca”, J S African Bot, 34, 153-199 86 Martin, P., (1968b), “Studies in the Xylariaceae: IV Hypoxylon, sections Papillata and Annulata”, J S African Bot, 34, 303-330 87 Martin, P., (1969a), “Studies in the Xylariaceae: V Euhypoxylon”, J S African Bot, 35, 149-206 88 Martin, P., (1969b), “Studies in the Xylariaceae: VI Daldinia, Numularia and their allies”, J S African Bot, 35, 267-320 89 Martin, P., (1970), “Studies in the Xylariaceae: VIII Xylaria and its allies”, J S African Bot, 36, 71-83 90 Martin, P., (1976), “Studies in the Xylariaceae: supplementary note”, J S African Bot, 42, 71- 83 91 Miller, J H., (1930), “Xylariaceae In: C E Chardon and R A Toro, eds Mycological explorations of Colombia”, J Dept Agric Univ Puerto Rico, 14, 271- 275 92 Miller, J H., (1932), ”British Xylariaceae II Trans Brit”, Mycol Soc, 17, 125-135 93 Miller, J H., (1933), “Some new species of Hypoxylon”, Mycologia, 25, 321-329 94 Miller, J H., (1934), “The Xylariaceae In: Chardon & Toro, eds Mycologica explorations of Venezuela”, Monogr Univ Puerto Rico, B., ser, 2, 205 95 Miller, J H., (1942), “South African Xylariaceae”, Bothalia, 4, 251-272 96 Miller, J H., (1961), “A monograph of the world species of Hypoxylon”, Univ Georgia Press, Athens: 1-158 97 Möller, A., (1901), “Phycomyceten and Ascomyceten Untersuchungen aus Brasilien”, G Fischer, Jena, Germany, 1-319 98 Mueller, G M and Bills, G.F., (2004), “Introduction inventory and monitoring methods: In: Biodiversity of fungi”, Elsevier Academic Press San Diego, 1- 99 Mueller, G M and Schmit, J P., (2006), “Fungal biodiversity: what we know? What can we predict”, Biodivers Conserv, 16, 1–5 100 Munk, A., (1957), ”Danish Pyrenomycetes”, Dansk Bot Ark, 17, 1–491 101 Melanie, S., (2007), “The application of wood decay fungi to improve the acoustic properties of resonance wood for violins”, Freiburg im Breisgau, Germany, 114 – 137 102 Page, R D M., (1996), “Treeview: An application to display phylogenetic trees on personal computers” Computer Applications in the Biosciences, 12(4), 357–358 103 Pereira, J., Rogers, J D and Bezerra, J L., (2010), “New Annulohypoxylon species from Brazil”, Mycogia, 102(1), 248 – 252 104 Peláez, F., González, V., Platas, G., Sánchez-Ballesteros, J and Rubio, V (2008), “Molecular phylogenetic studies within the family Xylariaceae based on ribosomal DNA sequences”, Fungal Diversity, 31, 111-134 105 Petrini, L E., (1992), “Rosellinia species of the temperate zones”, Sydowia, 44, 169 - 281 106 Petrini, L E., & Petrini, O., (1985), “Xylariaceous fungi as endophytes”, Sydowia, 38, 216 - 234 107 Petrini, L.E., (2003), “Rosellinia and related genera in New Zealand”, New Zealand, J Bot,(41), 71-138 108 Petrini, L E and Petrini, O., (2005), “Morphological studies in Rosellinia (Xylariaceae): the first step towards a polyphasic taxoomy”, Mycol Res, 109 (5), 569–580 109 Pitayakhajonwut, P., Suvannakad, R., Thienhirun, S., Prabpai, S., Kongsaereec, P and Tanticharoena, M., (2005), “An anti-herpes simplex virus-type agent from Xylaria mellisii (BCC 1005)”, Tetrahedron Leters 46, 1341–1344 110 Pinnoi A, Phongpaichit, P., Jeewon, R., Tang, A.M.C., Hyde, K.D and Jones E.B.G., (2010), “Phylogenetic relationships of Astrocystis eleiodoxae sp nov (Xylariaceae)”, Mycosphere, 