DANH SÁCH CHÍNH a Khái quát về Danh Sách Chính b Những bảng dữ liệu trong Danh Sách Chính c Xem dữ liệu d Cách làm dữ liệu Làm Không Hoạt Động e Chỉnh sửa dữ liệu f Thêm dữ liệu .1 Khái
Trang 1Hướng Dẫn Sử Dụng
Hệ Thống Thông Tin Phòng Xét Nghiệm
(ELIS)
I TỔNG QUAN VỀ HỆ THỐNG THÔNG TIN PHÒNG XÉT NGHIỆM 2
II BẢO MẬT 3
1 Cài đặt chế độ bảo mật ban đầu 3
2 Đăng nhập vào OpenELIS 3
3 Thoát khỏi OpenELIS 5
III DANH SÁCH CHÍNH 5
1 Khái quát về Danh Sách Chính 5
2 Những bảng dữ liệu trong Danh Sách Chính 6
3 Hiển thị dữ liệu 10
4 Cách làm cho dữ liệu Làm Không Hoạt Động 12
5 Chỉnh sửa dữ liệu 12
6 Thêm dữ liệu 14
IV KIẾN TRÚC HỆ THỐNG 15
Trang 2I TỔNG QUAN VỀ HỆ THỐNG THÔNG TIN PHÒNG XÉT NGHIỆM
- OpenELIS là một Hệ Thống Thông Tin Phòng Xét Nghiệm đựợc phát triển dựa trên nỗ lực hợp tác chung của các nhân viên công nghệ thông tin thuộc phòng thí nghiệm sức khỏe công cộng của 3 bang: Inova, Minnesota và Kansas Hệ thống được xây dựng dựa trên "Những yêu cầu đối với Các Hệ Thống Thông Tin Phòng Xét Nghiệm Sức Khỏe Công Cộng", được phát triển sau cuộc họp liên bang của
“Hiệp hội Các Phòng Xét Nghiệm Sức Khỏe Công Cộng” (Association of Public Health Laboratories (APHL)), và được triển khai bởi “Viện Khoa học Thông Tin
Sức Khỏe cộng đồng”(Public Health Informatics Institute (PHII)) với sự tài trợ
của tổ chức Robert Wood Johnson Sự nỗ lực hợp tác của các Bang này đã xác
định 16 qui trình tác nghiệp cho các phòng thí nghiệm sức khỏe công cộng, bao gồm tất cả các lĩnh vưc xét nghiệm của sức khỏe công cộng: xét nghiệm lâm sàng, xét nghiệm môi trường, sàng lọc sơ sinh và thử nghiệm trên động vật
- Mục đích của nhóm OpenELIS là phát triển một Hệ Thống Thông Tin Phòng Xét Nghiệm (LIS) nhằm đáp ứng yêu cầu của các phòng thí nghiệm sức khỏe công cộng, một hệ thống bền vững, tiết kiệm về mặt kinh tế, và có khả năng tạo ra một cộng đồng mã nguồn mở cho sự phát triển tương lai cũng như mở rộng các chức năng của hệ thống Bằng cách sử dụng những công cụ mã nguồn mở và tập trung vào hệ thống vận hành điều hành, và tính độc lập của cơ sở dữ liệu với thiết kế và triển khai hệ thống theo đó có thể giảm đáng kể chi phí đầu tư ban đầu và bảo trì
hệ thống về sau
- Trang Web OpenELIS hiện đã được đưa vào sử dụng, bao gồm một kho lưu trữ các mã nguồn, một diễn đàn Wiki lưu trữ những tài liệu, cũng như “những câu hỏi thường gặp”, và một ứng dụng tìm kiếm lỗi và các cải tiến.Truy cập website tại địa chỉ www.openelis.org
Trang 3II B Ả O M Ậ T
Cài đặt chế độ bảo mật ban đầu
Đăng nhập vào OpenELIS
Thoát khỏi OpenELIS
Thay Đổi Mật Khẩu
Cài đặt tài khoản người dùng mới
1 Cài đặt chế độ bảo mật ban đầu
- Trước khi bất cứ người dùng nào có thể truy cập vào OpenELIS, người quản
lý phải cài đặt tài khoản người dùng, môđun (màn hình) và cấp quyền cho người dùng Người quản lý của OpenELIS sử dụng 4 màn hình danh sách chính (Người Dùng Hệ Thống , Người đăng nhập, Mođun Hệ Thống và Mođun Người Dùng Hệ Thống) để thiết lập quá trình cài đặt bảo mật ban đầu Các màn hình danh sách chính được mô tả trong mục 9.5 Ngoài ra, bạn có thể xem thêm ở chương Danh sách chính và phụ lục dữ liệu danh sách chính để hiểu rõ hơn
