Luận án nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng, tính kháng kháng sinh, gen kháng thuốc của staphylococcus aureus và escherichia coli ở bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG HỌC VIỆN QUÂN Y LÊ VĂN NAM NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, CẬN LÂM SÀNG, TÍNH KHÁNG KHÁNG SINH, GEN KHÁNG THUỐC CỦA STAPHYLOCOCCUS AUREUS, ESCHERICHIA COLI Ở BỆNH NHÂN NHIỄM KHUẨN HUYẾT (10/2012 – 6/2014) LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI – NĂM 2017 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG HỌC VIỆN QUÂN Y LÊ VĂN NAM NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, CẬN LÂM SÀNG, TÍNH KHÁNG KHÁNG SINH, GEN KHÁNG THUỐC CỦA STAPHYLOCOCCUS AUREUS, ESCHERICHIA COLI Ở BỆNH NHÂN NHIỄM KHUẨN HUYẾT (10/2012 – 6/2014) Chuyên ngành: Truyền nhiễm Bệnh nhiệt đới Mã số: 62 72 01 53 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Hướng dẫn khoa học: PGS TS Trần Viết Tiến PGS TS Phạm Văn Ca HÀ NỘI – NĂM 2017 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan luận án phần số liệu đề tài nghiên cứu cấp nhà nước có tên: Nghiên cứu ứng dụng kỹ thuật sinh học phân tử xác định mức độ kháng kháng sinh số chủng vi khuẩn gây bệnh thường gặp việt nam Kết đề tài thành nghiên cứu tập thể mà thành viên Tôi chủ nhiệm đề tài đồng ý cho phép sử dụng số liệu đề tài cho luận án tiến sỹ Các số liệu, kết luận án trung thực chưa công bố cơng trình khác Hà Nội, ngày 30 tháng năm 2017 Người làm luận án NCS Lê Văn Nam LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành cảm ơn Ban Giám đốc, Phòng sau đại học – Học viện Quân y, Ban giám đốc – Bệnh viện Quân y 103 cho phép, tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình học tập, nghiên cứu hồn thành luận án Tơi vơ biết ơn sâu sắc tới PGS TS Trần Viết Tiến, PGS TS Phạm Văn Ca tận tình hướng dẫn, tạo điều kiện tốt cho q trình học tập hồn thiện luận án Tơi chân thành cảm ơn PGS TS Nguyễn Thái Sơn, TS Lê Văn Duyệt ThS Nguyễn Thị Thúy Hằng giúp đỡ nhiều để tơi hồn thiện luận án Tôi xin chân thành cảm ơn Ban Giám đốc, PGS TS Nguyễn Vũ Trung, Phòng Kế hoạch tổng hợp Khoa xét nghiệm – Bệnh viện Bệnh nhiệt đới Trung ương cho phép tạo điều kiện cho lấy số liệu phục vụ cho luận án Tôi xin chân thành cảm ơn Thầy cô, Bác sỹ, Điều dưỡng, Kỹ thuật viên Bộ môn - Khoa Truyền nhiễm, Khoa Vi sinh Y học – Bệnh viện Quân y 103, Học viện Quân y Tôi xin trân trọng cảm ơn thầy, ngồi sở đào tạo đóng góp ý kiến quý báu cho luận án Cuối cùng, vô quan trọng, tơi xin nói lời cảm ơn đầy u thương tới gia đình, người ln bên tơi lúc khó khăn chịu đựng nhiều tháng ngày bận rộn với luận án dành nhiều thời gian cho gia đình Hà Nội, 30 tháng năm 2017 NCS Lê Văn Nam MỤC LỤC Trang phụ bìa Lời cam đoan Lời cảm ơn Mục lục Danh mục chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục biểu đồ Danh mục hình ĐỀ TÀI LUẬN ÁN 131 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Viết tắt ADN Tiếng Anh Acid desoxyribonucleic Axít nhân ALT (GPT) Alanin Aminotransferase Enzym