1, 1–9 111 Pouzar, Z., (1979), “Notes on taxonomy and nomenclature of Nummularia (Pyrenomycetes)”, Ceská Mykol, 33, 207- 219 112 Pouzar, Z., (1985a), “Reassessment of Hypoxylon serpens complex”, Ceská Mykol, 39, 15-25 113 Pouzar, Z., (1985b), “Reassessment of the Hypoxylon serpens complex II”, Ceská Mykol, 39, 129 - 134 114 Quang, D N., Hashimoto, T., Toyota, M and Asakawa, Y., 2003, “Occurrence of a high concentration of spider pheromones in the ascomycete fungus Hypoxylon truncatum”, J Nat Prod, 66, 1613– 1614 115 Quang, D N., Hashimoto, T., Tanaka, M., Stadler, M and Asakawa, Y., (2004a), “Cyclic azaphilones daldinins E and F from the ascomycete fungus Hypoxylon fuscum (Xylariaceae)”, Phytochemistry 65, 469−473 116 Quang, D N., Hashimoto, T., Stadler, M and Asakawa, Y., (2004b), “New azaphilones from the inedible mushroom Hypoxylon rubiginosum”, J Nat Prod, 67, 1152–1155 117 Quang, D N., Hashimoto, T., Stadler, M and Asakawa, Y., (2005a), “Dimeric azaphilones from the xylariaceous ascomycete Hypoxylon rutilum”, Tetrahedron 61, 8451−8455 118 Quang, D N., Hashimoto, T., Nomura, Y., Wollweber, H., Hellwig, V., Fournier, J., Stadler, M and Asakawa, Y., (2005b), “Cohaerins A and B, azaphilones from the fungus Hypoxylon cohaerens, and com-parison of HPLC based metabolite profiles in Hypoxylon sect Annulata”, Phytochemistry, 66, 797−809 119 Quang, D N, Hashimoto, T., Radulovı´c, N., Stadler, M and Asakawa, Y., (2005c), “Antimicrobial azaphilones from the xylariaceous inedible mushrooms” Intern J Med Mushrooms, 3, 452–455 120 Quang D N, Hashimoto T, Stadler M, Radulovic N and Asakawa Y, (2005e), “Antimicrobial azaphilones from the fungus Hypoxylon multiforme”, Planta Medica, 71, 1058–1062 121 Quang, D N., Hashimoto, T., Asakawa, Y., (2006), “Inedible mushrooms: A good source of biologically active substances”, Chem Record, 6, 79-99 122 Quang, D N, Bach, D D, Hashimoto, T and Asakawa Y, (2006), “Chemical constituents of the Vietnamese inedible mushroom Xylaria intracolorata”, Nat Prod Res, 20(4), 317-21 123 Qing, X H., Guo, Q Z., Rui, Y Z., Dan, D H., He, X W and Tzi, B N (2012) “A novel aspartic protease with HIV-1 reverse transcriptase inhibitory activity from fresh fruiting bodies of the wild mushroom Xylaria hypoxylon”, J Biome Biotech, 10, 1155 – 1163 124 Qin, X D and Liu, J K., (2004), “Natural aromatic steroids as potential molecular fossils from the fruiting bodies of the ascomycete Daldinia concentrica”, J Nat Prod, 67, 2133–2135 125 Qin, X D., Dong, Z J., Liu, J K., Yang, L M., Wang, R R., Zheng, Y T., Lu, Y., Wu, Y S and Zheng, Q T., (2006), “Concentricolide, an anti-HIV agent from the ascomycete Daldinia concentrica”, Helv Chim Acta, 89, 127–133 126 Qin, X D., Dong, Z J and Liu, J K., (2006), “Two new compounds from the ascomycete Daldinia concentrica”, Helv Chim Acta, 89, 450–455 127 Rogers, J D and Berbee, J G., (1964), “Developmental morphology of Hypoxylon pruinatum in bark of quaking aspen”, Phytopathology, 54, 154162 128 Rogers, J D., (1979), “The Xylariaceae: systematics, biological and evolutionary aspects”, Mycologia, 71, 1- 42 129 Rogers, J D., Callan, B E and Samuels G J., (1987), “The Xylariaceae of the rain forests of North Sulawesi (Indonesia)”, Mycotaxon, 29, 113-172 130 Rogers, J