Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)Xây dựng cây phả hệ cho họ Ráy (Araceae) ở khu vực phía Nam Việt Nam dựa trên hình thái và Marker phân tử (LA tiến sĩ)
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - VĂN HỒNG THIỆN XÂY DỰNG CÂY PHẢ HỆ CHO HỌ RÁY (ARACEAE) Ở KHU VỰC PHÍA NAM VIỆT NAM DỰA TRÊN HÌNH THÁI VÀ MARKER PHÂN TỬ LUẬN ÁN TIẾN SỸ SINH HỌC Thành phố Hồ Chí Minh – 2017 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - VĂN HỒNG THIỆN XÂY DỰNG CÂY PHẢ HỆ CHO HỌ RÁY (ARACEAE) Ở KHU VỰC PHÍA NAM VIỆT NAM DỰA TRÊN HÌNH THÁI VÀ MARKER PHÂN TỬ Chuyên ngành: Sinh thái học Mã sỗ: 62 42 01 20 LUẬN ÁN TIẾN SỸ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS Lưu Hồng Trường TS Nguyễn Phi Ngà Thành phố Hồ Chí Minh – 2017 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu tác giả hướng dẫn TS Lưu Hồng Trường TS Nguyễn Phi Ngà Các số liệu, hình ảnh sử dụng luận án có nguồn gốc rõ ràng Kết nghiên cứu phân tích khách quan chưa sử dụng công bố nước quốc tế Tác giả luận án Văn Hồng Thiện LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành luận án này, tác giả xin chân thành cảm ơn: TS Lưu Hồng Trường (Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam) TS Nguyễn Phi Ngà (Bộ môn Sinh thái học & Tiến hóa, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên Tp HCM) quan tâm, tâm huyết, tận tình hướng dẫn chuyên môn cung cấp số mẫu vật cho luận án Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam hỗ trợ kinh phí cho số chuyến thực địa, cung cấp nhiều mẫu vật cho luận án TS Nguyễn Thị Phương Thảo–Viện Sinh học Nhiệt Đới tạo điều kiện hỗ trợ cho tác giả suốt trình học chương trình Nghiên cứu sinh Viện Sinh học Nhiệt Đới-Học Viện Khoa học & Công nghệ, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam Ngoài ra, chân thành cảm ơn hỗ trợ, đóng góp cộng tác từ quý Thầy, Cô, nhà chuyên môn, quý đồng nghiệp quý anh, chị em từ nhiều đơn vị khác trình thực luận án như: PGS TS Hoàng Nghĩa Sơn– Viện Sinh học Nhiệt Đới PGS TS Trần Hợp–Khoa Sinh học, Đại học KHTN Tp HCM PGS TS Nguyễn Thị Đẹp–Bộ môn Thực vật, Khoa Dược, Đại học Y Dược Tp HCM TS Trần Văn Tiến–Khoa Sinh học, Đại học Đà Lạt PSG TS Lê Huyền Ái Thúy–Khoa Công nghệ Sinh học, Đại học Mở Tp HCM TS Phạm Văn Ngọt – Khoa Sinh học, Đại học Sư Phạm Tp HCM TS Hoàng Minh Đức–Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam ThS Nguyễn Quốc Đạt–Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam ThS Nguyễn Trần Quốc Trung–Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 10 ThS Nguyễn Lê Xuân Bách–Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 11 CN Đặng Minh Trí–Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 12 KS Nguyễn Hiếu Cường–Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 13 KS Nguyễn Thị Luân–Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 14 ThS Trần Hữu Đăng–Viện Sinh thái học Miền Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 15 PSG TS Trần Thế Bách–Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 16 TS Nguyễn Quốc Bình–Bảo Tàng Thiên Thiên Việt Nam, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 17 TS Nguyễn Văn