- Sau khi hoàn tất việc cài đặt bảo mật, quá trình thêm người dùng mới vào hệ thống và cấp quyền là giống như với quá trình đã cài đặt ban đầu, ngoại trừ mođun hệ thống không cần phải định nghĩa lại Cách thêm 1 người dùng mới vào hệ thống sau khi cài đặt bảo mật ban đầu sẽ được mô tả hoàn chỉnh trong phần cuối cuả chương này
2 Đăng nhập vào OpenELIS
Để đăng nhập vào ứng dụng OpenELIS:
a Mở trang đăng nhập chính OpenELIS Người quản lý hệ thống OpenELIS cuả bạn sẽ cho bạn biết cách để vào trang đăng nhập này; thường thì bạn sẽ nhấn chuột vào đường kết nối cuả OpenELIS
b Người quản lý hệ thống OpenELIS sẽ cấp cho bạn 1 tên truy cập và mật khẩu Nhập tên truy cập và mật khẩu vào trang đăng nhập và nhấn nút
“Submit”
Trang 4c Nếu bạn nhập đúng tên truy cập và mật khẩu, trang chủ dưới đây sẽ mở ra.
d Nếu tên truy cập và mật khẩu sai, 1 thông báo "Đăng nhập không hợp lệ" sẽ hiện ra Có thể bạn đã nhập thông tin chưa chính xác, hãy thử điền tên truy cập và mật khẩu của bạn lại lần nữa Nếu vẫn nhận được thông báo như cũ, hãy liên lạc với người quản lý hệ thống OpenELIS cuả bạn để được giúp đỡ
e Nếu mật khẩu của bạn đã hết hạn, thông báo trên sẽ được hiển thị Hãy liên lạc với người quản lý hệ thống OpenELIS cuả bạn để được giúp đỡ Người quản lý hệ thống OpenELIS xác định ngày hết hạn mật khẩu của bạn trong quá trình cài đặt bảo mật ban đầu và sẽ xác lập lại ngày hết hạn
Trang 53 Thoát khỏi OpenELIS
Để thoát khỏi ứng dụng OpenELIS, nhấn vào ô Thoát trên trang chủ, được viền đỏ ở dưới đây Nếu bạn không tìm thấy ô Thoát, hãy thoát khỏi trang đó
để trở lại trang chủ và ô Thoát
III DANH SÁCH CHÍNH
a) Khái quát về Danh Sách Chính
b) Những bảng dữ liệu trong Danh Sách Chính
c) Xem dữ liệu
d) Cách làm dữ liệu Làm Không Hoạt Động
e) Chỉnh sửa dữ liệu
f) Thêm dữ liệu
.1 Khái quát về Danh Sách Chính
- Từng chức năng trong Danh Sách Chính sẽ tương ứng với từng bảng dữ liệu
mà trong đó chứa đựng danh sách của tất cả các giá trị hợp lệ cho các trường
dữ liệu trong ứng dụng Ví dụ: Bảng dữ liệu Tổ chức - Organization sẽ liệt kê tất cả các Tổ chức hợp lệ sẽ được nhập trong các màn hình ứng dụng
- Để ứng dụng hoạt động đúng đắn, trước tiên người quản trị cơ sơ dữ liệu phải dùng tập tin phát sinh dữ liệu để khởi tạo một phần hoạc toàn bộ dữ liệu cho các bảng danh sách chính
Trang 6- Chỉ có người giám sát hay quản trị hệ thống mói có thể truy cập đến danh sách các chức năng trong Danh Sách Chính Nếu có quyền truy cập, khi nhấn chọn thẻ Danh Sách Chính, bạn sẽ thấy danh sách các đường dẫn xuất hiện như bên dưới Mô tả phía dưới là những bảng dữ liệu được dùng trong Danh Sách Chính và các bước thực hiện cho việc thêm hoặc chỉnh sửa dữ liệu đã có Mô
tả chi tiết cho từng bảng trong Danh Sách Chính được xem trong phần Phụ
Lục: Dữ liệu Danh Sách Chính.