D., (1993), “Teleomorph, anamorph, and holomorph considerations in the Xylariaceae In: The fungal holomorph: mitotic, meiotic and pleomorphic speciation in fungal systematics (eds D.R Reynolds and J.W Taylor)”, CAB International, Wallingford, UK, 179-182 131 Rogers, J D and Ju, Y M., (1997), “The genus Stilbohypoxylon”, Mycol Res, 101, 135-138 Deleted: loài 132 Rogers, J D and Ju, Y M., (1998), “The genus Kretzschmaria”, Mycotaxon, 68, 345 - 393 133 Rogers, J D., Ju, Y M., San Martn, F., (1997), “Jumillera and Whalleya, new genera segregated from Biscogniauxia”, Mycotaxon, 64, 39-50 134 Rogers, J D (2000), “Thoughts and musings on tropical Xylariaceae”, Mycol Res, 104, 1412-1420 135 Rogers, J D., Ju, Y M and Lehmann, J., (2005), “Some Xylaria species on termite nests”, Mycologia, 97, 914–923 136 Rogers, J D., Ju, Y M., 2012, “The Xylariaceae of the Hawaiian Islands”, North American Fungi, 7(9), 1- 35 137 Saccardo, P A., (1882a), “Sylloge fungorum omnium hucusque cognitorum I”, Patavii (Typis Seminarii) 768 p 138 Schmit, J P and Mueller, G M., (2007), “An estimate of the lower limit of global fungal diversity”, Biodivers Conserv, 16(1), 99–111 139 Scudiero, D A., Shoemaker, R H., Paull, K D., Monks, A., Tierney, S., Nofziger, T H., Currens, M J., Seniff, D and Boyd, M R., (1988), “Evaluation of a soluble tetrazolium/formazan assay for cell growth and drug sensitivity in culture using human and other tumor cell lines” Cancer Res, 48(17), 4827–4833 140 Shenq, C C., Ming, K C., Ding, L W and Min, K C (2007), “Isolation and characterization of a polycyclic aromatic hydrocarbons degrading enzyme from Xylaria regalis”, Fung Sci, 22(1, 2), 25–33 141 Lee, S and Crous, P W., (2003), “New species of Anthostomella on fynbos, with a key to the genus in South Africa”, Mycol Res, 107 (3), 360–370 142 Sheo, B S., Deborah, Z., Jon, P., Delia, V., Ali, S., Keith, S., Peter, F., Ana T., Dolores, V., Daria, J H and Russell, B L., (1999), “Structure and absolute stereochemistry of HIV- integrase inhibitor integric acid A novel eremophilane sesquiterpenoid produced by a Xylaria sp”, Tetrahedron Leters, 40, 8775 – 8779 143 Sergio, M L., Lilia, C., Sarah, H., Elizabeth, A., Carmenza, S., Alicia, I., William, H G and Luis, C R (2011), “Screening and evaluation of antiparasitic and in vitro anticancer activities of Panamanian endophytic fungi”, Inter Micro, 14, 95-102 144 Seephueak, P., Phongpaichit, S., Hyde, K.D and Petcharat, V., (2011), “Diversity of saprobic fungi on decaying branch liter of the rubber tree (Hevea brasiliensis)” Mycosphere, 2(4), 307–330 145 Surat, B., Prasat, K., Masahiko, I., Daraporn, P., Morakot, T and Yodhathai, T (2001), “Multiplolides A and B, New antifungal 10- memberd lactones from Xylaria multiplex”, J Nat Pro, 64, 965-967 146 Suwannasai, N., (2005), “Molecular taxonomic studies of selected members of the Xylariaceae (Fungi)” PhD Thesis, Suranaree University of Technology, Nakhon Ratchasima Thailand, – 301 147 Suwannasai, N., Whalley, M A., Whalley, A J., Thienhirun, S., Sihanonth, P., (2012), “Ascus apical apparatus and ascospore characters in Xylariaceae”, IMA Fungus, 3(2), 125-33 148 Smith, G J D., Hyde, K D and Whalley, A J S., (1999), “A new species and new records of Hypoxylon from Acheron