Dư–Viện Sinh thái Tài nguyên Sinh vật, Viện Hàn Lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam 18 PSG TS Đàm Sao Mai–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 19 TS Trịnh Ngọc Nam–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 20 TS Nguyễn Bá Thanh–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 21 TS Phạm Tấn Việt–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 22 TS Nguyễn Thị Diệu Hạnh–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 23 TS Trần Thị Huyền–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 24 ThS Lưu Thảo Nguyên–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 25 ThS Lê Hồng Thía–Viện Môi Trường, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 26 TS Phạm Nguyễn Đức Hoàng–Trung tâm Công nghệ Sinh học Tp HCM 27 ThS Nguyễn Anh Tuấn–VQG Phước Bình 28 ThS Lê Thanh Sơn–KBTTN Bình Châu-Phước Bửu 29 ThS Lê Hồng Sơn–VQG Côn Đảo 30 KS Nguyễn Đình Trung–VQG Côn Đảo 31 KS Hà Văn Long–VQG Phú Quốc 32 KS Trần Ngọc Toàn–Trung tâm Đa dạng sinh học Nước Việt Xanh, Đà Nẵng 33 KS Trần Giỏi–Hội Bảo vệ thiên nhiên môi trường tỉnh Khánh Hòa 34 ThS Nguyễn Ái Tâm–VQG Kon Ka Kinh 35 KS Võ Huy Sang–VQG Bù Gia Mập 36 KS Phạm Hữu Nhân–VQG Bidoup-Núi Bà 37 KS Vũ Kim Công–Viện Sinh học Tây Nguyên 38 KS Nguyễn Thị Ngọc Mỹ–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 39 KS Đỗ Đình Quốc Bảo–Viện Công nghệ sinh học & Thực phẩm, Trường Đại học Công Nghiệp Tp HCM 40 Sư cô Mẫn–Chùa Quan Âm, núi Bà Đen, Tây Ninh 41 Anh Thủy–Hàm Thuận Nam, Bình Thuận 42 Thầy Nguyễn Thanh Tâm–Trường THPT Lê Hồng Phong, Hiệp Đức, Quảng Nam 43 Em Cảnh–Hiệp Đức, Quảng Nam 44 Anh Tâm–Thăng Bình, Quảng Nam Xin thành kính, cảm tạ công ơn dạy dỗ cố Nhà giáo, PGS TS Bùi Văn Lai– Viện Sinh học Nhiệt Đới DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT bp : Base pair CBHD : Cán hướng dẫn CI : Consistency index CS : Cộng DNA : Deoxyribonucleic acid HN : Phòng mẫu vật Viện Sinh thái tài nguyên sinh vật HNU : Phòng mẫu vật Trường Đại học Khoa học tự nhiên Hà Nội IGS : Intergenic spacer ITS : Internal transcribed spacer K : Bảo tàng mẫu vật Kew (Anh) KBTTN : Khu bảo tồn thiên nhiên MEGA : Molecular Evolutionary Genetics Analysis P : Bảo tàng mẫu vật Paris (Pháp) PAUP : Phylogenetic Analysis Using Parsimony PCR : Polymerase Chain Reaction PHH : Phòng mẫu vật Trường Đại học Khoa học tự nhiên Tp HCM RAPD : Random Amplification of Polymorphic DNA RC : Rescaled consistency index RFLP : Restriction fragment length polymorphism RI : Retention index RPH : Rừng phòng hộ Sect : Section SGN : Phòng mẫu vật Viện Sinh thái học miền Nam SSR : Simple sequence repeat Subfam : Subfamily–Phân họ Syn : Synonym Trib : Tribe–Tông VNM : Phòng mẫu vật Viện Sinh học nhiệt đới VQG Vườn quốc gia MỤC LỤC Trang MỞ ĐẦU CHƢƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Giới thiệu họ Ráy 1.2 Sinh thái dạng 1.2.1 Thực vật bán phụ sinh (hemiepiphytes) 1.2.2 Thực vật phụ sinh (epiphytes) 1.2.3 Thực vật mọc đá (lithophytes) 1.2.4 Thực vật chồi ngầm (geophytes) 1.2.5 Thực vật dòng chảy (rheophytes) 1.2.6 Thực vật ngập nước (submerged aquatics) ngập nước định kỳ (periodically