.2 Những bảng dữ liệu trong Danh Sách Chính
Danh sách ở dưới là các chức năng trong Danh Sách Chính và bảng dữ liệu tương ứng cho từng chức năng đó Những ví dụ minh họa sẽ làm rõ từng loại dữ liệu và mục đích của bảng dữ liệu
Bảng Nhóm các mẫu xét nghiệm được
dùng cho mục đích khi có yêu cầu chỉ định cùng lúc nhiều xét nghiệm cho mẫu xét nghiệm bằng cách chọn gán một nhóm cho mẫu xét nghiệm đó
Bảng xét nghiệm Vi khuẩn Bảng xét nghiệm Virus hô hấp
Trang 7Chỉ Số Thêm các chỉ số để thiết lập kết quả
cho xét nghiệm
Kết Quả Kết Quả (Âm tính/ Dương tính)
Chương Trình Chương trình điều tra nghiên cứu về
sức khỏe
Bệnh đường ruột Bệnh lây qua đường tình dục
Dấu Vết Xét Nghiệm Các mẫu thông báo sẽ được gắn vào
cho các xét nghiệm và được in ở phần cuối của mỗi báo cáo cho từng xét nghiệm Mẫu thông báo thường
in cho xét nghiệm đó và không được chỉnh sửa trên báo cáo của mẫu xét nghiệm các nhân
Chú ý: Kết quả PCR chỉ sử dụng cho nghiên cứu, không nên sử dụng cho việc chẩn đoán bênh
Dự Án Một dự án sẽ liên kết một loạt các
mẫu xét nghiệm liên quan đến việc bùng phát bệnh trong khoảng thời gian ngắn nào đó, một khóa học dài hạn hay các câu hỏi chất vấn dựa trên một loạt các tiêu chuẩn
Bùng phát bệnh ở nhà hàng ABC
Chương trình về HIV
Giới Tính Giới tính của bệnh nhân Nam
Nữ
Hành Động Hành động diễn ra đối với sự kiện
Kiểm Soát Chất lượng
Khách hàng đã gọi Ngày Lấy Mẫu đã chỉnh sửa
Khoa Những khoa của một tổ chức gửi
mẫu tới khoa xét nghiệm
Nội, Ngoại, Dịch Vụ, …
Loại Bệnh Nhân Quản lý các loại bệnh nhân của một
tổ chức
Nội Trú, Ngoại Trú
Loại Kết Quả Xét
Nghiệm
Loại của kết quả xét nghiệm có thể được nhập trong thành phần của xét nghiệm (câu hỏi) Loại “Từ điển”
được liệt kê trong bảng Dictionary
Loại Độ chuẩn và Số được định nghĩa trong “Thiết lập Thành phần/Chỉ số Xét nghiệm” và được lưu trong bảng TEST_RESULT
Từ Điển
Độ chuẩn Kiểu Số
Loại Mẫu Xét
Nghiệm Loại mẫu xét nghiệm được nhận từbệnh nhân cho việc kiểm tra (khác
với “nguồn mẫu xét nghiệm” sẽ được
mô tả trong vị trí lấy mẫu xét nghiệm)
Máu Mô Nước
Loại Thanh Toán Quản lý các hình thức thanh toán của
bệnh nhân
BHYT, Dịch Vụ, Viện Phí, Miễn Phí, …
Loại Từ Điển Nhóm hay loại của các mục từ điển Virút
Trang 8hay câu trả lời Đa khoa
Dịch tễ học
Nghề Nghiệp Quản lý những loại nghề nghiệp của
bệnh nhân
Nông Dân, Công Nhân, Bác Sĩ,
Kỹ Sư, …
Nguồn Mẫu Xét
Nghiệm
Vị trí thực hiện của mẫu xét nghiệm Tai trái
Tay phải Sông Mississippi
Phòng Xét Nghiệm Chương trình hoạt động hay điều tra
nghiên cứu của phòng xét nghiệm
Vi Trùng học Virút
Miễn dịch học
Phương Pháp Những kỹ thuật được sử dụng cho
việc kiểm tra mẫu xét nghiệm
Chuỗi dây chuyền phản ứng (PCR)
Sự nuôi cấy Sinh hóa
Quận Quản lý tất cả các quận/ huyện của
một đất nuớc
Quận 1, Quận 2, Huyện Châu Thành, …
Sự Kiện QA Sự kiện đảm bảo chất lượng có thể
được gán cho phân tích Những sự kiện này được gán cho từng xét nghiệm chứ không phải gán cho mẫu xét nghiêm