Gap, Victoria, Australia”, Fungal Diversity, 3, 147-152 149 Smith, G J D., Liew, E C Y and Hyde, K D., (2003), “The Xylariales: a monophyletic order containing families”, Fungal Diversity, 13, 185-218 150 Smith, G J D., Hyde, K D., (2001), ”Fungi from palms XLIX Astrocystis, Biscogniauxia, Cyanopulvis, Hypoxylon, Nemania, Guestia, Rosellinia and Stilbohypoxylon”, Fungal Diversity, 7, 89-127 Deleted: Sheo, B., et al (1999) 151 Smith, C J., Morin, N R., Bills, G F., Dombrowski, A W., Salituro, G M., Smith, S K., Zhao, A., MacNeil, D J., (2002), “Novel sesquiterpenoids from the fermentation of Xylaria persicaria are selective ligands for the NPY Y5 receptor”, J Org Chem, 67, 5001– 5004 152 Susana, R C and José Luis, T H (2006), “Lacasses in the textile industry”, Biotechnol Mol Biol Rev, 4, 115-120 153 Strobel, G.A., Dirksie, E., Sears, J., Markworth, C (2001), “Volatile antimicrobials from a Novel Endophytic Fungus”, Microbiol, 147, 2943 - 2950 154 Stadler M; et al (2001), “Molecular chemotaxonomy of Daldinia and other Xylariaceae”, Mycol Res, 105 (10), 1191 – 1205 155 Stadler, M and Hellwig, V (2005), “Chemotaxonomy of the Xylariaceae and remarkable bioactive compounds from Xylariales and their associated asexual stages”, Recent Research Development Phytochemistry 9: 41-93 156 Stadler, M., Quang, D.N., Tomita, A., Hashimoto, T., Asakawa, Y., (2006), “Production of bioactive metabolites during stromatal ontogeny of Hypoxylon fragiforme”, Mycol Res, 110, 811-820 157 Stadler, M., Fournier, J., Læssøe, T., Decock, C., Peršoh, D and Rambold, G (2010), “Ruwenzoria, a new genus of the Xylariaceae from Central Africa”, Mycol Progress, 9(2), 169–179 158 Stadler, M., (2011) “Importance of secondary metabolites in the Xylariaceae as parameters for assessment of their taxonomy, phylogeny, and functional biodiversity”, Current Research in Environmental & Applied Mycology 1(2), 75 - 133 159 Swofford, D L., (2004) PAUP*: “Phylogenetic Analysis Using Parsimony (*and other methods)” Version 4.0b10 Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts U.S.A 160 Tang, A M C., Jeewon, R and Hyde, K.D., (2009), “A re-evaluation of the evolutionary relationships within the Xylariaceae based on ribosomal Deleted: Biotechnology and Molecular Biology Review, Vol (4), 115-120 and protein coding gene sequences”, Fungal Diversity, 34, 127-155 161 Thin, N N., (1997), “The vegetation of Cuc Phuong National Park, Vietnam”, SIDA 17(4): 719 - 759 162 Thienhirun, S (1997), “A preliminary account of the Xylariaceae of Thailand”, PhD Thesis, Liverpool John Moores University, Liverpool, UK: 1-134 163 Tulasne, L., Tulasne, C., (1863), “Selecta fungorum Carpologia II, (English translation of W B Grove)”, Oxford Univ Press, 319 p 164 Thompson, J D., Gibson, T J., Plewniak, F., Jeanmougin, F and Higgins, D G (1997) “The Clustal X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools” Nuc Aci Res 24: 4876 - 4882 165 Triebel, D., Persoh, D., Wollwebe, H and Stadler, M., (2005), “Phylogenetic relationships among Daldinia, Entonaema and Hypoxylon as inferred from ITS nrDNA analyses of Xylariales”, Nova Hedwigia, 80, 25 - 43 166 Yun, W.J., In, K.L., Young, S.K., Soon, J.S., Seung, H.Y and Bong, S.Y., (2009), “Chemical Constituents of the Fruiting Body of