submerged aquatics) 1.2.7 Thực vật đầm lầy (helophytes) 1.2.8 Thực vật trôi (free-floading aquatics) 1.3 Lịch sử nghiên cứu phân loại họ Ráy 1.3.1 Lịch sử nghiên cứu phân loại họ Ráy giới 1.3.1.1 Nghiên cứu phân loại họ Ráy dựa đặc điểm hình thái 1.3.1.2 Nghiên cứu ứng dụng marker phân tử xây dựng hệ thống phát sinh chủng loại họ Ráy 1.3.2 Lịch sử nghiên cứu họ Ráy Việt Nam 10 CHƢƠNG ĐIỀU KIỆN VÀ PHƢƠNG PHÁP THỰC NGHIỆM 2.1 Đối tƣợng nghiên cứu 13 2.2 Phƣơng pháp nghiên cứu 13 2.2.1 Phƣơng pháp khảo sát thực địa 13 2.2.2 Phƣơng pháp thực phòng thí nghiệm 14 2.2.2.1 Phương pháp nghiên cứu đặc điểm hình thái 14 2.2.2.2 Phương pháp nghiên cứu phân tử 14 2.2.3 Phƣơng pháp xử lý số liệu 16 2.2.3.1 Xây dựng phả hệ dựa đặc điểm hình thái 16 2.2.3.2 Xây dựng phả hệ dựa marker phân tử 16 CHƢƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 Kết xây dựng phả hệ 17 3.1.1 Kết xây dựng phả hệ dựa đặc điểm hình thái 17 3.1.1.1 Phân họ Pothoideae Monsteroideae 18 3.1.1.3 Phân họ Lasioideae 18 3.1.1.4 Phân họ Aroideae 19 Tông Homalomeneae 19 Tông Schismatoglottis, Cryptocoryneae 19 Tông Aglaonemateae 19 Tông Thomsonieae 20 Tông Arisaemateae 20 Tông Pistieae 21 Tông Colocasieae 21 3.2.2 Kết xây dựng phả hệ dựa marker phân tử 23 3.2.2.1 Kết đặc điểm trình tự trnL-trnF IGS matK 23 3.2.2.2 Cây phả hệ dựa vùng trình tự trnL-trnF matK 24 Phân họ Pothoideae, Monsteroideae Lasioideae 25 Phân họ Aroideae 26 Tông Cryptocoryneae Schismatoglottideae 26 Tông Aglaonemateae 26 Tông Homalomeneae 30 Tông Thomsonieae 31 Tông Pistieae 34 Tông Colocasieae 34 Tông Arisaemateae 39 Tông Areae 42 3.3 Kết nghiên cứu đặc điểm hình thái 43 Khóa định loại chi thuộc họ Araceae miền Nam 43 Phân họ POTHOIDEAE 45 Tông Potheae 45 Chi Pothos 45 Khóa định loại loài Pothos phía Nam 46 Phân họ MONSTEROIDEAE 53 Tông Anadrndreae 53 Chi Anadendrum 53 Khóa định loại loài Anadendrum phía Nam 53 Tông Monstereae 55 Chi Rhaphidophora 55 Khóa định loại loài Rhaphidophora phía Nam 56 Chi Epipremnum 60 Khóa định loại loài Epipremnum phía Nam 60 Chi Sinsdapsus 62 Khóa định loại loài Sinsdapsus phía Nam 63 Phân họ LASIOIDEAE 64 Chi Pycnospatha 64 Chi Cyrtosperma 65 Chi Lasia 67 Phân họ AROIDEAE 68 Tông Homalomeneae 68 Chi Homalomena 69 Khóa định loại loài Homalomena phía Nam 69 Tông Schismatoglottideae 74 Chi Schismatoglottis 74 Khóa định loại loài Schismatoglottis phía Nam 74 Tông Cryptocoryneae 77 Chi Cryptocoryne 78 Khóa định loại loài Cryptocoryne phía Nam 78 Tông Aglaonemateae 81 Chi Aglaonema 81 Khóa định loại loài Aglaonema phía Nam 82 Tông Thomsonieae 87 Chi Amorphophallus 87 ... MỤC HÌNH Trang Hình 3.1 Cây phả hệ họ Ráy phía Nam Việt Nam dựa hình thái 17 Hình 3.2 Cây phả hệ họ Ráy phía Nam Việt Nam dựa marker phân tử 24 Hình 3.2 Cây phả hệ tông Colocasieae dựa marker. .. lý trên, định thực đề tài: Xây dựng phả hệ cho họ Ráy (Araceae) khu vực phía Nam Việt Nam dựa hình thái marker phân tử với mục tiêu sau: - Xây dựng hệ thống phả hệ cho họ Ráy phía Nam Việt Nam. .. VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - VĂN HỒNG THIỆN XÂY DỰNG CÂY PHẢ HỆ CHO HỌ RÁY (ARACEAE) Ở KHU VỰC PHÍA NAM VIỆT NAM DỰA TRÊN