Mẫu vật tiêu bản chưa được nhận
Chất lượng chưa hoàn hảo Ngày lấy mẫu trống
Thành Phần Bảng Từng xét nghiệm được gán vào bảng Nuôi cấy vi khuẩn hiếu khí
Gram dương hình que Phiến đồ Acid Fast Bacilli smear
Parainfluenza 1 PCR Parainfluenza 2 PCR
Thiết Lập Chỉ Số/
Kết Quả Cho Xét
Nghiệm
Màn hình này khác với những màn hình khác ở chỗ nó dùng đường dẫn
để định nghĩa trước Thành phần/Câu hỏi (bảng ANALYTE) và định nghĩa trước Kết quả/Câu Trả lời (bảng DICTIONARY) để định nghĩa cho từng xét nghiệm cụ thể Những giá trị chính liên kết được lưu trong bảng TEST_RESULT
Xét nghiệm là HIV-1 Western Blot
Thành phần là vạch p65, vạch p55, v.v
Kết quả là +, -,
+/-Tỉnh/ Thành Phố Quản lý tất cả các tỉnh/ thành phố
của một đất nuớc
Tp HCM, Hà Nội, Đà Nẵng, Bình Dương, Đồng Nai, …
Tổ Chức Tất cả các thực thể mà hệ thống
ELIS tương tác qua lại như: Nơi gửi xét nghiệm, liên bang và các văn phòng đại diện tiểu bang
Viện Sức khỏe Lâm sàng Miền đông
Bệnh viện dùng phương pháp học
Trang 9Cơ quan Kiểm soát sự ô nhiễm
Trạng Thái Mẫu Xét
Nghiệm Trạng thái sẽ theo dõi mẫu xétnghiệm và tiến trình phân tích trong
quá trình thực hiện của phòng xét nghiệm
Mẫu Xét Nghiệm Bệnh Nhân 2 hoàn tất
Hoàn tất
Từ Điển Những kết quả hoặc câu trả lời Dương tính
Âm tính Không có kháng thể có tiền tố HIV-1 hiện diện
Vùng Mẫu Xét
Nghiệm Lĩnh vực của mẫu xét nghiệm sẽđược thực hiện Xét nghiệm cho ngườiXét nghiệm cho động vật
Xét nghiệm về môi trường
Xét Nghiệm Thủ tục thực hiện trong phòng xét
nghiệm có phương pháp và sẽ được gắn kết cho mẫu xét nghiệm Chỉ duy nhất một xét nghiệm có thể được in trong bảng, kết quả được nhập và xác minh bởi xét nghiệm và những câu hỏi được gán cho xét nghiệm
HIV-1 EIA Nuôi cấy vi khuẩn hiếu khí Gram dương hình que
Virus bệnh cúm A PCR
Xét Nghiệm Có Điều
Kiện
Khi gặp những điều kiện này, những xét khác sẽ được thêm vào cho mẫu xét nghiệm Những điều kiện này được định nghĩa trong các xét nghiệm đầu tiên thành phần (câu hỏi)
và kết quả (câu trả lời) đó cho xét nghiệm
Nếu xét nghiệm là HIV ½ Plus O
Và Thành phần là Kết quả cuối cùng
Và Kết quả là Phản ứng lặp lại thì Xét nghiệm có điều kiện là HIV-1 Western Blot
Nhật Ký Kết Quả
Xét Nghiệm Lưu lại tất cả các thao tác của ngườisử dụng thao tác trên kết quả của xét
nghiệm Thông tin lưu lại bao gồm:
tên tài khoản thao tác, ngày giờ, chuyển từ kết quả nào sang kết quả nào
Nhật Ký Nhận Xét
Nghiệm Lưu lại thông tin của người dùngnhận xét nghiệm của bệnh nhân
Thông tin lưu lại bao gồm: tên tài khoản đã thêm, ngày giờ thêm, tên xét nghiệm
Nhật Ký Thông Tin
Bệnh Nhân
Lưu lại tất cả các thao tác của người
sử dụng trên thông tin bệnh nhân
Thông tin lưu lại bao gồm: tên tài khoản thao tác, ngày giờ, thông tin bị thay đổi
Trang 10Người Đăng Nhập Thiết lập tên người dùng và mật
khẩu cho những người có thể đăng nhập vào hệ thống
Người Dùng Hệ
Thống
Thiết lập họ, tên và tên đăng nhập