Xylaria polymorpha”, Mycobiology, 37(3), 207- 210 167 Van der Gucht, K and Whalley, A.J.S (1996), “Notes on the ecology of the Xylariaceae of Papua New Guinea”, Sydowia, 48 (1), 131- 144 168 Vasilyeva, L.N., Rogers, J.D and Miller, A.N., (2007), “Pyrenomycetes of the Great Smoky Mountains National Park V Annulohypoxylon and Hypoxylon (Xylariaceae)”, Fungal Diversity, 27, 231- 245 169 Whalley, A J S., (1996), “The xylariaceous way of life”, Mycol Res, 100, 897 – 922 170 Whalley, A J S and Whalley, M A., (1977), “Stromal pigments and taxonomy of Hypoxylon”, Mycopathologia, 61, 2, 99 - 103 171 Whalley, A J S., Hammelev, D and Taligoola, H K., (1988), “Two new species of Hypoxylon from Nigeria”, Trans Brit Mycol Soc, 90, 139-141 172 Whalley, A J S and Edwards, R L (1998), “The Xylariaceae: A case study in biological and chemical diversity”, Pure and Applied Chemistry, 70, 2123 2134 173 Whalley, A J S., Phosri, C., Ruchikachorn, N., Sihanonth, P., Deleted: Whalley, A J S; et al (2012) Sangvichien, E., Suwannasai, N., Thienhirun, S and Whalley, M A., (2012), “Interesting or rare Xylariaceae from Thailand”, Rajabhat J Sci Humanit Soc Sci, 13(1), - 19 174 Vietnam News (2001), “Fighting hard to give a heroic past its due”, Vietnam News May 2001 175 Vilgalys, R and Hester, M (1990), “Rapid genetic identification and mapping of enzymatically amplified ribosomal DNA from several Formatted: Bullets and Numbering Cryptococcus species” Jour Bac, 172, 4238 - 4246 Deleted: Visser, A A et al., (2009) 176 Visser, A A., Ros, V I., De, B Z W., Debets, A J., Hartog, E., Kuyper, T W., Laessøe, T., Slippers, B and Aanen, D K., (2009), “Levels of specificity of Xylaria species associated with fungus-growing termites: Deleted: ¶ a phylogenetic approach”, Molecular Ecology, 18, 553–567 Tiếng Khác 177 Hladki, A I., Romero, A I., (2009), “Novedades para los géneros Annulohypoxylon e Hypoxylon (Ascomycota, Xylariaceae) en la República Argentina”, Darwiniana, 47(2), 278-288 178 Maia, L C., and Carvalho, J R., (2010), “Catálogo de plantas e fungos Brasil [online]”, Rio de Janeiro: Andrea Jakobsson Estúdio: Instituto de Pesquisa Jardim Botânico Rio de Janeiro (1), 90-261 179 Kwang, T S., Ching, I P and Wen, Jer W., (2008), “Taiwan species diversity II Species checklist”, Publíhed by Forestry Bureau, Council of Agriculture, Executive Yuan, Taiwan, 114 – 151 Deleted: Kwang, T.S et al., (2008) Trang Web 180 http://www.vacne.org.vn/default.aspx?newsid=1869 181 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_PR OGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAUL TS=on&LINK_LOC=blasthome 182 htp://www.catalogueoflife.org/col/browse/tree/id/14815852 ... tiến hành nghiên cứu đề tài “ Nghiên cứu đa dạng đặc điểm sinh học nấm túi họ Xylariaceae Mường Phăng - Điện Biên Cúc Phương – Ninh Bình” Việc nghiên cứu góp phần bổ sung danh lục lồi nấm Việt... ITS 3.2 Nghiên cứu tính đa dạng sinh học nấm túi họ Xylariaceae KVNC 3.3 Nghiên cứu mối quan hệ di truyền chi, loài nấm túi họ Xylariaceae KVNC 3.4 Nghiên cứu thành phần hóa học số lồi nấm hoạt... tài sở khoa học phục vụ cho ngành hóa học, y – dược, sinh thái, tài nguyên sinh vật đa dạng sinh học Cung cấp liệu đặc điểm hình thái, tnh đa dạng sinh học khóa định loại loài nấm túi họ Xylariaceae