8. Vi rut ho hap hop bao TS Ha Oxford

Chương 4 SỰ QUANG HỢP VÀ HÔ HẤP TẾ BÀO S QUANG H P TH C V TỰ Ợ Ở Ự Ậ Sự quang tổng hợp (photosynthesis) hay sự quang hợp, là một quá trình sinh học, chuyển năng lượng ánh sáng thành năng lượng hóa học. Sự quang hợp sử dụng CO 2 và H 2 O để tổng hợp thành hợp chất hữu cơ (carbonhydrat) và giải phóng O 2 Lá là c quan th c hi n s quang h p th c v tơ ự ệ ự ợ ở ự ậ L c l p là bào quan chính th c hi n s quang h pụ ạ ự ệ ự ợ [...]...Pha sáng quang hợp Quang hệ thống I và II (photosystem) Diệp lục tố và các sắc tố phụ cần thiết cho quá trình quang hợp tổ chức thành hai quang hệ thống I và II, cả hai đều ở trên màng thylakoid Mỗi quang hệ thống chứa khoảng 300 phân tử sắc tố • Mỗi quang hệ thống có một trung tâm phản ứng gồm có 4 phân tử sắc tố, 4 phân tử enzym... này hấp thu năng lượng của ánh sáng có độ dài sóng khác nhau và truyền năng lượng về trung tâm phản ứng Quang hệ thống I chứa phức hợp trung tâm phản ứng P700, vì nó khơng thể hấp thu ánh sáng có độ dài sóng cao hơn 700 nm; quang hệ thống II chứa phức hợp trung tâm phản ứng P680, vì nó khơng thể hấp thu ánh sáng có độ dài sóng cao hơn 680 nm Sắc tố quang hợp Chlorophyll Sự tổ chức của các phức hợp. .. các phức hợp tham gia vào pha sáng quang hợp (Nicotinamid adenin dinucleotid phosphat) Phức hợp ATP synthetase Pha tối quang hợp SỰ HƠ HẤP Q trình oxy hố hơ hấp Q trình oxyhố hơ hấp (Nicotinamid adenin dinucleotid phosphat) (Flavine adenin dinucleotid) Q trình oxyhố hơ hấp * Q trình đường phân: - Con đường Embden – Meyerhoff – Parnas - Con đường Pentose - Phosphate Q trình oxyhố hơ hấp Con đường Embden... Phosphate Q trình oxyhố hơ hấp Con đường Embden – Meyerhoff – Parnas Q trình oxyhố hơ hấp Q trình oxyhố hơ hấp - Con đường Pentose - Phosphate Giai đoạn 1 Q trình oxyhố hơ hấp - Con đường Pentose - Phosphate Giai đoạn 2 Q trình oxyhố hơ hấp Chu trình Kreb Q trình oxyhố hơ hấp Chuỗi chuyển ehơ hấp Q trình oxyhố hơ hấp Các sản phẩm từ chu trình Krebs Q trình lên men Lên men rượu Q trình lên men PyruvateĐẶC ĐIỂM VIRUT HÔ HẤP HỢP BÀO: TỪ LÂM SÀNG ĐẾN PHỊNG THÍ NGHIỆM DO LIEN ANH HA ĐƠN VỊ NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG ĐẠI HỌC OXFORD (OUCRU) THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH – VIỆT NAM GIẢ THIẾT NGHIÊN CỨU Đặc điểm phân tử học: Nhóm vi-rút (A B) Kiểu gene vi-rút Tiến hóa gen vi-rút Biểu gen chủ thể: Biểu genes chủ thể VI-RÚT CHỦ THỂ BỆNH CẢNH LÂM SÀNG 1.Các nghiên cứu dịch tễ học lâm sàng: - Đặc điểm dân số học - Bệnh cảnh lâm sàng Các thử nghiệm thuốc: -Thuốc điều trị -Vắc-xin MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Tỉ lệ vi-rút nhiễm Ở trẻ nhập viện viêm nhiễm đường hơ hấp cấp Đặc điểm vi-rút học RSV - Phân nhóm RSV / nồng độ RSV - Giải mã toàn gene RSV ( định kiểu genes, phân tích biến chủng chủ thể …) Đáp ứng thể nhiễm vi-rút RSV - Trong trình nhiễm RSV tự nhiên (nhiễm RSV đơn độc đồng nhiễm với vi-rút khác) - So sánh với đáp ứng biểu gene thể vi-rút hRV - Trong trường hợp nhiễm RSV nặng không nặng THIẾT KẾ NGHIÊN CỨU N=632 (1 tháng -2 tuổi; 44% P Hot spots: SH & G => trường hợp bệnh nặng so với trường hợp bệnh không nặng Courtesy of Andreas Wilm – Wilm et al., 2012 CÁC NHÓM TRONG PHÂN TÍCH BiỂU HIỆN GENE CỦA CHỦ THỂ ĐƠN NHIỄM RSV (n= 44 trường hợp) (44/201=>22%) ĐỒNG NHIỄM VỚI RSV (n=18 trường hợp) (18/101=>18%) 7/18 đồng nhiễm hRV ĐƠN NHIỄM HRV (n=30 trường hợp) (30/87=>34%) KHƠNG TÌM THẤY VIRÚT (n=22 trường hợp) (22/58=>45%) DEGS TÌM THẤY Ở GIAI ĐOẠN NHIỄM CẤP A C A C CỦA ĐƠN NHIỄM RSV Spearman R= 0.5 p= 0.0000 Tại mẫu phết mũi Tại máu 3,576 611 334 MŨI MÁU Mũi Máu - 4.2 - 4.5 0 + 4.2 + 4.5 Mũi (3910 DEGs) Máu (945 DEGs) CÁC CON ĐƯỜNG SINH HỌC TRONG GIAI ĐOẠN NHIỄM CẤP CỦA ĐƠN NHIỄM RSV Các đường đứng vị trí hàng đầu tìm thấy hai nơi chủ thể từ phân tích ORA, GSEA Pathways analysis(*): • Interferon signaling pathway (IFN I, II and III) INFgamma (FC=6) / IL28A (FC=6), IL29 (FC=8) • Cytokine cytokine receptor interaction CCL8 (FC=31), CCL2 (FC=11), CXCL11(FC=10), CXCL10 (FC=9) • Leukocyte transendothelial migration ICAM1-2 (FC=2-3)/mũi, ICAM3 ↓FC=1.2/máu => Top hubs genes: STAT1, IRF1-2, IRF4, IRF7-8 (*)Ingenuity Pathway, Gene Set Enrichment analysis, Pathway Express analysis CÁC CON ĐƯỜNG SINH HỌC TRONG GIAI ĐOẠN NHIỄM CẤP CỦA ĐỒNG NHIỄM RSV -15/25 + 7/13 đường giống với giai đoạn nhiễm cấp đơn nhiễm RSV - đường đứng vị trí hàng đầu giống với đường tìm thấy giai đoạn nhiễm cấp đơn nhiễm RSV => Top hub genes : STAT1, IRF1, IRF2 IRF7 2,193 259 MŨI 247 MÁU CÁC CON ĐƯỜNG SINH HỌC TRONG GIAI ĐOẠN NHIỄM CẤP CỦA ĐƠN NHIỄM HRV Khơng có đường chung: mũi máu ORA: 5/7 (mũi) => đường chuyển hóa 12/17 (máu) => đường truyền tin miễn dịch tiên phát (innate immune signaling) GSEA: cytokine-cytokine receptor interaction (mũi) Pathway express: Leukocyte transendothelial migration (mũi) Toll-like receptor signaling (máu) 1,374 394 35 NASAL BLOOD ĐƠN NHIỄM RSV SO VỚI ĐƠN NHIỄM HRV ⇒Top hub genes : KHƠNG CĨ CHUNG TOP HUB GENE VỚI RSV ⇒ So sánh đơn nhiễm RSV so với đơn nhiễm hRV g/đoạn cấp (unpaired T-test, Benjamini-Hochberg correction) : • Interferon signaling (p = 8.7E-09) • Cytokine cytokine receptor interaction (p