Thành Phần Hệ
Thống
Thiết lập cho tất cả các màn hình của ứng dụng và khả năng thực hiện khi thực hiện chọn, thêm, chỉnh sửa và xóa
Quản Lý Kết Quả Xét Nghiệm, Xem Kết Quả, …
Quyền Cho Người
Dùng Hệ Thống Phân quyền từng chức năng trong hệthống cho từng tài khoản sử dụng
Thành phần cho
người quản trị hệ
thống
Thiết lập việc chọn, thêm, cập nhật
và xóa những quyền hạn đã được gán cho người dùng hệ thống và bộ phận
hệ thống
.3 Hiển thị dữ liệu
Để hiển thị dữ liệu trong Danh Sách Chính, thực hiện các bước sau:
1 Nhấn chọn thanh Danh Sách Chính
2 Nhấn chọn một đường dẫn
3 Màn hình giống bên dưới sẽ xuất hiện
4 Nhấn nút TRƯỚC và SAU để hiển thị khối dữ liệu phía trước hay phía sau của khối dữ liệu hiện tại Các mẫu dữ liệu sẽ được sắp xếp theo ký tự abc dựa theo trường dữ liệu quan trọng nhất
Trang 12.4 Cách làm cho dữ liệu Làm Không Hoạt Động
Thỉnh thoảng, các dữ liệu trong danh sách chính không còn hiệu lực nữa bởi nhiều nguyên nhân: một tổ chức nào đó không còn hoạt động nữa, một xét nghiệm không còn được thực hiện nữa hay một dự án nào đó đã hoàn thành
Để làm cho một mẫu dữ liệu nào đó không còn hiệu lực nữa ta làm theo cách sau:
f Nhấn chọn vào hộp chọn của mẫu dữ liệu trên màn hình hiển thị
g Nhấn nút Làm Không Hoạt Động (deactivate)
h Trường Có Hiệu Lực sẽ đổi từ Y sang N
i Một mẫu dữ liệu sẽ được được kích hoạt trở lại bằng cách sử dụng chức năng Chỉnh Sửa như mô tả ở phía dưới
.5 Chỉnh sửa dữ liệu
Để chỉnh sửa dữ liệu đã có trong Danh Sách Chính, thực hiện như sau:
1 Sử dụng nút TRƯỚC hoặc TIẾP trên màn hình để hiển thị các khối dữ liệu
và tìm mẫu dữ liệu mà bạn muốn chỉnh sửa
2 Nhấn chọn vào hộp chọn của mẫu dữ liệu đó
3 Nhấn nút Thay Đổi
Trang 134 Màn hình Thay Đổi sẽ hiển thị với từng giá trị hiện tại của mẫu tin đó tương ứng với các trường dữ liệu
5 Thay đổi trường dữ liệu nào cần thiết Những trường dữ liệu đánh dấu bằng dấu hoa thị màu đỏ (*) là trường bắt buộc
6 Để phục hồi hiệu lực lại một mẫu dữ liệu, bạn chỉ việc thay đổi giá trị N thành Y trong trường dữ liệu “Có Hiệu Lực” (activate)
7 Nhấn nút LƯU để lưu lại các thay đổi Nhấn nút THOÁT để thoát khỏi màn hình
mà không cần phải lưu lại Nếu trường dữ liệu bắt buộc mà không có dữ liệu thì khi bạn nhấn nút LƯU một hộp thoại sẽ xuất hiện thông báo những trường dữ liệu bắt buộc nào đang bị trống
Trang 14.6 Thêm dữ liệu
Để thêm mẫu dữ liệu mới cho Danh Sách Chính, thực hiện như sau:
1 Nhấn nút THÊM trên màn hình hiển thị
2 Màn hình Thêm sẽ xuất hiện như bên dưới Một vài trường dữ liệu sẽ tự động được điền với giá trị mặc định
3 Nhập dữ liệu vào các trường Những trường dữ liệu đánh dấu bằng dấu hoa thị màu đỏ (*) là trường bắt buộc Chi tiết các trường dữ liệu sẽ được mô tả trong
phần Phụ Lục: Dữ liệu Danh Sách Chính.
4 Nhấn nút LƯU để lưu lại các thay đổi của bạn cho mẫu dữ liệu đó Nhấn nút THOÁT để thoát khỏi màn hình mà không cần phải lưu lại sự thay đổi Nếu