Cơ quan thuế là cơ quan có chức năng thu và quản lý các nguồn thu của NSNN. SAI. Khoản 1 và khoản 3 Điều 54 LNN năm 2002 quy định: “Chỉ cơ quan tài chính, cơ quan thuế, cơ quan hải quan và cơ quan khác được Nhà nước giao nhiệm vụ thu ngân sách (gọi chung là cơ quan thu) được tổ chức thu ngân sách nhà nước…Toàn bộ các khoản thu ngân sách phải được nộp trực tiếp vào Kho bạc Nhà nước. Trong trường hợp đặc biệt, cơ quan thu được phép tổ chức thu trực tiếp, nhưng phải nộp đầy đủ, đúng thời hạn vào Kho bạc Nhà nước theo quy định của Bộ trưởng Bộ Tài chính”.
Cơ quan thuế quan có chức thu quản lý nguồn thu NSNN SAI Khoản khoản Điều 54 LNN năm 2002 quy định: “Chỉ quan tài chính, quan thuế, quan hải quan quan khác Nhà nước giao nhiệm vụ thu ngân sách (gọi chung quan thu) tổ chức thu ngân sách nhà nước…Toàn khoản thu ngân sách phải nộp trực tiếp vào Kho bạc Nhà nước Trong trường hợp đặc biệt, quan thu phép tổ chức thu trực tiếp, phải nộp đầy đủ, thời hạn vào Kho bạc Nhà nước theo quy định Bộ trưởng Bộ Tài chính”