gan a.n.l Above normal limit Trên giới hạn bình thường APTT Activated Parthial Thromboplastin Time Thời gian thromboplastin phần ARDS Acute Respiratory Distress Syndrome Suy hô hấp cấp tiến triển AST (GOT) Aspartat Aminotransferase Enzym gan BE Base excess Quá mức BN Tiếng việt Bệnh nhân CA-MRSA Community Asociated Methicillin Resistance Staphylococcus aureus CDC Centers for Disease Control and Prevention Trung tâm kiểm soát ngăn ngừa bệnh tật – Hoa Kỳ CNS Coagulase NonStaphylococcus aureus Coagulase S aureus CRP C-Reactive Protein Protein C phản ứng E coli Escherichia coli Vi khuẩn E coli ESBL Extended Spectrum Beta – Lactamase Enzym beta – lactamase phổ rộng HF Heart frequency Nhịp tim Hb Hemoglobin Huyết sắc tố hVISA heterogeneous Vancomycin Tụ cầu vàng kháng phần resistant Staphylococcus với Vancomycin aureus ICU Intensive care unit Đơn vị điều trị tích cực INR International Chỉ số bình thường hóa quốc tế Normalized Ratio KPC Klebsiella Pneumoniae Carbapenemase Enzym kháng Carbapenem MAP Mean artery pressure Huyết áp trung bình MBL Metalo β-lactamase MIC Minimum inhibitory concentration MLSB Macrolide-lincosamidestreptogram B MRSA Methicillin resistance Staphylococcus aureus Tụ cầu vàng kháng methicilin MSSA Methicillin sensitive Staphylococcus aureus Tụ cầu vàng nhạy với methicilin Nồng độ ức chế tối thiểu NKH Nhiễm khuẩn huyết NKHN Nhiễm khuẩn huyết nặng PBS Phosphate Buffer Saline PBP2a Low-affinity penicillinbinding protein PCT Procalcitonin PCR Polymerase Chain Reaction PFGE Pulsed Field Gel Electrophoresis RF Respiratory frequency Tần số hô hấp RLS Reaction level scale Quy mô mức độ phản ứng SNK Phản ứng khuếch đại gen Sốc nhiễm khuẩn SIRS Systemic Inflammatory Response Syndrome Hội chứng đáp ứng viêm hệ thống S aureus Staphylococcus aureus Tụ cầu vàng SCCmec Staphylococcal cassette chromosome mec SBP Systemic blood pressure Huyết áp tâm thu TKKT Thần kinh khu trú VISA Vancomycin Intermediate Staphylococcus aureus Tụ cầu vàng kháng trung gian với vancomycin VRSA Vancomycin resistant Staphylococcus aureus Tụ cầu vàng kháng với vancomycin WBC White Blood Cell Bạch cầu WHO World Health Organization Tổ chức Y Tế Thế Giới Viết tắt PEN ERY CM TE OXA SXT Kháng sinh Penicillin Erythromycin Clindamycin Tetracycline Oxacillin Trimethoprim/ GM CIP LVX MXF VAN RIF QD sulfamethoxazole Gentamycin Ciprofloxacin Levofloxacin Moxifloxacin Vancomycin Rifampin Quinupristin/ LZD TGE dalfopristin Linezolid Tigecycline AM SXT Ampicilin Trimethoprim/ CZ CRO SAM sulfamethoxazole Cephazolin Ceftriaxone Ampicilin/ CIP LVX GM CAZ sulbactam Ciprofloxacin Levofloxacin Gentamycin Ceftazidime TZP Piperacillin/ FEP TM AK DOR ETP Tazobactam Cefepime Tobramycin Amikacin Doripenem Ertapenem DANH MỤC BẢNG Bảng Tên bảng Trang MỘT SỐ KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ GEN PHIẾU THU THẬP THÔNG TIN NGHIÊN CỨU BỆNH NHÂN NHIỄM KHUẨN HUYẾT DO E COLI; S AUREUS Bệnh viện: Mã lưu trữ: Khoa điều trị: Tên chủng vi khuẩn: Mã chủng vi khuẩn: Ngày phân lập: Phương pháp định danh: I THÔNG TIN CƠ BẢN 1.Họ tên: Tuổi: Giới: Ngày vào viện: Ngày thứ: bệnh Tháng vào viện: Ngày viện: Tổng số ngày nằm viện: Địa chỉ: 10 Địa dư: 11 Điện thoại: 12 Chẩn đoán vào viện: 13 Chẩn đoán viện: 14 Triệu chứng khởi phát: 15 Ổ nhiễm khuẩn tiên phát: 16 Bệnh lý nền: Đái tháo đường Nghiện rượu Ung thư Viêm gan Tăng huyết áp Xơ gan COPD Sỏi tiết niệu Bệnh khớp MT Suy thận Sỏi mật Có thai II CÁC TRIỆU CHỨNG LÂM SÀNG Nghiện chích ma túy Nhiễm HIV/AIDS Suy giảm MD Viêm tắc TM chi Suy tim CTSN, Tủy sống Triệu chứng sốt Tình trạng thân nhiệt Sốt liên tục Sốt nóng Gai rét Cơn rét run Triệu chứng da niêm mạc - Lưỡi bẩn: - Da niêm mạc vàng: - XH da: - Viêm loét da: Triệu chứng tuần hoàn - Tiếng tim bất thường: - Nhịp mạch : - Huyết áp: Triệu chứng hô hấp - Ho : - Khạc đờm : - Khó thở: - Ran nổ: - Ran rít/ngáy/ẩm: - Suy hơ hấp: Triệu chứng tiêu hóa - Đau bụng: - Buồn nơn, nơn: - Đi ngồi lỏng: - Khám bụng : + Gan to: + Lách to: + Trướng bụng: + Cổ trướng: Triệu chứng thận tiết niệu - Đái buốt/Đái dắt: - Đái đục/ Đái sỏi: - Đái máu: - Đái không tự chủ : - Khám thận, tiết niệu: + Chạm thận: + Rung thận: Triệu chứng thần kinh - Đau đầu: - Rối loạn ý thức: - Khám thần kinh: + Hội chứng thần kinh khu trú: + Hội chứng màng não: Triệu chứng cơ, xương, khớp - Sưng mủ khớp: - Ổ mủ cơ: Triệu chứng quan sinh dục: - Viêm phần phụ: 10 Can thiệp xâm lấn Đặt ống NKQ Đặt Catheter TM trung ương Đặt Catheter TM ngoại vi Đặt sonde tiểu Lọc máu Kháng sinh III KẾT QUẢ CẬN LÂM SÀNG Bạch cầu Chỉ số Số lượng (G/l) N% Kết Hồng cầu, huyết sắc tố tiểu cầu L% M% E% B% Chỉ số Hồng cầu (T/l) Kết Đông máu Chỉ số Fibrinogen (g/l) APTT (s) Kết Markers viêm vi khuẩn gây bệnh Chỉ số Kết Sinh hóa máu Chỉ số Kết Chỉ số Huyết sắc tố (g/l) CRP (mg/l) Tiểu cầu (G/l) Prothrombin (%) PCT (ng/ml) Glucose (mmol/l) Ure (mmol/l) Creatinin (µmol/l) GOT (U/l) GPT (U/l) Billirubin TP (µmol/l) Billirubin TT (µmol/l) Na+ (mmol/l) K+ (mmol/l) Cl(mmol/l) Kết Xét nghiệm Xquang Bộ phận chụp Xquang phổi Các xét nghiệm khác Xét nghiệm Kết Siêu âm tim Siêu âm ổ bụng Kết kháng sinh đồ: (Có phiên giải kết đính kèm) Kết Kết xét nghiệm gen kháng thuốc: (Có phiên giải kết đính kèm) III KẾT QUẢ ĐIỀU TRỊ Kết quả: Ngày… tháng…năm… Nghiên cứu sinh NCS Lê Văn Nam (Khoa Truyền nhiễm BV103) ... nghiên cứu sâu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng, tính kháng sinh, gen kháng thuốc E coli S aureus mối liên quan tỷ lệ mang gen kháng thuốc với tình trạng kháng kháng sinh vi khuẩn tiên lượng bệnh. .. DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG HỌC VIỆN QUÂN Y LÊ VĂN NAM NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, CẬN LÂM SÀNG, TÍNH KHÁNG KHÁNG SINH, GEN KHÁNG THUỐC CỦA STAPHYLOCOCCUS AUREUS, ESCHERICHIA COLI Ở BỆNH NHÂN... chúng tơi tiến hành đề tài ? ?Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng, tính kháng kháng sinh, gen kháng thuốc Staphylococcus aureus, Escherichia coli bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết (10/2012-6/2014)”